seq1: chr10_9527650_9528840
seq2: B6Ng01-159I16.b_45_1215
seq1 GAATTCAGTGATTTTAATTATTTACTCAAAGCTTTATTCCTCTATGTCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAGTGATTTTAATTATTTACTCAAAGCTTTATTCCTCTATGTCCT 50
seq1 AAGAATTTAACCATTCAAAAATAGAAACTGAGCAGAAAATTGAAAACAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAATTTAACCATTCAAAAATAGAAACTGAGCAGAAAATTGAAAACAAA 100
seq1 AAATTTATCTAATTTATCCCTGCATTCAACTAGTATGGTCTTAAAATGAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAATTTATCTAATTTATCCCTGCATTCAACTAGTATGGTCTTAAAATGAT 150
seq1 GCAAAAATAAAGTCTTTTAAGTAACAGTAAAGTGATGCTATGATTTGAAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAAAAATAAAGTCTTTTAAGTAACAGTAAAGTGATGCTATGATTTGAAA 200
seq1 AAAATAACATGGTGAAAATATGAGAACGTCAAATCCAAGGTGAGGGTGGA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAATAACATGGTGAAAATATGAGAACGTCAAATCCAAGGTGAGGGTGGA 250
seq1 AGGAAGCAGAACCCTCGGAGGTGAGAGAAGAAAATGGACCTAAGCCACAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAAGCAGAACCCTCGGAGGTGAGAGAAGAAAATGGACCTAAGCCACAC 300
seq1 CCAGATCCAGACTGAGACCATGGGAAGGCCTAGTGAACACATGGGTGACA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGATCCAGACTGAGACCATGGGAAGGCCTAGTGAACACATGGGTGACA 350
seq1 TGCAGTCATCATACCTTGTGATTTTCAACCTTAGTCATCGTAGGTATGTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCAGTCATCATACCTTGTGATTTTCAACCTTAGTCATCGTAGGTATGTG 400
seq1 ACACTACAGAGTCAGCATCCTTAAACCATAAAAATACAGACTCAGTTAAC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACTACAGAGTCAGCATCCTTAAACCATAAAAATACAGACTCAGTTAAC 450
seq1 CACAGGCAAACAGGAGCACCCATTCTTATAGGAAACTGCTATTGTAACTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACAGGCAAACAGGAGCACCCATTCTTATAGGAAACTGCTATTGTAACTT 500
seq1 ACTAATGATTGTTATTTATCTAAATTAAGAGGTGCCAGATAAAGCTGACC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTAATGATTGTTATTTATCTAAATTAAGAGGTGCCAGATAAAGCTGACC 550
seq1 CAAGCTTTGGCGACTTACTTTAAGCAAGGAACGTTATCACGAAGCCCGTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGCTTTGGCGACTTACTTTAAGCAAGGAACGTTATCACGAAGCCCGTC 600
seq1 AGATGAGCTGCTGCTGGTAGACGGATGAGACTGAGGAGGAATGGGCTGAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGATGAGCTGCTGCTGGTAGACGGATGAGACTGAGGAGGAATGGGCTGAG 650
seq1 GGTTGGAGCTGCCCACGGGGGTGGACAGAGGCGGGGGCTGCTCACCCTCT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTTGGAGCTGCCCACGGGGGTGGACAGAGGCGGGGGCTGCTCACCCTCT 700
seq1 GGAGTATCCACATCATTTATTTCATATAACAGTCGAACTTCAAGCATCTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAGTATCCACATCATTTATTTCATATAACAGTCGAACTTCAAGCATCTG 750
seq1 TCATAAAAGAATGGTTGCTTACCTATTTCTAATAGTTAATACACATTGTG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCATAAAAGAATGGTTGCTTACCTATTTCTAATAGTTAATACACATTGTG 800
seq1 TTATAATGTACCAGAAAGAATATTTTTAAAAGTTAAAAACAAGAAAAAAT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATAATGTACCAGAAAGAATATTTTTAAAAGTTAAAAACAAGAAAAAAT 850
seq1 GCTATATTTAAATGTAAAAAAATGTTTCAACTGAACTTGTAAAGACTTGT 900
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2 GCTATATTTAAATGT-AAAAAATGTTTCAACTG-ACTTGTAAAGACTTGT 898
seq1 GTACACAGGTGTGACCTCATACAAGTGCACAATACACATCCTGCCTTTCG 950
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2 GTACACAGGTGTGACCTCATACAAGTGCAC-ATACACATCCTG-CTTTCG 946
seq1 AATAGATTGAATACTAATAAGTTGATATTCCTTAAATAAAAGATATAATA 1000
|||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | || |||
seq2 AATAGA-TGAATACTAAT-AGTTGATA-TCCTT-AATAA---AGATTATA 989
seq1 TAATTAAGGATTCACATAGTCCATTAAAAATATATATAAAGTGCTATTTT 1050
| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||
seq2 TTATTTAGGA-TCACATAGTTCAT--AAAATATTTATAAGGTGCTATTTT 1036
seq1 TGCACAAAACAGGTGGTGATATAAATAC-TAATGTTTATACAGAAGCAAC 1099
|| | ||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||
seq2 TG--CCAAACAGG-GGTGATAT-AATACTTAATGTTTTT--AGAAGC-AC 1079
seq1 TGCAAACTGTTTACTAAATGATTTTGAAAAGCGTAGAAGTCTCAGACAAT 1149
||||||||||||||| |||||||| | |||||| || || |||||||
seq2 TGCAAACTGTTTACT-AATGATTTGG--AAGCGT-GAGATC-CAGACAA- 1123
seq1 TGCCATGGCATAGTTATGAGGTGATTACCG---------GGATGACTTCG 1190
||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||
seq2 TGCCATGCCAT--GTATGAGG-GATTACCGGATGGACTCGGTAGACTTCG 1170
seq1 G 1191
|
seq2 G 1171
| seq1: chr10_9674632_9674819
seq2: B6Ng01-159I16.g_73_260 (reverse)
seq1 CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT 50
seq1 TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTCTTTTGTGAT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTCTTTTGTGAT 100
seq1 GGGAAGGAGACTCAGATGGGGCAGTAGTTTTGAAAAGTTGTAAGAGCTGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGAAGGAGACTCAGATGGGGCAGTAGTTTTGAAAAGTTGTAAGAGCTGT 150
seq1 GTCTGCCTTTGGTCAAAGAGGATAAAAAGGGGAAAGAG 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCTGCCTTTGGTCAAAGAGGATAAAAAGGGGAAAGAG 188
|
