BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152H07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 91,386,158 - 91,507,559
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAnks1b, Apaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
Downstream geneLOC100041799, LOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1, Gm872, 4930485B16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152H07.bB6Ng01-152H07.g
ACCDH948025DH948026
length1,1741,134
definitionDH948025|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152H07, 5' end.DH948026|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152H07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,386,158 - 91,387,330)(91,506,427 - 91,507,559)
sequence
gaattctctggaaaataaaaaattgatatccggaggaagcccttcccctc
caggctaattctctattgtacccctccctgagcaaatattcctgaatcta
atcacctttcatccttgcctcagcaacatctccttatgtaagctcggcat
atttagaatcccaacaagaaaaaggccagggcatttatagttgtgaccca
cacgatttaaagctagctgggagtctggcaaaacacagtggcatgctgaa
gttatttccagaacagcgggcgtctcttcaagcaaaccagctcaaagatg
tcaaactagccagcccatcttctcaagcacagttcttttaagactgagca
aatggtagggaaaaaatttaatcttctcatatatccaaattaattaacca
gcaagaatttattgcttgccacgagtcaggctataaaagagacctcatca
gtagcttggaatctggagttgaattttatgggtttgagacccagcttcat
tatttattggcagggagactttagcaagttacttaacttcctcatgctgt
gcctcagtttcctcttcaagaaactgttgataaaaattagacacacacca
tcaagctatcaatataattaatttagttcattcacaacaggtgctagtaa
atcacgtggtttctagtaagaggttataaatactagttcctattatagct
ctagcacctactccaactctcccatattgtcaatgtgagctaggaacaca
agctctcaagaatcttatgttcaaatgagagatatcaaagacatataaga
caagagaaataacatactatggaaagcacacatacaaatgtatgtgtatt
agccatgaatggaccaaatatacagttctcattggcatctatgtagatag
acaaggtttcaaggaactgcaggtgctcatgggtagactagttgtccata
tgaaggatcattattcagcaaatgttcatgaagtatttgagagactgtag
tcaaagtttgactcattaagctaaatctttaattatggaaaaaatatatt
agaatcagttatattttaatgcctaattgtaggaataaaaacctgttctg
attgtttctcatatgtttgtggtttggataaggttggtccgacctccttt
tatgggagtagaaattaggtagga
gaattcatgaacccagttttctcatgcaaaaaatgatggtattggatggc
cccacacacctttagcattgtatcaggttgaaccacacctgccatttgct
atggtaacagttaacattacttaattgcagcatctggcaggctacgacat
ccctgccattgtttcactcactgttagtcacataggcatgaaggtaaact
ggtcattccacaaacacagccttgaaaaatagcaattctagcagcttgcc
agggcctgagctgtgggctcaagatgggaacccacaaatgtcggtctttg
attaatgactattattcaaggcaataaaacttcaatggagaaaaaaatta
cagagactgtccacaaatttccccaacttctaccaactaataggaatatc
atcccagaggttctgagagaaatagttcaacatttaattgaaggcaagga
aatagcagtcagctaatgctgtcattggtgacatagttggcacgaagaaa
agctaactccttaattgtttcagatcagtttcgctcttgctttatgtttt
aaaagatgtcatttcaaagaaaaggtcatctcgtggcagaatttaccctt
taaaatcaagttgataatagcccattatagagagaaaggggtcaataatg
agaatttggaagatagttagttcttgtcacataagacgacagaagagccc
ttctgaaggaggaaaaaggtgttacatagaaaatcccattctgatatcct
cagagatgttgcatgggcttatagtcatagagatatctctgagtttcctt
ttttttttaaagggagttttatatgttttcatttaatacaggtttggaga
tattaaataaagacctgagagacctaagccagaatttattgttgaaaaat
taaactttatatccacacatgtcagaagaaagaggagcagaagtgttgct
ataatctataagtattgatggcttttctgatgggaagtgcaatagtgcac
ctttctgatgagcagacaaaaggaggaggaccctggttaggacagcctca
tccagatggccttcatcatttttcaaaggtccatctgaattttgcattga
aggaattttctatggatggctggtcacccataac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_91386158_91387330
seq2: B6Ng01-152H07.b_45_1218

seq1  GAATTCTCTGGAAAATAAAAAATTGATAT-TGGAGGAAGCCCTTCCCCTC  49
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGGAAAATAAAAAATTGATATCCGGAGGAAGCCCTTCCCCTC  50

seq1  CAGGCTAATTCTCTATTGTACCCCTCCCTGAGCAAATATTCCTGAATCTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTAATTCTCTATTGTACCCCTCCCTGAGCAAATATTCCTGAATCTA  100

seq1  ATCACCTTTCATCCTTGCCTCAGCAACATCTCCTTATGTAAGCTCGGCAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCTTTCATCCTTGCCTCAGCAACATCTCCTTATGTAAGCTCGGCAT  150

seq1  ATTTAGAATCCCAACAAGAAAAAGGCCAGGGCATTTATAGTTGTGACCCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGAATCCCAACAAGAAAAAGGCCAGGGCATTTATAGTTGTGACCCA  200

seq1  CACGATTTAAAGCTAGCTGGGAGTCTGGCAAAACACAGTGGCATGCTGAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGATTTAAAGCTAGCTGGGAGTCTGGCAAAACACAGTGGCATGCTGAA  250

seq1  GTTATTTCCAGAACAGCGGGCGTCTCTTCAAGCAAACCAGCTCAAAGATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTCCAGAACAGCGGGCGTCTCTTCAAGCAAACCAGCTCAAAGATG  300

seq1  TCAAACTAGCCAGCCCATCTTCTCAAGCACAGTTCTTTTAAGACTGAGCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACTAGCCAGCCCATCTTCTCAAGCACAGTTCTTTTAAGACTGAGCA  350

seq1  AATGGTAGGGAAAAAATTTAATCTTCTCATATATCCAAATTAATTAACCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTAGGGAAAAAATTTAATCTTCTCATATATCCAAATTAATTAACCA  400

seq1  GCAAGAATTTATTGCTTGCCACGAGTCAGGCTATAAAAGAGACCTCATCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAATTTATTGCTTGCCACGAGTCAGGCTATAAAAGAGACCTCATCA  450

seq1  GTAGCTTGGAATCTGGAGTTGAATTTTATGGGTTTGAGACCCAGCTTCAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTTGGAATCTGGAGTTGAATTTTATGGGTTTGAGACCCAGCTTCAT  500

seq1  TATTTATTGGCAGGGAGACTTTAGCAAGTTACTTAACTTCCTCATGCTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTGGCAGGGAGACTTTAGCAAGTTACTTAACTTCCTCATGCTGT  550

seq1  GCCTCAGTTTCCTCTTCAAGAAACTGTTGATAAAAATTAGACACACACCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAGTTTCCTCTTCAAGAAACTGTTGATAAAAATTAGACACACACCA  600

seq1  TCAAGCTATCAATATAATTAATTTAGTTCATTCACAACAGGTGCTAGTAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCTATCAATATAATTAATTTAGTTCATTCACAACAGGTGCTAGTAA  650

seq1  ATCACGTGGTTTCTAGTAAGAGGTTATAAATACTAGTTCCTATTATAGCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACGTGGTTTCTAGTAAGAGGTTATAAATACTAGTTCCTATTATAGCT  700

seq1  CTAGCACCTACTCCAACTCTCCCATATTGTCAATGTGAGCTAGGAACACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACCTACTCCAACTCTCCCATATTGTCAATGTGAGCTAGGAACACA  750

seq1  AGCTCTCAAGAATCTTATGTTCAAATGAGAGATATCAAAGACATATAAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTCAAGAATCTTATGTTCAAATGAGAGATATCAAAGACATATAAGA  800

seq1  CAAGAGAAATAACATACTATGGAAAGCACACATACAAATGTATGTGTATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGAAATAACATACTATGGAAAGCACACATACAAATGTATGTGTATT  850

seq1  AGCCATGAATGGACCAAATATACAGTTCTCATTGGCATCTATGTAGATAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATGAATGGACCAAATATACAGTTCTCATTGGCATCTATGTAGATAG  900

seq1  ACAAGGTTTCAAGGAACTGCAGGTGCTCATGGGTAGACTAGTTGTCCATA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTTTCAAGGAACTGCAGGTGCTCATGGGTAGACTAGTTGTCCATA  950

seq1  TGAAGGATCATTATTCAGCAAATGTTCATGAAGTATTTGAGAGACTGTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGATCATTATTCAGCAAATGTTCATGAAGTATTTGAGAGACTGTAG  1000

seq1  TCAAAGTTTGACTCATTAAGCTAAAATCTTTAATTATGGAAATAAATATA  1049
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TCAAAGTTTGACTCATTAAGCT-AAATCTTTAATTATGGAAA-AAATATA  1048

seq1  TTAGAATCAGTTATATTTTAATGCCTAATTGTAGGAATAAAAACCTGTCC  1099
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTAGAATCAGTTATATTTTAATGCCTAATTGTAGGAATAAAAACCTGTTC  1098

seq1  TGATTG-TTCTCATATGTTTGT-GTTTGGATAAAGGTTTGTACGAC--TC  1145
      |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||   |
seq2  TGATTGTTTCTCATATGTTTGTGGTTTGGAT-AAGGTTGGTCCGACCTCC  1147

seq1  TTTTATGGGAATGAGATTTTAGGTAGGA  1173
      |||||||||| | |||  ||||||||||
seq2  TTTTATGGGAGT-AGAAATTAGGTAGGA  1174

seq1: chr10_91506427_91507559
seq2: B6Ng01-152H07.g_66_1199 (reverse)

seq1  GTTATGGGTGA-CAGCATTCATTAGATAATATCATTCAATGCAAAATTCA  49
      ||||||||||| ||||  ||  |||| ||| || ||||||||||||||||
seq2  GTTATGGGTGACCAGCCATCCATAGAAAAT-TCCTTCAATGCAAAATTCA  49

seq1  GATGGACCTTTG-AAAATGATGAAGGCCATCTGGATGAAGGCTGTCCTAA  98
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GATGGACCTTTGAAAAATGATGAAGGCCATCTGGATG-AGGCTGTCCTAA  98

seq1  CCAGGTGTCTTCCTCCTTTGGTCTGCTCATTCAGAAAGGTGCACTATTGC  148
      ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCAGG-GTCCTCCTCCTTTTGTCTGCTCA-TCAGAAAGGTGCACTATTGC  146

seq1  ACTTCCCATCAG-AGAGCCATCAATACTTATAGATTATAGCAACACTTCT  197
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCATCAGAAAAGCCATCAATACTTATAGATTATAGCAACACTTCT  196

seq1  GCTCCTCTTTCTTCTGCCATGTGTGGATATAAAGTTTAATTTTTCAACAA  247
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTCTTTCTTCTGACATGTGTGGATATAAAGTTTAATTTTTCAACAA  246

seq1  TAAATTCTGGCTTAGGTCTCTCAGGTCTTTATTTAATATCTCCAAACCTG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTCTGGCTTAGGTCTCTCAGGTCTTTATTTAATATCTCCAAACCTG  296

seq1  TATT-AATG-AAACATATAAAACTCCCTTTAAAAAAAAAGGGAAACTCAG  345
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TATTAAATGAAAACATATAAAACTCCCTTTAAAAAAAAAAGGAAACTCAG  346

seq1  AGATATCTCTATGACTATAAGCCCATGCAACATCTCTGAGGATATCAGAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATCTCTATGACTATAAGCCCATGCAACATCTCTGAGGATATCAGAA  396

seq1  TGGGATTTTCTATGTAACACCTTTTTCCTCCTTCAGAAGGGCTCTTCTGT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTTTCTATGTAACACCTTTTTCCTCCTTCAGAAGGGCTCTTCTGT  446

seq1  CGTCTTATGTGACAAGAACTAACTATCTTCCAAATTCTCATTATTGACCC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTTATGTGACAAGAACTAACTATCTTCCAAATTCTCATTATTGACCC  496

seq1  CTTTCTCTCTATAATGGGCTATTATCAACTTGATTTTAAAGGGTAAATTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTCTATAATGGGCTATTATCAACTTGATTTTAAAGGGTAAATTC  546

seq1  TGCCACGAGATGACCTTTTCTTTGAAATGACATCTTTTAAAACATAAAGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACGAGATGACCTTTTCTTTGAAATGACATCTTTTAAAACATAAAGC  596

seq1  AAGAGCGAAACTGATCTGAAACAATTAAGGAGTTAGCTTTTCTTCGTGCC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCGAAACTGATCTGAAACAATTAAGGAGTTAGCTTTTCTTCGTGCC  646

seq1  AACTATGTCACCAATGACAGCATTAGCTGACTGCTATTTCCTTGCCTTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATGTCACCAATGACAGCATTAGCTGACTGCTATTTCCTTGCCTTCA  696

seq1  ATTAAATGTTGAACTATTTCTCTCAGAACCTCTGGGATGATATTCCTATT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATGTTGAACTATTTCTCTCAGAACCTCTGGGATGATATTCCTATT  746

seq1  AGTTGGTAGAAGTTGGGGAAATTTGTGGACAGTCTCTGTAATTTTTTTCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGTAGAAGTTGGGGAAATTTGTGGACAGTCTCTGTAATTTTTTTCT  796

seq1  CCATTGAAGTTTTATTGCCTTGAATAATAGTCATTAATCAAAGACCGACA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGAAGTTTTATTGCCTTGAATAATAGTCATTAATCAAAGACCGACA  846

seq1  TTTGTGGGTTCCCATCTTGAGCCCACAGCTCAGGCCCTGGCAAGCTGCTA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGGGTTCCCATCTTGAGCCCACAGCTCAGGCCCTGGCAAGCTGCTA  896

seq1  GAATTGCTATTTTTCAAGGCTGTGTTTGTGGAATGACCAGTTTACCTTCA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGCTATTTTTCAAGGCTGTGTTTGTGGAATGACCAGTTTACCTTCA  946

seq1  TGCCTATGTGACTAACAGTGAGTGAAACAATGGCAGGGATGTCGTAGCCT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTATGTGACTAACAGTGAGTGAAACAATGGCAGGGATGTCGTAGCCT  996

seq1  GCCAGATGCTGCAATTAAGTAATGTTAACTGTTACCATAGCAAATGGCAG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGATGCTGCAATTAAGTAATGTTAACTGTTACCATAGCAAATGGCAG  1046

seq1  GTGTGGTTCAACCTGATACAATGCTAAAGGTGTGTGGGGCCATCCAATAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGTTCAACCTGATACAATGCTAAAGGTGTGTGGGGCCATCCAATAC  1096

seq1  CATCATTTTTTGCATGAGAAAACTGGGTTCATGAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTTTTTGCATGAGAAAACTGGGTTCATGAATTC  1134