BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152F14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 66,072,230 - 66,228,608
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene1700023F02Rik, 4930407I19Rik
Downstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2, Egr2, Gm237, LOC100040081
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152F14.bB6Ng01-152F14.g
ACCDH947945DH947946
length1,053947
definitionDH947945|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F14, 5' end.DH947946|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,227,551 - 66,228,608)(66,072,230 - 66,073,178)
sequence
gaattctttcctatttacttatgtgtgcatatgagcatgtacagtgtttg
catgtatgaaggccagaggacaacttacaggtatcacttctttctttctt
ccatgtgggtcctagggatccaacatagattgtcagggttgacagcaatt
gtccttacctctaagccacctcataggcccttttctttttctaaaatctt
tcttaaatttagtgttctggatctaatagagttgccctttgataatattt
gctttgttaaacaaaactagctctcttgattctttcaaggaggatggcaa
gggagaccaaggtgggtttttttttaaaatttatcctagtgttctttgca
gctagatagcttaaaaaaaaaaaaaaggaagggcagtggataactaatat
aaaatgtaggcttctctccctgccctctttctctctgtctttttcaagaa
aggctttcacatagcccagactggccttgatctactctgtagtggaagat
tggcttgaattcctgatctaaagtttccacctcctgatttccaggattat
aagtgttgccaccacaatcgtctacaaagacactagggaaggactaagtc
aggactctgtgcatgcatgacaagcattctaccaagtaagctccaaaatg
cagaatatattaaaccattttctgttgcctctgtgttcacagtcatggac
acaataccttgtagatgcaacagaaagagccccagagtttggtgtatata
tatgtttaggagaataatgtctttttggttaactgttcctttgatagaaa
gaagtgttcatcttttatatcttctgattaattttagtctgaagtctgtt
ttgtcagatcttaggatagctttgctccttggtcccatttgactggagga
cttttgttcaactctttattctaaagtgatacttatctttaagctaagat
ttttgtttcttgatccatttagtcagtctatgtccttgatcagagaatga
agccattgttatttgaaggtagtatgaatgggtttataattgtgataatt
ttg
gaattcagaacatctggctctcccattaaagaacccttcagatgaagccc
tggtttctttctatagacaatgcagggattatggggtctgggtccaccaa
gatcctcacagagaaacaaaccaggaagagacagatactaggagatgctc
tgcaggacattggttcatacagctgtgaaacccagttcagcaagtctgaa
gccctcatgaagccagcaagtgatacacaccgatactctcggcataggct
tgtgtagagccacctccagaaatccttcttctgggagcttccatctgact
ggatgggcctcacttaccttatccaagaaagtccttgactcagaggcaac
ttatccttactgttacctacacccactgtcttagtcagggtttctattcc
tgtacaaacatcacgaccaagaagcaagttggggagaaaagggtttattc
agcttacacttccacacttctgatcattaccaaaggaaatcaggactgga
actcaagcaggtcaggaagcaggagctgatgcagaagccatggagggatg
tcacttctggcttgcttcctctgacttgttcagcttgctttcttatagaa
cacaggactactagtccagggatggcaccacctacaatcggccctccccg
cttgatcactaattgagaaaatgccccacagctggatttcatggaggcac
ttccccaactgaagctcctttctctgtaataactccagcctatgtcaagt
tgacacacaaaacatgccagtacacccacaaatatctccacagcaacagc
tgggtaagtgagtgattggttggctagaaatgacagccttgcccagatgg
cacaaaatgaccatcatagacttcaggatggctcactttgcgactttgta
cccttaagaactagtagtatgtttgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_66227551_66228608
seq2: B6Ng01-152F14.b_46_1098 (reverse)

seq1  CAAAATTATCACAATTAATAAACCCATTTCAATACTACCTTCAAATAACA  50
      |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTATCACAATT-ATAAACCCATT--CATACTACCTTCAAATAACA  47

seq1  ATGGCCTCCATTCTCTGATCAAAGGACATAGACTGACTAAATGGATCAAG  100
      |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGG-CTTCATTCTCTGATC-AAGGACATAGACTGACTAAATGGATCAAG  95

seq1  AAACAAAAATCTTAGCTTTAAAGATAAGTATCACCTTAGAATAAAGAGTT  150
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAACAAAAATCTTAGC-TTAAAGATAAGTATCACTTTAGAATAAAGAGTT  144

seq1  GAACAAAAGTCCTCCAGTCAAATGGGACCAGGAAGC-AAGCTATCCTAAG  199
      |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||
seq2  GAACAAAAGTCCTCCAGTCAAATGGGACCAAGGAGCAAAGCTATCCTAAG  194

seq1  ATCTGACAAAACAGACTTCAGACTAAAATTAATCAGAAGATAT-AAAGAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATCTGACAAAACAGACTTCAGACTAAAATTAATCAGAAGATATAAAAGAT  244

seq1  GAACACTTCTTTCTAATCAAAGGAACAGTTAACCAAAAAGACATTATTCT  298
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACTTCTTTCT-ATCAAAGGAACAGTTAACCAAAAAGACATTATTCT  293

seq1  CCTAAACATATATATACACCAAACTCTGGGGCTCTTTCTGTTGCATCTAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACATATATATACACCAAACTCTGGGGCTCTTTCTGTTGCATCTAC  343

seq1  AAGGTATTGTGTCCATGACTGTGAACACAGAGGCAACAGAAAATGGTTTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATTGTGTCCATGACTGTGAACACAGAGGCAACAGAAAATGGTTTA  393

seq1  ATATATTCTGCATTTTGGAGCTTACTTGGTAGAATGCTTGTCATGCATGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTCTGCATTTTGGAGCTTACTTGGTAGAATGCTTGTCATGCATGC  443

seq1  ACAGAGTCCTGACTTAGTCCTTCCCTAGTGTCTTTGTAGACGATTGTGGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGTCCTGACTTAGTCCTTCCCTAGTGTCTTTGTAGACGATTGTGGT  493

seq1  GGCAACACTTATAATCCTGGAAATCAGGAGGTGGAAACTTTAGATCAGGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACACTTATAATCCTGGAAATCAGGAGGTGGAAACTTTAGATCAGGA  543

seq1  ATTCAAGCCAATCTTCCACTACAGAGTAGATCAAGGCCAGTCTGGGCTAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGCCAATCTTCCACTACAGAGTAGATCAAGGCCAGTCTGGGCTAT  593

seq1  GTGAAAGCCTTTCTTGAAAAAGACAGAGAGAAAGAGGGCAGGGAGAGAAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGCCTTTCTTGAAAAAGACAGAGAGAAAGAGGGCAGGGAGAGAAG  643

seq1  CCTACATTTTATATTAGTTATCCACTGCCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATTTTATATTAGTTATCCACTGCCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTAA  693

seq1  GCTATCTAGCTGCAAAGAACACTAGGATAAATTTTAAAAAAAAACCCACC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCTAGCTGCAAAGAACACTAGGATAAATTTTAAAAAAAAACCCACC  743

seq1  TTGGTCTCCCTTGCCATCCTCCTTGAAAGAATCAAGAGAGCTAGTTTTGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCTCCCTTGCCATCCTCCTTGAAAGAATCAAGAGAGCTAGTTTTGT  793

seq1  TTAACAAAGCAAATATTATCAAAGGGCAACTCTATTAGATCCAGAACACT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAAAGCAAATATTATCAAAGGGCAACTCTATTAGATCCAGAACACT  843

seq1  AAATTTAAGAAAGATTTTAGAAAAAGAAAAGGGCCTATGAGGTGGCTTAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTAAGAAAGATTTTAGAAAAAGAAAAGGGCCTATGAGGTGGCTTAG  893

seq1  AGGTAAGGACAATTGCTGTCAACCCTGACAATCTATGTTGGATCCCTAGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGGACAATTGCTGTCAACCCTGACAATCTATGTTGGATCCCTAGG  943

seq1  ACCCACATGGAAGAAAGAAAGAAGTGATACCTGTAAGTTGTCCTCTGGCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACATGGAAGAAAGAAAGAAGTGATACCTGTAAGTTGTCCTCTGGCC  993

seq1  TTCATACATGCAAACACTGTACATGCTCATATGCACACATAAGTAAATAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATACATGCAAACACTGTACATGCTCATATGCACACATAAGTAAATAG  1043

seq1  GAAAGAATTC  1058
      ||||||||||
seq2  GAAAGAATTC  1053

seq1: chr10_66072230_66073178
seq2: B6Ng01-152F14.g_71_1017

seq1  GAATTCAGAACATCTGGCTCTCCCATTAAAGAACCCTTCAGATGAAGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAACATCTGGCTCTCCCATTAAAGAACCCTTCAGATGAAGCCC  50

seq1  TGGTTTCTTTCTATAGACAATGCAGGGATTATGGGGTCTGGGTCCACCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCTTTCTATAGACAATGCAGGGATTATGGGGTCTGGGTCCACCAA  100

seq1  GATCCTCACAGAGAAACAAACCAGGAAGAGACAGATACTAGGAGATGCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTCACAGAGAAACAAACCAGGAAGAGACAGATACTAGGAGATGCTC  150

seq1  TGCAGGACATTGGTTCATACAGCTGTGAAACCCAGTTCAGCAAGTCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGACATTGGTTCATACAGCTGTGAAACCCAGTTCAGCAAGTCTGAA  200

seq1  GCCCTCATGAAGCCAGCAAGTGATACACACCGATACTCTCGGCATAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCATGAAGCCAGCAAGTGATACACACCGATACTCTCGGCATAGGCT  250

seq1  TGTGTAGAGCCACCTCCAGAAATCCTTCTTCTGGGAGCTTCCATCTGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGAGCCACCTCCAGAAATCCTTCTTCTGGGAGCTTCCATCTGACT  300

seq1  GGATGGGCCTCACTTACCTTATCCAAGAAAGTCCTTGACTCAGAGGCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGCCTCACTTACCTTATCCAAGAAAGTCCTTGACTCAGAGGCAAC  350

seq1  TTATCCTTACTGTTACCTACACCCACTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCTTACTGTTACCTACACCCACTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCC  400

seq1  TGTACAAACATCACGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGAAAAGGGTTTATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAAACATCACGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGAAAAGGGTTTATTC  450

seq1  AGCTTACACTTCCACACTTCTGATCATTACCAAAGGAAATCAGGACTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTACACTTCCACACTTCTGATCATTACCAAAGGAAATCAGGACTGGA  500

seq1  ACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGAAGCCATGGAGGGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGAAGCCATGGAGGGATG  550

seq1  TCACTTCTGGCTTGCTTCCTCTGACTTGTTCAGCTTGCTTTCTTATAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTCTGGCTTGCTTCCTCTGACTTGTTCAGCTTGCTTTCTTATAGAA  600

seq1  CACAGGACTACTAGTCCAGGGATGGCACCACCTACAATCGGCCCTCCCCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGACTACTAGTCCAGGGATGGCACCACCTACAATCGGCCCTCCCCG  650

seq1  CTTGATCACTAATTGAGAAAATGCCCCACAGCTGGATTTCATGGAGGCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATCACTAATTGAGAAAATGCCCCACAGCTGGATTTCATGGAGGCAC  700

seq1  TTCCCCAACTGAAGCTCCTTTCTCTGTAATAACTCCAGCCTATGTCAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAACTGAAGCTCCTTTCTCTGTAATAACTCCAGCCTATGTCAAGT  750

seq1  TGACACACAAAACATGCCAGTACACCCACAAAATATCTCCACAGCAACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGACACACAAAACATGCCAGTACACCCAC-AAATATCTCCACAGCAACAG  799

seq1  CTGGGTAAGTGAGTGATTGGTTGGCTAGAAATGACAGCCTTGCCCAGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTAAGTGAGTGATTGGTTGGCTAGAAATGACAGCCTTGCCCAGATG  849

seq1  GCACAAAATGACCATCATAGACTTCAGGATGGCTCACTTTGCGACTTTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAAATGACCATCATAGACTTCAGGATGGCTCACTTTGCGACTTTGT  899

seq1  ACCTTTAAGAACTAGTAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  949
      ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACCCTTAAGAACTAGTAGTATGTTTGTGTGTGTGT-TGTGTGTGTGTGT  947