BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155H20
Chromosome10 (Build37)
Map Location 60,282,033 - 60,443,905
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUnc5b
Upstream geneCbara1, LOC664936, Dnajb12, Ddit4, D10Ertd641e, Ascc1, Spock2, Chst3, LOC100039080, Psap, Cdh23, 4632428N05Rik, Slc29a3
Downstream genePcbd1, Sgpl1, 1700021K02Rik, Adamts14, Prf1, EG237361, X99384, Nodal, Eif4ebp2, D830039M14Rik, Lrrc20, Npffr1, Ppa1, Sar1a, Tysnd1, Aifm2, H2afy2, LOC100039284, Col13a1, EG436164
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155H20.bB6Ng01-155H20.g
ACCDH950257DH950258
length1,034309
definitionDH950257|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155H20, 5' end.DH950258|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155H20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,442,871 - 60,443,905)(60,282,033 - 60,282,341)
sequence
gaattcaatggcccactgatgtcaggatgtcacacactcaaggctgggct
agagacccatgtaccccaccccagttcagtgctaagactctgactaggaa
gcaggggatgtgtccgtggctccttttctttcctgcttggctctatatga
actaaaggggcagctgtggactgattggtatttagtacctctaggagcca
ggctctgcccctctctgggaagctaggaagaggctctgggcatcagccct
ctgctggctctgtcaatccagggtcacagtagaagaaggctcatggaccc
tgtctggatgcctggtggatacactggtgtgtcaatgggtagaagatgcc
cccatcattcaccaggaaccagatacaaacatcgtccactacagatgcct
cctttggagcctatggaattctcaaggtagacaccagaagccgttccaat
gagggccttagcatcctctcagtcattcaatggaattctcccttgagcac
atgctcatagaaatcctgccctatcagaaatcaactccagcaaggacata
ctcctgctctaaagccttctatggctccccactgccccctacaaaaggat
tagtgggatcctggtcacacagggaagagaagtcatgttgagaaggtggg
ggtccgatgacttcataaaggatctttaatttttatttatttatttttta
acaagagatgaaactgaggctcagggttggataagccacccatggctaca
ctgctaggtcatgtctgagacaggagtcacaccaggtatttgtgtcagag
cccaagctctttaactctccagaaggaagaggtgtggggggatggtgtag
cattaaccaggtggctcccggggctgcagttgcagcagagaatggagtta
tcaggagtggatcctagccttgctcaaaggaccatgagctgccaggaaag
agaggcagtcttccactacgaaggcaacaaggcagattcttcacagctgc
ttgtggacatcagtaggtgcttactgaagccagc
cacaccagttagagaccctgtctccaaaagagatggatgattcatccctg
aggaatgacgccccagactgtcctctggcctccccacacatgtcagcttc
acacgcaggactacatacacaagccttggaaggtgtccagcaggatgcga
ttctcacactggcttattcaagtccagaggtcaccctcattgctctgtga
tgagactgttgtttaccgtccctaagatgaactgaggacagttctttcta
ttcctaaacacaagaattctctagaaagagccttggaaggaaagccgggg
ggggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_60442871_60443905
seq2: B6Ng01-155H20.b_47_1080 (reverse)

seq1  GCTGGCTTCAGTGAGCACCTACTGATGTCCACAGGCGGCTGTTGAGAATC  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||
seq2  GCTGGCTTCAGTAAGCACCTACTGATGTCCACAAGCAGCTGTGAAGAATC  50

seq1  TGCCTGTTTGCCTTCTGTAGTGG-AGACTGCCTTCTCCTTCCTGGCAGCT  99
      |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||
seq2  TGCCTTGTTGCCTTC-GTAGTGGAAGACTGCC-TCTCTTTCCTGGCAGCT  98

seq1  CATGGTCCTTTGGGCAAGGCTAGGATCCACCTCCTGATAACTCCATTCTC  149
      |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTCCTTTGAGCAAGGCTAGGATCCA-CTCCTGATAACTCCATTCTC  147

seq1  TGCTGCAACTGCAGCCCCGGGAGCCACCTGGTTAATGCTACACCAT-CCC  198
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGCTGCAACTGCAGCCCCGGGAGCCACCTGGTTAATGCTACACCATCCCC  197

seq1  CCACACCTCTTCCTTCTGGAGAGTTAAAGAGCTTGGGCTCTGACACAAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCTCTTCCTTCTGGAGAGTTAAAGAGCTTGGGCTCTGACACAAAT  247

seq1  ACCTGGTGTGACTCCTGTCTCAGACATGACCTAGCAGTGTAGCCATGGGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGTGTGACTCCTGTCTCAGACATGACCTAGCAGTGTAGCCATGGGT  297

seq1  GGCTTATCCAACCCTGAGCCTCAGTTTCATCTCTTGTTAAAAAATAAATA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTATCCAACCCTGAGCCTCAGTTTCATCTCTTGTTAAAAAATAAATA  347

seq1  AATAAAAATTAAAGATCCTTTATGAAGTCATCGGACCCCCACCTTCTCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAATTAAAGATCCTTTATGAAGTCATCGGACCCCCACCTTCTCAA  397

seq1  CATGACTTCTCTTCCCTGTGTGACCAGGATCCCACTAATCCTTTTGTAGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACTTCTCTTCCCTGTGTGACCAGGATCCCACTAATCCTTTTGTAGG  447

seq1  GGGCAGTGGGGAGCCATAGAAGGCTTTAGAGCAGGAGTATGTCCTTGCTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGTGGGGAGCCATAGAAGGCTTTAGAGCAGGAGTATGTCCTTGCTG  497

seq1  GAGTTGATTTCTGATAGGGCAGGATTTCTATGAGCATGTGCTCAAGGGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGATTTCTGATAGGGCAGGATTTCTATGAGCATGTGCTCAAGGGAG  547

seq1  AATTCCATTGAATGACTGAGAGGATGCTAAGGCCCTCATTGGAACGGCTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCATTGAATGACTGAGAGGATGCTAAGGCCCTCATTGGAACGGCTT  597

seq1  CTGGTGTCTACCTTGAGAATTCCATAGGCTCCAAAGGAGGCATCTGTAGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGTCTACCTTGAGAATTCCATAGGCTCCAAAGGAGGCATCTGTAGT  647

seq1  GGACGATGTTTGTATCTGGTTCCTGGTGAATGATGGGGGCATCTTCTACC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGATGTTTGTATCTGGTTCCTGGTGAATGATGGGGGCATCTTCTACC  697

seq1  CATTGACACACCAGTGTATCCACCAGGCATCCAGACAGGGTCCATGAGCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGACACACCAGTGTATCCACCAGGCATCCAGACAGGGTCCATGAGCC  747

seq1  TTCTTCTACTGTGACCCTGGATTGACAGAGCCAGCAGAGGGCTGATGCCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTACTGTGACCCTGGATTGACAGAGCCAGCAGAGGGCTGATGCCC  797

seq1  AGAGCCTCTTCCTAGCTTCCCAGAGAGGGGCAGAGCCTGGCTCCTAGAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTCTTCCTAGCTTCCCAGAGAGGGGCAGAGCCTGGCTCCTAGAGG  847

seq1  TACTAAATACCAATCAGTCCACAGCTGCCCCTTTAGTTCATATAGAGCCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAAATACCAATCAGTCCACAGCTGCCCCTTTAGTTCATATAGAGCCA  897

seq1  AGCAGGAAAGAAAAGGAGCCACGGACACATCCCCTGCTTCCTAGTCAGAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAAAGAAAAGGAGCCACGGACACATCCCCTGCTTCCTAGTCAGAG  947

seq1  TCTTAGCACTGAACTGGGGTGGGGTACATGGGTCTCTAGCCCAGCCTTGA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGCACTGAACTGGGGTGGGGTACATGGGTCTCTAGCCCAGCCTTGA  997

seq1  GTGTGTGACATCCTGACATCAGTGGGCCATTGAATTC  1035
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGACATCCTGACATCAGTGGGCCATTGAATTC  1034

seq1: chr10_60282033_60282341
seq2: B6Ng01-155H20.g_73_381

seq1  CACACCAGTTAGAGACCCTGTCTCCAAAAGAGATGGATGATTCATCCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAGTTAGAGACCCTGTCTCCAAAAGAGATGGATGATTCATCCCTG  50

seq1  AGGAATGACGCCCCAGACTGTCCTCTGGCCTCCCCACACATGTCAGCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGACGCCCCAGACTGTCCTCTGGCCTCCCCACACATGTCAGCTTC  100

seq1  ACACGCAGGACTACATACACAAGCCTTGGAAGGTGTCCAGCAGGATGCGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGCAGGACTACATACACAAGCCTTGGAAGGTGTCCAGCAGGATGCGA  150

seq1  TTCTCACACTGGCTTATTCAAGTCCAGAGGTCACCCTCATTGCTCTGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACACTGGCTTATTCAAGTCCAGAGGTCACCCTCATTGCTCTGTGA  200

seq1  TGAGACTGTTGTTTACCGTCCCTAAGATGAACTGAGGACAGTTCTTTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTGTTGTTTACCGTCCCTAAGATGAACTGAGGACAGTTCTTTCTA  250

seq1  TTCCTAAACACAAGAATTCTCTAGAAAGAGCCTTGGAAGGAAAGCCGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAAACACAAGAATTCTCTAGAAAGAGCCTTGGAAGGAAAGCCGGGG  300

seq1  GGGGGGGGG  309
      |||||||||
seq2  GGGGGGGGG  309