BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133J24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 32,039,197 - 32,160,155
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcba1
Upstream geneHddc2, Tpd52l1, LOC100041294, Ibrdc1, LOC666055, LOC667752, LOC100040638
Downstream geneEG667761, Trdn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133J24.bB6Ng01-133J24.g
ACCDH934124DH934125
length6301,153
definitionDH934124|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133J24, 5' end.DH934125|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,159,526 - 32,160,155)(32,039,197 - 32,040,375)
sequence
gaattctcctaaaagcaaggccaggtgatgaatgaggcccattcgctctg
atcatgaagtactagagtctggttgtctaaacagctattcctgttcaact
gcatcagtctgtttccctctagggtgataattgctcagagctcattgtgg
ctcatttctttataatgcccataagagtgctttttcaagggaagaaattg
catattttagtgctgtgataaaatgcaagaaggcgtgctgctgtaatgta
gttggcctcatctgggcacagtatgagcatttgtatttatgacaggcatt
taacactttgtatatttgggaaatggtgaattcttcatatgttcatataa
gactttgtgaaacttccataacctgctaacaatagagtgcttatctgatt
ttgatttctaaaagggcttcatttggtgtgtgtctgtatatgtgtatgta
tatgtgtatgtttctttgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtgtttgtatgtg
tacgtacatgagcacacatatatggtcatagcagaggcccaaggacaact
ctcaggaataggttctctcctgtcaccctgacaggtctgaggtaaaactc
aggtcatcaggacaccaacctctgccaact
gaattccagtacagccaggactacacagagaaaccatgtctcaaacaaac
aaacaaacaaacaacaacaacaacaacaaaaagaaaagtctatgagacta
aggatgcagaaacattgctattagatttcactcaacattagaactttagc
tgatgatgcctgggcaacaatatgtaattacatctaatgttttctgtgtg
tttcagaagtagctggaagctacttctgtaaagctgtcatgttttaagat
attttgtagttgtttctaggatacatatgtaatttgttattaaatgttgc
catatgaaaaagccaggtaatagtacacccaattcaatctttggggaata
aaactgttctattttttaacaggcagaaagaagttaaaacctgccacaca
ctgggtaaaatcagaaatgagtggaataccaaaaaatggaatattagaac
aattgcatatttcttttcctataatgaatgaattattcatttaaagagat
ttcaatgtttgtacatatttatgctcaataaaatcagtgcttatatcaaa
ttttttttctataaccttatggcatacttttctcctttcctttttacctg
tattacggaaattttacttagattagtgtttcttcaataactaatactca
tctttaagcaagacatgactatacacacctctaatcccagacacaagaga
gacattcagaacaagggcaatatcacggcttgcctacatttgcaatgagt
tcaagactatcctgggtaataagaacacatgctccactatgttcatagca
gccttatttataatagccagaagctggaaagaactctgatgtccctcaac
agaagaatggatacagaaaatgtggaacattacataataaggtactactc
agctattaaaacaatgaatttataaattcctagcaaatggatagatctgg
agggtatcatcctgagtgaggtacccaatcaagaagaactcacatgatat
tgcactcactgataagtggatattagccagaaagttagaagtacccaaga
atacaattcgcaaacaatgactcagagaggaagaccaaggtgatacttgc
cctcttgaatggaacaaatatccatgcagagattagagacaaggtggagc
tga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_32159526_32160155
seq2: B6Ng01-133J24.b_48_677 (reverse)

seq1  AGTTGGCAGAGGCTGGTGTCCTGATGACCTGAGTTTTACCTCAGACCTGT  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGCAGAGGTTGGTGTCCTGATGACCTGAGTTTTACCTCAGACCTGT  50

seq1  CAGGGTGACAGGAGAGAACCTATTCCTGAGAGTTGTCCTTGGGCCTCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTGACAGGAGAGAACCTATTCCTGAGAGTTGTCCTTGGGCCTCTGC  100

seq1  TATGACCATATATGTGTGCTCATGTACGTACACATACAAACACACACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACCATATATGTGTGCTCATGTACGTACACATACAAACACACACACA  150

seq1  GACACATACACACAAAGAAACATACACATATACATACACATATACAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACATACACACAAAGAAACATACACATATACATACACATATACAGACA  200

seq1  CACACCAAATGAAGCCCTTTTAGAAATCAAAATCAGATAAGCACTCTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAAATGAAGCCCTTTTAGAAATCAAAATCAGATAAGCACTCTATT  250

seq1  GTTAGCAGGTTATGGAAGTTTCACAAAGTCTTATATGAACATATGAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCAGGTTATGGAAGTTTCACAAAGTCTTATATGAACATATGAAGAA  300

seq1  TTCACCATTTCCCAAATATACAAAGTGTTAAATGCCTGTCATAAATACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCATTTCCCAAATATACAAAGTGTTAAATGCCTGTCATAAATACAA  350

seq1  ATGCTCATACTGTGCCCAGATGAGGCCAACTACATTACAGCAGCACGCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCATACTGTGCCCAGATGAGGCCAACTACATTACAGCAGCACGCCT  400

seq1  TCTTGCATTTTATCACAGCACTAAAATATGCAATTTCTTCCCTTGAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCATTTTATCACAGCACTAAAATATGCAATTTCTTCCCTTGAAAAA  450

seq1  GCACTCTTATGGGCATTATAAAGAAATGAGCCACAATGAGCTCTGAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCTTATGGGCATTATAAAGAAATGAGCCACAATGAGCTCTGAGCAA  500

seq1  TTATCACCCTAGAGGGAAACAGACTGATGCAGTTGAACAGGAATAGCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCACCCTAGAGGGAAACAGACTGATGCAGTTGAACAGGAATAGCTGT  550

seq1  TTAGACAACCAGACTCTAGTACTTCATGATCAGAGCGAATGGGCCTCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACAACCAGACTCTAGTACTTCATGATCAGAGCGAATGGGCCTCATT  600

seq1  CATCACCTGGCCTTGCTTTTAGGAGAATTC  630
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCTGGCCTTGCTTTTAGGAGAATTC  630

seq1: chr10_32039197_32040375
seq2: B6Ng01-133J24.g_62_1214

seq1  GAATTCCAGTACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCATGTCTCAAACAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCATGTCTCAAACAAAC  50

seq1  AAACAAACAAACAACAACAACAACAACAAAAAGAAAAGTCTATGAGACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACAAACAACAACAACAACAACAAAAAGAAAAGTCTATGAGACTA  100

seq1  AGGATGCAGAAACATTGCTATTAGATTTCACTCAACATTAGAACTTTAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCAGAAACATTGCTATTAGATTTCACTCAACATTAGAACTTTAGC  150

seq1  TGATGATGCCTGGGCAACAATATGTAATTACATCTAATGTTTTCTGTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATGCCTGGGCAACAATATGTAATTACATCTAATGTTTTCTGTGTG  200

seq1  TTTCAGAAGTAGCTGGAAGCTACTTCTGTAAAGCTGTCATGTTTTAAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAAGTAGCTGGAAGCTACTTCTGTAAAGCTGTCATGTTTTAAGAT  250

seq1  ATTTTGTAGTTGTTTCTAGGATACATATGTAATTTGTTATTAAATGTTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTAGTTGTTTCTAGGATACATATGTAATTTGTTATTAAATGTTGC  300

seq1  CATATGAAAAAGCCAGGTAATAGTACACCCAATTCAATCTTTGGGGAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGAAAAAGCCAGGTAATAGTACACCCAATTCAATCTTTGGGGAATA  350

seq1  AAACTGTTCTATTTTTTAACAGGCAGAAAGAAGTTAAAACCTGCCACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTTCTATTTTTTAACAGGCAGAAAGAAGTTAAAACCTGCCACACA  400

seq1  CTGGGTAAAATCAGAAATGAGTGGAATACCAAAAAATGGAATATTAGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTAAAATCAGAAATGAGTGGAATACCAAAAAATGGAATATTAGAAC  450

seq1  AATTGCATATTTCTTTTCCTATAATGAATGAATTATTCATTTAAAGAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCATATTTCTTTTCCTATAATGAATGAATTATTCATTTAAAGAGAT  500

seq1  TTCAATGTTTGTACATATTTATGCTCAATAAAATCAGTGCTTATATCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGTTTGTACATATTTATGCTCAATAAAATCAGTGCTTATATCAAA  550

seq1  TTTTTTTTCTATAACCTTATGGCATACTTTTCTCCTTTCCTTTTTACCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTATAACCTTATGGCATACTTTTCTCCTTTCCTTTTTACCTG  600

seq1  TATTACGGAAATTTTACTTAGATTAGTGTTTCTTCAATAACTAATACTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACGGAAATTTTACTTAGATTAGTGTTTCTTCAATAACTAATACTCA  650

seq1  TCTTTAAGCAAGACATGACTATACACACCTCTAATCCCAGACACAAGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGCAAGACATGACTATACACACCTCTAATCCCAGACACAAGAGA  700

seq1  GACATTCAGAACAAGGGCAATATCACGGCTTGCCTACATTTGCAATGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTCAGAACAAGGGCAATATCACGGCTTGCCTACATTTGCAATGAGT  750

seq1  TCAAGACTATCCTGGGTAATAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGACTATCCTGGGTAATAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA  800

seq1  GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACTCTGATGTCCCTCAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACTCTGATGTCCCTCAAC  850

seq1  AGAAGAATGGATACAGAAAATGTGGAACATTACATAATAAGGTACTACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATGGATACAGAAAATGTGGAACATTACATAATAAGGTACTACTC  900

seq1  AGCTATTAAAAACAATGAATTTATAAAATTCCTAGGCAAATGGATAGATC  950
      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGCTATT-AAAACAATGAATTTAT-AAATTCCTA-GCAAATGGATAGATC  947

seq1  TGGAGGGTATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCAAAGAAGAACTCACAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  TGGAGGGTATCATCCTGAGTGAGGT-ACCCAATC-AAGAAGAACTCACAT  995

seq1  GATA-TGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAAGTTAG-AGTAC  1048
      |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
seq2  GATATTGCACTCACTGATAAGTGGATATTAG-CCAGAAAGTTAGAAGTAC  1044

seq1  CCAAG-ATACAATTCGCAAAACACATGAAACTCAAGAAGAAGGAAGACCA  1097
      ||||| ||||||||||| ||||| |||  |||| |||   ||||||||||
seq2  CCAAGAATACAATTCGC-AAACA-ATG--ACTC-AGA--GAGGAAGACCA  1087

seq1  AAGTGTGAATACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAATACCCATGG  1147
      | |||   |||| ||||||  |||| ||||  ||||| ||||| ||||| 
seq2  AGGTG---ATAC-TTGCCC--TCTT-GAAT--GGAAC-AAATATCCATGC  1127

seq1  AAAGGAGTTATAGAGACAAAGTTTGGAGCTGA  1179
      |   ||| | ||||||||| |  |||||||||
seq2  A---GAGAT-TAGAGACAAGG--TGGAGCTGA  1153