BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136J16
Chromosome10 (Build37)
Map Location 23,858,919 - 23,990,429
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStx7, Moxd1
Upstream geneEya4, Rps12, 1110021L09Rik, Vnn3, Vnn1, Taar1, Taar2, Taar3, Taar4, Taar5, Taar6, Taar7a, Taar7b, Taar7c-ps, Taar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9
Downstream geneLOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136J16.bB6Ng01-136J16.g
ACCDH936336DH936337
length1,1451,084
definitionDH936336|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J16, 5' end.DH936337|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,858,919 - 23,860,065)(23,989,335 - 23,990,429)
sequence
gaattcctcaaatacttgacccaccttgagctcactcatgtttgtaaacc
actccttttaatggcaattggttttttactttaaagttttatttttatgt
gtgtgtgtaccattcaatccctcaatcccatttctagataattaatcaaa
tttaaaaaaaaaaaaccctcctgttgttaaaaaaatgaattctggtattt
atagacattttattgataacaagtgtaaactactagtagccatctggcaa
taataataagctatgtcatacccagacagtcagccagaaaagagcacagt
attgattcctacaacaatgtggaaacatcttaagtgcattgtgctaagta
aaacacgatagtctaagggtgagatcgtgtactccagctctgtactggtg
ccatgctgaggggtcagatccaccctcgcaccctgggcagcctcaggagt
agctttaataccttagggaacttgactcaggtcaaacttggatttgtggc
ttcgatacagaaaagcgtttctggctagctagtttgaaattgagctgagg
agtttagaaagaatatgaagaagcttaggggaggagaaaagtctcgcctg
agagcatgcgcagaggcttctggctgaaatcacagggtaagacatatcct
agtgcgggtgctcgttcctgtaggagctttgagactcactgtcttagtat
atcaccatgtagggggtcggggagctggttctcaagctatatctgaaaag
gtgcaaagaacaaagccccacccctttaacatgtgacgtctgtggatccc
gagattccttgtatggaattataatctgataaactaaacccaggaaccac
tagtgttgcacaagggtgttagtaccatcatctttctgtacatcgtgttt
ctggggagattcttagaaaacagcgcatttactgctaggaagggagagag
actttggtgcagttgttgattgtgctggatgcttgcttcattgatgctaa
atcaacatggttcctgggtaatgagtacctaattttcaggtgccaataaa
gtgcttgtcctttcttactgcttatcaggaacaagaagtaatccttacct
gtcgagttgaagagaaagcctatggttttaaaggaccgaaggaga
gaattcaggctgtgtaacatttgccactcatcttagccttccagtggaac
tcagtgcatcccctcagatgctccaggtcagtctcaagcacaaactggag
atttttagtctcaatagacttaacctggttttgtttcattgttgttatta
tttgtcttctgttatttttgttttgtttttctatttttccctaaacatgt
cacttccttttaaacaaaacaaatgcaatagtttgctagaatttaaatat
tcttaggctgtgagccataaaaattacattgaaaaatgggtctacttaca
aatgaaacataaaactcgttggtgatttattctatatttgggtattttcc
caggcatataaaagcaaaactacatttaactttgtaactcactctcctta
ggtgctcagagaaaaggcttccaatcttagaactatggtagagctctctt
cttggcagatgaagaagagatctgaagagatgataaactgagttataacc
atggttctaaggaagaacttgccataccctctgagctttgaaccatcagt
ttcttttagatgttattatgatcccaatgcctaacatcaaatgaatgagc
atgtgagcttcgtcctctgcagcagctctcatgaccctctgagccccttg
ccaaggtcattccccccagcagcagctgcctttcctcccaccctaccctg
tccaaatacccacggcagaactcctagctccagtgagccgatttctaaat
tctacagcagaccattccatttctccaaaggcagtgctggaagcacttgt
ctccccaggatgaaaatcaaagtctaatactcagtgcccaagaaaaatct
ggatgcagtcgtgcatgcccataacctaaggccagcaggaggattcccgg
gcttactggcctggcagtctggacaattactgagcactagtttaaagaga
gaccctgtctcaaaatcagatggagaaacatggacatccctgttgaagtt
tcactctaaatcacatgcttgtcacatggtgctcacatagcatggactca
atacacatgtgccacatatacatgggcctcatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_23858919_23860065
seq2: B6Ng01-136J16.b_43_1187

seq1  GAATTCCTCAAATACTTGACCCACCTTGAGCTCACTCATGTTTGTAAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAAATACTTGACCCACCTTGAGCTCACTCATGTTTGTAAACC  50

seq1  ACTCCTTTTAATGGCAATTGGTTTTTTACTTTAAAGTTTTATTTTTATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTTTAATGGCAATTGGTTTTTTACTTTAAAGTTTTATTTTTATGT  100

seq1  GTGTGTGTACCATTCAATCCCTCAATCCCATTTCTAGATAATTAATCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTACCATTCAATCCCTCAATCCCATTTCTAGATAATTAATCAAA  150

seq1  TTTAAAAAAAAAAAACCCTCCTGTTGTTAAAAAAATGAATTCTGGTATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAAAAAAAAACCCTCCTGTTGTTAAAAAAATGAATTCTGGTATTT  200

seq1  ATAGACATTTTATTGATAACAAGTGTAAACTACTAGTAGCCATCTGGCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACATTTTATTGATAACAAGTGTAAACTACTAGTAGCCATCTGGCAA  250

seq1  TAATAATAAGCTATGTCATACCCAGACAGTCAGCCAGAAAAGAGCACAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATAAGCTATGTCATACCCAGACAGTCAGCCAGAAAAGAGCACAGT  300

seq1  ATTGATTCCTACAACAATGTGGAAACATCTTAAGTGCATTGTGCTAAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTCCTACAACAATGTGGAAACATCTTAAGTGCATTGTGCTAAGTA  350

seq1  AAACACGATAGTCTAAGGGTGAGATCGTGTACTCCAGCTCTGTACTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACGATAGTCTAAGGGTGAGATCGTGTACTCCAGCTCTGTACTGGTG  400

seq1  CCATGCTGAGGGGTCAGATCCACCCTCGCACCCTGGGCAGCCTCAGGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTGAGGGGTCAGATCCACCCTCGCACCCTGGGCAGCCTCAGGAGT  450

seq1  AGCTTTAATACCTTAGGGAACTTGACTCAGGTCAAACTTGGATTTGTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTAATACCTTAGGGAACTTGACTCAGGTCAAACTTGGATTTGTGGC  500

seq1  TTCGATACAGAAAAGCGTTTCTGGCTAGCTAGTTTGAAATTGAGCTGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGATACAGAAAAGCGTTTCTGGCTAGCTAGTTTGAAATTGAGCTGAGG  550

seq1  AGTTTAGAAAGAATATGAAGAAGCTTAGGGGAGGAGAAAAGTCTCGCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAGAAAGAATATGAAGAAGCTTAGGGGAGGAGAAAAGTCTCGCCTG  600

seq1  AGAGCATGCGCAGAGGCTTCTGGCTGAAATCACAGGGTAAGACATATCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATGCGCAGAGGCTTCTGGCTGAAATCACAGGGTAAGACATATCCT  650

seq1  AGTGCGGGTGCTCGTTCCTGTAGGAGCTTTGAGACTCACTGTCTTAGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCGGGTGCTCGTTCCTGTAGGAGCTTTGAGACTCACTGTCTTAGTAT  700

seq1  ATCACCATGTAGGGGGTCGGGGAGCTGGTTCTCAAGCTATATCTGAAAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCATGTAGGGGGTCGGGGAGCTGGTTCTCAAGCTATATCTGAAAAG  750

seq1  GTGCAAAGAACAAAGCCCCACCCCTTTAACATGTGACGTCTGTGGATCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAAAGAACAAAGCCCCACCCCTTTAACATGTGACGTCTGTGGATCCC  800

seq1  GAGATTCCTTGTATGGAATTATAATCTGATAAACTAAACCCAGGAACCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTCCTTGTATGGAATTATAATCTGATAAACTAAACCCAGGAACCAC  850

seq1  TAGTGTTGCACAA-GGTGTTAGTACCATCATCTTTCTGTACATCGTGTTT  899
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTTGCACAAGGGTGTTAGTACCATCATCTTTCTGTACATCGTGTTT  900

seq1  CTGGGGAGATTCCTAGAAAACAGCGCATTTACTGCTAGGAAGGGAGAGAG  949
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGAGATTCTTAGAAAACAGCGCATTTACTGCTAGGAAGGGAGAGAG  950

seq1  ACTTT-GTGCAGTTGTTGATTGTGCTGGATGCTTGCTTCATTGATGCTAA  998
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGTGCAGTTGTTGATTGTGCTGGATGCTTGCTTCATTGATGCTAA  1000

seq1  ATTCAACATGGTTCCTGGGTAATGAGTACCTTATTTTCAAGTGCCCATAA  1048
      | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||
seq2  A-TCAACATGGTTCCTGGGTAATGAGTACCTAATTTTCAGGTGCCAATAA  1049

seq1  AGTGCCTTGT-CTTTCTATCTGCCTTATCAGGAAC-AGAAGATAT-CATA  1095
      |||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||  || | ||
seq2  AGTG-CTTGTCCTTTCTTACTG-CTTATCAGGAACAAGAAGTAATCCTTA  1097

seq1  CCTGTCCAGGTTAGAGGAGAAAGCATATTGGTTTAAAAGGAGCAGAAGGA  1145
      |||||| ||  | || |||||||| || |||||| |||||| | ||||||
seq2  CCTGTCGAG--TTGAAGAGAAAGCCTA-TGGTTTTAAAGGA-CCGAAGGA  1143

seq1  GA  1147
      ||
seq2  GA  1145

seq1: chr10_23989335_23990429
seq2: B6Ng01-136J16.g_67_1150 (reverse)

seq1  GTATGAGAGCACATGTATATGTGGGCACATGTGTATATGAGTCCATGTCT  50
      ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  GTATGAG-GCCCATGTATATGT-GGCACATGTGTAT-TGAGTCCATG-CT  46

seq1  ATGTGAGCA-CATGTGTACAAGCATGTGATTTTAGAAGTGAAACTTCAAC  99
      ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  ATGTGAGCACCATGTG-ACAAGCATGTGA-TTTAG-AGTGAAACTTCAAC  93

seq1  AGGGGATGTCCATTGTTTCTCCATCTGATTTTTGAGACAGGGTCTCTCTT  149
      | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  A-GGGATGTCCA-TGTTTCTCCATCTGA-TTTTGAGACAGGGTCTCTCTT  140

seq1  TAAACCTAGTGCTCAGTAATTTGTCCAGACTGCCAGGCCAGTAAGCCCGG  199
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAA-CTAGTGCTCAGTAA-TTGTCCAGACTGCCAGGCCAGTAAGCCCGG  188

seq1  GAATCCTCCTGCTGGCCTTAGGTTATGGGCATGCACGACTGCATCCAGAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTCCTGCTGGCCTTAGGTTATGGGCATGCACGACTGCATCCAGAT  238

seq1  TTTTCTTGGGCACTGAGTATTAGACTTTGATTTTCATCCTGGGGAGACAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTGGGCACTGAGTATTAGACTTTGATTTTCATCCTGGGGAGACAA  288

seq1  GTGCTTCCAGCACTGCCTTTGGAGAAATGGAATGGTCTGCTGTAGAATTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCCAGCACTGCCTTTGGAGAAATGGAATGGTCTGCTGTAGAATTT  338

seq1  AGAAATCGGCTCACTGGAGCTAGGAGTTCTGCCGTGGGTATTTGGACAGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCGGCTCACTGGAGCTAGGAGTTCTGCCGTGGGTATTTGGACAGG  388

seq1  GTAGGGTGGGAGGAAAGGCAGCTGCTGCTGGGGGGAATGACCTTGGCAAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGTGGGAGGAAAGGCAGCTGCTGCTGGGGGGAATGACCTTGGCAAG  438

seq1  GGGCTCAGAGGGTCATGAGAGCTGCTGCAGAGGACGAAGCTCACATGCTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCAGAGGGTCATGAGAGCTGCTGCAGAGGACGAAGCTCACATGCTC  488

seq1  ATTCATTTGATGTTAGGCATTGGGATCATAATAACATCTAAAAGAAACTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTGATGTTAGGCATTGGGATCATAATAACATCTAAAAGAAACTG  538

seq1  ATGGTTCAAAGCTCAGAGGGTATGGCAAGTTCTTCCTTAGAACCATGGTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTCAAAGCTCAGAGGGTATGGCAAGTTCTTCCTTAGAACCATGGTT  588

seq1  ATAACTCAGTTTATCATCTCTTCAGATCTCTTCTTCATCTGCCAAGAAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTCAGTTTATCATCTCTTCAGATCTCTTCTTCATCTGCCAAGAAGA  638

seq1  GAGCTCTACCATAGTTCTAAGATTGGAAGCCTTTTCTCTGAGCACCTAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTACCATAGTTCTAAGATTGGAAGCCTTTTCTCTGAGCACCTAAG  688

seq1  GAGAGTGAGTTACAAAGTTAAATGTAGTTTTGCTTTTATATGCCTGGGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTGAGTTACAAAGTTAAATGTAGTTTTGCTTTTATATGCCTGGGAA  738

seq1  AATACCCAAATATAGAATAAATCACCAACGAGTTTTATGTTTCATTTGTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCCAAATATAGAATAAATCACCAACGAGTTTTATGTTTCATTTGTA  788

seq1  AGTAGACCCATTTTTCAATGTAATTTTTATGGCTCACAGCCTAAGAATAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGACCCATTTTTCAATGTAATTTTTATGGCTCACAGCCTAAGAATAT  838

seq1  TTAAATTCTAGCAAACTATTGCATTTGTTTTGTTTAAAAGGAAGTGACAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTCTAGCAAACTATTGCATTTGTTTTGTTTAAAAGGAAGTGACAT  888

seq1  GTTTAGGGAAAAATAGAAAAACAAAACAAAAATAACAGAAGACAAATAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGGGAAAAATAGAAAAACAAAACAAAAATAACAGAAGACAAATAAT  938

seq1  AACAACAATGAAACAAAACCAGGTTAAGTCTATTGAGACTAAAAATCTCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAATGAAACAAAACCAGGTTAAGTCTATTGAGACTAAAAATCTCC  988

seq1  AGTTTGTGCTTGAGACTGACCTGGAGCATCTGAGGGGATGCACTGAGTTC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTGCTTGAGACTGACCTGGAGCATCTGAGGGGATGCACTGAGTTC  1038

seq1  CACTGGAAGGCTAAGATGAGTGGCAAATGTTACACAGCCTGAATTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAAGGCTAAGATGAGTGGCAAATGTTACACAGCCTGAATTC  1084