BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155G23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 17,967,103 - 18,131,424
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC627646, Nhsl1
Upstream geneCited2, Txlnb, LOC665321, Heca, 3110003A17Rik, Reps1, LOC100039660, Ccdc28a
Downstream geneHebp2, EG627729, D10Bwg1379e, EG237300, Perp, Tnfaip3, Tpi-rs5, EG637620, Olig3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155G23.bB6Ng01-155G23.g
ACCDH950219DH950220
length9891,151
definitionDH950219|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155G23, 5' end.DH950220|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155G23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(17,967,103 - 17,968,026)(18,130,266 - 18,131,424)
sequence
gaattcaggccctctgcaagagcgacaagcactcttaaatgctgaaccac
atctctagctccgatgcccacctttttatgtggatgctagaggatcaaac
tcgggttactgcgactgacacctttagtccccacagttagaacacagaag
cggatccctgtcagttcccagccaggctggtctacatagtgagttccaga
gcaatcagagttatacagtttgacctgtctcaaaagagaaacacactaaa
attgagtattgggcctgagatataatagctcggcagctaagagtacttgt
tgctcttgcaaggatcatgtacccacgtggtgggtcacaattttcaccca
ctgagctatgttcccactcaacaaaatgtagcatttactttagaaaatat
ggataacaaaaataaggaaattagagctgttaacaagggtagccagtcct
tcctgcttggttttagacctgttttaccaggcctaattttgtaaacatag
ttacaaaagattttgatgtagttaaaagttcataggtgaggatatcatag
ccgctaggagagatgttgcggtaaatctccaactccaataagcccgtgca
aagaacacacaactcagttatgatatttataagctacatgcctaaactgg
gcagataggccactatactactctatttcccagctatgagaggtctcttg
ctacttgtggctccttcatgccatgtggttccactccgtcttgctttcac
ctcctctttctccatcttcctatttctactctgtctcttcatctccccct
ccaccttcttctctcttccgctccaaaatttccagccccaactttccctt
ccactgcccaatcacaggctccaccctttattttgaccagttaaaatggg
gagaagggtcacctaaaatcacctgggtaggtgattcactcttgtctgag
gcagcttctctgaggaagcagattggcatcacatacaaa
gaattcatatatacatatatatatggaaaggagagatattcatttgagtt
cagaaagccctaaagtcccaggacagtgtcagatcccctgcagcgatagt
tacaggcagctgtgagccacctgacctaggtcatgggaatggaattcagg
ttctctgcaagagcagtagggattcttaacctctgagcccttccttcagc
cacacttcaggcaactttttaaaggtcatgtggtagaaagatacctactg
gtcacttctaatctcacaaatagagtcttccgagaaatcttaagctatta
ttttatcttagtttctggagtgtaagtaacaaagtcaaaggctatggctt
tttgcttgcagtgatgcatatcttcaaaagtagccatgcaaagccaagca
tggtgacgcatgtctttaatcctaacactcaggaggcaaaggcagatttc
tgtgagttcgaggccatgctggtctacataatgagttccaggacagccag
ggctatgtagagatactctgtctcaagaaataggtaaataagtacccacc
cacccccacccccaaagtaaccatgtaaaagcttgtattgtggcgttact
gagcagcctagagatacaagtaaaggggcctgctactttgcaaaatgaat
ggatgtgttattcaacttcctatccaccaaggatccagtgagttggctag
gcttcttaagaagtgttacctggtaacaatgggcaacagttacagccagt
ttatccttgaagcagctgggaactagcataaagaaggacctgcagagcca
ggctccccagtccctacagggcacaagcaaggtttatgttcctagtgacc
actggcctcatctccatccgtcaggctgaaggcacagagggaagaggaaa
ggacacagcttttcaaacatctatcaatcaaaagcctattcatgtctgag
agttagagatggaagtcaccgcaccctccatcataccagtagtcttaggt
gctttttcatctgtgaccttttctaaatgtcccccaccgcagtgctgcta
attcagtaggtacagattcagctttcttgcttattccatcgaaataaaaa
cctaacttgccatgaatttccttaggatggttccctctttgatctactag
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_17967103_17968026
seq2: B6Ng01-155G23.b_48_971

seq1  GAATTCAGGCCCTCTGCAAGAGCGACAAGCACTCTTAAATGCTGAACCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGCCCTCTGCAAGAGCGACAAGCACTCTTAAATGCTGAACCAC  50

seq1  ATCTCTAGCTCCGATGCCCACCTTTTTATGTGGATGCTAGAGGATCAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTAGCTCCGATGCCCACCTTTTTATGTGGATGCTAGAGGATCAAAC  100

seq1  TCGGGTTACTGCGACTGACACCTTTAGTCCCCACAGTTAGAACACAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGTTACTGCGACTGACACCTTTAGTCCCCACAGTTAGAACACAGAAG  150

seq1  CGGATCCCTGTCAGTTCCCAGCCAGGCTGGTCTACATAGTGAGTTCCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATCCCTGTCAGTTCCCAGCCAGGCTGGTCTACATAGTGAGTTCCAGA  200

seq1  GCAATCAGAGTTATACAGTTTGACCTGTCTCAAAAGAGAAACACACTAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCAGAGTTATACAGTTTGACCTGTCTCAAAAGAGAAACACACTAAA  250

seq1  ATTGAGTATTGGGCCTGAGATATAATAGCTCGGCAGCTAAGAGTACTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTATTGGGCCTGAGATATAATAGCTCGGCAGCTAAGAGTACTTGT  300

seq1  TGCTCTTGCAAGGATCATGTACCCACGTGGTGGGTCACAATTTTCACCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTGCAAGGATCATGTACCCACGTGGTGGGTCACAATTTTCACCCA  350

seq1  CTGAGCTATGTTCCCACTCAACAAAATGTAGCATTTACTTTAGAAAATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTATGTTCCCACTCAACAAAATGTAGCATTTACTTTAGAAAATAT  400

seq1  GGATAACAAAAATAAGGAAATTAGAGCTGTTAACAAGGGTAGCCAGTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAACAAAAATAAGGAAATTAGAGCTGTTAACAAGGGTAGCCAGTCCT  450

seq1  TCCTGCTTGGTTTTAGACCTGTTTTACCAGGCCTAATTTTGTAAACATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTTGGTTTTAGACCTGTTTTACCAGGCCTAATTTTGTAAACATAG  500

seq1  TTACAAAAGATTTTGATGTAGTTAAAAGTTCATAGGTGAGGATATCATAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAAGATTTTGATGTAGTTAAAAGTTCATAGGTGAGGATATCATAG  550

seq1  CCGCTAGGAGAGATGTTGCGGTAAATCTCCAACTCCAATAAGCCCGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTAGGAGAGATGTTGCGGTAAATCTCCAACTCCAATAAGCCCGTGCA  600

seq1  AAGAACACACAACTCAGTTATGATATTTATAAGCTACATGCCTAAACTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACACACAACTCAGTTATGATATTTATAAGCTACATGCCTAAACTGG  650

seq1  GCAGATAGGCCACTATACTACTCTATTTCCCAGCTATGAGAGGTCTCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATAGGCCACTATACTACTCTATTTCCCAGCTATGAGAGGTCTCTTG  700

seq1  CTACTTGTGGCTCCTTCATGCCATGTGGTTCCACTCCGTCTTGCTTTCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTGTGGCTCCTTCATGCCATGTGGTTCCACTCCGTCTTGCTTTCAC  750

seq1  CTCCTCTTTCTCCATCTTCCTATTTCTACTCTGTCTCTTCATCTCCCCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTTTCTCCATCTTCCTATTTCTACTCTGTCTCTTCATCTCCCCCT  800

seq1  CCACCTTCTTCTCTCTTCCGCTCCAAAATTTCCAGCCCCAACTTTCCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTTCTTCTCTCTTCCGCTCCAAAATTTCCAGCCCCAACTTTCCCTT  850

seq1  CCACTGCCCAATCACAGGCTCCACCCTTTATTTTGACCAGTTAAAATGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCCCAATCACAGGCTCCACCCTTTATTTTGACCAGTTAAAATGGG  900

seq1  GAGAAGGGTCACCTAAAATCACCT  924
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGGTCACCTAAAATCACCT  924

seq1: chr10_18130266_18131424
seq2: B6Ng01-155G23.g_69_1219 (reverse)

seq1  GCTAGTAGATCAAAAGAGGAACCATCTTTAAGGAAAATCAT-GCAAGGTT  49
      ||||||||||||||   |||||||||  |||||||| |||| |||||  |
seq2  GCTAGTAGATCAAAGAGGGAACCATC-CTAAGGAAATTCATGGCAAG--T  47

seq1  TGGGTTTTTATTCTGAT-GAAT-AGCAAAGAAGCTGAATCTGTA-CTACT  96
      | ||||||||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| 
seq2  TAGGTTTTTATTTCGATGGAATAAGCAAGAAAGCTGAATCTGTACCTAC-  96

seq1  TGAATTAGCAGCCACTGCGGTGGGTGACCACTAAGATAGGGTCACAGATG  146
      ||||||||||| |||||||||||| || || | ||| | |||||||||||
seq2  TGAATTAGCAG-CACTGCGGTGGGGGA-CATTTAGAAAAGGTCACAGATG  144

seq1  AAAAAGCACCTAAGACTTACTGGTATGATGGGAGTGTGCGGTGACTTCCA  196
      |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  AAAAAGCACCTAAGAC-TACTGGTATGAT-GGAGGGTGCGGTGACTTCCA  192

seq1  TCTCTAACTCTCAGAACATGAATAGGCTTTTGATTGATAGATGTTTTTGA  246
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||
seq2  TCTCTAACTCTCAG-ACATGAATAGGCTTTTGATTGATAGATG--TTTGA  239

seq1  AAAGCTGTTGTCCTTTCCTCTTCCCTCTGTGCCTTCAGCCCTGACGGATG  296
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAAGCTG-TGTCCTTTCCTCTTCCCTCTGTGCCTTCAG-CCTGACGGATG  287

seq1  GAGATG-GGCCAGTGGTCACTAGGAACATAAACCTTGCTTGTGCCCTGTA  345
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGAGGCCAGTGGTCACTAGGAACATAAACCTTGCTTGTGCCCTGTA  337

seq1  GGGACTGGGGAGCCTGGCTCTGCAGGTCCTTCTTTATGCTAGTTCCCAGC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTGGGGAGCCTGGCTCTGCAGGTCCTTCTTTATGCTAGTTCCCAGC  387

seq1  TGCTTCAAGGATAAACTGGCTGTAACTGTTGCCCATTGTTACCAGGTAAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCAAGGATAAACTGGCTGTAACTGTTGCCCATTGTTACCAGGTAAC  437

seq1  ACTTCTTAAGAAGCCTAGCCAACTCACTGGATCCTTGGTGGATAGGAAGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTTAAGAAGCCTAGCCAACTCACTGGATCCTTGGTGGATAGGAAGT  487

seq1  TGAATAACACATCCATTCATTTTGCAAAGTAGCAGGCCCCTTTACTTGTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAACACATCCATTCATTTTGCAAAGTAGCAGGCCCCTTTACTTGTA  537

seq1  TCTCTAGGCTGCTCAGTAACGCCACAATACAAGCTTTTACATGGTTACTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGGCTGCTCAGTAACGCCACAATACAAGCTTTTACATGGTTACTT  587

seq1  TGGGGGTGGGGGTGGGTGGGTACTTATTTACCTATTTCTTGAGACAGAGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTGGGGGTGGGTGGGTACTTATTTACCTATTTCTTGAGACAGAGT  637

seq1  ATCTCTACATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCATTATGTAGACCAGCATG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTACATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCATTATGTAGACCAGCATG  687

seq1  GCCTCGAACTCACAGAAATCTGCCTTTGCCTCCTGAGTGTTAGGATTAAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCGAACTCACAGAAATCTGCCTTTGCCTCCTGAGTGTTAGGATTAAA  737

seq1  GACATGCGTCACCATGCTTGGCTTTGCATGGCTACTTTTGAAGATATGCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCGTCACCATGCTTGGCTTTGCATGGCTACTTTTGAAGATATGCA  787

seq1  TCACTGCAAGCAAAAAGCCATAGCCTTTGACTTTGTTACTTACACTCCAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCAAGCAAAAAGCCATAGCCTTTGACTTTGTTACTTACACTCCAG  837

seq1  AAACTAAGATAAAATAATAGCTTAAGATTTCTCGGAAGACTCTATTTGTG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAGATAAAATAATAGCTTAAGATTTCTCGGAAGACTCTATTTGTG  887

seq1  AGATTAGAAGTGACCAGTAGGTATCTTTCTACCACATGACCTTTAAAAAG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAGAAGTGACCAGTAGGTATCTTTCTACCACATGACCTTTAAAAAG  937

seq1  TTGCCTGAAGTGTGGCTGAAGGAAGGGCTCAGAGGTTAAGAATCCCTACT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTGAAGTGTGGCTGAAGGAAGGGCTCAGAGGTTAAGAATCCCTACT  987

seq1  GCTCTTGCAGAGAACCTGAATTCCATTCCCATGACCTAGGTCAGGTGGCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGCAGAGAACCTGAATTCCATTCCCATGACCTAGGTCAGGTGGCT  1037

seq1  CACAGCTGCCTGTAACTATCGCTGCAGGGGATCTGACACTGTCCTGGGAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGCCTGTAACTATCGCTGCAGGGGATCTGACACTGTCCTGGGAC  1087

seq1  TTTAGGGCTTTCTGAACTCAAATGAATATCTCTCCTTTCCATATATATAT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGGCTTTCTGAACTCAAATGAATATCTCTCCTTTCCATATATATAT  1137

seq1  GTATATATGAATTC  1159
      ||||||||||||||
seq2  GTATATATGAATTC  1151