BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-164A23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 95,276,793 - 95,437,964
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEea1
Upstream genePlxnc1, Cradd, Socs2, LOC100042004, D10Ertd322e, Ube2n, Nudt4, EG628119
Downstream geneEG432491, LOC667380, Btg1, LOC628256
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-164A23.bB6Ng01-164A23.g
ACCDH956487DH956488
length1,094767
definitionDH956487|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164A23, 5' end.DH956488|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164A23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,436,861 - 95,437,964)(95,276,793 - 95,277,559)
sequence
gaattctagatcttgatccaaaagaaccgggaagaaactcttccacaaag
ggtaaagcttaagcataggacctcaaagcccaccccaccagtgacacact
ttccccaacaaagccacacctaccacaaagccacacctcctactagtggt
tcctcccatgggcccagcatactcaaaccaccacaactacctacaactgc
agctacatgaagttgcgctactcactctttcctgctgatttctcttagta
acacgcatatctaccctggtacattctgagaatgttttgtgttttgactg
cttacatagcaaatacaaggccagccaggggcagaaagtaagatttgtct
ccaacaaaagtgaatcagtattgtgaacataggtgaacatcctcaaaata
ttaacaagtaaaacctagcaacacattaaaatagtggtaacgacacatca
ttatcaagtgaatttgccctaagaatacaaaggtataacaatattgtttt
aagtgcatgtaatttatcacagaacacaagagaaaagtcatatcaacatg
tcaatgcatgtagaaaaagcactcagcaatggcaagatccatttgagggg
aaggggaggagaaaggagagagcagacagcgaggcagcgtatgcactgta
gtgatatgcactgtagtgatatgcactgtagtgatatgcactgtagtgat
atgcactgtagtgatatttagtgcaactgcggacagcaggcaactgctat
gttcctagacttagaagattatcctagcatttagggttttaccactaagt
gacatagacataggatttctttatgtcttctttttctataatgaacaaat
acttcttaaaataagtgtagtatacaacttaaaaggctttgtaattgaaa
tttaagcttatttacatttctactatttaacaggtccaaagtaaaatcag
aaaataccagaaaattgtgatatatatagttaattaatagttataacagt
acatacattacaaaagattatatattcttcattaaactcagatgatgaca
aaaagacaactggtagtataattttcaatctactatacagtttt
gaattcagaggacagctcaagaacaaaccgaaaatctataggtctttaat
cagggaagatgttatttacaatagatagtcttaacgaccccaaaaactct
ctcataatttggtgtcaacccatagattctacccacagaagcataaatat
ttgtgggaaaaggtaggaaaataaacagatagcatacaattaaactaaat
gaaaattttaaaataatggtgatctgtttagcactgtgtggtttacagaa
caccttctgcatttgattacctgtgtgctcgccactaacctgggagtgaa
gcgcctgctttgtgaggctgctcactttcctgatgcacggtgacaggtga
tttgctgcgaaaactacaaacaacttctgttggatttggacctcacctct
ggactctcctgtcaaagtccttctgagcgtagtgccttgagatcaatcca
tgagccaaattctctaaaaaaaaatttttttcagaaagaggttcagagaa
atgatatgattcggtctaagatccttagctaagggctaggccacacctcc
atccaacttcttgtcttacactctttaatatcaagtcattaaagtatgca
agtttgaactaaacgcatgataaaattcttgcatagatggccaagaacac
atagccagaaaatggtaggctggttacaactcaagtaagaagacctgtgt
atacactcaaaaatgatgccagagagagaaagagagagagagagagagag
agagagagagagagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_95436861_95437964
seq2: B6Ng01-164A23.b_49_1142 (reverse)

seq1  AAAACTGTATAGTAAGATTGAAAATTAATACTACCAGTTTGTCTTTTTTG  50
      ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||
seq2  AAAACTGTATAGT-AGATTGAAAATT-ATACTACCAG-TTGTC-TTTTTG  46

seq1  TCATCATCTGAGTTTAATGAAGAATATATTAATCTTTTGTATATGTATGT  100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  TCATCATCTGAGTTTAATGAAGAATATA-TAATCTTTTGTA-ATGTATGT  94

seq1  ACTGTTATAAACTATTAATTAACTATTATATATCACATTTTTCTGGTATT  150
      |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACTGTTAT-AACTATTAATTAACTA-TATATATCACAATTTTCTGGTATT  142

seq1  TTCTGATTTTACTTTGGACCTGTTAAATAGTAGAAATGTAAATAAGCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCTGATTTTACTTTGGACCTGTTAAATAGTAGAAATGTAAATAAGCTT-  191

seq1  AAATTTCAATTACAAAGCCTTTTAAGTTGTATTACTACACTTATTTTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCAATTACAAAGCCTTTTAAGTTGTA-TACTACACTTATTTTAAG  240

seq1  AAGTATTTGTTCATTATAGAAAAAGAAGACATAAAGAAATCCTATGTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATTTGTTCATTATAGAAAAAGAAGACATAAAGAAATCCTATGTCTA  290

seq1  TGTCACTTAGTGGTAAAACCCTAAATGCTAGGATAATCTTCTAAGTCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTTAGTGGTAAAACCCTAAATGCTAGGATAATCTTCTAAGTCTAG  340

seq1  GAACATAGCAGTTGCCTGCTGTCCGCAGTTGCACTAAATATCACTACAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATAGCAGTTGCCTGCTGTCCGCAGTTGCACTAAATATCACTACAGT  390

seq1  GCATATCACTACAGTGCATATCACTACAGTGCATATCACTACAGTGCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATCACTACAGTGCATATCACTACAGTGCATATCACTACAGTGCATA  440

seq1  TCACTACAGTGCATACGCTGCCTCGCTGTCTGCTCTCTCCTTTCTCCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTACAGTGCATACGCTGCCTCGCTGTCTGCTCTCTCCTTTCTCCTCC  490

seq1  CCTTCCCCTCAAATGGATCTTGCCATTGCTGAGTGCTTTTTCTACATGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCCTCAAATGGATCTTGCCATTGCTGAGTGCTTTTTCTACATGCA  540

seq1  TTGACATGTTGATATGACTTTTCTCTTGTGTTCTGTGATAAATTACATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACATGTTGATATGACTTTTCTCTTGTGTTCTGTGATAAATTACATGC  590

seq1  ACTTAAAACAATATTGTTATACCTTTGTATTCTTAGGGCAAATTCACTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAAACAATATTGTTATACCTTTGTATTCTTAGGGCAAATTCACTTG  640

seq1  ATAATGATGTGTCGTTACCACTATTTTAATGTGTTGCTAGGTTTTACTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGATGTGTCGTTACCACTATTTTAATGTGTTGCTAGGTTTTACTTG  690

seq1  TTAATATTTTGAGGATGTTCACCTATGTTCACAATACTGATTCACTTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATTTTGAGGATGTTCACCTATGTTCACAATACTGATTCACTTTTG  740

seq1  TTGGAGACAAATCTTACTTTCTGCCCCTGGCTGGCCTTGTATTTGCTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGACAAATCTTACTTTCTGCCCCTGGCTGGCCTTGTATTTGCTATG  790

seq1  TAAGCAGTCAAAACACAAAACATTCTCAGAATGTACCAGGGTAGATATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGTCAAAACACAAAACATTCTCAGAATGTACCAGGGTAGATATGC  840

seq1  GTGTTACTAAGAGAAATCAGCAGGAAAGAGTGAGTAGCGCAACTTCATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTACTAAGAGAAATCAGCAGGAAAGAGTGAGTAGCGCAACTTCATGT  890

seq1  AGCTGCAGTTGTAGGTAGTTGTGGTGGTTTGAGTATGCTGGGCCCATGGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCAGTTGTAGGTAGTTGTGGTGGTTTGAGTATGCTGGGCCCATGGG  940

seq1  AGGAACCACTAGTAGGAGGTGTGGCTTTGTGGTAGGTGTGGCTTTGTTGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCACTAGTAGGAGGTGTGGCTTTGTGGTAGGTGTGGCTTTGTTGG  990

seq1  GGAAAGTGTGTCACTGGTGGGGTGGGCTTTGAGGTCCTATGCTTAAGCTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTGTGTCACTGGTGGGGTGGGCTTTGAGGTCCTATGCTTAAGCTT  1040

seq1  TACCCTTTGTGGAAGAGTTTCTTCCCGGTTCTTTTGGATCAAGATCTAGA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTTTGTGGAAGAGTTTCTTCCCGGTTCTTTTGGATCAAGATCTAGA  1090

seq1  ATTC  1104
      ||||
seq2  ATTC  1094

seq1: chr10_95276793_95277559
seq2: B6Ng01-164A23.g_67_833

seq1  GAATTCAGAGGACAGCTCAAGAACAAACCGAAAATCTATAGGTCTTTAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGGACAGCTCAAGAACAAACCGAAAATCTATAGGTCTTTAAT  50

seq1  CAGGGAAGATGTTATTTACAATAGATAGTCTTAACGACCCCAAAAACTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAAGATGTTATTTACAATAGATAGTCTTAACGACCCCAAAAACTCT  100

seq1  CTCATAATTTGGTGTCAACCCATAGATTCTACCCACAGAAGCATAAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAATTTGGTGTCAACCCATAGATTCTACCCACAGAAGCATAAATAT  150

seq1  TTGTGGGAAAAGGTAGGAAAATAAACAGATAGCATACAATTAAACTAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGGAAAAGGTAGGAAAATAAACAGATAGCATACAATTAAACTAAAT  200

seq1  GAAAATTTTAAAATAATGGTGATCTGTTTAGCACTGTGTGGTTTACAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTTTAAAATAATGGTGATCTGTTTAGCACTGTGTGGTTTACAGAA  250

seq1  CACCTTCTGCATTTGATTACCTGTGTGCTCGCCACTAACCTGGGAGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTCTGCATTTGATTACCTGTGTGCTCGCCACTAACCTGGGAGTGAA  300

seq1  GCGCCTGCTTTGTGAGGCTGCTCACTTTCCTGATGCACGGTGACAGGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCCTGCTTTGTGAGGCTGCTCACTTTCCTGATGCACGGTGACAGGTGA  350

seq1  TTTGCTGCGAAAACTACAAACAACTTCTGTTGGATTTGGACCTCACCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTGCGAAAACTACAAACAACTTCTGTTGGATTTGGACCTCACCTCT  400

seq1  GGACTCTCCTGTCAAAGTCCTTCTGAGCGTAGTGCCTTGAGATCAATCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTCCTGTCAAAGTCCTTCTGAGCGTAGTGCCTTGAGATCAATCCA  450

seq1  TGAGCCAAATTCTCTAAAAAAAAATTTTTTTCAGAAAGAGGTTCAGAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCAAATTCTCTAAAAAAAAATTTTTTTCAGAAAGAGGTTCAGAGAA  500

seq1  ATGATATGATTCGGTCTAAGATCCTTAGCTAAGGGCTAGGCCACACCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATGATTCGGTCTAAGATCCTTAGCTAAGGGCTAGGCCACACCTCC  550

seq1  ATCCAACTTCTTGTCTTACACTCTTTAATATCAAGTCATTAAAGTATGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAACTTCTTGTCTTACACTCTTTAATATCAAGTCATTAAAGTATGCA  600

seq1  AGTTTGAACTAAACGCATGATAAAATTCTTGCATAGATGGCCAAGAACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGAACTAAACGCATGATAAAATTCTTGCATAGATGGCCAAGAACAC  650

seq1  ATAGCCAGAAAATGGTAGGCTGGTTACAACTCAAGTAAGAAGACCTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCAGAAAATGGTAGGCTGGTTACAACTCAAGTAAGAAGACCTGTGT  700

seq1  ATACACTCAAAAATGATGCCAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACTCAAAAATGATGCCAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  750

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGA  767
      |||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGA  767