BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121C18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,421,175 - 67,607,921
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlekhk1, Arid5b
Upstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2, Egr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365
Downstream geneLOC100040136, 1700040L02Rik, EG665342, Tmem26
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121C18.bB6Ng01-121C18.g
ACCDH924922DH924923
length1,1101,129
definitionDH924922|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121C18, 5' end.DH924923|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121C18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,606,788 - 67,607,921)(67,421,175 - 67,422,333)
sequence
gaattcatttgaatgatatagtttatccaagccattatagccaaactgtc
gttatcatctcaatatgtgcttgatttaaaatgctatcagtgagatcatt
tgctctctgccccacgtgttgaaaaccaatctgtgtaccaatctgtttta
tacgtaaagtacacctcagctcaggcttggcattccaagggctctgcaga
cgccggtgggcaccgagactgtattgggtgcagcaactttacacaggaag
ggaaatgttttcttttaactgaccacgtggagcttcacccttctctatca
ttattatttagtattactagtagtattatgagatccatggtatggtttcc
actaacatctgccctgctgttctactgtgacacaaactcttctttccaat
gacagagcactcaagcttgtccagccagcccagttacaatcacttgtccc
tagtgaatgtatcactgttgggagttagggaccctgttgctgcctctgca
cacacaccacaccacaggctcctttctcttctcctctggaccctccatcc
tgcattttctactctcttctatacagtcactgagagccatggtacagaag
gattttgaagagcctttgcagtatgagctgctgctcaggtatagcaaata
ctttacaaactgagtcataggctgtcccctccttagttaaaaaaaaaaaa
ggtacatttttatttgtggggtcatgtaccaccaagcacttatggaagtc
agaggccaattatttctttccacctggtgggtcctagggattggattcag
gtcacccatcttggcactgtagctcagcaggaccctggactcttatttcg
aaggaaggaacaacattacatgttagattgtcctttcggacagcataaag
aaattaataactgtattttcagcacaactccttttgtatatcttttaaat
aaatgggaccttattctatgttttgtgtgtggattaggaccaaactgttt
ctcctaagtattcatccatgtctgtatgagtagtatacacgctatcatgt
ggtgcatagcaaccaacaaacatacacatttacttatatccaatggaaca
tttcttatca
gaattcagagtatgggtggtttggggacaaagtccaaaagcattgcacct
gagctatcaaccacagatcaaatgatctggtttttttcttcctgtcgaaa
gacatatgcccactgaaatgcacgcaccatatttgaccctgactcacatg
aagtataaaatgatgtgccatgagtactgtgaactcactcacactggtga
taacacagtacaattagagccatggcattgagtttatgttctttaaaaag
caatgcatttgtctatcagcgagtcttctgaaacacttcagaagcaagag
gatgctgtctgaaacatacttctagggctggaggcagggaggaactcaga
taaaggaagatcagcttgagtgaatagtattgaaatcacctgacaggtca
gagaatttaataaattattctctttagatcattgtagtcacaataacatt
acaaaacatttacatgggcctttctaattggtttaggctctaggtactgt
ccttacgttaacagcttaacttattaagaacaagtgatttaagttattaa
ttactaagttaattgtacaaatacaccacaaatgcattcactttcatatt
agttggttgggtctattgatcaacctacaacactactactaaaccactct
cttcttctattaaaaggatagagcaaaagctattctatccacgttggtgt
ccacaaatatttcactgaattttcaccttttaaatatttcccaagtgttt
ttgaaactgtcatttcaaaacccaacttggagtcagcctcttactgcaat
gccagctctcaggaagtggaaactgaaggattatagattcaaacaaacta
acaaaccaaccaaccctgattggagagctgtctgttgccatacgtgtagg
tagcctgaaagtcccagattaggatcaggtacctctgtatctttgtgaat
gaataaaaaaagacattctggcattgcagactttacttgaaaaactgtag
tctctttctaatgaattccaatctaatctgaaacctatgtttcagaatgg
ggtggtttcatggtttatgactgcttaacagatgtacaggtatttagatc
catggctttattcatgtaatctgtcatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67606788_67607921
seq2: B6Ng01-121C18.b_43_1152 (reverse)

seq1  TGATAAAGGAAATGTTTCCCACTGGATATAAGTAAATGGTTGTTATGGTT  50
      ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||  || ||||  |
seq2  TGATAA--GAAATGTT--CCATTGGATATAAGTAAATG--TG-TATG--T  41

seq1  TTGGTTTGGTTGCTTATGCA-CACATGGATTAGCGTGTATACTAACTCAT  99
      |||  |||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| 
seq2  TTG--TTGGTTGC-TATGCACCACATG--ATAGCGTGTATACT-ACTCA-  84

seq1  TACAGACATGGATGAATACTTTAGGAGAAACAGTTTGGTTCCTAAATCCA  149
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||
seq2  TACAGACATGGATGAATAC-TTAGGAGAAACAGTTTGG-TCCT-AATCCA  131

seq1  CACAACAAAAACAATAGAATAAGGTCCCAATTTATTTAAAAAGATATACA  199
      ||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  CAC-ACAAAA--CATAGAATAAGGTCCC-ATTTATTT-AAAAGATATACA  176

seq1  AAAGGAGTTTGTGCTGAAAATACAGTTATTAATTTCTTTATGCTGTCCGA  249
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAG-TTGTGCTGAAAATACAGTTATTAATTTCTTTATGCTGTCCGA  225

seq1  AAGGACAATCTAACATGTAATGTTGTTCCTTCCTTCGAAATAAGAGTCCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACAATCTAACATGTAATGTTGTTCCTTCCTTCGAAATAAGAGTCCA  275

seq1  GGGTCCTGCTGAGCTACAGTGCCAAGATGGGTGACCTGAATCCAATCCCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCTGCTGAGCTACAGTGCCAAGATGGGTGACCTGAATCCAATCCCT  325

seq1  AGGACCCACCAGGTGGAAAGAAATAATTGGCCTCTGACTTCCATAAGTGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCCACCAGGTGGAAAGAAATAATTGGCCTCTGACTTCCATAAGTGC  375

seq1  TTGGTGGTACATGACCCCACAAATAAAAATGTACCTTTTTTTTTTTTAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGGTACATGACCCCACAAATAAAAATGTACCTTTTTTTTTTTTAAC  425

seq1  TAAGGAGGGGACAGCCTATGACTCAGTTTGTAAAGTATTTGCTATACCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGGGGACAGCCTATGACTCAGTTTGTAAAGTATTTGCTATACCTG  475

seq1  AGCAGCAGCTCATACTGCAAAGGCTCTTCAAAATCCTTCTGTACCATGGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAGCTCATACTGCAAAGGCTCTTCAAAATCCTTCTGTACCATGGC  525

seq1  TCTCAGTGACTGTATAGAAGAGAGTAGAAAATGCAGGATGGAGGGTCCAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGTGACTGTATAGAAGAGAGTAGAAAATGCAGGATGGAGGGTCCAG  575

seq1  AGGAGAAGAGAAAGGAGCCTGTGGTGTGGTGTGTGTGCAGAGGCAGCAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAGAGAAAGGAGCCTGTGGTGTGGTGTGTGTGCAGAGGCAGCAAC  625

seq1  AGGGTCCCTAACTCCCAACAGTGATACATTCACTAGGGACAAGTGATTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCCCTAACTCCCAACAGTGATACATTCACTAGGGACAAGTGATTGT  675

seq1  AACTGGGCTGGCTGGACAAGCTTGAGTGCTCTGTCATTGGAAAGAAGAGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGCTGGCTGGACAAGCTTGAGTGCTCTGTCATTGGAAAGAAGAGT  725

seq1  TTGTGTCACAGTAGAACAGCAGGGCAGATGTTAGTGGAAACCATACCATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCACAGTAGAACAGCAGGGCAGATGTTAGTGGAAACCATACCATG  775

seq1  GATCTCATAATACTACTAGTAATACTAAATAATAATGATAGAGAAGGGTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCATAATACTACTAGTAATACTAAATAATAATGATAGAGAAGGGTG  825

seq1  AAGCTCCACGTGGTCAGTTAAAAGAAAACATTTCCCTTCCTGTGTAAAGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCACGTGGTCAGTTAAAAGAAAACATTTCCCTTCCTGTGTAAAGT  875

seq1  TGCTGCACCCAATACAGTCTCGGTGCCCACCGGCGTCTGCAGAGCCCTTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCACCCAATACAGTCTCGGTGCCCACCGGCGTCTGCAGAGCCCTTG  925

seq1  GAATGCCAAGCCTGAGCTGAGGTGTACTTTACGTATAAAACAGATTGGTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCCAAGCCTGAGCTGAGGTGTACTTTACGTATAAAACAGATTGGTA  975

seq1  CACAGATTGGTTTTCAACACGTGGGGCAGAGAGCAAATGATCTCACTGAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGATTGGTTTTCAACACGTGGGGCAGAGAGCAAATGATCTCACTGAT  1025

seq1  AGCATTTTAAATCAAGCACATATTGAGATGATAACGACAGTTTGGCTATA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTTAAATCAAGCACATATTGAGATGATAACGACAGTTTGGCTATA  1075

seq1  ATGGCTTGGATAAACTATATCATTCAAATGAATTC  1134
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTGGATAAACTATATCATTCAAATGAATTC  1110

seq1: chr10_67421175_67422333
seq2: B6Ng01-121C18.g_67_1195

seq1  GAATTCAGAGTATGGGTGGTTTGGGGACAAAGTCCAAAAGCATTGCACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGTATGGGTGGTTTGGGGACAAAGTCCAAAAGCATTGCACCT  50

seq1  GAGCTATCAACCACAGATCAAATGATCTGGTTTTTTTCTTCCTGTCGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATCAACCACAGATCAAATGATCTGGTTTTTTTCTTCCTGTCGAAA  100

seq1  GACATATGCCCACTGAAATGCACGCACCATATTTGACCCTGACTCACATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATGCCCACTGAAATGCACGCACCATATTTGACCCTGACTCACATG  150

seq1  AAGTATAAAATGATGTGCCATGAGTACTGTGAACTCACTCACACTGGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATAAAATGATGTGCCATGAGTACTGTGAACTCACTCACACTGGTGA  200

seq1  TAACACAGTACAATTAGAGCCATGGCATTGAGTTTATGTTCTTTAAAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACAGTACAATTAGAGCCATGGCATTGAGTTTATGTTCTTTAAAAAG  250

seq1  CAATGCATTTGTCTATCAGCGAGTCTTCTGAAACACTTCAGAAGCAAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCATTTGTCTATCAGCGAGTCTTCTGAAACACTTCAGAAGCAAGAG  300

seq1  GATGCTGTCTGAAACATACTTCTAGGGCTGGAGGCAGGGAGGAACTCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTCTGAAACATACTTCTAGGGCTGGAGGCAGGGAGGAACTCAGA  350

seq1  TAAAGGAAGATCAGCTTGAGTGAATAGTATTGAAATCACCTGACAGGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAAGATCAGCTTGAGTGAATAGTATTGAAATCACCTGACAGGTCA  400

seq1  GAGAATTTAATAAATTATTCTCTTTAGATCATTGTAGTCACAATAACATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATTTAATAAATTATTCTCTTTAGATCATTGTAGTCACAATAACATT  450

seq1  ACAAAACATTTACATGGGCCTTTCTAATTGGTTTAGGCTCTAGGTACTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACATTTACATGGGCCTTTCTAATTGGTTTAGGCTCTAGGTACTGT  500

seq1  CCTTACGTTAACAGCTTAACTTATTAAGAACAAGTGATTTAAGTTATTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACGTTAACAGCTTAACTTATTAAGAACAAGTGATTTAAGTTATTAA  550

seq1  TTACTAAGTTAATTGTACAAATACACCACAAATGCATTCACTTTCATATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAAGTTAATTGTACAAATACACCACAAATGCATTCACTTTCATATT  600

seq1  AGTTGGTTGGGTCTATTGATCAACCTACAACACTACTACTAAACCACTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGTTGGGTCTATTGATCAACCTACAACACTACTACTAAACCACTCT  650

seq1  CTTCTTCTATTAAAAGGATAGAGCAAAAGCTATTCTATCCACGTTGGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCTATTAAAAGGATAGAGCAAAAGCTATTCTATCCACGTTGGTGT  700

seq1  CCACAAATATTTCACTGAATTTTCACCTTTTAAATATTTCCCAAGTGTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAATATTTCACTGAATTTTCACCTTTTAAATATTTCCCAAGTGTTT  750

seq1  TTGAAACTGTCATTTCAAAACCCAACTTGGAGTCAGCCTCTTACTGCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACTGTCATTTCAAAACCCAACTTGGAGTCAGCCTCTTACTGCAAT  800

seq1  GCCAGCTCTCAGGAAGTGGAAACTGAAGGATTATAGATTCAAACAAACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCTCTCAGGAAGTGGAAACTGAAGGATTATAGATTCAAACAAACTA  850

seq1  ACAAACCAACCAACCCTGATTGGAGAGCTGTCTGTTGCCATACGTGTAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCAACCAACCCTGATTGGAGAGCTGTCTGTTGCCATACGTGTAGG  900

seq1  TAGCCTGAAAGTCCCAAGATTAAGGAATCAGGTTACCTCTGTAATCTTTG  950
      ||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| |||||||
seq2  TAGCCTGAAAGTCCC-AGATTA--GGATCAGG-TACCTCTGT-ATCTTTG  945

seq1  TTGAATGAAATAAAGAAAAGAACATTCTGGCATTGCAAGACCTTTACTTG  1000
       |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  -TGAATG-AATAAA-AAAAG-ACATTCTGGCATTGC-AGA-CTTTACTTG  989

seq1  AAAAAAACTGTAGTCTCCTTTTCTAATGAATTTTCAAATCTAATCTGATA  1050
        |||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||| |
seq2  --AAAAACTGTAGTCTC--TTTCTAATGAA--TTCCAATCTAATCTGAAA  1033

seq1  CCTAATGTTTCAGAAATGTGTGTGTTTCAATTGTTTTATGACTGCCTTTA  1100
      ||| |||||||||||  | ||| ||||||  || |||||||||||  |||
seq2  CCT-ATGTTTCAGAATGGGGTG-GTTTCA--TGGTTTATGACTGC--TTA  1077

seq1  AAACCAGAATGTACAAGTATTTAGTATCCATTGCTTTTAATCCATGTACT  1150
      |   ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||  || |||||| |
seq2  A---CAG-ATGTACAGGTATTTAG-ATCCATGGCTTT--ATTCATGTAAT  1120

seq1  CTGTCATGA  1159
      |||||||||
seq2  CTGTCATGA  1129