BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-126M09
Chromosome10 (Build37)
Map Location 124,714,637 - 124,815,774
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc16a7, LOC100042987
Upstream gene4930503E24Rik, LOC671416
Downstream geneEG668313, LOC100042992, LOC668317, LOC100042994, Lrig3, LOC100043547
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-126M09.bB6Ng01-126M09.g
ACCDH929056DH929057
length8591,014
definitionDH929056|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126M09, 5' end.DH929057|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126M09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,714,637 - 124,715,503)(124,814,757 - 124,815,774)
sequence
gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcacttgaaaaaatg
ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc
agatgctggcgaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg
ggagtgcaggcttgtacaaccactctggaaatcagtctggcggttcctca
gaaaactggacatagtactaccggaggatccagcaatacctctcctgggc
atatatccagaagatgccccaacaggtaagaaggacacatgctccactat
gttcatagcagccttatttataatagccagaagctggaaagaacctagat
gcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgtggtacatctacacaatg
gagtacgactcttcagctttaaagttttcttgggaagctgcttatggagt
caatgaagtctctgctagcagcagaactgtatcaggacatgagggagtat
tacggctaggtttttcttaagctgtttaaggccacggcctctactgttag
cacggtaaaagcctgtgaagtagacattgagttgctatgcttttcctttt
ctctataactgcccttgtaactttgaatttctacactatgtgtggctgga
tggcaaggaaagaggaagagccgaaaagggttgattagcgatcacgggca
aacccatttcgcacagcaggaaggacaccgtggaaataaaaagctgacca
gaagagaatggtggtgaaaataagtattattgcttgggaagagtctagta
gaactgggg
gaattctttacgtaaccatttatgcatttcaacacagcacttcatagcct
aagccaaagagaaagttcatgatagaaacaacatactgaatccccaatac
tatgcatctttccgacatgtaaaaatttctggtttggggagcatatagaa
gggtactcagctatgaatatcaatgctgccaaaaaccaaccaaccaacca
aacaaacaaaaccataaaaattcagggtgaagttttcatttagcttcaga
gttagtggtcacatttggatatttcaagggacaattagaggggagttcct
ttttctccagatagaagtagttgtgcacaagaagcacatttaaagctacc
acaaagaggagcatggtcattgaccatgacatatggctgttcacatcaaa
gtgcaacatatataacaacaggattatcgatatcacataagtgcctccta
cgtgtctcctgccttctcatccccattgccatgtaaggcagatcacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacagacagagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggcag
agggaataaatagtcagcaaggcgagatacccatcagagtccctgagagt
cactatctcagcagttatcccagggcagggaagatgctgatggcatgctg
accctcctcagacacctgaaatcagtgtgaaccagtaaatagttaagggt
tccccagtgaagtaacctgctgagaggcccggggaaatgagccccctttt
tggctccatctctcccataacactacaatttcctaaacattatgttcacc
aattatgaataaaatccaaagtagaactaagtgtcaaaatgacctacaga
gaacacatctgtcttgaacaacagatgacaattattcatcctttgggggt
gacgagtgtgttgtctgttgctttaggcagctgtgtcagtgtgcttccgt
gtgctctagactgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_124714637_124715503
seq2: B6Ng01-126M09.b_51_909

seq1  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACTTGAAAAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACTTGAAAAAATG  50

seq1  TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT  100

seq1  TCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC  150

seq1  AGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG  200

seq1  GGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCA  250

seq1  GAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC  300

seq1  ATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT  350

seq1  GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGAT  400

seq1  GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG  450

seq1  GAGTACGACTCTTCAGCTTTAAAGTTTTCTTGGGAAGCTGCTTATGGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTACGACTCTTCAGCTTTAAAGTTTTCTTGGGAAGCTGCTTATGGAGT  500

seq1  CAATGAAGTCTCTGCTAGCAGCAGAACTGTATCAGGACATGAGGGAGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAAGTCTCTGCTAGCAGCAGAACTGTATCAGGACATGAGGGAGTAT  550

seq1  TACGGCTAGGTTTTTCTTAAGCTGTTTAAGGCCACGGCCTCTACTGTTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGGCTAGGTTTTTCTTAAGCTGTTTAAGGCCACGGCCTCTACTGTTAG  600

seq1  CACGGTAAAAGCCTGTGAAGTAGACATTGAGTTGCTATGCTTTTCCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGTAAAAGCCTGTGAAGTAGACATTGAGTTGCTATGCTTTTCCTTTT  650

seq1  CTCTATAACTGCCCTTGTAACTTTGAATTTCTACACTATGTGTGGCTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATAACTGCCCTTGTAACTTTGAATTTCTACACTATGTGTGGCTGGA  700

seq1  TGGCAAGGAAAGAGGAAGAGCCGAAAAGGGTTGATTAGCGATCACGGGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGGCAAGGAAAGAGGAAGAGCCGAAAAGGGTTGATTAGCGATCAC-GGGC  749

seq1  AAACCCATCTCGCACAGCAGGGAAGGGACACCGTGGAAATAAAAAGCTGA  800
      |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCATTTCGCACAGCAGG--AAGGACACCGTGGAAATAAAAAGCTGA  797

seq1  CCCAGAAGAGAATGGTGGTTGAAAATAAGTAATTATTGCTTGGGAAGAGT  850
       ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -CCAGAAGAGAATGGTGG-TGAAAATAAGT-ATTATTGCTTGGGAAGAGT  844

seq1  CTAGTAGGAAACTGGGG  867
      |||||||  ||||||||
seq2  CTAGTAG--AACTGGGG  859

seq1: chr10_124814757_124815774
seq2: B6Ng01-126M09.g_68_1081 (reverse)

seq1  GCAGTCTAGAGCACACGGAAGCACACTGACACAGCTGCCTTAAAGACAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  GCAGTCTAGAGCACACGGAAGCACACTGACACAGCTGCC-TAAAG-CAAC  48

seq1  AGACAACACACTCGTTCACCCCCAAAGGATGAATAATTTGTCATCTGTTG  100
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGACAACACACTCG-TCACCCCCAAAGGATGAATAA-TTGTCATCTGTTG  96

seq1  TTCAAGACAGATGTGTTCTCTGTAGGTCATTTTGACACTTAGTTCTACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGACAGATGTGTTCTCTGTAGGTCATTTTGACACTTAGTTCTACTT  146

seq1  TGGATTTTATTCATAATTGGTGAACATAATGTTTAGGAAATTGTAGTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTTTATTCATAATTGGTGAACATAATGTTTAGGAAATTGTAGTGTT  196

seq1  ATGGGAGAGATGGAGCCAAAAAGGGGGCTCATTTCCCCGGGCCTCTCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAGAGATGGAGCCAAAAAGGGGGCTCATTTCCCCGGGCCTCTCAGC  246

seq1  AGGTTACTTCACTGGGGAACCCTTAACTATTTACTGGTTCACACTGATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTACTTCACTGGGGAACCCTTAACTATTTACTGGTTCACACTGATTT  296

seq1  CAGGTGTCTGAGGAGGGTCAGCATGCCATCAGCATCTTCCCTGCCCTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTCTGAGGAGGGTCAGCATGCCATCAGCATCTTCCCTGCCCTGGG  346

seq1  ATAACTGCTGAGATAGTGACTCTCAGGGACTCTGATGGGTATCTCGCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGCTGAGATAGTGACTCTCAGGGACTCTGATGGGTATCTCGCCTT  396

seq1  GCTGACTATTTATTCCCTCTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACTATTTATTCCCTCTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  446

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  496

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCTGCCTTACATGGCAATGGGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCTGCCTTACATGGCAATGGGGAT  546

seq1  GAGAAGGCAGGAGACACGTAGGAGGCACTTATGTGATATCGATAATCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGCAGGAGACACGTAGGAGGCACTTATGTGATATCGATAATCCTG  596

seq1  TTGTTATATATGTTGCACTTTGATGTGAACAGCCATATGTCATGGTCAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATATATGTTGCACTTTGATGTGAACAGCCATATGTCATGGTCAAT  646

seq1  GACCATGCTCCTCTTTGTGGTAGCTTTAAATGTGCTTCTTGTGCACAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATGCTCCTCTTTGTGGTAGCTTTAAATGTGCTTCTTGTGCACAACT  696

seq1  ACTTCTATCTGGAGAAAAAGGAACTCCCCTCTAATTGTCCCTTGAAATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTATCTGGAGAAAAAGGAACTCCCCTCTAATTGTCCCTTGAAATAT  746

seq1  CCAAATGTGACCACTAACTCTGAAGCTAAATGAAAACTTCACCCTGAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATGTGACCACTAACTCTGAAGCTAAATGAAAACTTCACCCTGAATT  796

seq1  TTTATGGTTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTTTTGGCAGCATTGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGGTTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTTTTGGCAGCATTGAT  846

seq1  ATTCATAGCTGAGTACCCTTCTATATGCTCCCCAAACCAGAAATTTTTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAGCTGAGTACCCTTCTATATGCTCCCCAAACCAGAAATTTTTAC  896

seq1  ATGTCGGAAAGATGCATAGTATTGGGGATTCAGTATGTTGTTTCTATCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCGGAAAGATGCATAGTATTGGGGATTCAGTATGTTGTTTCTATCAT  946

seq1  GAACTTTCTCTTTGGCTTAGGCTATGAAGTGCTGTGTTGAAATGCATAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTTCTCTTTGGCTTAGGCTATGAAGTGCTGTGTTGAAATGCATAAA  996

seq1  TGGTTACGTAAAGAATTC  1018
      ||||||||||||||||||
seq2  TGGTTACGTAAAGAATTC  1014