BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-111O17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,581,566 - 90,752,568
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc25a3, Tmpo, LOC100041769
Upstream geneAnks1b, LOC544719, Apaf1, 1200009F10Rik
Downstream geneLOC100041799, LOC667203
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-111O17.bB6Ng01-111O17.g
ACCDH918128DH918129
length1,050930
definitionDH918128|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-111O17, 5' end.DH918129|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-111O17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,581,566 - 90,582,629)(90,751,643 - 90,752,568)
sequence
gaattcagcactggcagaagaagctaaatacagtgatgtgcgccacaggt
aggtgttttcctaaaagacaatatacagaacagatataaaccgctgtcac
gtggccatctcaatctaactttctatgacaatgtgatttcagagactcta
aaattactcctctccccctttctggtttaagatctaacttcatcagtcta
tcctagtctagccttgttatatgggacaatctggctacaaaaatcacaat
atacccaaatgctaggaaacagatgcacattataccctgcctgacttgtc
tgaactactcttattacacagtccatgaataacactgtgtcagaattaag
tttatattgtctctcaacctcataactaatacaaggtatatactctgaat
atagatgggacacatacagtaatcctatactacataagagaaaccccaga
ctcttctcttacactaacacacacaccacccatacttacttagaaataac
atagtacattgagaagctagaatcttatgaaatacactttgcttttcatc
ctgtctttgctattgctaaatatgccttatgaattgagacatgctgcact
ctttctagggccatttcttcagccataaaacaaggtaagcccaacaaaaa
gcataacatctttctcaaacacttgggacactaaatgtcaaagtaaaatc
acatacctcaccaagtatgttgctatataaggctttgaagacttcataaa
agccgaatttgcagagcccttgcatggaatagccaatcaaagttggggcc
catcctttagccaaaccacgaacgccatcttctttcagtgtaatggagaa
tccattaaatatgcctttgtacttctgagggtccaccttttaaatgggaa
attgtcatataaaagatttagctatgttatttagttgtgtttttttttat
ttgccaagttatttatatgagttttataattagatttagaatatctacac
tttcacaaaacttatctactactgtgcttttttgtttaaattaactacaa

gaattcactctgttgttaccttgtgcctgatagctttcactcccgaaagg
taatgtgagtgacacattttgctctggtaaatgacttggcttatagagcc
catcctggtgacagtcatactatacatctctgctgttagaaactgagctt
tgttaggccttatcaggccatacctgcaatacacaaattatctccaaacc
catttggtgcttggtttccctccccttccttaaagaacgtgccctttaaa
gcgtatgtttagaggtagtctgctcacccgtggctaattttgaggctgtt
tatctacagtaaggatttattcgagtctgtcttggtaaatgtaacgaagc
ccgggtgtgctttcacaggggagtaaggtgacactggggacggcagagaa
ggctctccagctagtttcagaaatgtcatttcagaatcccctaaaatgga
aaaattctggaccgttcgaaaagaagattccaataaacaaacctatcaaa
acaaatcagatagaaaaaccctcgactgctcttgggagcaggagacagca
tagtattgtatgtggattctatctcagagactattaacagcctgccttgc
taatgttccaatccctccaaggtctggacaatagcactgtgcaatggagt
gtatctattgtgagattaatccagtctttctctagtccaaggtctacaca
gatgggaatgggggtggtggtataattgtcccactttagaaaagtttgcc
atgctctaaggtaacacaaaataaaatgctgaaacttaaaactcatcatt
tgcctttgggatcccagcatatttttgtcttttttggtcacaaacccctc
tgaaaatacctcaactatcctttgaggatcattcgctgtcttaccatctg
ctcctgagagagccacagatggaatataag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90581566_90582629
seq2: B6Ng01-111O17.b_48_1097

seq1  GAATTCAGCACTGGCAGAAGAAGCTAAATACAGTGATGTGCGCCACAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCACTGGCAGAAGAAGCTAAATACAGTGATGTGCGCCACAGGT  50

seq1  AGGTGTTTTCCTAAAAGACAATATACAGAACAGATATAAACCGCTGTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTTTCCTAAAAGACAATATACAGAACAGATATAAACCGCTGTCAC  100

seq1  GTGGCCATCTCAATCTAACTTTCTATGACAATGTGATTTCAGAGACTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCATCTCAATCTAACTTTCTATGACAATGTGATTTCAGAGACTCTA  150

seq1  AAATTACTCCTCTCCCCCTTTCTGGTTTAAGATCTAACTTCATCAGTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTACTCCTCTCCCCCTTTCTGGTTTAAGATCTAACTTCATCAGTCTA  200

seq1  TCCTAGTCTAGCCTTGTTATATGGGACAATCTGGCTACAAAAATCACAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGTCTAGCCTTGTTATATGGGACAATCTGGCTACAAAAATCACAAT  250

seq1  ATACCCAAATGCTAGGAAACAGATGCACATTATACCCTGCCTGACTTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCAAATGCTAGGAAACAGATGCACATTATACCCTGCCTGACTTGTC  300

seq1  TGAACTACTCTTATTACACAGTCCATGAATAACACTGTGTCAGAATTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTACTCTTATTACACAGTCCATGAATAACACTGTGTCAGAATTAAG  350

seq1  TTTATATTGTCTCTCAACCTCATAACTAATACAAGGTATATACTCTGAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATTGTCTCTCAACCTCATAACTAATACAAGGTATATACTCTGAAT  400

seq1  ATAGATGGGACACATACAGTAATCCTATACTACATAAGAGAAACCCCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGGGACACATACAGTAATCCTATACTACATAAGAGAAACCCCAGA  450

seq1  CTCTTCTCTTACACTAACACACACACCACCCATACTTACTTAGAAATAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTCTTACACTAACACACACACCACCCATACTTACTTAGAAATAAC  500

seq1  ATAGTACATTGAGAAGCTAGAATCTTATGAAATACACTTTGCTTTTCATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTACATTGAGAAGCTAGAATCTTATGAAATACACTTTGCTTTTCATC  550

seq1  CTGTCTTTGCTATTGCTAAATATGCCTTATGAATTGAGACATGCTGCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTTGCTATTGCTAAATATGCCTTATGAATTGAGACATGCTGCACT  600

seq1  CTTTCTAGGGCCATTTCTTCAGCCATAAAACAAGGTAAGCCCAACAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTAGGGCCATTTCTTCAGCCATAAAACAAGGTAAGCCCAACAAAAA  650

seq1  GCATAACATCTTTCTCAAACACTTGGGACACTAAATGTCAAAGTAAAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAACATCTTTCTCAAACACTTGGGACACTAAATGTCAAAGTAAAATC  700

seq1  ACATACCTCACCAAGTATGTTGCTATATAAGGCTTTGAAGACTTCATAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACCTCACCAAGTATGTTGCTATATAAGGCTTTGAAGACTTCATAAA  750

seq1  AGCCGAATTTGCAGAGCCCTTGCATGGAATAGCCAATCAAAGTTGGGGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGAATTTGCAGAGCCCTTGCATGGAATAGCCAATCAAAGTTGGGGCC  800

seq1  CATCCTTTAGCCAAACCACGAACGCCATCTTCTTTCAGTGTAATGGAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTTTAGCCAAACCACGAACGCCATCTTCTTTCAGTGTAATGGAGAA  850

seq1  TCCATTAAATATGCCTTTGTACTTCTGAGGGTCCACCTTTAAAATGGGAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCCATTAAATATGCCTTTGTACTTCTGAGGGTCCACCTTTTAAATGGGAA  900

seq1  AATGTCAATATAAAAGAATTAGCTATGTTAATTTAGTTGTGTTTTTTTTT  950
      | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTC-ATATAAAAGATTTAGCTATGTT-ATTTAGTTGTGTTTTTTTTT  948

seq1  ATTTGCCAAGTTATTTATAATGAGTTTTATAAATTAAGATTTAAGAATAT  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||
seq2  ATTTGCCAAGTTATTTAT-ATGAGTTTTATAA--TTAGATTT-AGAATAT  994

seq1  CTAACACCTTTCACAAAAACTTTATTCTACTACTGTGCTTTTTTGTTTTA  1050
      || ||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||  
seq2  CT-ACA-CTTTCAC-AAAACTT--ATCTACTACTGTGCTTTTTTGTTT--  1037

seq1  AAATTTAACTACAA  1064
       || ||||||||||
seq2  -AAATTAACTACAA  1050

seq1: chr10_90751643_90752568
seq2: B6Ng01-111O17.g_71_1000 (reverse)

seq1  CTTATATTCCATGCTGTGGCTCTCTCAGGAGCAGATGGTAAGACAGCGAA  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATATTCCAT-CTGTGGCTCTCTCAGGAGCAGATGGTAAGACAGCGAA  49

seq1  TGATACTCAAAGGAT-GTTGAGGTA-TTTCAGAGGGGTTTGTTGACAAAA  98
      |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||
seq2  TGATCCTCAAAGGATAGTTGAGGTATTTTCAGAGGGGTTTGTGACCAAAA  99

seq1  AAGAACAAAATATGCTGGGAT-CCAAAGGCAAATGATGAG-TTTAAG-TT  145
      ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  AAGACAAAAATATGCTGGGATCCCAAAGGCAAATGATGAGTTTTAAGTTT  149

seq1  CAGCATTTTATTTTGTGTTACCTTAGAGCATGGCTAACTTTTCTAAAGTG  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGCATTTTATTTTGTGTTACCTTAGAGCATGGCAAACTTTTCTAAAGTG  199

seq1  GGACAATTATACCACCACCCCCATTCCCATCTGTGTAGACCTTGGACTAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATTATACCACCACCCCCATTCCCATCTGTGTAGACCTTGGACTAG  249

seq1  AGAAAGACTGGATTAATCTCACAATAGATACACTCCATTGCACAGTGCTA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGACTGGATTAATCTCACAATAGATACACTCCATTGCACAGTGCTA  299

seq1  TTGTCCAGACCTTGGAGGGATTGGAACATTAGCAAGGCAGGCTGTTAATA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCAGACCTTGGAGGGATTGGAACATTAGCAAGGCAGGCTGTTAATA  349

seq1  GTCTCTGAGATAGAATCCACATACAATACTATGCTGTCTCCTGCTCCCAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGAGATAGAATCCACATACAATACTATGCTGTCTCCTGCTCCCAA  399

seq1  GAGCAGTCGAGGGTTTTTCTATCTGATTTGTTTTGATAGGTTTGTTTATT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTCGAGGGTTTTTCTATCTGATTTGTTTTGATAGGTTTGTTTATT  449

seq1  GGAATCTTCTTTTCGAACGGTCCAGAATTTTTCCATTTTAGGGGATTCTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCTTCTTTTCGAACGGTCCAGAATTTTTCCATTTTAGGGGATTCTG  499

seq1  AAATGACATTTCTGAAACTAGCTGGAGAGCCTTCTCTGCCGTCCCCAGTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACATTTCTGAAACTAGCTGGAGAGCCTTCTCTGCCGTCCCCAGTG  549

seq1  TCACCTTACTCCCCTGTGAAAGCACACCCGGGCTTCGTTACATTTACCAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTACTCCCCTGTGAAAGCACACCCGGGCTTCGTTACATTTACCAA  599

seq1  GACAGACTCGAATAAATCCTTACTGTAGATAAACAGCCTCAAAATTAGCC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACTCGAATAAATCCTTACTGTAGATAAACAGCCTCAAAATTAGCC  649

seq1  ACGGGTGAGCAGACTACCTCTAAACATACGCTTTAAAGGGCACGTTCTTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGTGAGCAGACTACCTCTAAACATACGCTTTAAAGGGCACGTTCTTT  699

seq1  AAGGAAGGGGAGGGAAACCAAGCACCAAATGGGTTTGGAGATAATTTGTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGGGGAGGGAAACCAAGCACCAAATGGGTTTGGAGATAATTTGTG  749

seq1  TATTGCAGGTATGGCCTGATAAGGCCTAACAAAGCTCAGTTTCTAACAGC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGCAGGTATGGCCTGATAAGGCCTAACAAAGCTCAGTTTCTAACAGC  799

seq1  AGAGATGTATAGTATGACTGTCACCAGGATGGGCTCTATAAGCCAAGTCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGTATAGTATGACTGTCACCAGGATGGGCTCTATAAGCCAAGTCA  849

seq1  TTTACCAGAGCAAAATGTGTCACTCACATTACCTTTCGGGAGTGAAAGCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCAGAGCAAAATGTGTCACTCACATTACCTTTCGGGAGTGAAAGCT  899

seq1  ATCAGGCACAAGGTAACAACAGAGTGAATTC  926
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGCACAAGGTAACAACAGAGTGAATTC  930