BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-167M10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 64,903,239 - 65,050,861
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC216036
Upstream geneCtnna3, LOC665206
Downstream gene1700023F02Rik, 4930407I19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167M10.bB6Ng01-167M10.g
ACCDH959183DH959184
length1,039477
definitionDH959183|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167M10, 5' end.DH959184|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,049,809 - 65,050,861)(64,903,239 - 64,903,635)
sequence
gaattctctgaattatccataggtgaccctgctattcctgctgtaccatt
ggccttagagcaaacattctagaaggaaacatggagaaaccttaatgact
gtttttatcctaaggatttcgtatataacttatgcacattccaaatattt
tacccacttctctttcaggcagaaatagtcactagagaacaaattaagca
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ggactgcctaatgactttaagatttgataacttttatttgtgtgtgtgtc
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ttggatcccatgatacatgtctatacactctctatcgtgtccgcctttgg
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ttgactacatttatcgaatattacgtatggacatgaaag
gaattcatacttaaaccagccccagtcttttacaaaacatcaatattgaa
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attagaattcacacgcttggctccagctggccatgtgagcttgctctcta
ggatctacatggaataaggagagaactaacagaagaatattctcctagcc
ttcacatgtgggccatgtgggccatggtatgcatattgtgtgtatacatg
catatacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatataacatacacacatagacataggtatatcacatatacaca
tatatatatcacatacacacatatgtacatatatatatatatgtatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatat
aaaatgatgtctttttttccactggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_65049809_65050861
seq2: B6Ng01-167M10.b_46_1084 (reverse)

seq1  CTTTCATGGTCCATACCTATTATTTCATTAAATGTAGTCTGAATGATTCT  50
      ||||||| |||||||| || || |||  |||||||||||  || ||| ||
seq2  CTTTCAT-GTCCATACGTAATA-TTCGATAAATGTAGTC--AAAGATGCT  46

seq1  GTTTGTGGATTAGATCAGCATTTGATCACTCTCCCCCGCATCCAGTTCCC  100
      | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||
seq2  G-TTGTGGA-TAGATCAGCA-TTGATCACTCT-CCCCTCATCCAGTT-CC  91

seq1  AAAGGCCTAAAAAGAAAAGAGAGTGAATAGCCATGGTACCAAGGGATCCA  150
      ||||||    | |  | |||||||| |||| ||| ||| || ||||||||
seq2  AAAGGC--GGACACGATAGAGAGTGTATAGACAT-GTATCATGGGATCCA  138

seq1  ATGACATATGTTGGCTTCCATATGCATCTGCTAACATGTGCACATATCCA  200
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2  ATGTCATATGTTGGCTTCCATATGCATCTGCTCACATGTGCACATATCTA  188

seq1  TAAAATGTTCACACACACATACACACACGCACAGACACACTCATATACAC  250
      | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGTTCACACACACATACACACAGTCACAGACACACTCATATACAC  238

seq1  AGACACACAAAAAAATAAAAGTAAACAAATCTTTAAAGGCATTAGGCAGT  300
      ||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||
seq2  AGACACACACACAAATAAAAGTTATCAAATC-TTAAAGTCATTAGGCAGT  287

seq1  CCCAAGAGCTATTAAGAATTACAAATGGCAGAAGAGATGATATGGATATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGAGCTATTAAGAATTACAAATGGCAGAAGAGATGATATGGATATG  337

seq1  TGCTTATGAGCATGTGCCCATACCATATCCTTAGTACACTGTCCTTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  TGCTTATGAGCATGTGCCCATACCATATCCTCAGTACACTGTCCTTTTTA  387

seq1  TTTAGAGAGATGAACAGTGAAGCCAGAACAGCTACAAAGTTTCAACTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTTAGAGAGATGAACAGTGAAGCCAGAACAGCTACAAAGTTTCAATTAAA  437

seq1  GTTCATGGGTGACAAAAAATAAGAGATTGTTTTCTAACAAAAATACATCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  GTTCATGGGTGACAAAAAATAAGAGATTGTTTTTTAACAATAATACATCG  487

seq1  ACTTCATAAAATTTATGTTGGAAACATTTAAAATAATAGTTTTTCTAATT  550
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATAAAATTTATGTTGGAAACATTTAAAATAATAGTTTTTCTAATT  537

seq1  ATAATTGTTCTCTAAAATTTATGTTCAATTCATGACCTAAGGCTATATAT  600
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGTTCTGTAAAATTTATGTTCAATTCATGACCTAAGGCTATATAT  587

seq1  TACCCATCAAAATTATATTCATTCTTTATCCTAGAGAAAGAAATTAACTA  650
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TACCCATCAAAATTATATTCATTCTTTATCTTAGAGAAAGAAATTAACTA  637

seq1  AAATGCTTTAAATTAAAAAAAAACATTTATAAGTGTTTGCCAATAACAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTTTAAATTAAAAAAAAACATTTATAAGTGTTTGCCAATAACAGA  687

seq1  TATGATCAAAATGGCAAAGCCGGTATGAGGGACAATTAAATCAGGTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TATGATCAAAATGGCAAAGCCGGTATGAGGGACAATTAAATCAGGTTTTG  737

seq1  ATTGCTTAGTTTGACTCTTTCAATCTATATACTTTTTCTAAACAAGTCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATTGCTTAGTTTGACTCTTTCAATCTATATACTTTTTTTAAACAAGTCAT  787

seq1  ATGTAAATACAAATTCTGTGTGTCTAGTATACATCCAGACCAATATCAGA  850
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAATACAAATTTTGTGTGTCTAGTATACATCCAGACCAATATCAGA  837

seq1  AGTGCTTAATTTGTTCTCTAGTGACTATTTCTGCCTGAAAGAGAAGTGGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGTGCTTAATTTGTTCTCTAGTGACTATTTCTGCCTGAAAGAGAAGTGGG  887

seq1  TAAAATATTTGGAATGTGCATAAGTTATATCTGAAATCCTTCGGATAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||
seq2  TAAAATATTTGGAATGTGCATAAGTTATATACGAAATCCTTAGGATAAAA  937

seq1  ACAGTCATTAAGGTTTCTCCATGTTTCCTTCTAGAATGTTTGCTCTAAGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATTAAGGTTTCTCCATGTTTCCTTCTAGAATGTTTGCTCTAAGG  987

seq1  CCAATGGTCTCTTCTGGAATAGCTTGGTAACCTATGGATAATTCAGAGAA  1050
      ||||||||  |  | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGGT-ACAGCAGGAATAGCAGGGTCACCTATGGATAATTCAGAGAA  1036

seq1  TTC  1053
      |||
seq2  TTC  1039

seq1: chr10_64903239_64903635
seq2: B6Ng01-167M10.g_67_517

seq1  GAATTCAGACTTATACCAGCCCCAGTCTTTTACAAAACATCAATATTGAA  50
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATACTTAAACCAGCCCCAGTCTTTTACAAAACATCAATATTGAA  50

seq1  ACACCCAAAGTGGCAGAACATAGGATGGTTGGAAGATCAAATTCTGAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAAAGTGGCAGAACATAGGATGGTTGGAAGATCAAATTCTGAAGC  100

seq1  ATTAGAATTCACACACTTGGCTCCAGCTGGCCATGTGAGCTTGCTCTCTA  150
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAATTCACACGCTTGGCTCCAGCTGGCCATGTGAGCTTGCTCTCTA  150

seq1  GGATCTACATGGAATAAGGAGAGAACTAACAGAAGAATATTCTCCTAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTACATGGAATAAGGAGAGAACTAACAGAAGAATATTCTCCTAGCC  200

seq1  TTCACATGTGGGCCATGTGGGCCATGGTATGCATATTGTGTGTATACATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATGTGGGCCATGTGGGCCATGGTATGCATATTGTGTGTATACATG  250

seq1  CATATACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATA  300

seq1  TATATATATATAACATACACACATATACATATATATATCACATATACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||
seq2  TATATATATATAACATACACACATAGACATAGGTATATCACATATACACA  350

seq1  TATATATATCACATACACACATATGTACATATATGTATATATATATA---  397
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   
seq2  TATATATATCACATACACACATATGTACATATATATATATATGTATATAT  400

seq1  --------------------------------------------------  397
                                                        
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATAT  450

seq1  -  397
       
seq2  A  451