BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152B08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 82,473,309 - 82,608,028
singlet/doubletdoublet
Overlap geneChst11
Upstream geneLOC666571, AL117821, BC062115, 4933439G19Rik, BC024063, AU041133, LOC100042712, B230315N10Rik, LOC100042718, EG237412, LOC666611, Gm1553, LOC544716, 1190007I07Rik, Tdg, Glt8d2, Hcfc2, Nfyb, 1700028I16Rik, Txnrd1, Eid3, EG216185
Downstream geneSlc41a2, D10Wsu102e, LOC666748, Aldh1l2, A230046K03Rik, Appl2, 1500009L16Rik, LOC100041225, C230099D08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152B08.bB6Ng01-152B08.g
ACCDH947745DH947746
length1,0471,142
definitionDH947745|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152B08, 5' end.DH947746|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152B08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,473,309 - 82,474,361)(82,606,880 - 82,608,028)
sequence
gaattcactatgtagctcaggctggtctagaatttgcagtctacaaccac
agctagaatcttcctcagtggctaggtggacagacctgtaccaccatgcc
cagcaaccctttgattgatgccagagcctgtatcatgaagagcagggtcc
tgcatgggtagtctctgtctgcttagaaatggtcttatctttactgtatg
actcagagtcttcttttgacattttcaatatattgttacctttcatttaa
ttgtgagcgcgtgtgcgtgcatgtgtgtgcgtttgtctgttcaggtgaca
actttcaggagttggttatgtctttccactgtgtttgtcccagggaatga
atttaaggggtcagatttggcccctttacctgcagtgcctcctctctggc
cccggtttttatgttctttgtacgttattcttttatcattattttagtat
gttggaggctttttttgtgacagggtcagactgacctggaactcagtatg
tcgctcaggccttggtccttccaatgctataactacagatgtgtgtgcgc
ctgtgctcagctgagaacagcctatcttgttctattggcagctccttaaa
ctatcatttgtcttgactgcatggaggctgtgttgaataactgctctgca
ctgtgcaggcttgagttagggactctgtggggcacgtataacagaatgat
cctcagagtacagtgatacaggctgatgatcccactgtgtgggagacaag
gatccctggttcaaagccatccggggctacaaaataacaccaaacctcaa
agacaaacaaagctcctaaattggcttacaggtgcatttgtcagtggaaa
ttccagtccgtggcgaccagtctgagtcatggtcagtacagtctttcagg
gaattgcagacatatgggctcatcagtacagccatattttgatctgtttt
cggatcaaagtacactatgatatttctattcttcaaaattagtgagctgg
gtggtggtggagcacaatttgaaatcccaaccctctggaggaagagg
gaattctcactgttatggcaaaacaccccatcccatcgtcactgtcacag
gaaatccacatcatgtggggacaagggtgttctcctgccaaggagagaaa
caagctcaaggatgcagaggacgggcaaggtcacggctgagggagttgat
cccgcagtgtgccatctctagaagaattgggtgacggtgctcccacctcc
tcggtacacacctgagcaggccctccaggcttagtgctgaggttctcaga
cacaaagcagtgccagggagatttataaggaaccagcagtaatgccacaa
gtgctgtgagctagccagacactgtgccacaggctttgcccatgtctaca
gtttagtctcagaataccctacaacgggtacttacattagtgacctttct
gctcatggtgacaaaatgcctgctagaaagaactggagaggggaggagtg
tagctcatggtctgagggtatgtagtctgctgtggtgggagaacatggct
gtgaagctcctgcagggagtgaggggtctggagcaaagagctctagaaca
tgacctagctgcaactctcaaagtccatcctctggttccactgcctttca
agacagcataggcatcttggatacgtgttcaaacataggagcctttgggt
gacacttggcatggaaaccctaacaggactggtgggaacccactccacag
gaagggaaactgaggcacaaagaagtgagttgctcaaggacacagcttat
gagcaagagtccagtttcagagcctgcagctttcagcatggagttggccc
tccattcctcagagtggctgctctgtcactcactcattgacttgttgact
gactgactgactgactgactgactgactcactcactcattcactcactca
ctcacttactctttacccagcactcattgactcactgacttgatgagtcc
ctgctcatccatgtatcatcccctgaattctcacttcttgggtcctgagg
aaaagacacttaaaagccttctactaccaccttactgtgacatcaggttt
ggcataggcaagacacgtctacccgaagggagatggcgggaggccgcttg
tctgctggtgggggcttgggaccccaatcttaactaatacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_82473309_82474361
seq2: B6Ng01-152B08.b_44_1090

seq1  GAATTCACTATGTAGCTCAGGCTGGTCTAGAATTTGCAGTCTACAACCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATGTAGCTCAGGCTGGTCTAGAATTTGCAGTCTACAACCAC  50

seq1  AGCTAGAATCTTCCTCAGTGGCTAGGTGGACAGACCTGTACCACCATGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAATCTTCCTCAGTGGCTAGGTGGACAGACCTGTACCACCATGCC  100

seq1  CAGCAACCCTTTGATTGATGCCAGAGCCTGTATCATGAAGAGCAGGGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAACCCTTTGATTGATGCCAGAGCCTGTATCATGAAGAGCAGGGTCC  150

seq1  TGCATGGGTAGTCTCTGTCTGCTTAGAAATGGTCTTATCTTTACTGTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGGGTAGTCTCTGTCTGCTTAGAAATGGTCTTATCTTTACTGTATG  200

seq1  ACTCAGAGTCTTCTTTTGACATTTTCAATATATTGTTACCTTTCATTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAGTCTTCTTTTGACATTTTCAATATATTGTTACCTTTCATTTAA  250

seq1  TTGTGAGCGCGTGTGCGTGCATGTGTGTGCGTTTGTCTGTTCAGGTGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGCGCGTGTGCGTGCATGTGTGTGCGTTTGTCTGTTCAGGTGACA  300

seq1  ACTTTCAGGAGTTGGTTATGTCTTTCCACTGTGTTTGTCCCAGGGAATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAGGAGTTGGTTATGTCTTTCCACTGTGTTTGTCCCAGGGAATGA  350

seq1  ATTTAAGGGGTCAGATTTGGCCCCTTTACCTGCAGTGCCTCCTCTCTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGGGTCAGATTTGGCCCCTTTACCTGCAGTGCCTCCTCTCTGGC  400

seq1  CCCGGTTTTTATGTTCTTTGTACGTTATTCTTTTATCATTATTTTAGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGTTTTTATGTTCTTTGTACGTTATTCTTTTATCATTATTTTAGTAT  450

seq1  GTTGGAGGCTTTTTTTGTGACAGGGTCAGACTGACCTGGAACTCAGTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAGGCTTTTTTTGTGACAGGGTCAGACTGACCTGGAACTCAGTATG  500

seq1  TCGCTCAGGCCTTGGTCCTTCCAATGCTATAACTACAGATGTGTGTGCGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTCAGGCCTTGGTCCTTCCAATGCTATAACTACAGATGTGTGTGCGC  550

seq1  CTGTGCTCAGCTGAGAACAGCCTATCTTGTTCTATTGGCAGCTCCTTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTCAGCTGAGAACAGCCTATCTTGTTCTATTGGCAGCTCCTTAAA  600

seq1  CTATCATTTGTCTTGACTGCATGGAGGCTGTGTTGAATAACTGCTCTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCATTTGTCTTGACTGCATGGAGGCTGTGTTGAATAACTGCTCTGCA  650

seq1  CTGTGCAGGCTTGAGTTAGGGACTCTGTGGGGCACGTATAACAGAATGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAGGCTTGAGTTAGGGACTCTGTGGGGCACGTATAACAGAATGAT  700

seq1  CCTCAGAGTACAGTGATACAGGCTGATGATCCCACTGTGTGGGAGACAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGAGTACAGTGATACAGGCTGATGATCCCACTGTGTGGGAGACAAG  750

seq1  GATCCCTGGTTCAAAGCCATCCGGGGCTACAAAATAACACCAAACCTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCTGGTTCAAAGCCATCCGGGGCTACAAAATAACACCAAACCTCAA  800

seq1  AGACAAACAAAGCTCCTAAATTGGCTTACAGGTGCATTTGTCAGTGGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAACAAAGCTCCTAAATTGGCTTACAGGTGCATTTGTCAGTGGAAA  850

seq1  TTCCAGTCCGTGGCGACCAGTCTGAGTCATGGTCAGTACAGTCTTTCAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTCCGTGGCGACCAGTCTGAGTCATGGTCAGTACAGTCTTTCAGG  900

seq1  GGAAATTGCAGACAATATGGGCTCATCAGTACAGCCCATATTTTGATCTG  950
      |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  G--AATTGCAGAC-ATATGGGCTCATCAGTACAG-CCATATTTTGATCTG  946

seq1  TTTCCGGATCAAAGTACACCTATGATAATTTCTATTCTTCAAAAATTAGT  1000
      ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTTCGGATCAAAGTACA-CTATGAT-ATTTCTATTCTTC-AAAATTAGT  993

seq1  GAGCTGGGTGGTGGTGGAGCAC-ACTTGAAATCCCAACCCTCTGGAGGCA  1049
      |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAGCTGGGTGGTGGTGGAGCACAATTTGAAATCCCAACCCTCTGGAGGAA  1043

seq1  GAGG  1053
      ||||
seq2  GAGG  1047

seq1: chr10_82606880_82608028
seq2: B6Ng01-152B08.g_67_1208 (reverse)

seq1  CTGTCTTAGTTAGAGCTGTGGGTCCCCAGGGCCCCACCAGCAGCAAGGCT  50
      |||| ||||||| || | ||||  |||| | ||||||||||||  | || 
seq2  CTGTATTAGTTA-AGAT-TGGGGTCCCAAGCCCCCACCAGCAGACAAGCG  48

seq1  GCCTCCTGCCCATCTCCCTCTGGGTGAGCTGGTCTTGCCTTGTGCAAACT  100
      |||||| | ||||||||||  ||||   |  |||||||||    ||||| 
seq2  GCCTCCCG-CCATCTCCCTTCGGGTAGACGTGTCTTGCCTATGCCAAACC  97

seq1  TGATGTCACTGTATGGTGTGAGTAGAAGGCTCTT-AGTGTCTTTATCCTC  149
      ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||
seq2  TGATGTCACAGTAAGGTGGTAGTAGAAGGCTTTTAAGTGTCTTT-TCCTC  146

seq1  AGGACCCAAGAAGTTGAGAATTCAGTGGATGAATACATGGATGAGCAGGG  199
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||
seq2  AGGACCCAAGAAG-TGAGAATTCAGGGGATG-ATACATGGATGAGCA-GG  193

seq1  GACTCATCAAGTCAGTGAGTCAATGAGTGCTGGGTAAATGAGTAAGTGAG  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GACTCATCAAGTCAGTGAGTCAATGAGTGCTGGGTAAA-GAGTAAGTGAG  242

seq1  TGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTC  299
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGAGTGAATGAGTGAGTGAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTC  292

seq1  AGTCAACAAGTCAATGAGTGAGTGACAGAGCAGCCACTCTGAGGAATGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAACAAGTCAATGAGTGAGTGACAGAGCAGCCACTCTGAGGAATGGA  342

seq1  GGGCCAACTCCATGCTGAAAGCTGCAGGCTCTGGAACTGGACTCTTGCTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGGCCAACTCCATGCTGAAAGCTGCAGGCTCTGAAACTGGACTCTTGCTC  392

seq1  CTAAGCTGTGTCCTTGAGCAACTCACTTCTTTGTGCCTCAGTTTCCCTTC  449
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTGTGTCCTTGAGCAACTCACTTCTTTGTGCCTCAGTTTCCCTTC  442

seq1  CTGTGGAGTGGGTTCCCACCAGTCCTGTTAGGGTTTCCATGCCAAGTGTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGAGTGGGTTCCCACCAGTCCTGTTAGGGTTTCCATGCCAAGTGTC  492

seq1  ACCCAAAGGCTCCTATGTTTGAACACGTATCCAAGATGCCTATGCTGTCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAAGGCTCCTATGTTTGAACACGTATCCAAGATGCCTATGCTGTCT  542

seq1  TGAAAGGCAGTGGAACCAGAGGATGGACTTTGAGAGTTGCAGCTAGGTCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGGCAGTGGAACCAGAGGATGGACTTTGAGAGTTGCAGCTAGGTCA  592

seq1  TGTTCTAGAGCTCTTTGCTCCAGACCCCTCACTCCCTGCAGGAGCTTCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTAGAGCTCTTTGCTCCAGACCCCTCACTCCCTGCAGGAGCTTCAC  642

seq1  AGCCATGTTCTCCCACCACAGCAGACTACATACCCTCAGACCATGAGCTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATGTTCTCCCACCACAGCAGACTACATACCCTCAGACCATGAGCTA  692

seq1  CACTCCTCCCCTCTCCAGTTCTTTCTAGCAGGCATTTTGTCACCATGAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTCCCCTCTCCAGTTCTTTCTAGCAGGCATTTTGTCACCATGAGC  742

seq1  AGAAAGGTCACTAATGTAAGTACCCGTTGTAGGGTATTCTGAGACTAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGTCACTAATGTAAGTACCCGTTGTAGGGTATTCTGAGACTAAAC  792

seq1  TGTAGACATGGGCAAAGCCTGTGGCACAGTGTCTGGCTAGCTCACAGCAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGACATGGGCAAAGCCTGTGGCACAGTGTCTGGCTAGCTCACAGCAC  842

seq1  TTGTGGCATTACTGCTGGTTCCTTATAAATCTCCCTGGCACTGCTTTGTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCATTACTGCTGGTTCCTTATAAATCTCCCTGGCACTGCTTTGTG  892

seq1  TCTGAGAACCTCAGCACTAAGCCTGGAGGGCCTGCTCAGGTGTGTACCGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAACCTCAGCACTAAGCCTGGAGGGCCTGCTCAGGTGTGTACCGA  942

seq1  GGAGGTGGGAGCACCGTCACCCAATTCTTCTAGAGATGGCACACTGCGGG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTGGGAGCACCGTCACCCAATTCTTCTAGAGATGGCACACTGCGGG  992

seq1  ATCAACTCCCTCAGCCGTGACCTTGCCCGTCCTCTGCATCCTTGAGCTTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACTCCCTCAGCCGTGACCTTGCCCGTCCTCTGCATCCTTGAGCTTG  1042

seq1  TTTCTCTCCTTGGCAGGAGAACACCCTTGTCCCCACATGATGTGGATTTC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTCCTTGGCAGGAGAACACCCTTGTCCCCACATGATGTGGATTTC  1092

seq1  CTGTGACAGTGACGATGGGATGGGGTGTTTTGCCATAACAGTGAGAATTC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACAGTGACGATGGGATGGGGTGTTTTGCCATAACAGTGAGAATTC  1142