BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168I07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 118,513,830 - 118,631,774
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042861, LOC674417
Upstream geneMdm1, Il22, LOC672934, LOC668180, LOC668186, LOC668187, LOC668191, EG668193, Iltifb, LOC668198, EG668203, EG668205, EG668209, EG668213, LOC668216, Ifng, LOC100043478, LOC100042850, Dyrk2, LOC668223
Downstream geneCand1, Grip1, Helb, Irak3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168I07.bB6Ng01-168I07.g
ACCDH959737DH959738
length1,1831,131
definitionDH959737|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168I07, 5' end.DH959738|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168I07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,513,830 - 118,515,014)(118,630,642 - 118,631,774)
sequence
gaattcagttcacaagtggtcagtgacaaccttacaagtcagaatttccc
aaactgggaaatgagaaaatgtacggatggcttaaaaatcattaattgtt
accaatattgggaacttattatttttttaatcatggcaggattttaaaat
acataatcataaacaaggtatacctcagcgatgtatgtaactctcgaatt
ttgggttttgttttgtttgtttgtttgtttgtttgttttgagacagggtc
tctctacatggctctagctgtcctgaaactcactacttagaccaggctgt
cctcaaactcacataaatcccccggcctttgcttctgcctcccaagggat
gaaaggtgtgtgcctccatatctggctgcaatgcatataactctggatgc
aattaaaaactcaaaagcaagcttataaggcaaaagcccagtaagtggta
tattaacatgaccactttggtgcaatagatatttaatgcaatagacgttg
ttatttaactaaaaccgaataaccatgggcttgtgactatggtgagccat
gtgcatgagcaaggtttctgtcctgccaccctgtgtgaccagagcaccgc
aggaattgttctcccacacctccccaagcaagctgaaaggaagccattat
cacaagaacttggtagtgtttggctctcacttccctaatctctgtgtcaa
gtttgtctccagctcttttcccaatagtatagagataaagacagggatgg
cttcttgacttgaccctgggagtcatcttaaatacaagaagaaatgtaga
aaccaaagttaattgacatttgtctacacatactttgaatgatctagaaa
taaatgcttctttaaacctcaaactgtccttgagattaaagagtgggttc
tttgtttgttgtttgtttgttttctgtcagtttctgaaaggcaccgtgta
tatctcccggagacatcatagaagcaggccatgtgtttttatgaaaaact
acgaaagtgctcccagcctgccgtgacaatttgagcaggaagtgtcacga
tcagattcatattagagttactgaaccaggtagcctgtggacatgttatt
gagagaggaaacttgaatgtttaagggatacttggagcataacgtaatct
cataccaacatacgccattgcttcgccacacat
gaattccatgtcagcttaaatagtggggtctcagataagctgcttttagt
attcagtatttatacctagagaggaggttcaatgggcgagagtcattgct
tttcttccagaggacctgggttcaatccccagcacccacgtggtggctcc
caaccatttataactctagtcctagcatagctgatgctctcctcttctgg
cttctctgggcatgaggcacacgtgctggatacagatacatgcaaacaaa
acaccacagataaaaaaaattttaagtttaaatttaaaaaggaaaaatta
cggtgccttagttctgaagctagccacattttcggaagaagagtcaatca
gacttgaaagaaagtgaaactgtagggatgtcaaaaaattttttgaggtg
gttaatgtctctatgattccagagagaatagtggggagcagaaaaagcaa
aggaatagaaaggagggctaaaactttattcaagaatagcatacataggg
ctaagtatgagttatggctcaatgaattatcaaaaagagaatacattcat
gggaccatcattcaggtcagaaaagatcactaatcagctctctgcttggt
ccttgttgctcaccactttgtctcggtggtgagtacataccaggactaag
actttgggactcatactccctttgtgggccagtcaactcctagtaattta
catattgcctgtatacctataactctgaaattaatgtctccactacttat
ttctccatttgtttcttttcccctgaatctgagccatgtagaaccaagtg
cctagttggcaccatcattttgatgtcttacaaagcatctccagcctgat
gacacagaactgaattagagttagagacatttattgtctgacagatctct
taagcatagtaatttaatcttttttaaaaagatttatttattttatttat
atgagtacattgtagctgtcttcaaacacaccagatggcagcatcggatt
ctataaagatgtttttgagccacatgtggctgctgagtatggacgcagga
ctttggaagagcagtcagtgctcttaacaactgagccacttctcccacct
ggagcaatttaaatttttggggggggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_118513830_118515014
seq2: B6Ng01-168I07.b_48_1230

seq1  GAATTCAGTTCACAAGTGGTCAGTGACAACCTTACAAGTCAGAATTTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCACAAGTGGTCAGTGACAACCTTACAAGTCAGAATTTCCC  50

seq1  AAACTGGGAAATGAGAAAATGTACGGATGGCTTAAAAATCATTAATTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGGAAATGAGAAAATGTACGGATGGCTTAAAAATCATTAATTGTT  100

seq1  ACCAATATTGGGAACTTATTATTTTTTTAATCATGGCAGGATTTTAAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATATTGGGAACTTATTATTTTTTTAATCATGGCAGGATTTTAAAAT  150

seq1  ACATAATCATAAACAAGGTATACCTCAGCGATGTATGTAACTCTCGAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAATCATAAACAAGGTATACCTCAGCGATGTATGTAACTCTCGAATT  200

seq1  TTGGGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACAGGGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACAGGGTC  250

seq1  TCTCTACATGGCTCTAGCTGTCCTGAAACTCACTACTTAGACCAGGCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTACATGGCTCTAGCTGTCCTGAAACTCACTACTTAGACCAGGCTGT  300

seq1  CCTCAAACTCACATAAATCCCCCGGCCTTTGCTTCTGCCTCCCAAGGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAACTCACATAAATCCCCCGGCCTTTGCTTCTGCCTCCCAAGGGAT  350

seq1  GAAAGGTGTGTGCCTCCATATCTGGCTGCAATGCATATAACTCTGGATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGTGTGTGCCTCCATATCTGGCTGCAATGCATATAACTCTGGATGC  400

seq1  AATTAAAAACTCAAAAGCAAGCTTATAAGGCAAAAGCCCAGTAAGTGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAAACTCAAAAGCAAGCTTATAAGGCAAAAGCCCAGTAAGTGGTA  450

seq1  TATTAACATGACCACTTTGGTGCAATAGATATTTAATGCAATAGACGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAACATGACCACTTTGGTGCAATAGATATTTAATGCAATAGACGTTG  500

seq1  TTATTTAACTAAAACCGAATAACCATGGGCTTGTGACTATGGTGAGCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAACTAAAACCGAATAACCATGGGCTTGTGACTATGGTGAGCCAT  550

seq1  GTGCATGAGCAAGGTTTCTGTCCTGCCACCCTGTGTGACCAGAGCACCGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATGAGCAAGGTTTCTGTCCTGCCACCCTGTGTGACCAGAGCACCGC  600

seq1  AGGAATTGTTCTCCCACACCTCCCCAAGCAAGCTGAAAGGAAGCCATTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATTGTTCTCCCACACCTCCCCAAGCAAGCTGAAAGGAAGCCATTAT  650

seq1  CACAAGAACTTGGTAGTGTTTGGCTCTCACTTCCCTAATCTCTGTGTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGAACTTGGTAGTGTTTGGCTCTCACTTCCCTAATCTCTGTGTCAA  700

seq1  GTTTGTCTCCAGCTCTTTTCCCAATAGTATAGAGATAAAGACAGGGATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCTCCAGCTCTTTTCCCAATAGTATAGAGATAAAGACAGGGATGG  750

seq1  CTTCTTGACTTGACCCTGGGAGTCATCTTAAATACAAGAAGAAATGTAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGACTTGACCCTGGGAGTCATCTTAAATACAAGAAGAAATGTAGA  800

seq1  AACCAAAGTTAATTGACATTTGTCTACACATACTTTGAATGATCTAGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAAGTTAATTGACATTTGTCTACACATACTTTGAATGATCTAGAAA  850

seq1  TAAATGCTTCTTTAAACCTCAAACTGTCCTTGAGATTAAAGAGTGGGTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGCTTCTTTAAACCTCAAACTGTCCTTGAGATTAAAGAGTGGGTTC  900

seq1  TTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTCTGTCAGTTTCTGAAAGGCACCGTGT  950
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTG-TTGTTTGTTTGTTTTCTGTCAGTTTCTGAAAGGCACCGTGT  949

seq1  ATATCTCCCGGAGGACATCATAGAAGCAGGCCATGTGTTTTTATGAAAAA  1000
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCCCGGA-GACATCATAGAAGCAGGCCATGTGTTTTTATGAAAAA  998

seq1  CTACGAAAGTGCTCCCAGCCTGCCGTGGACAAATTTGAGGCAAGGAAGTG  1050
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||
seq2  CTACGAAAGTGCTCCCAGCCTGCCGT-GAC-AATTTGAG--CAGGAAGTG  1044

seq1  TCACGATCAGAATTCCATATTAGAGTTACTGAACCCAGGTAGCCTTGTGG  1100
      |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  TCACGATCAGA--TTCATATTAGAGTTACTGAA-CCAGGTAGCC-TGTGG  1090

seq1  ACATGTTA-TGAGAGAGGAGAC-TGAATG-TTAAGGGATTACTTGGAGCC  1147
      |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| 
seq2  ACATGTTATTGAGAGAGGAAACTTGAATGTTTAAGGGA-TACTTGGAGC-  1138

seq1  AATAACAGTAATCATCATACACACACATAC------------ACACACAT  1185
       ||||| |||||| |||||| || ||||||             |||||||
seq2  -ATAAC-GTAATC-TCATAC-CA-ACATACGCCATTGCTTCGCCACACAT  1183

seq1: chr10_118630642_118631774
seq2: B6Ng01-168I07.g_70_1200 (reverse)

seq1  CCCCCCACCCCCCAAAA--TTAAATTGCTACAGGTTGGAGAAGTGGCTCA  48
      |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCCCCCAAAAATTTAAATTGCTCCAGGTGGGAGAAGTGGCTCA  50

seq1  GTTGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGTCCTGCGTTCAATACTCA  98
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
seq2  GTTGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAA-GTCCTGCG-TCCATACTCA  98

seq1  GCAGCCACATGGTGGCTCAAAAACATCTATAATAGAATCCGATGCTGCCT  148
      |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| 
seq2  GCAGCCACAT-GTGGCTCAAAAACATCT-TTATAGAATCCGATGCTGCCA  146

seq1  TCTGGTGTGTTTGAAGACAGCTACAATGTACTCATATAAATAAAATAAAT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGTGTTTGAAGACAGCTACAATGTACTCATATAAATAAAATAAAT  196

seq1  AAATCTTTTTTAAAAAGATTAAATTACTATGCTTAAGAGATCTGTCAGAC  248
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTTTTAAAAAAGATTAAATTACTATGCTTAAGAGATCTGTCAGAC  246

seq1  AATAAATGTCTCTAACTCTAATTCAGTTCTGTGTCATCAGGCTGGAGATG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATGTCTCTAACTCTAATTCAGTTCTGTGTCATCAGGCTGGAGATG  296

seq1  CTTTGTAAGACATCAAAATGATGGTGCCAACTAGGCACTTGGTTCTACAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAAGACATCAAAATGATGGTGCCAACTAGGCACTTGGTTCTACAT  346

seq1  GGCTCAGATTCAGGGGAAAAGAAACAAATGGAGAAATAAGTAGTGGAGAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGATTCAGGGGAAAAGAAACAAATGGAGAAATAAGTAGTGGAGAC  396

seq1  ATTAATTTCAGAGTTATAGGTATACAGGCAATATGTAAATTACTAGGAGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTTCAGAGTTATAGGTATACAGGCAATATGTAAATTACTAGGAGT  446

seq1  TGACTGGCCCACAAAGGGAGTATGAGTCCCAAAGTCTTAGTCCTGGTATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGGCCCACAAAGGGAGTATGAGTCCCAAAGTCTTAGTCCTGGTATG  496

seq1  TACTCACCACCGAGACAAAGTGGTGAGCAACAAGGACCAAGCAGAGAGCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACCACCGAGACAAAGTGGTGAGCAACAAGGACCAAGCAGAGAGCT  546

seq1  GATTAGTGATCTTTTCTGACCTGAATGATGGTCCCATGAATGTATTCTCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGTGATCTTTTCTGACCTGAATGATGGTCCCATGAATGTATTCTCT  596

seq1  TTTTGATAATTCATTGAGCCATAACTCATACTTAGCCCTATGTATGCTAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATAATTCATTGAGCCATAACTCATACTTAGCCCTATGTATGCTAT  646

seq1  TCTTGAATAAAGTTTTAGCCCTCCTTTCTATTCCTTTGCTTTTTCTGCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAATAAAGTTTTAGCCCTCCTTTCTATTCCTTTGCTTTTTCTGCTC  696

seq1  CCCACTATTCTCTCTGGAATCATAGAGACATTAACCACCTCAAAAAATTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTATTCTCTCTGGAATCATAGAGACATTAACCACCTCAAAAAATTT  746

seq1  TTTGACATCCCTACAGTTTCACTTTCTTTCAAGTCTGATTGACTCTTCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACATCCCTACAGTTTCACTTTCTTTCAAGTCTGATTGACTCTTCTT  796

seq1  CCGAAAATGTGGCTAGCTTCAGAACTAAGGCACCGTAATTTTTCCTTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAAAATGTGGCTAGCTTCAGAACTAAGGCACCGTAATTTTTCCTTTTT  846

seq1  AAATTTAAACTTAAAATTTTTTTTATCTGTGGTGTTTTGTTTGCATGTAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTAAACTTAAAATTTTTTTTATCTGTGGTGTTTTGTTTGCATGTAT  896

seq1  CTGTATCCAGCACGTGTGCCTCATGCCCAGAGAAGCCAGAAGAGGAGAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATCCAGCACGTGTGCCTCATGCCCAGAGAAGCCAGAAGAGGAGAGC  946

seq1  ATCAGCTATGCTAGGACTAGAGTTATAAATGGTTGGGAGCCACCACGTGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCTATGCTAGGACTAGAGTTATAAATGGTTGGGAGCCACCACGTGG  996

seq1  GTGCTGGGGATTGAACCCAGGTCCTCTGGAAGAAAAGCAATGACTCTCGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGGGATTGAACCCAGGTCCTCTGGAAGAAAAGCAATGACTCTCGC  1046

seq1  CCATTGAACCTCCTCTCTAGGTATAAATACTGAATACTAAAAGCAGCTTA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGAACCTCCTCTCTAGGTATAAATACTGAATACTAAAAGCAGCTTA  1096

seq1  TCTGAGACCCCACTATTTAAGCTGACATGGAATTC  1133
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGACCCCACTATTTAAGCTGACATGGAATTC  1131