BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168J02
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,763,242 - 24,905,691
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC212399, Akap7
Upstream geneLOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479
Downstream geneLOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168J02.bB6Ng01-168J02.g
ACCDH959773DH959774
length9231,127
definitionDH959773|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168J02, 5' end.DH959774|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168J02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,904,771 - 24,905,691)(24,763,242 - 24,764,378)
sequence
gaattctgggaggtgcctgggaaccagttagagtaaaaacaggagggaca
atgaggagctaacatatcaagacagcgtcttactgaaaatggaagatcta
tgagaagactcattggctgatgagcacaaacaagacagcctgcctgaaca
ttgtcggcactctacctctccctacgttcagtcatgtgcacacacgtgtg
tccatttgtgtgctcatgtgtgtccatgtgtatgtgtgatggcttttttt
tttttctttttaagacagggttcctatcttggggctcattcagtgtggca
agattgaatggccacctagccgccgcaggagtcttgcctgtttctgtgtc
ttcagtgctgaggtcatgaatgtgtgcagcttcctcggcacttttgtgtg
ggttctgggggttgaactaggctccatgtgcttgcgtggcacccacttac
cactaaccactaaccactaaccactaaccactaaccactaaccactaacc
acttacttatggtgagtggccatatccccaaccgttgccttctcagcttt
tgcttggtgttgactgtggctcccagcggcttctctgttctcacgcttac
tggcctcactggtttatggaggtgggacttccctcagctctgggaaacaa
agagttcttctctccttcccacatagaagatcaggagctgcacctgaatg
gccagtgtgccattgctgccctctcctacagggctcctggagagctattg
agcggtgctgctatggcccacagggtaacctaggggaagtttttaacagc
tctgtaggagctctgtagaaagggaggggagccagaacacacaggtagaa
gtggagtgagcctaataatcttgtttgcttagtgaaagggtgggaggaag
gtatggaaaggaaattgggagga
gaattctctgttgttcgattaaaacattggaattggacacaaagaagagt
caccttgaaatctagccaaaagatcctagctggtgaaatgctgggtttat
tgcattaagagtaatcaccaagcatagatattaaaagcagtgattagtca
atcttttaccagagtctgtagtattttgaaattcaattgaagatgaaaaa
tgatgtatatctcatttagaatcattgtcaaatagtaaaccaaattatta
gaagatctatgattatgaattaggtcccaaatgtatctccatcttgaaaa
atagatgtattatgtattgctagtgaaatctgaaataagatagacactga
aaaatggcttgccaatttttcaaacattatgtaaagtatgactctatgac
cccctccctagtctattcctatgtatgcattttatatatacattcagcag
aattgaaaataggacttaaatagaaacttgtctaccagtattcataaagt
gaattcattttttaaagaagcagagacagaaggatctctctgaattccag
gacagcctggtctacagagtgagttccaggacagccagggctataaaaaa
attaaaaaacaaaaccaaaaccaaaaccaaaccaaaacaaaacaaaaaca
cctggtcttaaacaacaacaacagaaatttcgttcatcataaccaagagg
tagaaaacaacccttagcacccatgcacagatgaacaacaactgaaatgt
ggcatacacataagaaacattatccagccacagaaagcaatgaagttcta
cacatgctacatcttgggtatctacagctttttcttcaccatcttgaaat
ccccaaggtaattacattatgaagagaaaatatttacttttactcagcct
tggaggtctcagcctacagtcaggcagatctgttgctgtggacccctggt
ggacatgttggatgctaatggtaagaaggccagagtggaggacaactggt
tacctcaaagacagggacaaaaaggcaaagagacgggaagtagtgagtcc
taagaatccttgaggcgggtcttcatactcttaaaagcttcacctctagg
tcatgccatctgttttgagtatgccta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24904771_24905691
seq2: B6Ng01-168J02.b_43_964 (reverse)

seq1  CCTCCCAATCTCC-TTCCATACCTTCCTCCCACCCTTTCACTAAGCAAAC  49
      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAATTTCCTTTCCATACCTTCCTCCCACCCTTTCACTAAGCAAAC  50

seq1  AAGATTATTAGGCTCACTCCACTTCTACCTGTGTGTTCTGGCTCCCCTCC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTATTAGGCTCACTCCACTTCTACCTGTGTGTTCTGGCTCCCCTCC  100

seq1  CTTTCTACAGAGCTCCTACAGAGCTGTTAAAAACTTCCCCTAGGTTACCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTACAGAGCTCCTACAGAGCTGTTAAAAACTTCCCCTAGGTTACCC  150

seq1  TGTGGGCCATAGCAGCACCGCTCAATAGCTCTCCAGGAGCCCTGTAGGAG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGCCATAGCAGCACCGCTCAATAGCTCTCCAGGAGCCCTGTAGGAG  200

seq1  AGGGCAGCAATGGCACACTGGCCATTCAGGTGCAGCTCCTGATCTTCTAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGCAATGGCACACTGGCCATTCAGGTGCAGCTCCTGATCTTCTAT  250

seq1  GTGGGAAGGAGAGAAGAACTCTTTGTTTCCCAGAGCTGAGGGAAGTCCCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAGGAGAGAAGAACTCTTTGTTTCCCAGAGCTGAGGGAAGTCCCA  300

seq1  CCTCCATAAACCAGTGAGGCCAGTAAGCGTGAGAACAGAGAAGCCGCTGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATAAACCAGTGAGGCCAGTAAGCGTGAGAACAGAGAAGCCGCTGG  350

seq1  GAGCCACAGTCAACACCAAGCAAAAGCTGAGAAGGCAACGGTTGGGGATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCACAGTCAACACCAAGCAAAAGCTGAGAAGGCAACGGTTGGGGATA  400

seq1  TGGCCACTCACCATAAGTAAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTTAGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACTCACCATAAGTAAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTTAGT  450

seq1  GGTTAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTAAGTGGGTGCCACGCAAGCACATGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGTGGTTAGTGGTTAGTGGTAAGTGGGTGCCACGCAAGCACATGGA  500

seq1  GCCTAGTTCAACCCCCAGAACCCACACAAAAGTGCCGAGGAAGCTGCACA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGTTCAACCCCCAGAACCCACACAAAAGTGCCGAGGAAGCTGCACA  550

seq1  CATTCATGACCTCAGCACTGAAGACACAGAAACAGGCAAGACTCCTGCGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATGACCTCAGCACTGAAGACACAGAAACAGGCAAGACTCCTGCGG  600

seq1  CGGCTAGGTGGCCATTCAATCTTGCCACACTGAATGAGCCCCAAGATAGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTAGGTGGCCATTCAATCTTGCCACACTGAATGAGCCCCAAGATAGG  650

seq1  AACCCTGTCTTAAAAAGAAAAAAAAAAAAGCCATCACACATACACATGGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGTCTTAAAAAGAAAAAAAAAAAAGCCATCACACATACACATGGA  700

seq1  CACACATGAGCACACAAATGGACACACGTGTGTGCACATGACTGAACGTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGAGCACACAAATGGACACACGTGTGTGCACATGACTGAACGTA  750

seq1  GGGAGAGGTAGAGTGCCGACAATGTTCAGGCAGGCTGTCTTGTTTGTGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAGGTAGAGTGCCGACAATGTTCAGGCAGGCTGTCTTGTTTGTGCT  800

seq1  CATCAGCCAATGAGTCTTCTCATAGATCTTCCATTTTCAGTAAGACGCTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCCAATGAGTCTTCTCATAGATCTTCCATTTTCAGTAAGACGCTG  850

seq1  TCTTGATATGTTAGCTCCTCATTGTCCCTCCTGTTTTTACTCTAACTGGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATATGTTAGCTCCTCATTGTCCCTCCTGTTTTTACTCTAACTGGT  900

seq1  TCCCAGGCACCTCCCAGAATTC  921
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCACCTCCCAGAATTC  922

seq1: chr10_24763242_24764378
seq2: B6Ng01-168J02.g_70_1196

seq1  GAATTCTCTGTTGTTCGATTAAAACATTGGAATTGGACACAAAGAAGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTTGTTCGATTAAAACATTGGAATTGGACACAAAGAAGAGT  50

seq1  CACCTTGAAATCTAGCCAAAAGATCCTAGCTGGTGAAATGCTGGGTTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGAAATCTAGCCAAAAGATCCTAGCTGGTGAAATGCTGGGTTTAT  100

seq1  TGCATTAAGAGTAATCACCAAGCATAGATATTAAAAGCAGTGATTAGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTAAGAGTAATCACCAAGCATAGATATTAAAAGCAGTGATTAGTCA  150

seq1  ATCTTTTACCAGAGTCTGTAGTATTTTGAAATTCAATTGAAGATGAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTACCAGAGTCTGTAGTATTTTGAAATTCAATTGAAGATGAAAAA  200

seq1  TGATGTATATCTCATTTAGAATCATTGTCAAATAGTAAACCAAATTATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTATATCTCATTTAGAATCATTGTCAAATAGTAAACCAAATTATTA  250

seq1  GAAGATCTATGATTATGAATTAGGTCCCAAATGTATCTCCATCTTGAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATCTATGATTATGAATTAGGTCCCAAATGTATCTCCATCTTGAAAA  300

seq1  ATAGATGTATTATGTATTGCTAGTGAAATCTGAAATAAGATAGACACTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGTATTATGTATTGCTAGTGAAATCTGAAATAAGATAGACACTGA  350

seq1  AAAATGGCTTGCCAATTTTTCAAACATTATGTAAAGTATGACTCTATGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGCTTGCCAATTTTTCAAACATTATGTAAAGTATGACTCTATGAC  400

seq1  CCCCTCCCTAGTCTATTCCTATGTATGCATTTTATATATACATTCAGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCCCTAGTCTATTCCTATGTATGCATTTTATATATACATTCAGCAG  450

seq1  AATTGAAAATAGGACTTAAATAGAAACTTGTCTACCAGTATTCATAAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAAAATAGGACTTAAATAGAAACTTGTCTACCAGTATTCATAAAGT  500

seq1  GAATTCATTTTTTAAAGAAGCAGAGACAGAAGGATCTCTCTGAATTCCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTTTAAAGAAGCAGAGACAGAAGGATCTCTCTGAATTCCAG  550

seq1  GACAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATAAAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATAAAAAA  600

seq1  ATTAAAAAACAAAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAACAAAACAAAAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAAACAAAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAACAAAACAAAAACA  650

seq1  CCTGGTCTTAAACAACAACAACAGAAATTTCGTTCATCATAACCAAGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCTTAAACAACAACAACAGAAATTTCGTTCATCATAACCAAGAGG  700

seq1  TAGAAAACAACCCTTAGCACCCATGCACAGATGAACAACAACTGAAATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAACAACCCTTAGCACCCATGCACAGATGAACAACAACTGAAATGT  750

seq1  GGCATACACATAAGAAACATTATCCAGCCACAGAAAGCAATGAAGTTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATACACATAAGAAACATTATCCAGCCACAGAAAGCAATGAAGTTCTA  800

seq1  CACATGCTACATCTTGGGTATCTACAGC-TTTTCTTCACCATCTTGAAAT  849
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCTACATCTTGGGTATCTACAGCTTTTTCTTCACCATCTTGAAAT  850

seq1  CCCCAAGGTAATTACATTATGAAGAGAAAATATTTACTTTTACTCAGCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAGGTAATTACATTATGAAGAGAAAATATTTACTTTTACTCAGCCT  900

seq1  TGGAGGTCTCAGCCTACAGTCAGGCAGATCTGTTGCTGTGGACCCCTGGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTCTCAGCCTACAGTCAGGCAGATCTGTTGCTGTGGACCCCTGGT  950

seq1  GGACATGTTGGATGCTAATGGTAAAGAAGGCCAGAGTGGAGGAC-ACTGG  998
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGACATGTTGGATGCTAATGGT-AAGAAGGCCAGAGTGGAGGACAACTGG  999

seq1  TTACCTCAAAGACAGGGACAAAAAGCAAAAGAGAACGGGAAGGTAGTGAG  1048
      |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||
seq2  TTACCTCAAAGACAGGGACAAAAAGGCAAAGAG-ACGGGAA-GTAGTGAG  1047

seq1  TCCT-AGAATCCCCTTTGAGGGCGTGTCTTCAATACCTCTTATAAGCTTC  1097
      |||| |||||||   |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||| 
seq2  TCCTAAGAATCC---TTGA-GGCGGGTCTTC-ATA-CTCTTAAAAGCTT-  1090

seq1  CACCTCTTAAGGGGTCATGGCATCTG-TTTGAGTATGCCTA  1137
      |||||||     ||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  CACCTCT----AGGTCATGCCATCTGTTTTGAGTATGCCTA  1127