BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-122H13
Chromosome10 (Build37)
Map Location 65,736,561 - 65,914,238
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC665206, LOC216036, 1700023F02Rik, 4930407I19Rik
Downstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-122H13.bB6Ng01-122H13.g
ACCDH925885DH925886
length9901,041
definitionDH925885|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122H13, 5' end.DH925886|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122H13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,736,561 - 65,737,398)(65,913,195 - 65,914,238)
sequence
gaattccaagcccaaggtcttgctaaggacaaactaggactgttggaaca
ctggcagacggctttagctatgtcagaattcaatcttcaaaggcacttat
gataggaaaatattgaaagagagcacgtggatccatacactagactaacg
cgggaatggaatgcgggaatgaaaaattactgtatgggtagggaacgcta
gactccaggaggagagcttccttgaaactcttttgcctcatgagtgactt
ttaagcctctcggcttgtccagttgactccaccagagagcgtagcatccc
tggaagccagtcttctcctagcagccttcagatgaatatgtagaactctc
agctcctccagtcccacatcttcttgaatcctgccatgctcctgccttga
tgataatggactacacctctgaacctgcaagccggtctcaattaaatgtc
ctttataagagttgctttggtcatagtgtctgttcacagcaataaaactc
aaactaagacaactcttctctgcctacagagaactgagattacagatatt
tactattacatacagcacttttacatgggtctgggggttaaactcaggcc
ctcatgctaagaagcaaatatgtgtttgcttctgagatatcctttcaatt
tcgtctgttttctcgtgtctgttctattatcccccttctcagactcgtaa
gatccctttctccccctctcattattctcattcctgcttcatgccacata
catgggatatatgtatatttacatacatgtatacctacatatataattta
gaattcagttctgattatgagcaaaattgttctgtatctttctgcatctg
gtttattgttctccatatggctctgttcatctattgaaatggaaatttaa
ggattgaagtctgtgagtcataggaataattgtctgctagatagtcccaa
ctaatacctagtatttatgtggatgtttgtatgggatgtg
gaattcttactcattccattagatccttgcattttattttattttatttt
attttattgtggtattagggattgaacccagggcctcatgaatgctagct
cagtactgtcctactaagttgtctcagcccccatcagattccttaacggt
taacattttgtagtatttgaactctctcttttctttatacattcatagac
ttatatatacataggtatgaaggtatgaatttttgttataaaaacattta
ttttatattggtagcttgagatttattttggctggaggattgatacaaca
aaaataggcctatgccatgtactggggcttttagatttgtttttccagga
agatcatttgttaacactccatcaccatcaaccctaaatattacatacgt
ctatgaatggaagcattttcatacataacctactggaaagacaatataag
aaatccaggtcattatgtaacctaactctttatctaggcttcatcagtga
tctcaaaagctttttaagcttctttctagtttttgccttcctgaccttgg
tgttatggagatgcacaggataatgctgtgaaggatgccctttggttgca
gttttccagcctttgcctgatacgctttgtctgccatgaatataatttaa
ggggtgtcatgtccttgctgactgatattaggagctacacagtgcttgtt
ttaatatcagtgatgttattaactttgatcatttgttattaactttgatc
acttagctaaagggttgtgtggatgctgagtttcttcacagtaaactgct
tccatctgtaattaaccatttaaaagctgggtgggtatgaaaacatttgc
ctatgttccaaactgagacactaggatgcagaggagggatcccgggcaga
ctggatattagagtgtctgaactggcgagttctgtgttcaaaccattctt
cagtaagtaaagcaggagtggtagaaggaaggttccagcatgaactttca
tattcagacctcatattcacacattgtatgcttataagtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_65736561_65737398
seq2: B6Ng01-122H13.b_200_1035

seq1  AATGGAATGCGGGAATGAAAAATTACTGTATGGGTAGGGAACGCTAGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAATGCGGGAATGAAAAATTACTGTATGGGTAGGGAACGCTAGACT  50

seq1  CCAGGAGGAGAGCTTCCTTGAAACTCTTTTGCCTCATGAGTGACTTTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGGAGAGCTTCCTTGAAACTCTTTTGCCTCATGAGTGACTTTTAA  100

seq1  GCCTCTCGGCTTGTCCAGTTGACTCCACCAGAGAGCGTAGCATCCCTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCGGCTTGTCCAGTTGACTCCACCAGAGAGCGTAGCATCCCTGGA  150

seq1  AGCCAGTCTTCTCCTAGCAGCCTTCAGATGAATATGTAGAACTCTCAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTCTTCTCCTAGCAGCCTTCAGATGAATATGTAGAACTCTCAGCT  200

seq1  CCTCCAGTCCCACATCTTCTTGAATCCTGCCATGCTCCTGCCTTGATGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGTCCCACATCTTCTTGAATCCTGCCATGCTCCTGCCTTGATGAT  250

seq1  AATGGACTACACCTCTGAACCTGCAAGCCGGTCTCAATTAAATGTCCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGACTACACCTCTGAACCTGCAAGCCGGTCTCAATTAAATGTCCTTT  300

seq1  ATAAGAGTTGCTTTGGTCATAGTGTCTGTTCACAGCAATAAAACTCAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGTTGCTTTGGTCATAGTGTCTGTTCACAGCAATAAAACTCAAAC  350

seq1  TAAGACAACTCTTCTCTGCCTACAGAGAACTGAGATTACAGATATTTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACAACTCTTCTCTGCCTACAGAGAACTGAGATTACAGATATTTACT  400

seq1  ATTACATACAGCACTTTTACATGGGTCTGGGGGTTAAACTCAGGCCCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATACAGCACTTTTACATGGGTCTGGGGGTTAAACTCAGGCCCTCA  450

seq1  TGCTAAGAAGCAAATATGTGTTTGCTTCTGAGATATCCTTTCAATTTCGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAGAAGCAAATATGTGTTTGCTTCTGAGATATCCTTTCAATTTCGT  500

seq1  CTGTTTTCTCGTGTCTGTTCTATTATCCCCCTTCTCAGACTCGTAAGATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTCTCGTGTCTGTTCTATTATCCCCCTTCTCAGACTCGTAAGATC  550

seq1  CCTTTCTCCCCCTCTCATTATTCTCATTCCTGCTTCATGCCACATACAT-  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTTTCTCCCCCTCTCATTATTCTCATTCCTGCTTCATGCCACATACATG  600

seq1  GGATATATGTATATTTACATACATGTATACCTACATATATAATTTAGAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATATGTATATTTACATACATGTATACCTACATATATAATTTAGAAT  650

seq1  TCAGTTCTGATTATGAGCAAAATTGTTCTGTATCTTTCTGCATCTGGTTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCTGATTATGAGCAAAATTGTTCTGTATCTTTCTGCATCTGGTTT  700

seq1  ATTGTTCTCCATATGGCTCTGTTCCATCTATTGAAATGGAAATTTAAGGA  749
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTCTCCATATGGCTCTGTT-CATCTATTGAAATGGAAATTTAAGGA  749

seq1  TTGAAGTCTGTGAGTCATAGGAATAATTGTCTGCTAAGAATAGTCCCAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||
seq2  TTGAAGTCTGTGAGTCATAGGAATAATTGTCTGCTA--GATAGTCCC-AA  796

seq1  CTAATACCTAGTATTTATGTGGATGTTTGTAT-GGATGTG  838
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTAATACCTAGTATTTATGTGGATGTTTGTATGGGATGTG  836

seq1: chr10_65913195_65914238
seq2: B6Ng01-122H13.g_66_1106 (reverse)

seq1  TCACTTATGTAGGCATAC-ATGTGTGAATATGA-GTCTGAATACTGAAAG  48
      |||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  TCACTTA--TAAGCATACAATGTGTGAATATGAGGTCTGAATA-TGAAAG  47

seq1  TTCATGCTGGAAACCTTCC-TCTACCACTCTCTGCTTTACTTACTGAGGA  97
      |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  TTCATGCTGG-AACCTTCCTTCTACCACTC-CTGCTTTACTTACTGAAGA  95

seq1  ATGGTTTGAACACAGAACTCGCCAGTTCAGACACTCTAATATCCAGTCTG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTGAACACAGAACTCGCCAGTTCAGACACTCTAATATCCAGTCTG  145

seq1  CCCGGGATCCCCTCCTCTGCATCCTAGTGTCTCAGTTTGGAACATAGGCA  197
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGGAT-CCCTCCTCTGCATCCTAGTGTCTCAGTTTGGAACATAGGCA  194

seq1  AATGTTTTCATACCCACCCAGCTTTTAAATGGTTAATTACAGATGGAAGC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTTCATACCCACCCAGCTTTTAAATGGTTAATTACAGATGGAAGC  244

seq1  AGTTTACTGTGAAGAAACTCAGCATCCACACAACCCTTTAGCTAAGTGAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTACTGTGAAGAAACTCAGCATCCACACAACCCTTTAGCTAAGTGAT  294

seq1  CAAAGTTAATAACAAATGATCAAAGTTAATAACATCACTGATATTAAAAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTTAATAACAAATGATCAAAGTTAATAACATCACTGATATTAAAAC  344

seq1  AAGCACTGTGTAGCTCCTAATATCAGTCAGCAAGGACATGACACCCCTTA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACTGTGTAGCTCCTAATATCAGTCAGCAAGGACATGACACCCCTTA  394

seq1  AATTATATTCATGGCAGACAAAGCGTATCAGGCAAAGGCTGGAAAACTGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATATTCATGGCAGACAAAGCGTATCAGGCAAAGGCTGGAAAACTGC  444

seq1  AACCAAAGGGCATCCTTCACAGCATTATCCTGTGCATCTCCATAACACCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAAGGGCATCCTTCACAGCATTATCCTGTGCATCTCCATAACACCA  494

seq1  AGGTCAGGAAGGCAAAAACTAGAAAGAAGCTTAAAAAGCTTTTGAGATCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGGAAGGCAAAAACTAGAAAGAAGCTTAAAAAGCTTTTGAGATCA  544

seq1  CTGATGAAGCCTAGATAAAGAGTTAGGTTACATAATGACCTGGATTTCTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGAAGCCTAGATAAAGAGTTAGGTTACATAATGACCTGGATTTCTT  594

seq1  ATATTGTCTTTCCAGTAGGTTATGTATGAAAATGCTTCCATTCATAGACG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTCTTTCCAGTAGGTTATGTATGAAAATGCTTCCATTCATAGACG  644

seq1  TATGTAATATTTAGGGTTGATGGTGATGGAGTGTTAACAAATGATCTTCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAATATTTAGGGTTGATGGTGATGGAGTGTTAACAAATGATCTTCC  694

seq1  TGGAAAAACAAATCTAAAAGCCCCAGTACATGGCATAGGCCTATTTTTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAAACAAATCTAAAAGCCCCAGTACATGGCATAGGCCTATTTTTGT  744

seq1  TGTATCAATCCTCCAGCCAAAATAAATCTCAAGCTACCAATATAAAATAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCAATCCTCCAGCCAAAATAAATCTCAAGCTACCAATATAAAATAA  794

seq1  ATGTTTTTATAACAAAAATTCATACCTTCATACCTATGTATATATAAGTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTTATAACAAAAATTCATACCTTCATACCTATGTATATATAAGTC  844

seq1  TATGAATGTATAAAGAAAAGAGAGAGTTCAAATACTACAAAATGTTAACC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATGTATAAAGAAAAGAGAGAGTTCAAATACTACAAAATGTTAACC  894

seq1  GTTAAGGAATCTGATGGGGGCTGAGACAACTTAGTAGGACAGTACTGAGC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGGAATCTGATGGGGGCTGAGACAACTTAGTAGGACAGTACTGAGC  944

seq1  TAGCATTCATGAGGCCCTGGGTTCAATCCCTAATACCACAATAAAATAAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATTCATGAGGCCCTGGGTTCAATCCCTAATACCACAATAAAATAAA  994

seq1  ATAAAATAAAATAAAATGCAAGGATCTAATGGAATGAGTAAGAATTC  1044
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAAAATAAAATGCAAGGATCTAATGGAATGAGTAAGAATTC  1041