BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163F02
Chromosome10 (Build37)
Map Location 109,411,019 - 109,565,480
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNav3, LOC100042497
Upstream geneSyt1
Downstream geneLOC100042502, LOC100042506, LOC100042510, LOC667855, 9230102K24Rik, LOC100042518, E2f7, Csrp2, Zdhhc17, EG432502
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163F02.bB6Ng01-163F02.g
ACCDH955937DH955938
length1,1461,043
definitionDH955937|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163F02, 5' end.DH955938|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163F02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,411,019 - 109,412,162)(109,564,451 - 109,565,480)
sequence
gaattcctttttctgagttgggaaaagttttcatcaacaaggatgcttta
aatatcatgaggctatgtggctctgaagtcattggctaattttgtcctat
tacacgagacacttccttggttacagatttgagagaacctttctgtgaaa
gaacattagcattcatgacaagcatccccgtgataaataagtaatgggat
ttttccaaagcagcattttgaaatgatctgttatttgactatcaactcat
acaaatatacctcaaatgaatactgccttgccaaataattcagaccaaaa
tggtcgtttatacatcttgtaaaggctagttttgaacatcatgcccttta
tttccctttaacgggccaattaaaacagcttgactgaaaatcacggaaat
actaagcacactgtcattcaaatcacacaagaaactgccagcagccctgc
ctgcttggtttaaaaccatatggagctctatttaaacatttaaacttgac
tttaggcattcacatctgcatctaacattttgacagcgaaagccaaattc
actctacttgaatgtcaaatgcagtctgactattgtaccttactcaaata
aaataattccaatttaatctgaccctaaagtaataatatttatttaatga
tgataattaatgagctatcaagattacacttgacttataagaaatattgt
gaaacaactacaaaggtgcatacttttcctgctggaatattcaccttggt
tttctttgatagagaacaattttgggtgtgaatcatctgcaagtaagaca
tgtcggtttttattaaattccaacaagcttttggtagaggagctcaaatt
tttaagtgatgtaagtgataaaaatattagacaatataaggcatatatat
atatatataaacaaatatatatatatgtatatacgtatgtatgtatatac
atatatatccatgcatgtatgtgagtttacagagtctacttttctattta
gtgtatatataatctaaacatgaattgaaatatttacatgatattatcat
gtgtataaaatggtgcatatataataaattgtaatgaaatctactggttc
cattgaattttaagggtcctcattgccccttctttcctaaaggcaa
gaattctcccaaagaacaaagtttggttaacattcaggctgtctctgaat
atttttattaaattagttacagctccctgtattcccattaccaaaattta
acttccaaattaatatcttcagttatgagatgaatcattctttccaaaga
gagactaaaattttattaagagtattagaaaaatgtgtcacttagctgtc
ttttccagacccataagacctgtaattctgtatacaagtaaaatttgcaa
acagctgtattgtgttttcttcagttgggggttactgttagcttgtgtga
tttggttatgttcaataaaaaaggttttcatgaaattgaatggcttttca
cacaggtaaaactaatacttatcactctacttcttatccctaaattcttc
attctgactcctcgccgaatattctctggaagatatatctaagggttagt
tattaaatgcaggtacttttaaatcatactcaaaatttgactttaatgct
tttgaaaaattaaccttttatgtttatattcttaaccaatgctggtgcat
tgaatacccatagtatgtcctagatagagaatatttaaatgaagatacag
cagggaaccagcctaaaccctagcaagaaatacagttaagtgccaagcaa
gggatcatttcaccagaggaagtgcggcataataaaaacaagcatcaaaa
agcaggatttgaactgatttgttggttggcaaagatagaattactaaagg
gctttatgttgtgactgaacggctagagcatggtgtgtgtgaatttaagg
aaaggagagaccaggatggaagtcttttaagaacatagggattactacac
agtctaaagaaactcatgctgtgaatctggtatgcatcaaaatgtaacac
atttgccttatccactatttactcttctttatatacctcatttgcatgtc
acatttcagagagaaaagacctggtaagagatctgtataggaggtggatt
gtagaaattgcatggatagtctcagtccacagcagtctttaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_109411019_109412162
seq2: B6Ng01-163F02.b_44_1189

seq1  GAATTCCTTTTTCTGAGTTGGGAAAAGTTTTCATCAACAAGGATGCTTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTTTCTGAGTTGGGAAAAGTTTTCATCAACAAGGATGCTTTA  50

seq1  AATATCATGAGGCTATGTGGCTCTGAAGTCATTGGCTAATTTTGTCCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCATGAGGCTATGTGGCTCTGAAGTCATTGGCTAATTTTGTCCTAT  100

seq1  TACACGAGACACTTCCTTGGTTACAGATTTGAGAGAACCTTTCTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGAGACACTTCCTTGGTTACAGATTTGAGAGAACCTTTCTGTGAAA  150

seq1  GAACATTAGCATTCATGACAAGCATCCCCGTGATAAATAAGTAATGGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATTAGCATTCATGACAAGCATCCCCGTGATAAATAAGTAATGGGAT  200

seq1  TTTTCCAAAGCAGCATTTTGAAATGATCTGTTATTTGACTATCAACTCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAAAGCAGCATTTTGAAATGATCTGTTATTTGACTATCAACTCAT  250

seq1  ACAAATATACCTCAAATGAATACTGCCTTGCCAAATAATTCAGACCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATATACCTCAAATGAATACTGCCTTGCCAAATAATTCAGACCAAAA  300

seq1  TGGTCGTTTATACATCTTGTAAAGGCTAGTTTTGAACATCATGCCCTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCGTTTATACATCTTGTAAAGGCTAGTTTTGAACATCATGCCCTTTA  350

seq1  TTTCCCTTTAACGGGCCAATTAAAACAGCTTGACTGAAAATCACGGAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTTAACGGGCCAATTAAAACAGCTTGACTGAAAATCACGGAAAT  400

seq1  ACTAAGCACACTGTCATTCAAATCACACAAGAAACTGCCAGCAGCCCTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGCACACTGTCATTCAAATCACACAAGAAACTGCCAGCAGCCCTGC  450

seq1  CTGCTTGGTTTAAAACCATATGGAGCTCTATTTAAACATTTAAACTTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTGGTTTAAAACCATATGGAGCTCTATTTAAACATTTAAACTTGAC  500

seq1  TTTAGGCATTCACATCTGCATCTAACATTTTGACAGCGAAAGCCAAATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGCATTCACATCTGCATCTAACATTTTGACAGCGAAAGCCAAATTC  550

seq1  ACTCTACTTGAATGTCAAATGCAGTCTGACTATTGTACCTTACTCAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTACTTGAATGTCAAATGCAGTCTGACTATTGTACCTTACTCAAATA  600

seq1  AAATAATTCCAATTTAATCTGACCCTAAAGTAATAATATTTATTTAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATTCCAATTTAATCTGACCCTAAAGTAATAATATTTATTTAATGA  650

seq1  TGATAATTAATGAGCTATCAAGATTACACTTGACTTATAAGAAATATTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATTAATGAGCTATCAAGATTACACTTGACTTATAAGAAATATTGT  700

seq1  GAAACAACTACAAAGGTGCATACTTTTCCTGCTGGAATATTCACCTTGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAACTACAAAGGTGCATACTTTTCCTGCTGGAATATTCACCTTGGT  750

seq1  TTTCTTTGATAGAGAACAATTTTGGGTGTGAATCATCTGCAAGTAAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTGATAGAGAACAATTTTGGGTGTGAATCATCTGCAAGTAAGACA  800

seq1  TGTCGGTTTTTATTAAATTCCAACAAGCTTTTGGTAGAGGAGCTCAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCGGTTTTTATTAAATTCCAACAAGCTTTTGGTAGAGGAGCTCAAATT  850

seq1  TTTAAGTGATGTAAGTGATAAAAATATTAGACAATATAAGGCATATATAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTGATGTAAGTGATAAAAATATTAGACAATATAAGGCATATATAT  900

seq1  ATATATATAAACAAATATATATATATGTATATACGTATGTATGTATATAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATAAACAAATATATATATATGTATATACGTATGTATGTATATAC  950

seq1  ATATATATCCATGCATGTATGTGAGTTTACAGAGTCTACTTTTCTATTTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATCCATGCATGTATGTGAGTTTACAGAGTCTACTTTTCTATTTA  1000

seq1  GTGTATATATAATCTAAACATGAATTGACATATTTACATGATATTTATTT  1050
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | 
seq2  GTGTATATATAATCTAAACATGAATTGAAATATTTACATGATATT--ATC  1048

seq1  ATGTGTATATA--TGTGCATATAT-ATAAA-TGTAATGAAATCCTACTTG  1096
      ||||||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
seq2  ATGTGTATAAAATGGTGCATATATAATAAATTGTAATGAAAT-CTACTGG  1097

seq1  TTCCATTGAATTTTAA-GGTTCTCATTGCCCCTTCTTCCTAAAAGGCAA  1144
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||
seq2  TTCCATTGAATTTTAAGGGTCCTCATTGCCCCTTCTTTCCTAAAGGCAA  1146

seq1: chr10_109564451_109565480
seq2: B6Ng01-163F02.g_67_1089 (reverse)

seq1  GAGACTTATCCATGCAATTTCTTACAATCCACCTCCTAATACAGATCTCT  50
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGAC-TATCCATGCAATTTC-TACAATCCACCTCCT-ATACAGATCTCT  47

seq1  TACCAGGTCTGTTTCTCTTCTTGAAATGTGACATGCAAATGAGGTATATA  100
      |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGTCT-TTTCTCT--CTGAAATGTGACATGCAAATGAGGTATATA  94

seq1  AAGAAGAGTAAATAGTGGATAAGGCAAAATGTGTTACATTTTGATGCATA  150
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAGTAAATAGTGGATAAGGC-AAATGTGTTACATTTTGATGCATA  143

seq1  CCAGATTCACAGCATGAGTTTCTTTAGACTGTGTAGTAATCCCTATGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTCACAGCATGAGTTTCTTTAGACTGTGTAGTAATCCCTATGTTC  193

seq1  TTAAAAGACTTCCATCCTGGTCTCTCCTTTCCTTAAATTCACACACACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGACTTCCATCCTGGTCTCTCCTTTCCTTAAATTCACACACACCA  243

seq1  TGCTCTAGCCGTTCAGTCACAACATAAAGCCCTTTAGTAATTCTATCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTAGCCGTTCAGTCACAACATAAAGCCCTTTAGTAATTCTATCTTT  293

seq1  GCCAACCAACAAATCAGTTCAAATCCTGCTTTTTGATGCTTGTTTTTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACCAACAAATCAGTTCAAATCCTGCTTTTTGATGCTTGTTTTTATT  343

seq1  ATGCCGCACTTCCTCTGGTGAAATGATCCCTTGCTTGGCACTTAACTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCGCACTTCCTCTGGTGAAATGATCCCTTGCTTGGCACTTAACTGTA  393

seq1  TTTCTTGCTAGGGTTTAGGCTGGTTCCCTGCTGTATCTTCATTTAAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGCTAGGGTTTAGGCTGGTTCCCTGCTGTATCTTCATTTAAATAT  443

seq1  TCTCTATCTAGGACATACTATGGGTATTCAATGCACCAGCATTGGTTAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATCTAGGACATACTATGGGTATTCAATGCACCAGCATTGGTTAAG  493

seq1  AATATAAACATAAAAGGTTAATTTTTCAAAAGCATTAAAGTCAAATTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAAACATAAAAGGTTAATTTTTCAAAAGCATTAAAGTCAAATTTTG  543

seq1  AGTATGATTTAAAAGTACCTGCATTTAATAACTAACCCTTAGATATATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGATTTAAAAGTACCTGCATTTAATAACTAACCCTTAGATATATCT  593

seq1  TCCAGAGAATATTCGGCGAGGAGTCAGAATGAAGAATTTAGGGATAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGAATATTCGGCGAGGAGTCAGAATGAAGAATTTAGGGATAAGAA  643

seq1  GTAGAGTGATAAGTATTAGTTTTACCTGTGTGAAAAGCCATTCAATTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGTGATAAGTATTAGTTTTACCTGTGTGAAAAGCCATTCAATTTCA  693

seq1  TGAAAACCTTTTTTATTGAACATAACCAAATCACACAAGCTAACAGTAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACCTTTTTTATTGAACATAACCAAATCACACAAGCTAACAGTAAC  743

seq1  CCCCAACTGAAGAAAACACAATACAGCTGTTTGCAAATTTTACTTGTATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAACTGAAGAAAACACAATACAGCTGTTTGCAAATTTTACTTGTATA  793

seq1  CAGAATTACAGGTCTTATGGGTCTGGAAAAGACAGCTAAGTGACACATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTACAGGTCTTATGGGTCTGGAAAAGACAGCTAAGTGACACATTT  843

seq1  TTCTAATACTCTTAATAAAATTTTAGTCTCTCTTTGGAAAGAATGATTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAATACTCTTAATAAAATTTTAGTCTCTCTTTGGAAAGAATGATTCA  893

seq1  TCTCATAACTGAAGATATTAATTTGGAAGTTAAATTTTGGTAATGGGAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAACTGAAGATATTAATTTGGAAGTTAAATTTTGGTAATGGGAAT  943

seq1  ACAGGGAGCTGTAACTAATTTAATAAAAATATTCAGAGACAGCCTGAATG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGAGCTGTAACTAATTTAATAAAAATATTCAGAGACAGCCTGAATG  993

seq1  TTAACCAAACTTTGTTCTTTGGGAGAATTC  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCAAACTTTGTTCTTTGGGAGAATTC  1023