BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151N02
Chromosome10 (Build37)
Map Location 26,844,300 - 26,947,106
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLama2
Upstream geneSamd3, L3mbtl3, LOC435208, LOC667572, LOC100040349, Arhgap18
Downstream geneLOC100040385, LOC100040961, LOC100040401, Ptprk
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151N02.bB6Ng01-151N02.g
ACCDH947543DH947544
length1,1051,135
definitionDH947543|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151N02, 5' end.DH947544|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151N02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,844,300 - 26,845,424)(26,945,945 - 26,947,106)
sequence
gaattcttccaaggattctgctctggagttggtcctctcagcatcttgtc
ctgtttgctcaccatctgctgtcactttggttgcctaatgatccatattt
aggaaaagcataattaatagagatgataaagttagagcaagataagctcc
ctctggctacattttctttcaaattttactttgagccaaatgcaatcgat
gaattattgatcagatgtactggcaatgacaccctgtgctcaagtataca
attaaactttatgactgtttccattaaatgaaaatcagaaagctgtattt
ggtcctgttaaagttccttttataggtgatggcacagaagtgttaaaaca
tagctatttagaagtatatcttcaaggttccgatgccaatgtctttaatg
gaatcctgagcctccacatgtggcagttttgtctggcttttattttctga
aactatgtggtatgcagcactgacctcttgagggaggaactggacatctg
tctcaataagcttgattctatggattcggtttagatcaatacgttaatta
aaatgcacagggggcagggagtacttagcatctcagtagtaaatgctatt
ttgtaacactccagcgatgccagtaaaacattcaggcagaattaatactt
gctttcccatatgacatcacaagaagtaagaacagaatcatacatcatga
tcaacaaaaggaaacggaagcccccagacagctctcccttccaatgcata
gcctaaaaggtactcatttgtgctcacattggttactccctggatgcaat
gggatagatttatgttcaatgcagatataacacagtcaaatacaaacaga
atggatgatgttaagtatttctttaaaaaaaaaacaaggtttcaatcaca
aaagcatgggcttaagctttgttctctatgcaatatgacttctctttgtt
caaaagatgctgcgaatctagtactgaatcaaagataaaaaggtgccttt
gcgtgatattcatgatgtcagtctcacctgtgtttgggggatgggcaaac
aatctttgggggtcaaatgatttttccaagggtgctaaggatcatcctgc
atgtc
gaattcatatttacatatagattcacacacagtcatttacaactataagt
atgtatataatatatatatatatatatatacagttataaataactccttg
tatatattccatgacaatttaatgttattttaaaacaaagctagttatag
ctgtacatgtgaattcatatttcatatggactcacacatagtcatgtatg
actaattataaatatatatatatacatacatgtaaataagtccttgcgca
tataatatgtgcttggctattgagaaaggctgtacagttcattccaacca
cagcttgcctttcttcccatctttgcccttagctcacctaatgtttgttg
tcatgggctgaaaaatctatgaaacagaatctttttgtctgttagtgatg
catgagccaaccagcattcagtggcataaggttagaatcacttgaactca
gtgatgaccttcccgttctcttcttgtgtctcacagcaatcagctccaca
tgtgggccagagtctgtgtggaggcgaccactctgcctgtctagactccc
agggatcattactgtccacattagtttcttgttcgcattttctttatatc
attgcatgtcatcttctcttgtgactgtgactacaattactctaggaaag
aaacaatgcccacttagcattgtttaaggagtgtggaagcatgtgtgcat
agggggatattttaagaagagattttacttgaatacaccatgacaagtaa
gcatgggagcttaaactcatggaattctcatcagcaaggttgaatgacag
gtagatatagctgaggagaggatcaaatgaagaccctgaagctatggatc
tcatgtaaattcccctggaaagtagtgtgcgaccttgaggaagtaaaatt
atgagtgtctcaaccagcacataggattctgataaattcactacattatg
ataaacagtactctggaagtagagtcagtcaatagatatatgtactgcta
tatctttctgaaaagtatgctctgtgtcagtgagcacatttgactttact
gctgtagcttactgacaaggaggtatttttttagaattgacattatttag
atgcttaagggccgaggctgtcgtcacctttgcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_26844300_26845424
seq2: B6Ng01-151N02.b_46_1150

seq1  GAATTCTTCCAAGGATTCTGCTCTGGAGTTGGTCCTCTCAGCATCTTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCAAGGATTCTGCTCTGGAGTTGGTCCTCTCAGCATCTTGTC  50

seq1  CTGTTTGCTCACCATCTGCTGTCACTTTGGTTGCCTAATGATCCATATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTGCTCACCATCTGCTGTCACTTTGGTTGCCTAATGATCCATATTT  100

seq1  AGGAAAAGCATAATTAATAGAGATGATAAAGTTAGAGCAAGATAAGCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAGCATAATTAATAGAGATGATAAAGTTAGAGCAAGATAAGCTCC  150

seq1  CTCTGGCTACATTTTCTTTCAAATTTTACTTTGAGCCAAATGCAATCGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCTACATTTTCTTTCAAATTTTACTTTGAGCCAAATGCAATCGAT  200

seq1  GAATTATTGATCAGATGTACTGGCAATGACACCCTGTGCTCAAGTATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATTGATCAGATGTACTGGCAATGACACCCTGTGCTCAAGTATACA  250

seq1  ATTAAACTTTATGACTGTTTCCATTAAATGAAAATCAGAAAGCTGTATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAACTTTATGACTGTTTCCATTAAATGAAAATCAGAAAGCTGTATTT  300

seq1  GGTCCTGTTAAAGTTCCTTTTATAGGTGATGGCACAGAAGTGTTAAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGTTAAAGTTCCTTTTATAGGTGATGGCACAGAAGTGTTAAAACA  350

seq1  TAGCTATTTAGAAGTATATCTTCAAGGTTCCGATGCCAATGTCTTTAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATTTAGAAGTATATCTTCAAGGTTCCGATGCCAATGTCTTTAATG  400

seq1  GAATCCTGAGCCTCCACATGTGGCAGTTTTGTCTGGCTTTTATTTTCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCTGAGCCTCCACATGTGGCAGTTTTGTCTGGCTTTTATTTTCTGA  450

seq1  AACTATGTGGTATGCAGCACTGACCTCTTGAGGGAGGAACTGGACATCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATGTGGTATGCAGCACTGACCTCTTGAGGGAGGAACTGGACATCTG  500

seq1  TCTCAATAAGCTTGATTCTATGGATTCGGTTTAGATCAATACGTTAATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAATAAGCTTGATTCTATGGATTCGGTTTAGATCAATACGTTAATTA  550

seq1  AAATGCACAGGGGGCAGGGAGTACTTAGCATCTCAGTAGTAAATGCTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCACAGGGGGCAGGGAGTACTTAGCATCTCAGTAGTAAATGCTATT  600

seq1  TTGTAACACTCCAGCGATGCCAGTAAAACATTCAGGCAGAATTAATACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAACACTCCAGCGATGCCAGTAAAACATTCAGGCAGAATTAATACTT  650

seq1  GCTTTCCCATATGACATCACAAGAAGTAAGAACAGAATCATACATCATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCCATATGACATCACAAGAAGTAAGAACAGAATCATACATCATGA  700

seq1  TCAACAAAAGGAAACGGAAGCCCCCAGACAGCTCTCCCTTCCAATGCATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAAAAGGAAACGGAAGCCCCCAGACAGCTCTCCCTTCCAATGCATA  750

seq1  GCCTAAAAGGTACTCATTTGTGCTCACATTGGTTACTCCCTGGATGCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAAAAGGTACTCATTTGTGCTCACATTGGTTACTCCCTGGATGCAAT  800

seq1  GGGATAGATTTATGTTCAATGCAGATATAACACAGTCAAATACAAACAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAGATTTATGTTCAATGCAGATATAACACAGTCAAATACAAACAGA  850

seq1  ATGGATGATGTTAAGTATTTCTTTAAAAAAAAAACAAGGTTTCAATCACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGATGTTAAGTATTTCTTTAAAAAAAAAACAAGGTTTCAATCACA  900

seq1  AAAGCATGGGCTTAAGCTTTGTTTCTCTATGCAATATGACTTCTCTTTTG  950
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAAGCATGGGCTTAAGCTTTG-TTCTCTATGCAATATGACTTCTC-TTTG  948

seq1  TTCAAAAGATGCTGCGAATCTAGTTACTGAATCAAAGAATAAAAAAGGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||
seq2  TTCAAAAGATGCTGCGAATCTAG-TACTGAATCAAAGA--TAAAAAGGTG  995

seq1  CCTTTGCGTGATATTCCATGATGTTCAGGTTCTCAACCTGTGTTTGGGGG  1050
      ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||
seq2  CCTTTGCGTGATATT-CATGATG-TCAG--TCTC-ACCTGTGTTT-GGGG  1039

seq1  GATGGGCCAAACAATCCTTTTGGGGGGTCAAATGATTTTTTTTCACAGGG  1100
      |||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||     || ||
seq2  GATGGG-CAAACAATC---TTTGGGGGTCAAATGATTTTT----CCAAGG  1081

seq1  GTTGCCTAAGATCATCCTGCATGTC  1125
      | |||  | ||||||||||||||||
seq2  G-TGCTAAGGATCATCCTGCATGTC  1105

seq1: chr10_26945945_26947106
seq2: B6Ng01-151N02.g_67_1201 (reverse)

seq1  TGGCAAAGGTGACTGACAAGACTTCTGACACCTTAAAACCATTTCTAAAA  50
      ||||||||||||| ||||   | || |   ||||  || ||  |||||| 
seq2  TGGCAAAGGTGAC-GACA--GCCTCGG--CCCTT--AAGCA--TCTAAA-  40

seq1  TAAATGTCAAATTCTTTAAAAAAATACTCTCTTGTCAGTTAAGCTAACAG  100
        |||||| |||||  |||||||||||   |||||||| |||||| ||||
seq2  -TAATGTC-AATTC--TAAAAAAATACCTCCTTGTCAG-TAAGCT-ACAG  84

seq1  CAGTAAAGTCAAATGTGCTCACTGACACAGAGCAATACTTTTTCAGGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||
seq2  CAGTAAAGTCAAATGTGCTCACTGACACAGAGC-ATAC-TTTTCA-GAAA  131

seq1  GATATTAAGCAGTAACAATATATTCTATTTGACTGACTCTTACCTTCCAG  200
      |||||  |||||||   ||||| |||| ||||||||||||   |||||||
seq2  GATAT--AGCAGTA--CATATA-TCTA-TTGACTGACTCT--ACTTCCAG  173

seq1  AGTACTGTTTATCATAATTGTAGTGAATTTTATCAGAATCCTATGTGCTG  250
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTGTTTATCATAA-TGTAGTGAA-TTTATCAGAATCCTATGTGCTG  221

seq1  GTTGAGACACTCATAATTTTACTTCCTCAAGGTCGCACACTACTTTCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGACACTCATAATTTTACTTCCTCAAGGTCGCACACTACTTTCCAG  271

seq1  GGGAATTTACATGAGATCCATAGCTTCAGGGTCTTCATTTGATCCTCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATTTACATGAGATCCATAGCTTCAGGGTCTTCATTTGATCCTCTCC  321

seq1  TCAGCTATATCTACCTGTCATTCAACCTTGCTGATGAGAATTCCATGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTATATCTACCTGTCATTCAACCTTGCTGATGAGAATTCCATGAGT  371

seq1  TTAAGCTCCCATGCTTACTTGTCATGGTGTATTCAAGTAAAATCTCTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCTCCCATGCTTACTTGTCATGGTGTATTCAAGTAAAATCTCTTCT  421

seq1  TAAAATATCCCCCTATGCACACATGCTTCCACACTCCTTAAACAATGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATCCCCCTATGCACACATGCTTCCACACTCCTTAAACAATGCTA  471

seq1  AGTGGGCATTGTTTCTTTCCTAGAGTAATTGTAGTCACAGTCACAAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGCATTGTTTCTTTCCTAGAGTAATTGTAGTCACAGTCACAAGAGA  521

seq1  AGATGACATGCAATGATATAAAGAAAATGCGAACAAGAAACTAATGTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACATGCAATGATATAAAGAAAATGCGAACAAGAAACTAATGTGGA  571

seq1  CAGTAATGATCCCTGGGAGTCTAGACAGGCAGAGTGGTCGCCTCCACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAATGATCCCTGGGAGTCTAGACAGGCAGAGTGGTCGCCTCCACACA  621

seq1  GACTCTGGCCCACATGTGGAGCTGATTGCTGTGAGACACAAGAAGAGAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGGCCCACATGTGGAGCTGATTGCTGTGAGACACAAGAAGAGAAC  671

seq1  GGGAAGGTCATCACTGAGTTCAAGTGATTCTAACCTTATGCCACTGAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGTCATCACTGAGTTCAAGTGATTCTAACCTTATGCCACTGAATG  721

seq1  CTGGTTGGCTCATGCATCACTAACAGACAAAAAGATTCTGTTTCATAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGGCTCATGCATCACTAACAGACAAAAAGATTCTGTTTCATAGAT  771

seq1  TTTTCAGCCCATGACAACAAACATTAGGTGAGCTAAGGGCAAAGATGGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGCCCATGACAACAAACATTAGGTGAGCTAAGGGCAAAGATGGGA  821

seq1  AGAAAGGCAAGCTGTGGTTGGAATGAACTGTACAGCCTTTCTCAATAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGCAAGCTGTGGTTGGAATGAACTGTACAGCCTTTCTCAATAGCC  871

seq1  AAGCACATATTATATGCGCAAGGACTTATTTACATGTATGTATATATATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACATATTATATGCGCAAGGACTTATTTACATGTATGTATATATATA  921

seq1  TATTTATAATTAGTCATACATGACTATGTGTGAGTCCATATGAAATATGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATAATTAGTCATACATGACTATGTGTGAGTCCATATGAAATATGA  971

seq1  ATTCACATGTACAGCTATAACTAGCTTTGTTTTAAAATAACATTAAATTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACATGTACAGCTATAACTAGCTTTGTTTTAAAATAACATTAAATTG  1021

seq1  TCATGGAATATATACAAGGAGTTATTTATAACTG--TATATATATATATA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  TCATGGAATATATACAAGGAGTTATTTATAACTGTATATATATATATATA  1071

seq1  TATATTATATACATACTTATAGTTGTAAATGACTGTGTGTGAATCTATAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTATATACATACTTATAGTTGTAAATGACTGTGTGTGAATCTATAT  1121

seq1  GTAAATATGAATTC  1162
      ||||||||||||||
seq2  GTAAATATGAATTC  1135