BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158I10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 64,607,459 - 64,783,212
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCtnna3
Downstream geneLOC665206, LOC216036, 1700023F02Rik, 4930407I19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158I10.bB6Ng01-158I10.g
ACCDH952452DH952453
length1,189724
definitionDH952452|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158I10, 5' end.DH952453|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158I10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,782,010 - 64,783,212)(64,607,459 - 64,608,182)
sequence
gaattcacactctacaattattcagcctgaaattgatgtgaggctgctgc
taacagaaacatttacctaaatgatacaaatttgcagctgaccttgaaaa
gtaacaactttgcccacatacaagcaagtccccacttggcacttctcttc
tgaaaatgacctggaacaggtgttcctcctcaatttgcaggttcattata
gatctatgaaagtttagaagtttagcatatctctcaagcgattccaaatt
ctgccattttcatctgcatagtgggtttatgttccattgcttccagggaa
catatgctgctcaatgctaatggggtccattgcatcatgagtggtatgta
aaccctcttctctgtgaagcattttcccatgaatttgacagcgtcagctt
tcctcctcattttcaaaattcatttaaatgacaaattctaggtttcttta
aaaatattttaacattttgccatgggatattttttttaaatcaatcagta
tatatttcttgtgaaaccttttggagagaatttatttccaaacatataga
caaacatgaccctacataactggaatgatttttcatgatatggggcaagc
aacataagaaaccaaagtagaattggtactgaactttttcatgagaaagt
agcacatgcattcataaatgtgttgtcatgtttggacacaaataatacta
gatgtcaacattgtttgaatataatcctgagaatgattttaaccacatag
gctgcctttcagtgtgagcaaagtgtaataaacttactttctggatcgtt
agaacatgagaaattggcaatgttactaggattagtgagaggaccatatc
agtatagaaacaattttaaaatataacatattgtagatactatactgaac
agaattaagagtaggtaaatttatgaaaaagccaagcatgtcagcatata
tagcaagactgcaaaacatataattaagaattagtgaggatgccagttca
atgagatatgaataatttcaacatggttactttatatgtataaaaatagt
ggtattgagatgacttatatatttgctaccagtttaattaaaattttaca
tgatgggatggagagaatggctcagaggcttgaaaggcactgactgcctc
tccagagtctagttcatccagaaaccacgtagtggctca
gaattcacagagatggaattatcaagataatcttgtgatgtggttacaga
cagatgggcagcactctaagactacaaatttcttcatgaattagggtatg
gtaaggcctttagtgtcccattacagaaaatgtatgtaatatctctgaat
catgctcgtacttgccacaaaccataagatctctaaatagtagaaacata
aaccactggttttattagttgcttacaatgaggtaccactatttccaaag
aacttaaaatatttatgttagcagggctcacatcgcactgtgacagttat
gtagaatacacacacacacacacacacacacacacacacacacatgtata
tatatatatatatatatatacttgcttcaaaatcagacctaggacagaaa
ttttcatattccacattataattattgatcatggtctggctagatggctc
aatgcagtgagtggctatgtaatcttgaagacctaatttttattcgctgg
atgcgaagtttttacccaaaattgatttacaaaatggtgtattaacttcc
atacatgttctgtgttatggatgtgactctgcacacacacacacacacac
acacagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agagagaagagagaagagagtagagagttaagagaagagagaagagaaga
gaagaggagaggagaggagaggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_64782010_64783212
seq2: B6Ng01-158I10.b_49_1237 (reverse)

seq1  TGAGCCACTACGTGGTTTCTGGGGATTGAACTTAGGACCTCTGGAAGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||    ||||| |||   |||||||   ||
seq2  TGAGCCACTACGTGGTTTCTGG---ATGAAC-TAG--ACTCTGGAGAGGC  44

seq1  AGTCAGTG-CTCTC-AGCTTCTGAGCCA-TCTCTCCATCCCATCAATGTA  97
      |||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  AGTCAGTGCCTTTCAAGCCTCTGAGCCATTCTCTCCATCCCATC-ATGTA  93

seq1  AAATTTTAAATTAAACTTGTAGCAAATATATAAGTCAATCTCAAATAACC  147
      ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |
seq2  AAATTTT-AATTAAACTGGTAGCAAATATATAAGTC-ATCTC-AATA--C  138

seq1  AACTATTTTAATACATATTAAAGTAACCATGTTGAAATTATTCATATCTT  197
       |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CACTATTTTTATACATA-TAAAGTAACCATGTTGAAATTATTCATATC-T  186

seq1  CATTGAACTGGCATCCTCACTAATTCTTTTAATTATATGTTTTGCAGTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAACTGGCATCCTCACTAATTC--TTAATTATATGTTTTGCAGTCT  234

seq1  TGCTATATATGCTGACATGCTTGGCTTTTTCATAAATTTTACCTACTCTT  297
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCTATATATGCTGACATGCTTGGCTTTTTCATAAA-TTTACCTACTCTT  283

seq1  AATTCTGTTCAGTATAGTATCTACAATATGTTATATTTTAAAATTGTTTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGTTCAGTATAGTATCTACAATATGTTATATTTTAAAATTGTTTC  333

seq1  TATACTGATATGGTCCTCTCACTAATCCTAGTAACATTGCCAATTTCTCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGATATGGTCCTCTCACTAATCCTAGTAACATTGCCAATTTCTCA  383

seq1  TGTTCTAACGATCCAGAAAGTAAGTTTATTACACTTTGCTCACACTGAAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTAACGATCCAGAAAGTAAGTTTATTACACTTTGCTCACACTGAAA  433

seq1  GGCAGCCTATGTGGTTAAAATCATTCTCAGGATTATATTCAAACAATGTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCCTATGTGGTTAAAATCATTCTCAGGATTATATTCAAACAATGTT  483

seq1  GACATCTAGTATTATTTGTGTCCAAACATGACAACACATTTATGAATGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCTAGTATTATTTGTGTCCAAACATGACAACACATTTATGAATGCA  533

seq1  TGTGCTACTTTCTCATGAAAAAGTTCAGTACCAATTCTACTTTGGTTTCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTACTTTCTCATGAAAAAGTTCAGTACCAATTCTACTTTGGTTTCT  583

seq1  TATGTTGCTTGCCCCATATCATGAAAAATCATTCCAGTTATGTAGGGTCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGCTTGCCCCATATCATGAAAAATCATTCCAGTTATGTAGGGTCA  633

seq1  TGTTTGTCTATATGTTTGGAAATAAATTCTCTCCAAAAGGTTTCACAAGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTCTATATGTTTGGAAATAAATTCTCTCCAAAAGGTTTCACAAGA  683

seq1  AATATATACTGATTGATTTAAAAAAAATATCCCATGGCAAAATGTTAAAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATACTGATTGATTTAAAAAAAATATCCCATGGCAAAATGTTAAAA  733

seq1  TATTTTTAAAGAAACCTAGAATTTGTCATTTAAATGAATTTTGAAAATGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTAAAGAAACCTAGAATTTGTCATTTAAATGAATTTTGAAAATGA  783

seq1  GGAGGAAAGCTGACGCTGTCAAATTCATGGGAAAATGCTTCACAGAGAAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAAAGCTGACGCTGTCAAATTCATGGGAAAATGCTTCACAGAGAAG  833

seq1  AGGGTTTACATACCACTCATGATGCAATGGACCCCATTAGCATTGAGCAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTTACATACCACTCATGATGCAATGGACCCCATTAGCATTGAGCAG  883

seq1  CATATGTTCCCTGGAAGCAATGGAACATAAACCCACTATGCAGATGAAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTTCCCTGGAAGCAATGGAACATAAACCCACTATGCAGATGAAAA  933

seq1  TGGCAGAATTTGGAATCGCTTGAGAGATATGCTAAACTTCTAAACTTTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAATTTGGAATCGCTTGAGAGATATGCTAAACTTCTAAACTTTCA  983

seq1  TAGATCTATAATGAACCTGCAAATTGAGGAGGAACACCTGTTCCAGGTCA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCTATAATGAACCTGCAAATTGAGGAGGAACACCTGTTCCAGGTCA  1033

seq1  TTTTCAGAAGAGAAGTGCCAAGTGGGGACTTGCTTGTATGTGGGCAAAGT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGAAGAGAAGTGCCAAGTGGGGACTTGCTTGTATGTGGGCAAAGT  1083

seq1  TGTTACTTTTCAAGGTCAGCTGCAAATTTGTATCATTTAGGTAAATGTTT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACTTTTCAAGGTCAGCTGCAAATTTGTATCATTTAGGTAAATGTTT  1133

seq1  CTGTTAGCAGCAGCCTCACATCAATTTCAGGCTGAATAATTGTAGAGTGT  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGCAGCAGCCTCACATCAATTTCAGGCTGAATAATTGTAGAGTGT  1183

seq1  GAATTC  1203
      ||||||
seq2  GAATTC  1189

seq1: chr10_64607459_64608182
seq2: B6Ng01-158I10.g_69_792

seq1  GAATTCACAGAGATGGAATTATCAAGATAATCTTGTGATGTGGTTACAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAGATGGAATTATCAAGATAATCTTGTGATGTGGTTACAGA  50

seq1  CAGATGGGCAGCACTCTAAGACTACAAATTTCTTCATGAATTAGGGTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGGCAGCACTCTAAGACTACAAATTTCTTCATGAATTAGGGTATG  100

seq1  GTAAGGCCTTTAGTGTCCCATTACAGAAAATGTATGTAATATCTCTGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGCCTTTAGTGTCCCATTACAGAAAATGTATGTAATATCTCTGAAT  150

seq1  CATGCTCGTACTTGCCACAAACCATAAGATCTCTAAATAGTAGAAACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCGTACTTGCCACAAACCATAAGATCTCTAAATAGTAGAAACATA  200

seq1  AACCACTGGTTTTATTAGTTGCTTACAATGAGGTACCACTATTTCCAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACTGGTTTTATTAGTTGCTTACAATGAGGTACCACTATTTCCAAAG  250

seq1  AACTTAAAATATTTATGTTAGCAGGGCTCACATCGCACTGTGACAGTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAAATATTTATGTTAGCAGGGCTCACATCGCACTGTGACAGTTAT  300

seq1  GTAGAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGTATA  350

seq1  TATATATATATATATATATACTTGCTTCAAAATCAGACCTAGGACAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATACTTGCTTCAAAATCAGACCTAGGACAGAAA  400

seq1  TTTTCATATTCCACATTATAATTATTGATCATGGTCTGGCTAGATGGCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATATTCCACATTATAATTATTGATCATGGTCTGGCTAGATGGCTC  450

seq1  AATGCAGTGAGTGGCTATGTAATCTTGAAGACCTAATTTTTATTCGCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAGTGAGTGGCTATGTAATCTTGAAGACCTAATTTTTATTCGCTGG  500

seq1  ATGCGAAGTTTTTACCCAAAATTGATTTACAAAATGGTGTATTAACTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCGAAGTTTTTACCCAAAATTGATTTACAAAATGGTGTATTAACTTCC  550

seq1  ATACATGTTCTGTGTTATGGATGTGACTCTGCACACACACACACACACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGTTCTGTGTTATGGATGTGACTCTGCACACACACACACACACAC  600

seq1  ACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  650

seq1  AGAGAGAAGAGAGAAGAGAGTAGAGAGTTAAGAGAAGAGAGAAGAGAAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAGAGAGAAGAGAGTAGAGAGTTAAGAGAAGAGAGAAGAGAAGA  700

seq1  GAAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAG  724
      |||||||||||||||||||||| |
seq2  GAAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGTG  724