BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119B10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 31,460,583 - 31,556,222
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcba1
Upstream geneNcoa7, LOC382354, Hey2, LOC654431, EG432448, Hddc2, Tpd52l1, LOC100041294, Ibrdc1, LOC666055, LOC667752, LOC100040638
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119B10.bB6Ng01-119B10.g
ACCDH923393DH923394
length1,1311,157
definitionDH923393|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119B10, 5' end.DH923394|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,555,076 - 31,556,222)(31,460,583 - 31,461,760)
sequence
gaattcaccactattacagtatttggcaagaactggatagcttctcatct
aaataaagcctaatgtgcagacgtcatttagcaccctctcaccagtgtaa
gcccccaatatgattactctgtaatctgaagtattactttttaatgtttc
ctacacaatgaaacaaaaacatctctcaatccagaactaagattatctaa
ataattccatgtggttttctactctgaaacttttcttctgaattttattg
actttgctacaataactatgtaagaatccaccatggctggaaagatagaa
aaaatacccattataacaattgtactaaaattccaccaaaactatacaca
ttgttaaataatccaaaccaacctcatgaatttacagaggaacaaacaga
tctggacactcatattaagctgttgaagatcacagacagttgcagatgta
cccacaaagtcatcttgtttttaccaaagttgcaatatttttggaattct
gtctatctttcaggtgagactggcaggattctgatccaaactacaagatc
tttgtttatgttctttgatgttatcactggtcttatgcgtaagaagaagc
aaacaccacactccatggtttgtaactgaggaacacattttgttaaggga
tggcttgaatacatggaaatatgaaagagaactcgtgatcctcagaaatg
caatgcaaatatgaaaaagcagaccaatctagcaaacctaattataactt
caggcctttgatgagtgtcttagggttgctattgctgtaatgacaaaaac
caacttcactcaatcactgagagaagtcagggcagaaacttaaagcatgt
acctggaggcaaaaactgaagcagaagacacataggaatacttcttaata
gcttcagctcaagcttgctcagccttctctctaatacagccaggaccacc
tgcatgggtggcacagcctacagtgagctagccctatcacagtactcaat
catcaagaaagtgcccacagacatgtccataggcaagttgatcagcactt
ttcagcagatcttttcacagaaaactatacttctgtcaaatacaacacat
cagccagtcactgaaagagagcaagatatga
gaattcaggacagggctttattcatttgcatttagttggtgggcatttgt
atgtgtctaacttcaaatttaagtagctagaattcattttccaatattga
tttcagactaagtcccttaggttatgacagtccacaacttttccctaggt
gattttcatattgaataacatctggaaaaggcattgtgtctctattaggt
aaggtggtaaccatagtcattttttatagtagccatggggattccaggaa
cttcctgtggatttaaaacttacaatttcctaggtatcctagaaaaaaaa
tgacacagagtttatatataatctacacacaccctgcactagacacagtc
atctttggattactgcattggattgtattatccaatgcagtgtaaatgtt
ctgttcaataaacagttgctatcatctatctatctatctatctatctatc
tatctatctatctatctatctatctactctttgtaacttttgacaaggac
aacacatctggccatagtttgtacaaatgtactcttccctctccccaaat
attttctatctgccattttgagtctacaagtaaaggaatccatagatatg
gataaagtatttagaaaaaggtactttaaaatggatgcatgtactttgtt
ctaatgaaattactttaagaaagaaactaatgaaaatggagaagtcatgt
attgaaggactttttttttccctcttaaagactgtagatattttctataa
agatcttttaatagcatgtaacactcgaaggtaaatttttagtattgtca
ctgaagtgacaaagtgtcaatgctatgcatcaggggtggggtctaagcaa
gagaaaagtgctcatgcatatggtaaaaaggatgaagaccagtgatccca
gacactttaattttcttttatagaagattgtaaacaagaacaatatgggg
tgttaactggttggaggagacatggggcataaagctatgtcagagacagg
ggagctgggctgtaaagagcatagtgagatgcccactctaaggtattgca
gagactacatttagttctaagaaaagaatgttcctcttagacgacaccca
caggtgttttctagggccactggctcaatggtgagaacagtcatgctgct
ttaagtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_31555076_31556222
seq2: B6Ng01-119B10.b_49_1179 (reverse)

seq1  TCATATCCTTTGCTCTCTTTCAGTGACCTGGCTGATGTGTTGTTAATTTG  50
      |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||
seq2  TCATATC--TTGCTCTCTTTCAGTGA-CTGGCTGATGTGTTGT--ATTTG  45

seq1  ACAGAAGTTATAGTTTTCTGTGAAAAAGATCTTGGTTGAAAAAGTGCCTT  100
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||  |
seq2  ACAGAAG-TATAGTTTTCTGTG-AAAAGATCT--GCTG-AAAAGTGC--T  88

seq1  GATCAACTTGCCTATGGACATGTTCTGTGGGGCACTTTCTTGATGATTGA  150
      |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GATCAACTTGCCTATGGACATG-TCTGT-GGGCACTTTCTTGATGATTGA  136

seq1  GTACTGTGATAGGGGCTAGCTCACTGTAGGCTGTGCCACCCATGCAGGTG  200
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGTGATA-GGGCTAGCTCACTGTAGGCTGTGCCACCCATGCAGGTG  185

seq1  GTCCTGGCTTGTATTAGAGAGAAGGCTGAGCAAGCTTGAGCTGAAGCTAT  250
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGGC-TGTATTAGAGAGAAGGCTGAGCAAGCTTGAGCTGAAGCTAT  234

seq1  TAAGAAGTATTCCTATGTGTCTTCTGCTTCAGTTTTTGCCTCCAGGTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TAAGAAGTATTCCTATGTGTCTTCTGCTTCAGTTTTTGCCTCCAGGTACA  284

seq1  TGCTTTAAGTTTCTGCCCTGACTTCTCTCAGTGATTGAGTGAAGTTGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTAAGTTTCTGCCCTGACTTCTCTCAGTGATTGAGTGAAGTTGGTT  334

seq1  TTTGTCATTACAGCAATAGCAACCCTAAGACACTCATCAAAGGCCTGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCATTACAGCAATAGCAACCCTAAGACACTCATCAAAGGCCTGAAG  384

seq1  TTATAATTAGGTTTGCTAGATTGGTCTGCTTTTTCATATTTGCATTGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATTAGGTTTGCTAGATTGGTCTGCTTTTTCATATTTGCATTGCAT  434

seq1  TTCTGAGGATCACGAGTTCTCTTTCATATTTCCATGTATTCAAGCCATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGGATCACGAGTTCTCTTTCATATTTCCATGTATTCAAGCCATCC  484

seq1  CTTAACAAAATGTGTTCCTCAGTTACAAACCATGGAGTGTGGTGTTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACAAAATGTGTTCCTCAGTTACAAACCATGGAGTGTGGTGTTTGCT  534

seq1  TCTTCTTACGCATAAGACCAGTGATAACATCAAAGAACATAAACAAAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTACGCATAAGACCAGTGATAACATCAAAGAACATAAACAAAGAT  584

seq1  CTTGTAGTTTGGATCAGAATCCTGCCAGTCTCACCTGAAAGATAGACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAGTTTGGATCAGAATCCTGCCAGTCTCACCTGAAAGATAGACAGA  634

seq1  ATTCCAAAAATATTGCAACTTTGGTAAAAACAAGATGACTTTGTGGGTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAAAAATATTGCAACTTTGGTAAAAACAAGATGACTTTGTGGGTAC  684

seq1  ATCTGCAACTGTCTGTGATCTTCAACAGCTTAATATGAGTGTCCAGATCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCAACTGTCTGTGATCTTCAACAGCTTAATATGAGTGTCCAGATCT  734

seq1  GTTTGTTCCTCTGTAAATTCATGAGGTTGGTTTGGATTATTTAACAATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTCCTCTGTAAATTCATGAGGTTGGTTTGGATTATTTAACAATGT  784

seq1  GTATAGTTTTGGTGGAATTTTAGTACAATTGTTATAATGGGTATTTTTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGTTTTGGTGGAATTTTAGTACAATTGTTATAATGGGTATTTTTTC  834

seq1  TATCTTTCCAGCCATGGTGGATTCTTACATAGTTATTGTAGCAAAGTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTCCAGCCATGGTGGATTCTTACATAGTTATTGTAGCAAAGTCAA  884

seq1  TAAAATTCAGAAGAAAAGTTTCAGAGTAGAAAACCACATGGAATTATTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTCAGAAGAAAAGTTTCAGAGTAGAAAACCACATGGAATTATTTA  934

seq1  GATAATCTTAGTTCTGGATTGAGAGATGTTTTTGTTTCATTGTGTAGGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATCTTAGTTCTGGATTGAGAGATGTTTTTGTTTCATTGTGTAGGAA  984

seq1  ACATTAAAAAGTAATACTTCAGATTACAGAGTAATCATATTGGGGGCTTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAAAAAGTAATACTTCAGATTACAGAGTAATCATATTGGGGGCTTA  1034

seq1  CACTGGTGAGAGGGTGCTAAATGACGTCTGCACATTAGGCTTTATTTAGA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGTGAGAGGGTGCTAAATGACGTCTGCACATTAGGCTTTATTTAGA  1084

seq1  TGAGAAGCTATCCAGTTCTTGCCAAATACTGTAATAGTGGTGAATTC  1147
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGCTATCCAGTTCTTGCCAAATACTGTAATAGTGGTGAATTC  1131

seq1: chr10_31460583_31461760
seq2: B6Ng01-119B10.g_70_1226

seq1  GAATTCAGGACAGGGCTTTATTCATTTGCATTTAGTTGGTGGGCATTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGACAGGGCTTTATTCATTTGCATTTAGTTGGTGGGCATTTGT  50

seq1  ATGTGTCTAACTTCAAATTTAAGTAGCTAGAATTCATTTTCCAATATTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCTAACTTCAAATTTAAGTAGCTAGAATTCATTTTCCAATATTGA  100

seq1  TTTCAGACTAAGTCCCTTAGGTTATGACAGTCCACAACTTTTCCCTAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGACTAAGTCCCTTAGGTTATGACAGTCCACAACTTTTCCCTAGGT  150

seq1  GATTTTCATATTGAATAACATCTGGAAAAGGCATTGTGTCTCTATTAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCATATTGAATAACATCTGGAAAAGGCATTGTGTCTCTATTAGGT  200

seq1  AAGGTGGTAACCATAGTCATTTTTTATAGTAGCCATGGGGATTCCAGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGTAACCATAGTCATTTTTTATAGTAGCCATGGGGATTCCAGGAA  250

seq1  CTTCCTGTGGATTTAAAACTTACAATTTCCTAGGTATCCTAGAAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGTGGATTTAAAACTTACAATTTCCTAGGTATCCTAGAAAAAAAA  300

seq1  TGACACAGAGTTTATATATAATCTACACACACCCTGCACTAGACACAGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACAGAGTTTATATATAATCTACACACACCCTGCACTAGACACAGTC  350

seq1  ATCTTTGGATTACTGCATTGGATTGTATTATCCAATGCAGTGTAAATGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTGGATTACTGCATTGGATTGTATTATCCAATGCAGTGTAAATGTT  400

seq1  CTGTTCAATAAACAGTTGCTATCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCAATAAACAGTTGCTATCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  450

seq1  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTACTCTTTGTAACTTTTGACAAGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTACTCTTTGTAACTTTTGACAAGGAC  500

seq1  AACACATCTGGCCATAGTTTGTACAAATGTACTCTTCCCTCTCCCCAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATCTGGCCATAGTTTGTACAAATGTACTCTTCCCTCTCCCCAAAT  550

seq1  ATTTTCTATCTGCCATTTTGAGTCTACAAGTAAAGGAATCCATAGATATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTATCTGCCATTTTGAGTCTACAAGTAAAGGAATCCATAGATATG  600

seq1  GATAAAGTATTTAGAAAAAGGTACTTTAAAATGGATGCATGTACTTTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGTATTTAGAAAAAGGTACTTTAAAATGGATGCATGTACTTTGTT  650

seq1  CTAATGAAATTACTTTAAGAAAGAAACTAATGAAAATGGAGAAGTCATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGAAATTACTTTAAGAAAGAAACTAATGAAAATGGAGAAGTCATGT  700

seq1  ATTGAAGGACTTTTTTTTTCCCTCTTAAAGACTGTAGATATTTTCTATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAGGACTTTTTTTTTCCCTCTTAAAGACTGTAGATATTTTCTATAA  750

seq1  AGATCTTTTAATAGCAGGTAACACTCGAAGGTAAATTTTTAGTATTGTCA  800
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTTTAATAGCATGTAACACTCGAAGGTAAATTTTTAGTATTGTCA  800

seq1  CTGAAGTGACAAAGTGTCAATGCTATGCATCAGGGGGTGGGGTCTAAGCA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTGACAAAGTGTCAATGCTATGCATCA-GGGGTGGGGTCTAAGCA  849

seq1  AGAGAAAAGTGC-CATGCATATGGTAAAAAGGATGAAGACCAGTGATCCC  899
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAAGTGCTCATGCATATGGTAAAAAGGATGAAGACCAGTGATCCC  899

seq1  AGACACTTTAA-TTTCTTTTATAGAAGATTGTAAACAAGAACAAATATGG  948
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGACACTTTAATTTTCTTTTATAGAAGATTGTAAACAAGAAC-AATATGG  948

seq1  GGTGTTAACTGGTTGGAGGAGACATGGGGCCATAAAGCTATGGTCAGAGA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  GGTGTTAACTGGTTGGAGGAGACATGGGG-CATAAAGCTAT-GTCAGAGA  996

seq1  CAGGGGAGCTGGGCTGTAAAGAGCATAGTGAGGATGCCCACTCTAAGGTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGAGCTGGGCTGTAAAGAGCATAGTGA-GATGCCCACTCTAAGGTA  1045

seq1  TTTGCAAGAGACCAACATTTAGTTCTTAAAAGGACAAGATGTT-CTCTTA  1097
       |||| ||||| | ||||||||||||   ||| | |  ||||| ||||| 
seq2  -TTGC-AGAGA-CTACATTTAGTTCT---AAGAAAAGAATGTTCCTCTT-  1088

seq1  AGACAGAACAAACACAAACATGTGTGTTCTAAGGGCCACTGTGCTCAAAT  1147
      ||||       ||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||| |||
seq2  AGAC------GACACCCACAGGTGTTTTCT-AGGGCCACTG-GCTC-AAT  1129

seq1  GGTTGAG-ACAGTCCATGCTTTGCTTTTAGTT  1178
      || |||| ||||| |||||  |||||| ||||
seq2  GG-TGAGAACAGT-CATGC--TGCTTTAAGTT  1157