BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128P09
Chromosome10 (Build37)
Map Location 96,675,156 - 96,858,756
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667407
Upstream geneLOC667380, Btg1, LOC628256, 4930556N09Rik
Downstream geneDcn, Lum, Kera, Epyc, 4921510H08Rik, EG667438
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128P09.bB6Ng01-128P09.g
ACCDH930672DH930673
length1,1121,159
definitionDH930672|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P09, 5' end.DH930673|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,857,744 - 96,858,756)(96,675,156 - 96,676,329)
sequence
gaattcccctggaactgtagctacagatggttgtgagcaaccagatatgt
gttgaaaaccaaatgtgggtcactgtgcttacagagaccgaaggcatagg
atatttgtgagtcaccagatatgtgctggaaaccaaatgtgggccctctg
tagagcagtacatgttcttatccacttagccattgtttcgtaacaaacta
ctctgtttgacatcatctgtctgctctacttttaaagattaaaagattat
gtgtgaatggatgtctgtgtgattgtatacaacgtgtttctgtatgtatg
caaaggttacaaaagggaaaaagcttttcacctctatctgtttaaaggtt
ttcctttgaatgtggggtttgcctttccctggctagactagaaaccaact
agtctcagcgatcctcctgtctctatctccagccctgagaacttgggtta
aaggcaggttgtggatgctctgtgtattaaatacatgctagcttctgaac
tctgaccctcatcattgtacaagaagcatttttaaagccatctctccagg
cccttccattgcatgtctgtttgcttacagggttttaaggagaaactgga
gatgaagctcaggagttaaaagatctcacagctctgtcttcctgctggag
gtgggctctataagttccctctccctactgtcaggcatttcatctaaggc
ccctccctttgattcctgagagtctctcacctcccaggccctggtgcatt
ctggagggtggccccaacctcctatttcctgagttgcctgtttacattct
ttctgctggccctcagggcttgggtccttttcctcagccaatactagatc
aggttcccctctaccccctactcccccaaccccatgtccactttccctcc
caggtctcttccctccttccccacttgtgatgctttctttctctctcttc
caagtgggactgaggcatcctcacttgagcatttcagcttgttgacttgt
tgatctttttggagtctgctactgactttgggtttctgtattttttttcc
taatattgacttatagggagaacatagcatgcaccatctttttgagtctg
agtacttcactc
gaattccatagaacaagagctaccaacaattgtctgtcaccttatgggtg
ctcagaaccaaacctgggatggtgaaagcagcaagtgttgctacctgcta
agtcttccctccaaacttttatctacatttctattgtaaatacagaataa
aattgtggatgcaaataagtacatatactattataatgcatttttattca
ggtctgtttggatttacagaggtaaaatgcaatgaatctgagtagccact
aatttagatataaatatattttgcgtttctacatgcgtgaaacaagagaa
aacataccatgattaagtgaacctcaatcattcaagtatatgaaattgtt
tattatgcttccccctgcatgctttgctgaaatacactacattcatcata
tcagaatgcaaaatttgtctagaaaaggtgtaatttagctcaactttacc
tcataaatgggtccctatctgttatttgttctaaggctatacatcaagat
gattgtagtatttataatgcaaagtgcgggcacagattataaactgcggg
cccttcagacagagcagtaacaaagagagcatgaacaaagagagttcata
ctttaaatgtgggcattactcaccatggtgttaggggtcaatctcagcct
ctgagaccttcagcttcctgatgttaaaacaacagccacaataaaaacaa
aacaaagcaaaatcagtaagggttaaaggctctgatgtatgtagatattg
atctcaaaacagactctcagaggagattattgtagagagagtctgaccag
catatcagctccaagtgccttgaggattacaaatacacatgtcaaattgt
tgcgagataaagagaaagtgtaaccaacatagcttctgcaacatctttgc
tccagaaaaccccaggcaggtgaaacctttcaaacactgtctcattggca
aaggactgtcatctatgtcatctaatgtccacatagatgtgaacataccc
tgaagaccagatcctgtcagatgcactgcccagaaaaaagtcttgatgac
tctgatatgaaactctctctaagaacatgacctcctgtaccgctaaggta
ttttggattaatacaagactgaaaaacaattcccatataccgtgtgtaca
cgtgacatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_96857744_96858756
seq2: B6Ng01-128P09.b_156_1163 (reverse)

seq1  GAGTGAAGTAACTCAGACTCAAAAAGAT-GTGCATGCTATGTACTCACTA  49
      ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || 
seq2  GAGTGAAGT-ACTCAGACTCAAAAAGATGGTGCATGCTATGTTCTCCCT-  48

seq1  ATAAGTCAATATTAGGGAAAAAAATACAGAATACCCAAGATACAGTAGAC  99
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||| |
seq2  ATAAGTCAATATTAGGAAAAAAAATACAGAA-ACCCAA-AGTCAGTAG-C  95

seq1  AGAACTCAAAAAGATCAACAAGTCAACAAGCTGAAATGCTCAAGTGAGGA  149
      |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCCAAAAAGATCAACAAGTCAACAAGCTGAAATGCTCAAGTGAGGA  145

seq1  TGCCTCAGTCCCACTTGGGAGAGAGAG-AAGAAAGCATTCACAAGTGGGG  198
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  TGCCTCAGTCCCACTTGGAAGAGAGAGAAAGAAAGCA-TCACAAGTGGGG  194

seq1  AGGGAGGG-AGAGACCTGGGAGGGAAAGTGGACATGGGGTTGGGGGAGTA  247
      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGGGAAGAGACCTGGGAGGGAAAGTGGACATGGGGTTGGGGGAGTA  244

seq1  GGGGGTAGAGGGGAACCTGATCTAGTATTGGCTGAGGGAAAAGGACCCAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGGGGTAGAGGGGAACCTGATCTAGTATTGGCTGA-GGAAAAGGACCCAA  293

seq1  GCCCTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGTAAACAGGCAACCTCAGGAAATAGG  347
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCCCTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGTAAACAGGCAA-CTCAGGAAATAGG  342

seq1  AGGTTGGGGCCACCCTCCAGAATGCACCAGGGCCTGGGAGGTGAGAGACT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGGGGCCACCCTCCAGAATGCACCAGGGCCTGGGAGGTGAGAGACT  392

seq1  CTCAGGAATCAAAGGGAGGGGCCTTAGATGAAATGCCTGACAGTAGGGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGAATCAAAGGGAGGGGCCTTAGATGAAATGCCTGACAGTAGGGAG  442

seq1  AGGGAACTTATAGAGCCCACCTCCAGCAGGAAGACAGAGCTGTGAGATCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAACTTATAGAGCCCACCTCCAGCAGGAAGACAGAGCTGTGAGATCT  492

seq1  TTTAACTCCTGAGCTTCATCTCCAGTTTCTCCTTAAAACCCTGTAAGCAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTCCTGAGCTTCATCTCCAGTTTCTCCTTAAAACCCTGTAAGCAA  542

seq1  ACAGACATGCAATGGAAGGGCCTGGAGAGATGGCTTTAAAAATGCTTCTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATGCAATGGAAGGGCCTGGAGAGATGGCTTTAAAAATGCTTCTT  592

seq1  GTACAATGATGAGGGTCAGAGTTCAGAAGCTAGCATGTATTTAATACACA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATGATGAGGGTCAGAGTTCAGAAGCTAGCATGTATTTAATACACA  642

seq1  GAGCATCCACAACCTGCCTTTAACCCAAGTTCTCAGGGCTGGAGATAGAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATCCACAACCTGCCTTTAACCCAAGTTCTCAGGGCTGGAGATAGAG  692

seq1  ACAGGAGGATCGCTGAGACTAGTTGGTTTCTAGTCTAGCCAGGGAAAGGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGGATCGCTGAGACTAGTTGGTTTCTAGTCTAGCCAGGGAAAGGC  742

seq1  AAACCCCACATTCAAAGGAAAACCTTTAAACAGATAGAGGTGAAAAGCTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCCACATTCAAAGGAAAACCTTTAAACAGATAGAGGTGAAAAGCTT  792

seq1  TTTCCCTTTTGTAACCTTTGCATACATACAGAAACACGTTGTATACAATC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTTTGTAACCTTTGCATACATACAGAAACACGTTGTATACAATC  842

seq1  ACACAGACATCCATTCACACATAATCTTTTAATCTTTAAAAGTAGAGCAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGACATCCATTCACACATAATCTTTTAATCTTTAAAAGTAGAGCAG  892

seq1  ACAGATGATGTCAAACAGAGTAGTTTGTTACGAAACAATGGCTAAGTGGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGATGTCAAACAGAGTAGTTTGTTACGAAACAATGGCTAAGTGGA  942

seq1  TAAGAACATGTACTGCTCTACAGAGGGCCCACATTTGGTTTCCAGCACAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAACATGTACTGCTCTACAGAGGGCCCACATTTGGTTTCCAGCACAT  992

seq1  ATCTGGTGACTCACAA  1013
      ||||||||||||||||
seq2  ATCTGGTGACTCACAA  1008

seq1: chr10_96675156_96676329
seq2: B6Ng01-128P09.g_70_1227

seq1  GAATTCCATAGAACAAGAGCTACCAACAATTGTCTGTCACCTTATGGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAGAACAAGAGCTACCAACAATTGTCTGTCACCTTATGGGTG  50

seq1  CTCAGAACCAAACCTGGGATGGTGAAAGCAGCAAGTGTTGCTACCTGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAACCAAACCTGGGATGGTGAAAGCAGCAAGTGTTGCTACCTGCTA  100

seq1  AGTCTTCCCTCCAAACTTTTATCTACATTTCTATTGTAAATACAGAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCCCTCCAAACTTTTATCTACATTTCTATTGTAAATACAGAATAA  150

seq1  AATTGTGGATGCAAATAAGTACATATACTATTATAATGCATTTTTATTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGGATGCAAATAAGTACATATACTATTATAATGCATTTTTATTCA  200

seq1  GGTCTGTTTGGATTTACAGAGGTAAAATGCAATGAATCTGAGTAGCCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGTTTGGATTTACAGAGGTAAAATGCAATGAATCTGAGTAGCCACT  250

seq1  AATTTAGATATAAATATATTTTGCGTTTCTACATGCGTGAAACAAGAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGATATAAATATATTTTGCGTTTCTACATGCGTGAAACAAGAGAA  300

seq1  AACATACCATGATTAAGTGAACCTCAATCATTCAAGTATATGAAATTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATACCATGATTAAGTGAACCTCAATCATTCAAGTATATGAAATTGTT  350

seq1  TATTATGCTTCCCCCTGCATGCTTTGCTGAAATACACTACATTCATCATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATGCTTCCCCCTGCATGCTTTGCTGAAATACACTACATTCATCATA  400

seq1  TCAGAATGCAAAATTTGTCTAGAAAAGGTGTAATTTAGCTCAACTTTACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAATGCAAAATTTGTCTAGAAAAGGTGTAATTTAGCTCAACTTTACC  450

seq1  TCATAAATGGGTCCCTATCTGTTATTTGTTCTAAGGCTATACATCAAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAATGGGTCCCTATCTGTTATTTGTTCTAAGGCTATACATCAAGAT  500

seq1  GATTGTAGTATTTATAATGCAAAGTGCGGGCACAGATTATAAACTGCGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTAGTATTTATAATGCAAAGTGCGGGCACAGATTATAAACTGCGGG  550

seq1  CCCTTCAGACAGAGCAGTAACAAAGAGAGCATGAACAAAGAGAGTTCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCAGACAGAGCAGTAACAAAGAGAGCATGAACAAAGAGAGTTCATA  600

seq1  CTTTAAATGTGGGCATTACTCACCATGGTGTTAGGGGTCAATCTCAGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAATGTGGGCATTACTCACCATGGTGTTAGGGGTCAATCTCAGCCT  650

seq1  CTGAGACCTTCAGCTTCCTGATGTTAAAACAACAGCCACAATAAAAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACCTTCAGCTTCCTGATGTTAAAACAACAGCCACAATAAAAACAA  700

seq1  AACAAAGCAAAATCAGTAAGGGTTAAAGGCTCTGATGTATGTAGATATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGCAAAATCAGTAAGGGTTAAAGGCTCTGATGTATGTAGATATTG  750

seq1  ATCTCAAAACAGACTCTCAGAGGAGATTATTGTAGAGAGAGTCTGACCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAAAACAGACTCTCAGAGGAGATTATTGTAGAGAGAGTCTGACCAG  800

seq1  CATATCAGCTCCAAGTGCCTTGAGGATTACAAATACACATGTCAAATTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCAGCTCCAAGTGCCTTGAGGATTACAAATACACATGTCAAATTGT  850

seq1  TGCGAGATAAAGGAGAAAGTGTAACCAACATAGCTTCTGCAACATCTTTT  900
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGCGAGATAAA-GAGAAAGTGTAACCAACATAGCTTCTGCAACATC-TTT  898

seq1  GCTCCAGAAAACCCCAGGCAGGTGAAACCTTTCAAACACTGTCTCATTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGAAAACCCCAGGCAGGTGAAACCTTTCAAACACTGTCTCATTGG  948

seq1  CAAAGGACTGTCATCTAATGTCATCTAATGT-CACATAGATGTGAACATA  999
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGACTGTCATCT-ATGTCATCTAATGTCCACATAGATGTGAACATA  997

seq1  CCCTGAAGGACACAGATTCCTGTCAGATGCCAACTGCCCAAGAAAAAAGT  1049
      ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||
seq2  CCCTGAA-GAC-CAGA-TCCTGTCAGATGC--ACTGCCC-AGAAAAAAGT  1041

seq1  CTTGATGACTCTGATACTGAAACTCTCTCTTAAGAACATGACCCTCCTGT  1099
      |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  CTTGATGACTCTGATA-TGAAACTCTCTC-TAAGAACATGA-CCTCCTGT  1088

seq1  AACAGCATAAGTTATTTTTGATAAAATACATAGGACTGGAAAAACATATC  1149
       || || |||| |||||| |||  |||||  | |||| |||||||| || 
seq2  -ACCGC-TAAGGTATTTTGGAT-TAATAC--AAGACT-GAAAAACA-ATT  1131

seq1  CACATATA-CACGTGTACACGT-ACAT  1174
      | |||||| |  |||||||||| ||||
seq2  CCCATATACCGTGTGTACACGTGACAT  1158