BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113B21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 109,541,304 - 109,651,739
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042502
Upstream geneNav3, LOC100042497
Downstream geneLOC100042506, LOC100042510, LOC667855, 9230102K24Rik, LOC100042518, E2f7, Csrp2, Zdhhc17, EG432502, LOC667904, Osbpl8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113B21.bB6Ng01-113B21.g
ACCDH918994DH918995
length1,051839
definitionDH918994|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113B21, 5' end.DH918995|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113B21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,650,694 - 109,651,739)(109,541,304 - 109,542,136)
sequence
gaattcttggaagagttttccacattgctttcttagaaactttaaacaat
ggtctgtacccatgtgtagattcccaggccagttcacaaaagactcttca
gctcatacttaagtttagaaaaagcatagagagttataattttgtgagaa
acttagaaattccagctttgtgcttggggactacaatattccaatttttt
tttctctagcctttgggagaggaagtggaagaaagggaacatttttgttt
ttattgtgtaggaagaagaatggaaaatgggctctaataattaccctttt
ggctgccacactgattggatattttagaggacaacatggtatataagatc
tacaagtaaattagagatcacatagatagttaaacagatagatatagaaa
agatatatatagatatttatgcaaataactaggcagtcaatcaataaata
taagaaaagtaaatagagaggttagacagatagattcaggggcatttaaa
attcaaatttgttaagtgtcagctgaaacctctaatgtcaatgacacttt
tgtgagtttgcattatagaggaacatgaaatctattatcataaatcattg
tagacaaataattgacctcagtcttgccatcacataattcctagaagaga
ttataaaattatgcttgtaattacttgaagcgtttgctatccttcatgat
gagtgaatttcatgggtccagggttccacactatcgaaataaaacatgta
tattctaggtgctgcctagatgatcatatcactgatactttgtacatatc
ttattttcataggctttattatgtattagaaatttaaaacaatatactac
aaagagtggggcatgggcacgcagtccatctatttgcacagctaagctct
tatagtctacaaacaccttgcatgatttaagtttatttttcctaatatgt
agatttgtgctttttgtgcttatttctaagtgaatttctttctattattc
ctgttggtggtgagtttggaagccactcttatcaaggtgaagtaagtgag
g
gaattcaactcttccgcctttcccagtgtgctgttgtctgcttgcagtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaaaactataataattacatcat
aattaaataagaggttagaaaattgataaaacgtggagagaaggaaggat
ggaaattatgtaaatgaaatactcaggtatgaaattctcaaagagataat
ataattgaataaaaagggagtctgcctgtattatgatttcacaaggttca
gactaatcttgttcatccaggtctgtacataagccacgataccccattaa
aggaagaaggcaggtcttgcataagcatccatagaacagacagcatggtg
atgataccatcttttatggatggaatgtgaaaggtctcccaacccccaac
ccgaacaggccatgcctttgaagacttgatacccagaggtggtgctgtct
taggagatcatggagccttaaagaaatgggcttggccggtggaaggtcat
cagctatgagcacctggattgtaaacggaacctgataacagataataaaa
cttaagatcatctcctccactctcttaaagcatcgaagtaagtgtagtgg
ctattcctggttgtcaacttgacaatatttggaatgaactacaatccgga
attggaaggctcaccagtgacccttatctggaggcttggagatccttatc
tggatcttggtttgaagatcttgagcccatagtggctatggattccagaa
gattgaattctccgagttaaggaacacaccttttaatctgggctatgcct
tttcatctgggattaaaagttgttggtggaacacacctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_109650694_109651739
seq2: B6Ng01-113B21.b_49_1099 (reverse)

seq1  CTTCACTTAC-TCACCTTGATA--GGTGGCTTCCAAACTCAC--ACAACA  45
      | |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||   |||||
seq2  CCTCACTTACTTCACCTTGATAAGAGTGGCTTCCAAACTCACCACCAACA  50

seq1  GGAATAATAGAAAGAAATTCCACTTAGAAATAAAGCACAAAAAGCACAAA  95
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGAATAATAGAAAGAAATT-CACTTAGAAAT-AAGCACAAAAAGCACAAA  98

seq1  TCTACATATTAGGAAAATAAAACTAAAATCATGCAAGGTGTTTGTAGACT  145
      |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACATATTAGGAAAAATAAACTTAAATCATGCAAGGTGTTTGTAGACT  148

seq1  ATAAGAGCTTAGCTGTGC-AATAGATGGACTGCGTGCCCATG-CCCACTC  193
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATAAGAGCTTAGCTGTGCAAATAGATGGACTGCGTGCCCATGCCCCACTC  198

seq1  TTTGTAGTATATTGTTTTAAATTTCTAATACATAATAAAGCCTATGAAAA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGTATATTGTTTTAAATTTCTAATACATAATAAAGCCTATGAAAA  248

seq1  TAAGATATGTACAAAGTATCAGTGATATGATCATCTAGGCAGCACCTAGA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATATGTACAAAGTATCAGTGATATGATCATCTAGGCAGCACCTAGA  298

seq1  ATATACATGTTTTATTTCGATAGTGTGGAACCCTGGACCCATGAAATTCA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACATGTTTTATTTCGATAGTGTGGAACCCTGGACCCATGAAATTCA  348

seq1  CTCATCATGAAGGATAGCAAACGCTTCAAGTAATTACAAGCATAATTTTA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCATGAAGGATAGCAAACGCTTCAAGTAATTACAAGCATAATTTTA  398

seq1  TAATCTCTTCTAGGAATTATGTGATGGCAAGACTGAGGTCAATTATTTGT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTCTTCTAGGAATTATGTGATGGCAAGACTGAGGTCAATTATTTGT  448

seq1  CTACAATGATTTATGATAATAGATTTCATGTTCCTCTATAATGCAAACTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAATGATTTATGATAATAGATTTCATGTTCCTCTATAATGCAAACTC  498

seq1  ACAAAAGTGTCATTGACATTAGAGGTTTCAGCTGACACTTAACAAATTTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAGTGTCATTGACATTAGAGGTTTCAGCTGACACTTAACAAATTTG  548

seq1  AATTTTAAATGCCCCTGAATCTATCTGTCTAACCTCTCTATTTACTTTTC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTAAATGCCCCTGAATCTATCTGTCTAACCTCTCTATTTACTTTTC  598

seq1  TTATATTTATTGATTGACTGCCTAGTTATTTGCATAAATATCTATATATA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATTTATTGATTGACTGCCTAGTTATTTGCATAAATATCTATATATA  648

seq1  TCTTTTCTATATCTATCTGTTTAACTATCTATGTGATCTCTAATTTACTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTCTATATCTATCTGTTTAACTATCTATGTGATCTCTAATTTACTT  698

seq1  GTAGATCTTATATACCATGTTGTCCTCTAAAATATCCAATCAGTGTGGCA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATCTTATATACCATGTTGTCCTCTAAAATATCCAATCAGTGTGGCA  748

seq1  GCCAAAAGGGTAATTATTAGAGCCCATTTTCCATTCTTCTTCCTACACAA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAAGGGTAATTATTAGAGCCCATTTTCCATTCTTCTTCCTACACAA  798

seq1  TAAAAACAAAAATGTTCCCTTTCTTCCACTTCCTCTCCCAAAGGCTAGAG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACAAAAATGTTCCCTTTCTTCCACTTCCTCTCCCAAAGGCTAGAG  848

seq1  AAAAAAAAATTGGAATATTGTAGTCCCCAAGCACAAAGCTGGAATTTCTA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAATTGGAATATTGTAGTCCCCAAGCACAAAGCTGGAATTTCTA  898

seq1  AGTTTCTCACAAAATTATAACTCTCTATGCTTTTTCTAAACTTAAGTATG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCTCACAAAATTATAACTCTCTATGCTTTTTCTAAACTTAAGTATG  948

seq1  AGCTGAAGAGTCTTTTGTGAACTGGCCTGGGAATCTACACATGGGTACAG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAGAGTCTTTTGTGAACTGGCCTGGGAATCTACACATGGGTACAG  998

seq1  ACCATTGTTTAAAGTTTCTAAGAAAGCAATGTGGAAAACTCTTCCAAGAA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTGTTTAAAGTTTCTAAGAAAGCAATGTGGAAAACTCTTCCAAGAA  1048

seq1  TTC  1046
      |||
seq2  TTC  1051

seq1: chr10_109541304_109542136
seq2: B6Ng01-113B21.g_67_905

seq1  GAATTCAACTCTTCCGCCTTTCCCAGTGTGCTGTTGTCTGCTTGCAGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTCTTCCGCCTTTCCCAGTGTGCTGTTGTCTGCTTGCAGTGT  50

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAAACTATAATAATTACATCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAAACTATAATAATTACATCAT  100

seq1  AATTAAATAAGAGGTTAGAAAATTGATAAAACGTGGAGAGAAGGAAGGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATAAGAGGTTAGAAAATTGATAAAACGTGGAGAGAAGGAAGGAT  150

seq1  GGAAATTATGTAAATGAAATACTCAGGTATGAAATTCTCAAAGAGATAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTATGTAAATGAAATACTCAGGTATGAAATTCTCAAAGAGATAAT  200

seq1  ATAATTGAATAAAAAGGGAGTCTGCCTGTATTATGATTTCACAAGGTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGAATAAAAAGGGAGTCTGCCTGTATTATGATTTCACAAGGTTCA  250

seq1  GACTAATCTTGTTCATCCAGGTCTGTACATAAGCCACGATACCCCATTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAATCTTGTTCATCCAGGTCTGTACATAAGCCACGATACCCCATTAA  300

seq1  AGGAAGAAGGCAGGTCTTGCATAAGCATCCATAGAACAGACAGCATGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAAGGCAGGTCTTGCATAAGCATCCATAGAACAGACAGCATGGTG  350

seq1  ATGATACCATCTTTTATGGATGGAATGTGAAAGGTCTCCCAACCCCCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATACCATCTTTTATGGATGGAATGTGAAAGGTCTCCCAACCCCCAAC  400

seq1  CCGAACAGGCCATGCCTTTGAAGACTTGATACCCAGAGGTGGTGCTGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAACAGGCCATGCCTTTGAAGACTTGATACCCAGAGGTGGTGCTGTCT  450

seq1  TAGGAGATCATGGAGCCTTAAAGAAATGGGCTTGGCCGGTGGAAGGTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGATCATGGAGCCTTAAAGAAATGGGCTTGGCCGGTGGAAGGTCAT  500

seq1  CAGCTATGAGCACCTGGATTGTAAACGGAACCTGATAACAGATAATAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATGAGCACCTGGATTGTAAACGGAACCTGATAACAGATAATAAAA  550

seq1  CTTAAGATCATCTCCTCCACTCTCTTAAAGCATCGAAGTAAGTGTAGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGATCATCTCCTCCACTCTCTTAAAGCATCGAAGTAAGTGTAGTGG  600

seq1  CTATTCCTGGTTGTCAACTTGACAATATTTGGAATGAACTACAATCCGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCTGGTTGTCAACTTGACAATATTTGGAATGAACTACAATCCGGA  650

seq1  ATTGGAAGGCTCACCAGTGACCCTTATCTGGAGGCTTGGAGATCCTTATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAAGGCTCACCAGTGACCCTTATCTGGAGGCTTGGAGATCCTTATC  700

seq1  TGGATCTTGGTTTGAAGATCTTGAG-CCATAGTGGCTATGGATTCCAGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCTTGGTTTGAAGATCTTGAGCCCATAGTGGCTATGGATTCCAGAA  750

seq1  GATTGAA-TCTCCGAGTTAAGGAACACACC-TTTAATCTGGGCTATGCC-  796
      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| 
seq2  GATTGAATTCTCCGAGTTAAGGAACACACCTTTTAATCTGGGCTATGCCT  800

seq1  TTTCATCTGGGATTAAAGGT--GTGGTGGAACACACCTT  833
      ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||
seq2  TTTCATCTGGGATTAAAAGTTGTTGGTGGAACACACCTT  839