BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131A24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 51,412,193 - 51,530,341
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRfxdc1, 4933411G06Rik
Upstream geneAscc3, Sim1, LOC268300, LOC100041768, Gp49a, Lilrb4, LOC669246, 9430073N08Rik, Gprc6a
Downstream geneVgll2, Ros1, Dcbld1, Gopc, LOC625811, EG668294, Nepn, D10Ertd438e, EG629689, Zfa, Slc35f1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131A24.bB6Ng01-131A24.g
ACCDH932216DH932217
length770525
definitionDH932216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131A24, 5' end.DH932217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131A24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,412,193 - 51,412,962)(51,529,811 - 51,530,341)
sequence
gaattccttgatctaaagactacatctttccccttgggccctagaacctt
gacattcctcatctgagaggctttttcccttgagctctggggagctgctc
ccaatcatccataggaggccacctcaccctaccaatcatccacaccttac
cctacctgcacatatgacccttaactgaagagtgactttaggaaatttga
gagtggtggaaggatctgggatgtgcagtacctatccctcacaataaaca
gaccaaaaaacgataagtgctgtaatggtgggttttccctactaccatgc
tctcacctggacttccatgagtctaagaatctcaaagtctgtttgctaga
tcattataggtgtgcattataaatgcaaatgcagacactattgcatatgc
cagcaggattttgctgacaggaccctgatatagcttctcttgtgaggcta
tgccagtgcctggcaaatagagaagtggatgctcacagtcatctattgga
tggaacacagggcccccaacagaggagctagagaaagtactcaaggagct
gaaggagtctgtaaccctataggaggaagaacaatatggactaaccagta
ccccctgagcttgtgtctctagctgcacatgtagcagaagatggcctagt
cggccatcattgagagcagaggcccttggtcttgcaaagattatatgccc
cggtataggggaatgccagggccaggaagcggtaatgggtgggttgggga
gcagggtggggtgagggtag
tttgttcatctctgtaccccattttaaaatagggttatttggttctctgg
agtctaacttcttgagttccttggatactaggactctatagaatgtaggg
ttggtaaagttctttttacaatctgtaggttgccattttgtcttatcttt
gttgctgagtatttgaacccagggcctcacactttccagacaagtgctgt
accagtgaaaccacaccagcaggaatctattctgatatgtaaacttttgt
tttaactcatatatgccaatgcaaaaacacaattattaatacctgaattg
cagctttctggactcctctgtgcgcctgtgtccttatgtatgggagaatg
agcttacacatgtcagcccccatcccacttgcttaacaaggaactcatca
tcttctgacaaaatctaagtgcaatcctgttcttgttttaactggttgtg
ctggcaagggtcttttccaggcctgaaatttctcatgttggcaatatagc
gaagcaaaacaaacctagtatggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_51412193_51412962
seq2: B6Ng01-131A24.b_41_810

seq1  GAATTCCTTGATCTAAAGACTACATCTTTCCCCTTGGGCCCTAGAACCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGATCTAAAGACTACATCTTTCCCCTTGGGCCCTAGAACCTT  50

seq1  GACATTCCTCATCTGAGAGGCTTTTTCCCTTGAGCTCTGGGGAGCTGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTCCTCATCTGAGAGGCTTTTTCCCTTGAGCTCTGGGGAGCTGCTC  100

seq1  CCAATCATCCATAGGAGGCCACCTCACCCTACCAATCATCCACACCTTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATCATCCATAGGAGGCCACCTCACCCTACCAATCATCCACACCTTAC  150

seq1  CCTACCTGCACATATGACCCTTAACTGAAGAGTGACTTTAGGAAATTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTGCACATATGACCCTTAACTGAAGAGTGACTTTAGGAAATTTGA  200

seq1  GAGTGGTGGAAGGATCTGGGATGTGCAGTACCTATCCCTCACAATAAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGTGGAAGGATCTGGGATGTGCAGTACCTATCCCTCACAATAAACA  250

seq1  GACCAAAAAACGATAAGTGCTGTAATGGTGGGTTTTCCCTACTACCATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAAAAACGATAAGTGCTGTAATGGTGGGTTTTCCCTACTACCATGC  300

seq1  TCTCACCTGGACTTCCATGAGTCTAAGAATCTCAAAGTCTGTTTGCTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCTGGACTTCCATGAGTCTAAGAATCTCAAAGTCTGTTTGCTAGA  350

seq1  TCATTATAGGTGTGCATTATAAATGCAAATGCAGACACTATTGCATATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATAGGTGTGCATTATAAATGCAAATGCAGACACTATTGCATATGC  400

seq1  CAGCAGGATTTTGCTGACAGGACCCTGATATAGCTTCTCTTGTGAGGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGGATTTTGCTGACAGGACCCTGATATAGCTTCTCTTGTGAGGCTA  450

seq1  TGCCAGTGCCTGGCAAATAGAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGTGCCTGGCAAATAGAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGA  500

seq1  TGGAACACAGGGCCCCCAACAGAGGAGCTAGAGAAAGTACTCAAGGAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACACAGGGCCCCCAACAGAGGAGCTAGAGAAAGTACTCAAGGAGCT  550

seq1  GAAGGAGTCTGTAACCCTATAGGAGGAAGAACAATATGGACTAACCAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGTCTGTAACCCTATAGGAGGAAGAACAATATGGACTAACCAGTA  600

seq1  CCCCCTGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCACATGTAGCAGAAGATGGCCTAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCACATGTAGCAGAAGATGGCCTAGT  650

seq1  CGGCCATCATTGAGAGCAGAGGCCCTTGGTCTTGCAAAGATTATATGCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCATCATTGAGAGCAGAGGCCCTTGGTCTTGCAAAGATTATATGCCC  700

seq1  CGGTATAGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCGGTAATGGGTGGGTTGGGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTATAGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCGGTAATGGGTGGGTTGGGGA  750

seq1  GCAGGGTGGGGTGAGGGTAG  770
      ||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGTGGGGTGAGGGTAG  770

seq1: chr10_51529811_51530341
seq2: B6Ng01-131A24.g_66_596 (reverse)

seq1  AACCATACTAGGTTTGTTTTGCTTCGCTATATTGCCAACATGAGAAATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATACTAGGTTTGTTTTGCTTCGCTATATTGCCAACATGAGAAATTT  50

seq1  CAGGCCTGGAAAAGACCCTTGCCAGCACAACCAGTTAAAACAAGAACAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTGGAAAAGACCCTTGCCAGCACAACCAGTTAAAACAAGAACAGG  100

seq1  ATTGCACTTAGATTTTGTCAGAAGATGATGAGTTCCTTGTTAAGCAAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACTTAGATTTTGTCAGAAGATGATGAGTTCCTTGTTAAGCAAGTG  150

seq1  GGATGGGGGCTGACATGTGTAAGCTCATTCTCCCATACATAAGGACACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGGGCTGACATGTGTAAGCTCATTCTCCCATACATAAGGACACAG  200

seq1  GCGCACAGAGGAGTCCAGAAAGCTGCAATTCAGGTATTAATAATTGTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCACAGAGGAGTCCAGAAAGCTGCAATTCAGGTATTAATAATTGTGTT  250

seq1  TTTGCATTGGCATATATGAGTTAAAACAAAAGTTTACATATCAGAATAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATTGGCATATATGAGTTAAAACAAAAGTTTACATATCAGAATAGA  300

seq1  TTCCTGCTGGTGTGGTTTCACTGGTACAGCACTTGTCTGGAAAGTGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCTGGTGTGGTTTCACTGGTACAGCACTTGTCTGGAAAGTGTGAG  350

seq1  GCCCTGGGTTCAAATACTCAGCAACAAAGATAAGACAAAATGGCAACCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGGGTTCAAATACTCAGCAACAAAGATAAGACAAAATGGCAACCTA  400

seq1  CAGATTGTAAAAAGAACTTTACCAACCCTACATTCTATAGAGTCCTAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTGTAAAAAGAACTTTACCAACCCTACATTCTATAGAGTCCTAGTA  450

seq1  TCCAAGGAACTCAAGAAGTTAGACTCCAGAGAACCAAATAACCCTATTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGGAACTCAAGAAGTTAGACTCCAGAGAACCAAATAACCCTATTTT  500

seq1  AAAATGGGGTACAGAGATGAACAAAGAATTC  531
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGGGTACAGAGATGAACAAAGAATTC  531