BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-131M13
Chromosome10 (Build37)
Map Location 75,115,671 - 75,283,847
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCabin1, Ddt, Gstt3, Gstt1, Gstt4
Upstream geneEG630453, EG623346, Gnaz, LOC100040057, Rab36, Bcr, Specc1l, LOC100040670, Adora2a, EG544707, Upb1, 1110038D17Rik, Snrpd3, AI646023, Ggt1, Ggtla1, Susd2
Downstream geneGstt2, Mif, Derl3, Smarcb1, Mmp11, Ndg2, Gm867, Vpreb3, EG333669, Suhw2, Slc5a4b, Slc5a4a, LOC100040150, Prmt2, S100b, Dip2a, Pcnt, 2610028H24Rik, A130042E20Rik, Mcm3ap, Lss, 1700027D21Rik, Ftcd, Col6a2, Col6a1, Pcbp3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-131M13.bB6Ng01-131M13.g
ACCDH932754DH932755
length1,0821,038
definitionDH932754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131M13, 5' end.DH932755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-131M13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,282,772 - 75,283,847)(75,115,671 - 75,116,718)
sequence
gaattcactgtgtagacaaaactcaaaagagatccatctgtctctttgtc
ctgattattaggattaaaggtttgcaacatcaggctagtctatttattta
ttttggtctatggaaaaatttatgtgtacatgcagacacatacacagtgc
atccatttatgtacacacacacacacacacacacacacacagagcacatt
catttacacacacacatacacacacaaacacagcaatccatttacacaca
cacacaaacacagcacaaccctttacacacacacagcacattcatttaca
cacacacacacacacacataaacatagcacatccatttacacacacgcag
cacaaccatttacacacacacacagcatagccatctcaagcttctgcagc
tagtccactctaccccattttcacctctacaccttgctcctctttctctc
aaacaccccatcactttacctatggacattctatgaagcaatgaagactc
tgaaacacacatcactcaatactattatgacagcaaataaacttatctgc
cttttccagattccagtctgtagtcggcttgccttcaagtctctgatcgc
atcataaatattttcctgccccccccacacacatttattttacgtgtgtg
ggtatttttcctgcatgcatgtatgtgcatcgtgtgcctgcctggtgact
gggatgttagtagagctcataagatctggaaacggagtcatgaatagttg
tgaatcaccgtgtggtgccaggaaccataccagggtcctctgtgagagcc
acaagtgctcttaagcattgagcgaccgctctagcccctctttaactgtg
ttccctgtcctagtctggtttggcttgctttgattgaatatggtggtgtg
ggtgactgtaagagcccggggctgactttagttcatggttctagaggctg
caagcccatcagagtggaactgacaccttgcttagcatctcctttcccct
ctgggtcctagcaccacagaagattaacaacatggttgagtcatcaggtg
gattcaagctggtttgttgttataacaaagcc
gaattccaggatctgtggataggtctgggatagaggctgaagctgaggga
gggcaggtgatgacagtagccaatacaggcttgaggtgggagtcactggg
cctctggagagcatcaggtgctgtggggtcaggtaccgtggggaccactg
ttgcagggaagaaattctctctgctgtccttggggtgcttgggggtagtg
ggcgtatctcctgaggcctgtgaagacaaaggcaaagtgaggaaagtcaa
tggggtactatactgccccgtgctagccaattcaggcgcataggtgtgac
acttcatctggaccctggatgccaacatcatatcttgcctcattctgagc
tctctggcatagccaacacgagccacagtctaccagcacgagccacagtc
taccagaacacaactgacacacaggcagagtccagctcctccctctcttg
aagacatccacccatactagcagggcctcagtaaagacctctggcttgtc
tccctgttccctcctcagtgccagcctgggaggaagctattcacttatgt
ctctatgtacgatgtagggccactagtgggcaagttccaagagaaaaatc
taactagtctattccctaaactttagactttcagtagggagaacacggag
cctacttcaaaacttgaggggagcctatagttagctttttcctagaagag
gcgaagcatgtggaaagatgaagagacagtaaatggctctctgagatgcc
tcaagggaaaagtggagctgtatgtggtggtaagaggacccagggtacac
catcccgtgcggcctggggagggagtggcagtcttgaggaccacttgcct
ggctctcttctactctggcttgtactccaggaggggacactgcctagcag
caggcagcctgaaatgtagggatcctatcctagcttcatctactccattt
cctggctggttctttcaaaggcaactggcagcattctgcccatgccatcc
aatggtctgttggcagctttggttagcttcctctctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_75282772_75283847
seq2: B6Ng01-131M13.b_44_1125 (reverse)

seq1  GGCTTTGTTAT-ACAACAAACACGCTCTGACT-CACTTGATGGCTC-ACC  47
      ||||||||||| |||||||||  ||| ||| | ||| ||||| ||| |||
seq2  GGCTTTGTTATAACAACAAACCAGCT-TGAATCCACCTGATGACTCAACC  49

seq1  ATGTTG-TAATC-TCTGTGTTGCTAGGACCC--AGGGGGAAGGAGATGCT  93
      |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||
seq2  ATGTTGTTAATCTTCTGTGGTGCTAGGACCCAGAGGGGAAAGGAGATGCT  99

seq1  AAGC-AGGTGTCAGTTCCACTCTGATGGGCTTTGCAGCCTCTAGAACCAT  142
      |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGGTGTCAGTTCCACTCTGATGGGC-TTGCAGCCTCTAGAACCAT  148

seq1  GAACTAAAGTCAGCCCC-GGCTCTTTACAGTCACCCACACCACCATATTC  191
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAAAGTCAGCCCCGGGCTC-TTACAGTCACCCACACCACCATATTC  197

seq1  AATCAAAGCAAGCCAAAACAGACTAGGACAGGGAACACAGTTAAAGAGGG  241
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAAGCAAGCCAAACCAGACTAGGACAGGGAACACAGTTAAAGAGGG  247

seq1  GCTAGAGCGGTCGCTCAATGCTTAAGAGCACTTGTGGCTCTCACAGAGGA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGCGGTCGCTCAATGCTTAAGAGCACTTGTGGCTCTCACAGAGGA  297

seq1  CCCTGGTATGGTTCCTGGCACCACACGGTGATTCACAACTATTCATGACT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGTATGGTTCCTGGCACCACACGGTGATTCACAACTATTCATGACT  347

seq1  CCGTTTCCAGATCTTATGAGCTCTACTAACATCCCAGTCACCAGGCAGGC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTTCCAGATCTTATGAGCTCTACTAACATCCCAGTCACCAGGCAGGC  397

seq1  ACACGATGCACATACATGCATGCAGGAAAAATACCCACACACGTAAAATA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGATGCACATACATGCATGCAGGAAAAATACCCACACACGTAAAATA  447

seq1  AATGTGTGTGGGGGGGGCAGGAAAATATTTATGATGCGATCAGAGACTTG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGTGGGGGGGGCAGGAAAATATTTATGATGCGATCAGAGACTTG  497

seq1  AAGGCAAGCCGACTACAGACTGGAATCTGGAAAAGGCAGATAAGTTTATT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAGCCGACTACAGACTGGAATCTGGAAAAGGCAGATAAGTTTATT  547

seq1  TGCTGTCATAATAGTATTGAGTGATGTGTGTTTCAGAGTCTTCATTGCTT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCATAATAGTATTGAGTGATGTGTGTTTCAGAGTCTTCATTGCTT  597

seq1  CATAGAATGTCCATAGGTAAAGTGATGGGGTGTTTGAGAGAAAGAGGAGC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAATGTCCATAGGTAAAGTGATGGGGTGTTTGAGAGAAAGAGGAGC  647

seq1  AAGGTGTAGAGGTGAAAATGGGGTAGAGTGGACTAGCTGCAGAAGCTTGA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGTAGAGGTGAAAATGGGGTAGAGTGGACTAGCTGCAGAAGCTTGA  697

seq1  GATGGCTATGCTGTGTGTGTGTGTAAATGGTTGTGCTGCGTGTGTGTAAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTATGCTGTGTGTGTGTGTAAATGGTTGTGCTGCGTGTGTGTAAA  747

seq1  TGGATGTGCTATGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAATGAATGTGC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTGCTATGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAATGAATGTGC  797

seq1  TGTGTGTGTGTAAAGGGTTGTGCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTAAATGGAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTAAAGGGTTGTGCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTAAATGGAT  847

seq1  TGCTGTGTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTAAATGAATGTGCTCTGTGTG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTAAATGAATGTGCTCTGTGTG  897

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATAAATGGATGCACTGTGTATGTGT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATAAATGGATGCACTGTGTATGTGT  947

seq1  CTGCATGTACACATAAATTTTTCCATAGACCAAAATAAATAAATAGACTA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATGTACACATAAATTTTTCCATAGACCAAAATAAATAAATAGACTA  997

seq1  GCCTGATGTTGCAAACCTTTAATCCTAATAATCAGGACAAAGAGACAGAT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGATGTTGCAAACCTTTAATCCTAATAATCAGGACAAAGAGACAGAT  1047

seq1  GGATCTCTTTTGAGTTTTGTCTACACAGTGAATTC  1076
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTCTTTTGAGTTTTGTCTACACAGTGAATTC  1082

seq1: chr10_75115671_75116718
seq2: B6Ng01-131M13.g_72_1109

seq1  GAATTCCAGGATCTGTGGATAGGTCTGGGATAGAGGCTGAAGCTGAGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGATCTGTGGATAGGTCTGGGATAGAGGCTGAAGCTGAGGGA  50

seq1  GGGCAGGTGATGACAGTAGCCAATACAGGCTTGAGGTGGGAGTCACTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGGTGATGACAGTAGCCAATACAGGCTTGAGGTGGGAGTCACTGGG  100

seq1  CCTCTGGAGAGCATCAGGTGCTGTGGGGTCAGGTACCGTGGGGACCACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGAGAGCATCAGGTGCTGTGGGGTCAGGTACCGTGGGGACCACTG  150

seq1  TTGCAGGGAAGAAATTCTCTCTGCTGTCCTTGGGGTGCTTGGGGGTAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGGAAGAAATTCTCTCTGCTGTCCTTGGGGTGCTTGGGGGTAGTG  200

seq1  GGCGTATCTCCTGAGGCCTGTGAAGACAAAGGCAAAGTGAGGAAAGTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGTATCTCCTGAGGCCTGTGAAGACAAAGGCAAAGTGAGGAAAGTCAA  250

seq1  TGGGGTACTATACTGCCCCGTGCTAGCCAATTCAGGCGCATAGGTGTGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTACTATACTGCCCCGTGCTAGCCAATTCAGGCGCATAGGTGTGAC  300

seq1  ACTTCATCTGGACCCTGGATGCCAACATCATATCTTGCCTCATTCTGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCATCTGGACCCTGGATGCCAACATCATATCTTGCCTCATTCTGAGC  350

seq1  TCTCTGGCATAGCCAACACGAGCCACAGTCTACCAGCACGAGCCACAGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGCATAGCCAACACGAGCCACAGTCTACCAGCACGAGCCACAGTC  400

seq1  TACCAGAACACAACTGACACACAGGCAGAGTCCAGCTCCTCCCTCTCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGAACACAACTGACACACAGGCAGAGTCCAGCTCCTCCCTCTCTTG  450

seq1  AAGACATCCACCCATACTAGCAGGGCCTCAGTAAAGACCTCTGGCTTGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATCCACCCATACTAGCAGGGCCTCAGTAAAGACCTCTGGCTTGTC  500

seq1  TCCCTGTTCCCTCCTCAGTGCCAGCCTGGGAGGAAGCTATTCACTTATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTTCCCTCCTCAGTGCCAGCCTGGGAGGAAGCTATTCACTTATGT  550

seq1  CTCTATGTACGATGTAGGGCCACTAGTGGGCAAGTTCCAAGAGAAAAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGTACGATGTAGGGCCACTAGTGGGCAAGTTCCAAGAGAAAAATC  600

seq1  TAACTAGTCTATTCCCTAAACTTTAGACTTTCAGTAGGGAGAACACGGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGTCTATTCCCTAAACTTTAGACTTTCAGTAGGGAGAACACGGAG  650

seq1  CCTACTTCAAAACTTGAGGGGAGCCTATAGTTAGC-TTTTCCTAGAAGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCTACTTCAAAACTTGAGGGGAGCCTATAGTTAGCTTTTTCCTAGAAGAG  700

seq1  GCGAAGCATGTGGAAAGATGAAGAGACAGTAAATGGCTCTCTGAGATGCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAAGCATGTGGAAAGATGAAGAGACAGTAAATGGCTCTCTGAGATGCC  750

seq1  TCAAGGGAAAAGTGGAGCTGTATGTGGTGGTAAGAGGACCCAGGGTACAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGGAAAAGTGGAGCTGTATGTGGTGGTAAGAGGACCCAGGGTACAC  800

seq1  CATCCCGTGCGGCCTGGGGAGGGAGTGGCAGGTCTTGAGGACCACTTGCC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CATCCCGTGCGGCCTGGGGAGGGAGTGGCA-GTCTTGAGGACCACTTGCC  849

seq1  TGGCTCTCTTCTACTCTGGCTTTGTACTCCAGGAGGTGACACTGCCTAGC  899
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGCTCTCTTCTACTCTGGC-TTGTACTCCAGGAGGGGACACTGCCTAGC  898

seq1  AGCAGGCAGCCTGAAATGTAGGGATCCTATCCTAGCTTCATCTACTCCAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCAGCCTGAAATGTAGGGATCCTATCCTAGCTTCATCTACTCCAT  948

seq1  TTCCTTGCCTGGTTCTTTCGAGGGCCACTGGCAGCAGCTTCTGCCCATGC  999
      |||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||
seq2  TTCC-TGGCTGGTTCTTTCAAAGGCAACTGGCAGCA--TTCTGCCCATGC  995

seq1  ACTCCAGTGGTACTGTGTGCAGGTCTTTGGCTTTAGCTTCCTCCTCTAA  1048
        |||| |||| ||||  ||||  ||||||  |||||||||| ||||||
seq2  CATCCAATGGT-CTGTTGGCAG--CTTTGG--TTAGCTTCCT-CTCTAA  1038