BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113E19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 65,595,891 - 65,747,041
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930407I19Rik
Upstream geneLOC665206, LOC216036, 1700023F02Rik
Downstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113E19.bB6Ng01-113E19.g
ACCDH919130DH919131
length1,148692
definitionDH919130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113E19, 5' end.DH919131|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113E19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,745,892 - 65,747,041)(65,595,891 - 65,596,580)
sequence
gaattctctcacattttaaatgcacatctccctctataaatatggctctg
ttttaaaacacctgatctgtacccataagaaaaaaacaagttaactacta
tgctatataatgctgtataatgccttctcaaagatggtggggctttgaaa
ctgattcctagttcagtatgtatgatataaaatattgtcatttaaaaaca
gaaacattgcagtgaagtataaagataggtagtagtaaacacagcagaca
gcaagtttcttcattttgaaattatatatgaacatgtttagcagactttc
ctgagacatctggtagagatatgactattgcaatcagcacttccccattt
gcatacttgaaaaacttccaaaagtttacaaatgagaagtgaagatcaag
attggtttcagtaaaatgacaacaaatcatgccaaactctggacattaaa
acatgtaaaacatttaaagtaccatagagggtgtaagaaagacagttcag
ctattatgaaagatcatttgttgcataatcatgaggttcagagttcagat
ccaagcattcatctgaaagaaaaagttgggtatggtcctgtacatgacag
cctttggaagaatggagacaggaaaactgaaggggcttcctggatgctct
cctacaggaagaacccaggctccatgttcagtaaaagattttgcctttaa
ggaacaagtcagaggatggccaaagatgtcaccttatacttgtgtctgtt
gtccttccacaagagtaggtatctatacattcaaacacatacacatttgc
atatatgcatatactctacatccatctacataaatccatgcagaaaagag
tagaagagacatatagggtgacacaagaaaagctctatcagagacactca
gttcagtggctctcagagtgctctgcagaacactctacagtgagtggcac
ctgatttcacatagattacacacaacttaccatttcacatttgtgattgt
gggaagaaacatggctgcagacaccaaagaaggcttctatatacagttta
gttccaagaaaaggtgtctccagcctaaggcttggcccaatgggcaacac
ttggctatcgaagtatctggagaagaatgaccgagtattgacttacac
gaattctgaactttatacatcatgtctgagggccctgactttgatataag
ctaaccttgatatttttttctctgtcagtcagctattccaatcctctcca
cagctacttaggattctcagaggaccttaaatattatatttctagaataa
ttttcaattgattcagatacatatttatatcactgtcctttcttcaatac
agtctcttctatctccctctaagccccagcctagcatccttctgagtaac
atgattaagttctatgtggtggtgcaaaggcagagcaagttagtaagtta
ggggagcttttaagagccaaagattgacatttgaagagaaagatgctatt
catagaagagaaagttaaagtttcagtttaatgttaaaacccatagaata
aaaatcagagggaaaaaatgtcagtgtgaagagttcgatttactgagctc
agcttcaagatgtattgacatttgatgatctaaaattacttacttaagcc
tctgataggatgatgagctactactgctctgacagaggaaaatcctgtgg
tatcggggttgtccatctggaggtgggtctgggtgttttgctccaaattt
ttattgtaactcccacatatgggatatgagatatgagatcaccaaggggc
atggagattgaatacaacggaaattttaatgacctcagctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_65745892_65747041
seq2: B6Ng01-113E19.b_47_1194 (reverse)

seq1  GTGTAAGTCAATAATCAGTCAT--CTCTCCAGGAAACTTCTGATAGCCAA  48
      ||||||||||||| || |||||   |||||| || ||||| |||||||||
seq2  GTGTAAGTCAATACTCGGTCATTCTTCTCCA-GATACTTC-GATAGCCAA  48

seq1  GGGTGTGCCCATTTGGGCAAGACCTTAAGCTGGAGACAACATTTCTTGGA  98
      | || |||||||| || |||| ||||| |||||||||| | |||||||||
seq2  GTGT-TGCCCATTGGGCCAAG-CCTTAGGCTGGAGACACCTTTTCTTGGA  96

seq1  ACTAAACTGTATATAGGAAGCCTTCTCTGGTGTCTGCAG-CATGTTTCCT  147
      ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||
seq2  ACTAAACTGTATATA-GAAGCCTTCTTTGGTGTCTGCAGCCATGTTT-CT  144

seq1  TCCCACAATCACAAATGTGGAATTGTAAGTTGTGTGT-ATCTATGTGAAA  196
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCCCACAATCACAAATGTGAAATGGTAAGTTGTGTGTAATCTATGTGAAA  194

seq1  TCAGGTGCCACTCACTGTAGAGTGTTCTGCAGAGCACTCTGAGAGCCACT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTGCCACTCACTGTAGAGTGTTCTGCAGAGCACTCTGAGAGCCACT  244

seq1  GAACTGAGTGTCTCTGATAGAGCTTTTCTTGTGTCACCCTATATGTCTCT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAGTGTCTCTGATAGAGCTTTTCTTGTGTCACCCTATATGTCTCT  294

seq1  TCTACTCTTTTCTGCATGGATTTATGTAGATGGATGTAGAGTATATGCAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTCTTTTCTGCATGGATTTATGTAGATGGATGTAGAGTATATGCAT  344

seq1  ATATGCAAATGTGTATGTGTTTGAATGTATAGATACCTACTCTTGTGGAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCAAATGTGTATGTGTTTGAATGTATAGATACCTACTCTTGTGGAA  394

seq1  GGACAACAGACACAAGTATAAGGTGACATCTTTGGCCATCCTCTGACTTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAACAGACACAAGTATAAGGTGACATCTTTGGCCATCCTCTGACTTG  444

seq1  TTCCTTAAAGGCAAAATCTTTTACTGAACATGGAGCCTGGGTTCTTCCTG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTAAAGGCAAAATCTTTTACTGAACATGGAGCCTGGGTTCTTCCTG  494

seq1  TAGGAGAGCATCCAGGAAGCCCCTTCAGTTTTCCTGTCTCCATTCTTCCA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGAGCATCCAGGAAGCCCCTTCAGTTTTCCTGTCTCCATTCTTCCA  544

seq1  AAGGCTGTCATGTACAGGACCATACCCAACTTTTTCTTTCAGATGAATGC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTGTCATGTACAGGACCATACCCAACTTTTTCTTTCAGATGAATGC  594

seq1  TTGGATCTGAACTCTGAACCTCATGATTATGCAACAAATGATCTTTCATA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATCTGAACTCTGAACCTCATGATTATGCAACAAATGATCTTTCATA  644

seq1  ATAGCTGAACTGTCTTTCTTACACCCTCTATGGTACTTTAAATGTTTTAC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTGAACTGTCTTTCTTACACCCTCTATGGTACTTTAAATGTTTTAC  694

seq1  ATGTTTTAATGTCCAGAGTTTGGCATGATTTGTTGTCATTTTACTGAAAC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTAATGTCCAGAGTTTGGCATGATTTGTTGTCATTTTACTGAAAC  744

seq1  CAATCTTGATCTTCACTTCTCATTTGTAAACTTTTGGAAGTTTTTCAAGT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTGATCTTCACTTCTCATTTGTAAACTTTTGGAAGTTTTTCAAGT  794

seq1  ATGCAAATGGGGAAGTGCTGATTGCAATAGTCATATCTCTACCAGATGTC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATGGGGAAGTGCTGATTGCAATAGTCATATCTCTACCAGATGTC  844

seq1  TCAGGAAAGTCTGCTAAACATGTTCATATATAATTTCAAAATGAAGAAAC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAAAGTCTGCTAAACATGTTCATATATAATTTCAAAATGAAGAAAC  894

seq1  TTGCTGTCTGCTGTGTTTACTACTACCTATCTTTATACTTCACTGCAATG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTCTGCTGTGTTTACTACTACCTATCTTTATACTTCACTGCAATG  944

seq1  TTTCTGTTTTTAAATGACAATATTTTATATCATACATACTGAACTAGGAA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTTTTAAATGACAATATTTTATATCATACATACTGAACTAGGAA  994

seq1  TCAGTTTCAAAGCCCCACCATCTTTGAGAAGGCATTATACAGCATTATAT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTCAAAGCCCCACCATCTTTGAGAAGGCATTATACAGCATTATAT  1044

seq1  AGCATAGTAGTTAACTTGTTTTTTTCTTATGGGTACAGATCAGGTGTTTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGTAGTTAACTTGTTTTTTTCTTATGGGTACAGATCAGGTGTTTT  1094

seq1  AAAACAGAGCCATATTTATAGAGGGAGATGTGCATTTAAAATGTGAGAGA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGAGCCATATTTATAGAGGGAGATGTGCATTTAAAATGTGAGAGA  1144

seq1  ATTC  1150
      ||||
seq2  ATTC  1148

seq1: chr10_65595891_65596580
seq2: B6Ng01-113E19.g_72_763

seq1  GAATTCTGAACTTTATACATCATGTCTGAGGGCCCTGACTTTGATATAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAACTTTATACATCATGTCTGAGGGCCCTGACTTTGATATAAG  50

seq1  CTAACCTTGATATTTTTTTCTCTGTCAGTCAGCTATTCCAATCCTCTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCTTGATATTTTTTTCTCTGTCAGTCAGCTATTCCAATCCTCTCCA  100

seq1  CAGCTACTTAGGATTCTCAGAGGACCTTAAATATTATATTTCTAGAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTACTTAGGATTCTCAGAGGACCTTAAATATTATATTTCTAGAATAA  150

seq1  TTTTCAATTGATTCAGATACATATTTATATCACTGTCCTTTCTTCAATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAATTGATTCAGATACATATTTATATCACTGTCCTTTCTTCAATAC  200

seq1  AGTCTCTTCTATCTCCCTCTAAGCCCCAGCCTAGCATCCTTCTGAGTAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTTCTATCTCCCTCTAAGCCCCAGCCTAGCATCCTTCTGAGTAAC  250

seq1  ATGATTAAGTTCTATGTGGTGGTGCAAAGGCAGAGCAAGTTAGTAAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTAAGTTCTATGTGGTGGTGCAAAGGCAGAGCAAGTTAGTAAGTTA  300

seq1  GGGGAGCTTTTAAGAGCCAAAGATTGACATTTGAAGAGAAAGATGCTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGCTTTTAAGAGCCAAAGATTGACATTTGAAGAGAAAGATGCTATT  350

seq1  CATAGAAGAGAAAGTTAAAGTTTCAGTTTAATGTTAAAACCCATAGAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAAGAGAAAGTTAAAGTTTCAGTTTAATGTTAAAACCCATAGAATA  400

seq1  AAAATCAGAGGGAAAAAATGTCAGTGTGAAGAGTTCGATTTACTGAGCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCAGAGGGAAAAAATGTCAGTGTGAAGAGTTCGATTTACTGAGCTC  450

seq1  AGCTTCAAGATGTATTGACATTTGATGATCTAAAATTACTTACTTAAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCAAGATGTATTGACATTTGATGATCTAAAATTACTTACTTAAGCC  500

seq1  TCTGATAGGATGATGAGCTACTACTGCTCTGACAGAGGAAAATCCTGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATAGGATGATGAGCTACTACTGCTCTGACAGAGGAAAATCCTGTGG  550

seq1  TATCGGGGTTGTCCATCTGGAGGTGGGTCTGGGTGTTTTGCTCCAAA-TT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TATCGGGGTTGTCCATCTGGAGGTGGGTCTGGGTGTTTTGCTCCAAATTT  600

seq1  TTATTGTAACTCCCACATATGGGATATGAGATATGAGATCACCAAGGGGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTAACTCCCACATATGGGATATGAGATATGAGATCACCAAGGGGC  650

seq1  ATGGAGATTGAATACAACGGAAA-TTTAATGACCTCAGCTCT  690
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGATTGAATACAACGGAAATTTTAATGACCTCAGCTCT  692