BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147C21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 23,831,326 - 23,957,885
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStx7, Moxd1
Upstream geneEya4, Rps12, 1110021L09Rik, Vnn3, Vnn1, Taar1, Taar2, Taar3, Taar4, Taar5, Taar6, Taar7a, Taar7b, Taar7c-ps, Taar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9
Downstream geneLOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147C21.bB6Ng01-147C21.g
ACCDH944131DH944132
length1,129527
definitionDH944131|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147C21, 5' end.DH944132|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147C21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,956,763 - 23,957,885)(23,831,326 - 23,831,858)
sequence
gaattcaaatatgggtaaaataacctacaggttgatattgataaaatgat
actgtataatacttgtgatattaaatttcccagcttgttttcactgtatc
ttatttctttcttgatagttaaaccaaatgatgccctggccactccctga
tctacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacctgcactgcacatgcaagaggagtaattactcaggcatcttcc
tgtagtacatgatggtctgagacctcaaataagtacaggagtgtggctca
cagtacacaggtactgccatggtagaatgctgaagctgttataacatttt
aattgtaccctctatgcattaagtgcatctattctaaatatcacgtaaat
agtgacaaataaaacttccaattaagatgaattacaagtgagtggctaga
gagatgctcaatcattaagtgtctgctgcccaagatgagggcctgggttt
ggatccttaacacctgtgaaaaaagccaggcatggtagtgtgcatttgta
actccaacaccatgagtggagaggggcagagataagcagctcccttacat
tcattggctagccagcccagcagaatcagtgagcattagagttagagtcg
gtgagagactcttaataacagttaacaaaataaaaaaggggagccgactc
aagatacctgatgtccatctctggcctctatacaaaacaccaccaccacc
acacacatccatactacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacaaacacattatatacatgtatactacacactcaccacat
actcatactacaagcacacgctcatatacactggtactacacacatactc
ataatacacactaacacaaacatgctcactcacacacccatactacacat
tacacacccactcacattacacacttatacaacacaaaggcacacactca
tacacactcatactacatactcacacgttgaaattacaccactaacataa
aaacactcactcaaaattcacatgtgcccaatctacacactatacaatac
cccccattacagcttttatacacacactc
tgagtcctcagtctttgaataaccgtcccccacttccctatgtccaaata
atgatgctcttgtgcaagagagcatgcttgcctttcctatccctctaccc
ttgagctcaaggatgacagctttcagtctcgacaatctcttaatccttgc
ccttaccatagaagcaagggctccagtaacacctccaagatccatattgt
tctttaatggtgctctttattcataggagagattagaattttgtaaagaa
atgttggtcccagcaatgggataaggagcagggaaaggaacaactgaagc
cacgtttgtgcagaggagacaatgtcaaagcattttataaggtcgctgct
gacagtgtgaataggcacccagtctacaaatctcaaatgccaaaataata
atggagaataaataattacaaatagtcagaaagaggactaaatgaggcca
tagtaattaagggtagatctgtatataaaataagtgatggaggaggagaa
agaggaagaagaggagggagagagagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_23956763_23957885
seq2: B6Ng01-147C21.b_43_1171 (reverse)

seq1  GAGTGTGTGTATAAACG-TGTAATGTGGGTGTATTGTAT-GTGTGTAGAT  48
      ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||
seq2  GAGTGTGTGTATAAAAGCTGTAATG-GGGGGTATTGTATAGTGTGTAGAT  49

seq1  TGGG--CATGTGAATTTGTGAGTGAGTGTGTTTATGTTAGT-GTGTAGTT  95
      ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
seq2  TGGGCACATGTGAATTT-TGAGTGAGTGTTTTTATGTTAGTGGTGTAATT  98

seq1  --CATGTGTGAGTATGTAGTATGAGTGTGTATGAGTGTGTGTCTTTGTG-  142
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 
seq2  TCAACGTGTGAGTATGTAGTATGAGTGTGTATGAGTGTGTGCCTTTGTGT  148

seq1  TGTATAAGTGTGTAATGTGAGTGGGTGTGTAATGTTGTAGTATGGGTGTG  192
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGTATAAGTGTGTAATGTGAGTGGGTGTGTAATG-TGTAGTATGGGTGTG  197

seq1  TGAGTGAGCATGTTTGTGTTAGTGTGTATTATGAGTATGTGTGTAGTACC  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGAGCATGTTTGTGTTAGTGTGTATTATGAGTATGTGTGTAGTACC  247

seq1  AGTGTATATGAGCGTGTGCTTGTAGTATGAGTATGTGGTGAGTGTGTAGT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATATGAGCGTGTGCTTGTAGTATGAGTATGTGGTGAGTGTGTAGT  297

seq1  ATACATGTATATAATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGTATATAATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  347

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTAGTATGGATGTGTGTGGTGGTGGTGGTG-TTTG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTAGTATGGATGTGTGTGGTGGTGGTGGTGTTTTG  397

seq1  TATAGAGGCCAGAGATGGACATCAGGTATCTTGAGTCGGCTCCCCTTTTT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAGGCCAGAGATGGACATCAGGTATCTTGAGTCGGCTCCCCTTTTT  447

seq1  TATTTTGTTAACTGTTATTAAGAGTCTCTCACCGACTCTAACTCTAATGC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGTTAACTGTTATTAAGAGTCTCTCACCGACTCTAACTCTAATGC  497

seq1  TCACTGATTCTGCTGGGCTGGCTAGCCAATGAATGTAAGGGAGCTGCTTA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGATTCTGCTGGGCTGGCTAGCCAATGAATGTAAGGGAGCTGCTTA  547

seq1  TCTCTGCCCCTCTCCACTCATGGTGTTGGAGTTACAAATGCACACTACCA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCCCCTCTCCACTCATGGTGTTGGAGTTACAAATGCACACTACCA  597

seq1  TGCCTGGCTTTTTTCACAGGTGTTAAGGATCCAAACCCAGGCCCTCATCT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGCTTTTTTCACAGGTGTTAAGGATCCAAACCCAGGCCCTCATCT  647

seq1  TGGGCAGCAGACACTTAATGATTGAGCATCTCTCTAGCCACTCACTTGTA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGCAGACACTTAATGATTGAGCATCTCTCTAGCCACTCACTTGTA  697

seq1  ATTCATCTTAATTGGAAGTTTTATTTGTCACTATTTACGTGATATTTAGA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCTTAATTGGAAGTTTTATTTGTCACTATTTACGTGATATTTAGA  747

seq1  ATAGATGCACTTAATGCATAGAGGGTACAATTAAAATGTTATAACAGCTT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGCACTTAATGCATAGAGGGTACAATTAAAATGTTATAACAGCTT  797

seq1  CAGCATTCTACCATGGCAGTACCTGTGTACTGTGAGCCACACTCCTGTAC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTCTACCATGGCAGTACCTGTGTACTGTGAGCCACACTCCTGTAC  847

seq1  TTATTTGAGGTCTCAGACCATCATGTACTACAGGAAGATGCCTGAGTAAT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGAGGTCTCAGACCATCATGTACTACAGGAAGATGCCTGAGTAAT  897

seq1  TACTCCTCTTGCATGTGCAGTGCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCTCTTGCATGTGCAGTGCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  947

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGATCAGGGAGTGGCCAGGGC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGATCAGGGAGTGGCCAGGGC  997

seq1  ATCATTTGGTTTAACTATCAAGAAAGAAATAAGATACAGTGAAAACAAGC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTGGTTTAACTATCAAGAAAGAAATAAGATACAGTGAAAACAAGC  1047

seq1  TGGGAAATTTAATATCACAAGTATTATACAGTATCATTTTATCAATATCA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAATTTAATATCACAAGTATTATACAGTATCATTTTATCAATATCA  1097

seq1  ACCTGTAGGTTATTTTACCCATATTTGAATTC  1123
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTAGGTTATTTTACCCATATTTGAATTC  1129

seq1: chr10_23831326_23831858
seq2: B6Ng01-147C21.g_68_600

seq1  GAATTCTGAGTCCTCAGTCTTTGAATAACCGTCCCCCACTTCCCTATGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGTCCTCAGTCTTTGAATAACCGTCCCCCACTTCCCTATGTC  50

seq1  CAAATAATGATGCTCTTGTGCAAGAGAGCATGCTTGCCTTTCCTATCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATGATGCTCTTGTGCAAGAGAGCATGCTTGCCTTTCCTATCCCT  100

seq1  CTACCCTTGAGCTCAAGGATGACAGCTTTCAGTCTCGACAATCTCTTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCTTGAGCTCAAGGATGACAGCTTTCAGTCTCGACAATCTCTTAAT  150

seq1  CCTTGCCCTTACCATAGAAGCAAGGGCTCCAGTAACACCTCCAAGATCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCCCTTACCATAGAAGCAAGGGCTCCAGTAACACCTCCAAGATCCA  200

seq1  TATTGTTCTTTAATGGTGCTCTTTATTCATAGGAGAGATTAGAATTTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTTCTTTAATGGTGCTCTTTATTCATAGGAGAGATTAGAATTTTGT  250

seq1  AAAGAAATGTTGGTCCCAGCAATGGGATAAGGAGCAGGGAAAGGAACAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAATGTTGGTCCCAGCAATGGGATAAGGAGCAGGGAAAGGAACAAC  300

seq1  TGAAGCCACGTTTGTGCAGAGGAGACAATGTCAAAGCATTTTATAAGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCACGTTTGTGCAGAGGAGACAATGTCAAAGCATTTTATAAGGTC  350

seq1  GCTGCTGACAGTGTGAATAGGCACCCAGTCTACAAATCTCAAATGCCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGACAGTGTGAATAGGCACCCAGTCTACAAATCTCAAATGCCAAA  400

seq1  ATAATAATGGAGAATAAATAATTACAAATAGTCAGAAAGAGGACTAAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATGGAGAATAAATAATTACAAATAGTCAGAAAGAGGACTAAATG  450

seq1  AGGCCATAGTAATTAAGGGTAGATCTGTATATAAAATAAGTGATGGAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATAGTAATTAAGGGTAGATCTGTATATAAAATAAGTGATGGAGGA  500

seq1  GGAGAAAGAGGAAGAAGAGGAGGGAGAGAGAGG  533
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAGAGGAAGAAGAGGAGGGAGAGAGAGG  533