BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113O01
Chromosome10 (Build37)
Map Location 93,154,299 - 93,334,128
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNtn4, LOC100041907, Usp44, Metap2
Upstream geneNedd1, Gm872, 4930485B16Rik, EG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, LOC667338
Downstream geneVezt, Fgd6, Nr2c1, Ndufa12, EG215472, LOC100041955, Tmcc3, EG667315, 4921537D05Rik, Plxnc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113O01.bB6Ng01-113O01.g
ACCDH919554DH919555
length1,060731
definitionDH919554|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113O01, 5' end.DH919555|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113O01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,333,064 - 93,334,128)(93,154,299 - 93,155,030)
sequence
gaattccagccagctatttagtggaccctatctttttaaggagtcagggg
aggtggtcattttagtcctgactagcttcttagttaaaattggctcttac
tagtcttttgttagtaacattctttatcttaggtagagattctgtgtctc
ctcagtcaagttcttgtaaaagtagagaactatgcagcttgcatacattt
gcacatcagcatgtccttttgtgtacagttttatttgggtgtacttgtat
acagtagtgactaattttctctctggaaattgtttatttactacaggtaa
tccatattcctttaaactattttatttagtacactgtcactgtcctcaga
aacaccagattgactgcatcagatccattacagatggttgtgagccacca
tgtggttgctaggaaattaaactcaggacctctagaagagcagtcagtgc
tcttaaccactgagccatttctccatctcagaaaggaattcttacatttc
tatacacaaatatagtgagggaactagtaaacttattcttcttaaccttg
tgaaatgattagcagagaagagaattctcttacttaaataatttttaaaa
tacacactatgagcctggagagatgggtcagtggttgagagaacactggc
tgctcttcaagctgtcctgggtggaattcccagcacccacgtggcagtgc
agtggcagctcacagttgtttgtaactccatggagggcatctgctgcttt
tttctggcctctttcagcaccaggcatgcaggtggtacgtacatagacat
acatgcaggcagagcacccaggtatataacattaaaacgtatatatgtgt
gtgcacatatgcacatgacgtgcagcttgtagcagcaacttaatttggtg
taagttgaaacttataaaatggctggtactgaagttcagagtagtgttct
cttgagtttgggatggcaggagattatttccgtgtctcttatgagctccg
cattccgagaagtactcatatcatccagaaagtaccagttttaaagtatg
gaaactgaaa
gaattccttgtggggtttcttgcaagagttctcatagaatacttaaagtg
tttacttataggcctttagttatttcacagtgaggtaaggtaagaggata
aaagtgcccgaaagctcgaacgctgacgtcatagctgctgcctctaaggg
tgaactataaagcccgtggagacgtgaggtggacagagtctccgaaatgc
tccttcgccttttcatgagcacgatttgaagaaagtggagcgtgtatatt
gggggtaaaaaatcggagctggagagatataaaacaagtctctaacagtt
taaacttctaagactagagaaggaacaaggcaactctgtcatttcctttc
tttaaagtatcccctaataggtaaagcatatctcattttggaaattttct
catgaacccttccagcatggcattctgcagtccatattgtagatagctaa
gaacctggaattgtgcccatgcctgcaaggcctggtctcccactctatta
acttcatccagaagataagctgcaatgtaagttcttactcccactttcaa
agagaatttttattgaccagacacataaactaaacaaagatacatacacg
tgtacacccatacacactcacacatgtgagcacacacacacaacacatgt
atagtgacacatacacatgcacacaaatactcatacatatatgagcatac
attcatacgtgtgcacacactgatcacacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_93333064_93334128
seq2: B6Ng01-113O01.b_48_1107 (reverse)

seq1  TTTCAGTTT-CATACCTTAAAAACCTGGTTACTTTCTGGGAATGATATGA  49
      ||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||||||||
seq2  TTTCAGTTTCCATACTTTAAAA--CTGG-TACTTTCTGG--ATGATATGA  45

seq1  GTACTT-TCTGAATGCGGAGCTCATAAGAGACACGGAAATAAATCT-CTG  97
      |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  GTACTTCTCGGAATGCGGAGCTCATAAGAGACACGGAAAT-AATCTCCTG  94

seq1  CCATCCCAAACTCAAGAGAACACTACTCTGAACTTCAGTTACCAGCCATT  147
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCATCCCAAACTCAAGAGAACACTACTCTGAACTTCAG-TACCAGCCATT  143

seq1  TTATAAGTTTCAACTTACACCAAATTTAAGTTGCTGCTACAAGCTGCACG  197
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGTTTCAACTTACACCAAA-TTAAGTTGCTGCTACAAGCTGCACG  192

seq1  TCATGTGCATATGTGCACACACATATATACGTTTTAATGTTATATACCTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGCATATGTGCACACACATATATACGTTTTAATGTTATATACCTG  242

seq1  GGTGCTCTGCCTGCATGTATGTCTATGTACGTACCACCTGCATGCCTGGT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTCTGCCTGCATGTATGTCTATGTACGTACCACCTGCATGCCTGGT  292

seq1  GCTGAAAGAGGCCAGAAAAAAGCAGCAGATGCCCTCCATGGAGTTACAAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAAGAGGCCAGAAAAAAGCAGCAGATGCCCTCCATGGAGTTACAAA  342

seq1  CAACTGTGAGCTGCCACTGCACTGCCACGTGGGTGCTGGGAATTCCACCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGTGAGCTGCCACTGCACTGCCACGTGGGTGCTGGGAATTCCACCC  392

seq1  AGGACAGCTTGAAGAGCAGCCAGTGTTCTCTCAACCACTGACCCATCTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGCTTGAAGAGCAGCCAGTGTTCTCTCAACCACTGACCCATCTCT  442

seq1  CCAGGCTCATAGTGTGTATTTTAAAAATTATTTAAGTAAGAGAATTCTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTCATAGTGTGTATTTTAAAAATTATTTAAGTAAGAGAATTCTCT  492

seq1  TCTCTGCTAATCATTTCACAAGGTTAAGAAGAATAAGTTTACTAGTTCCC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCTAATCATTTCACAAGGTTAAGAAGAATAAGTTTACTAGTTCCC  542

seq1  TCACTATATTTGTGTATAGAAATGTAAGAATTCCTTTCTGAGATGGAGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTATATTTGTGTATAGAAATGTAAGAATTCCTTTCTGAGATGGAGAA  592

seq1  ATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAGTTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAGTTT  642

seq1  AATTTCCTAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGATCTGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCTAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGATCTGA  692

seq1  TGCAGTCAATCTGGTGTTTCTGAGGACAGTGACAGTGTACTAAATAAAAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTCAATCTGGTGTTTCTGAGGACAGTGACAGTGTACTAAATAAAAT  742

seq1  AGTTTAAAGGAATATGGATTACCTGTAGTAAATAAACAATTTCCAGAGAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAAAGGAATATGGATTACCTGTAGTAAATAAACAATTTCCAGAGAG  792

seq1  AAAATTAGTCACTACTGTATACAAGTACACCCAAATAAAACTGTACACAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTAGTCACTACTGTATACAAGTACACCCAAATAAAACTGTACACAA  842

seq1  AAGGACATGCTGATGTGCAAATGTATGCAAGCTGCATAGTTCTCTACTTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACATGCTGATGTGCAAATGTATGCAAGCTGCATAGTTCTCTACTTT  892

seq1  TACAAGAACTTGACTGAGGAGACACAGAATCTCTACCTAAGATAAAGAAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAACTTGACTGAGGAGACACAGAATCTCTACCTAAGATAAAGAAT  942

seq1  GTTACTAACAAAAGACTAGTAAGAGCCAATTTTAACTAAGAAGCTAGTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTAACAAAAGACTAGTAAGAGCCAATTTTAACTAAGAAGCTAGTCA  992

seq1  GGACTAAAATGACCACCTCCCCTGACTCCTTAAAAAGATAGGGTCCACTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAAAATGACCACCTCCCCTGACTCCTTAAAAAGATAGGGTCCACTA  1042

seq1  AATAGCTGGCTGGAATTC  1065
      ||||||||||||||||||
seq2  AATAGCTGGCTGGAATTC  1060

seq1: chr10_93154299_93155030
seq2: B6Ng01-113O01.g_70_800

seq1  GAATTCCTTGTGGGGTTTCTTGCAAGAGTTCTCATAGAATACTTAAAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGTGGGGTTTCTTGCAAGAGTTCTCATAGAATACTTAAAGTG  50

seq1  TTTACTTATAGGCCTTTAGTTATTTCACAGTGAGGTAAGGTAAGAGGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTATAGGCCTTTAGTTATTTCACAGTGAGGTAAGGTAAGAGGATA  100

seq1  AAAGTGCCCGAAAGCTCGAACGCTGACGTCATAGCTGCTGCCTCTAAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGCCCGAAAGCTCGAACGCTGACGTCATAGCTGCTGCCTCTAAGGG  150

seq1  TGAACTATAAAGCCCGTGGAGACGTGAGGTGGACAGAGTCTCCGAAATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTATAAAGCCCGTGGAGACGTGAGGTGGACAGAGTCTCCGAAATGC  200

seq1  TCCTTCGCCTTTTCATGAGCACGATTTGAAGAAAGTGGAGCGTGTATATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCGCCTTTTCATGAGCACGATTTGAAGAAAGTGGAGCGTGTATATT  250

seq1  GGGGGTAAAAAATCGGAGCTGGAGAGATATAAAACAAGTCTCTAACAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTAAAAAATCGGAGCTGGAGAGATATAAAACAAGTCTCTAACAGTT  300

seq1  TAAACTTCTAAGACTAGAGAAGGAACAAGGCAACTCTGTCATTTCCTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTTCTAAGACTAGAGAAGGAACAAGGCAACTCTGTCATTTCCTTTC  350

seq1  TTTAAAGTATCCCCTAATAGGTAAAGCATATCTCATTTTGGAAATTTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGTATCCCCTAATAGGTAAAGCATATCTCATTTTGGAAATTTTCT  400

seq1  CATGAACCCTTCCAGCATGGCATTCTGCAGTCCATATTGTAGATAGCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACCCTTCCAGCATGGCATTCTGCAGTCCATATTGTAGATAGCTAA  450

seq1  GAACCTGGAATTGTGCCCATGCCTGCAAGGCCTGGTCTCCCACTCTATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGGAATTGTGCCCATGCCTGCAAGGCCTGGTCTCCCACTCTATTA  500

seq1  ACTTCATCCAGAAGATAAGCTGCAATGTAAGTTCTTACTCCCACTTTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCATCCAGAAGATAAGCTGCAATGTAAGTTCTTACTCCCACTTTCAA  550

seq1  AGAGAATTTTTATTGACCAGACACATAAACTAAACAAAGATACATACACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATTTTTATTGACCAGACACATAAACTAAACAAAGATACATACACG  600

seq1  TGTACACCCATACACACTCACACATGTGAGCACACACACACAACACATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACACCCATACACACTCACACATGTGAGCACACACACACAACACATGT  650

seq1  ATAGTGACACATACACATGCACACAAATACTCATACATATATGAGCATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGACACATACACATGCACACAAATACTCATACATATATGAGCATAC  700

seq1  ATTCATACATGTGCACACACATGATCACACAC  732
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2  ATTCATACGTGTGCACACAC-TGATCACACAC  731