BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-117E11
Chromosome10 (Build37)
Map Location 71,151,953 - 71,272,950
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG216082, LOC622812, EG327767
Upstream geneBicc1, LOC622551, C730027H18Rik, Tfam, Ube2d1, LOC665472, Zcd1, Ipmk, LOC100039860, LOC216081
Downstream gene1700049L16Rik, LOC100040505, Zwint
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-117E11.bB6Ng01-117E11.g
ACCDH922058DH922059
length525506
definitionDH922058|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-117E11, 5' end.DH922059|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-117E11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,272,426 - 71,272,950)(71,151,953 - 71,152,464)
sequence
gaattctgtctgtatatcccataagttacagccacaaaacttactactgc
ccatatcaattgacttttttatacttaagtctcaagctccaaaatccaga
tggctaaaaaatacattttcatattttaatcaaattttaattaataagct
gtaacatattttgtcaaccaggggtcagtcagcttgtccttctacttacc
taaaataaaaaaatcatatatacatatatatgtatgtatgtatgtgtgtg
catatatatatatatatatatatatatatatatatatatgaaaacacatg
cacacgaacatatattatgaaatatattaatataatttatatgaatataa
tatatttatcatgtttatcatgtcctatataatatataaatatattttcc
atgataaatatattatatttattacatatagtatattatataaatataat
atagagagggacttatatggaatatgttatatgtacatataattataata
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ggatgaacaaagctgtcttcttctcagatatttgacaaagaaacccagag
aggatttttttttgaatgttcagagatgataaaagtaaaatttcctaaaa
gtatgtggattaaaatgcatcacaattttcatgaataattgatttaactt
tgaaagaacaatagatcctcaatttcctccatgttttgaagaaaaacagg
tggaaacgagtcaagggtagaattactgttatccatgggaaatatcttac
agctgggatttcatatctgtctcaacctcacccaagctaactatagacca
tgtaaaatttaaaggatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_71272426_71272950
seq2: B6Ng01-117E11.b_44_568 (reverse)

seq1  ATGTATTATTATATATTTTACAATATATTATAATTATATGTACATATAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATTATTATATATTTTACAATATATTATAATTATATGTACATATAAC  50

seq1  ATATTCCATATAAGTTTATATTTATATTATATTTATATAATATACTATAT  100
      |||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCATATAAGTCCCTCTCTATATTATATTTATATAATATACTATAT  100

seq1  GTAATAAATATAATATATTTATCATGGAAAATATATTTATATATTATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAATATAATATATTTATCATGGAAAATATATTTATATATTATATA  150

seq1  GGACATGATAAACATGATAAATATATTATATTCATATAAATTATATTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATGATAAACATGATAAATATATTATATTCATATAAATTATATTAAT  200

seq1  ATATTTCATATACATA-GTTCCTGAGCATTTCTTTTCATATATATATATA  249
      |||||||||| | ||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCATA-ATATATGTTCGTGTGCATGTGTTTTCATATATATATATA  249

seq1  TATATATATATATATATATATATATGCACACACATACATACATACATATA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATGCACACACATACATACATACATATA  299

seq1  TATGTATATATGATTTTTTTATTTTAGGTAAGTAGAAGGACAAGCTGACT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATATGATTTTTTTATTTTAGGTAAGTAGAAGGACAAGCTGACT  349

seq1  GACCCCTGGTTGACAAAATATGTTACAGCTTATTAATTAAAATTTGATTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCTGGTTGACAAAATATGTTACAGCTTATTAATTAAAATTTGATTA  399

seq1  AAATATGAAAATGTATTTTTTAGCCATCTGGATTTTGGAGCTTGAGACTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGAAAATGTATTTTTTAGCCATCTGGATTTTGGAGCTTGAGACTT  449

seq1  AAGTATAAAAAAGTCAATTGATATGGGCAGTAGTAAGTTTTGTGGCTGTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATAAAAAAGTCAATTGATATGGGCAGTAGTAAGTTTTGTGGCTGTA  499

seq1  ACTTATGGGATATACAGACAGAATTC  525
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATGGGATATACAGACAGAATTC  525

seq1: chr10_71151953_71152464
seq2: B6Ng01-117E11.g_67_578

seq1  GAATTCCTTGATGGCTCAGCTGATATTTAATTTAACAACCTAATTGAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGATGGCTCAGCTGATATTTAATTTAACAACCTAATTGAGTG  50

seq1  ATAATTCAGGCTTGTATTTTAGGAAGACAATTTACCATCCAAATCATTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTCAGGCTTGTATTTTAGGAAGACAATTTACCATCCAAATCATTAA  100

seq1  GGCAAAAGAAATGAAAGGTGGCATCTGACTCTGGGATGTGAACAGCATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAAGAAATGAAAGGTGGCATCTGACTCTGGGATGTGAACAGCATGG  150

seq1  GTGATGGGATGAACAAAGCTGTCTTCTTCTCAGATATTTGACAAAGAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGGGATGAACAAAGCTGTCTTCTTCTCAGATATTTGACAAAGAAAC  200

seq1  CCAGAGAGGATTTTTTTTTGAATGTTCAGAGATGATAAAAGTAAAATTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAGGATTTTTTTTTGAATGTTCAGAGATGATAAAAGTAAAATTTC  250

seq1  CTAAAAGTATGTGGATTAAAATGCATCACAATTTTCATGAATAATTGATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGTATGTGGATTAAAATGCATCACAATTTTCATGAATAATTGATT  300

seq1  TAACTTTGAAAGAACAATAGATCCTCAATTTCCTCCATGTTTTGAAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTGAAAGAACAATAGATCCTCAATTTCCTCCATGTTTTGAAGAAA  350

seq1  AACAGGTGGAAACGAGTCAAGGGTAGAATTACTGTTATCCATGGGAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTGGAAACGAGTCAAGGGTAGAATTACTGTTATCCATGGGAAATA  400

seq1  TCTTACAGCTGGGATTTCATATCTGTCTCAACCTCACCCAAGCTAACTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACAGCTGGGATTTCATATCTGTCTCAACCTCACCCAAGCTAACTAT  450

seq1  AGACCATGTAAAATTTAAAGGATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCATGTAAAATTTAAAGGATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATG  500

seq1  TATGTATGTATG  512
      ||||||||||||
seq2  TATGTATGTATG  512