BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168N05
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,301,429 - 90,416,373
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneE530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168N05.bB6Ng01-168N05.g
ACCDH959965DH959966
length920895
definitionDH959965|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168N05, 5' end.DH959966|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168N05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,301,429 - 90,302,347)(90,415,480 - 90,416,373)
sequence
gaattctcagaattgtgttgactcgcctctctagggagtatgaacagggt
taagaagaaaacagcacggagccacttcatcctctacggaaccttctgcc
tctttccttacctgccaatgtggatggtggttgtgtctgactggttactg
tttgtctctctccctctctcatgccgtggccccctcctctttcccacctt
ccctccctcccttcctccaacacttactatttttctcatctttgctagaa
atttaagaaaaaaaaagttctgtgaagtaatccgataacgtcatgtattt
tggagctggctttaacaggtcttgctgttgggttgctttgaaagaagtcc
ccaatggatcttctgtctttcaaagacctgagcaactggatgggtgatag
cagactgtgcttttgggtgggagggaaatcaagagttctgggttaagctt
ttaagttggagaaacttagaatcgatgtgaaaaatgtcaagcaggtggtt
ggatctaccagtcatgaaactcaggaatgctagatacacatttagtctat
aaccctgtacccagggacgtgtatgacaaacctacattattcagaaacac
ctgtttttatggactatttagccctatgagtaaacttatttataatctaa
caagtgtctgacatcttttaatataaatgaatcaggttaatggttggtat
gaattagcaaaatttccttctcactttaaagttcaagataatttctctta
aattgtacatattcaccaagaagtccaaaacggtcttaattgtggtactt
agaaaagcaaatggaaatagagcctctctggttgtggaagggtaaagaac
gcattgcatgatagggcatgggatgtaaacagtagagatgctggaccact
gtgactgggggggggggggg
gaattcatcacgctccaagtcacgtgttgacacaggtccgcgtcatctgc
ggtgagagcggaggaagtccccagtgtttggccttacaacacagccctgg
ccttttctacgcatccctggtgcacccgattcctggtcacagtctggatg
actgcagtatgctagctccccttggcatctactgatggcggagtagtagt
gcacgccgctacacagtcagctgaccgtgttttctgaatactgttattta
tgttccttttggtttagatcctttcagggttcacatctggccacaaaaat
ctcagggaagagggagctctgtctcccacgtgggctgatttccagcacca
gggttgcgacatttcctacatgttcacaagccaatctcagccctaccaca
ttttgaacatagaagagcatagaactgcagaattacaagaaagtgaagaa
ttaagcataaatgaatataccagagcatgcagacatgttctttataggga
actaagaattagcaagggtctgtctaggtcagtggttctcaaccttccta
aggctttgaccctttaatacagttcctcatgttgtggtgactcccaacca
taaaattatctttgttgctacttcataactataattttattactgctata
agttgtaatgtaaatatctaatatgcaggagatatgatatttgatccctg
tgaaagggttgttagaaaaaaccaaacaaacaaaaacaaaacaaaacaaa
acaaaaaaagaaagggttgttagaccccccccaggggggtcaaaacccag
actgagaacctgttggtctagcagagaaggtaaagctttttaatgttcgt
gttctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90301429_90302347
seq2: B6Ng01-168N05.b_47_965

seq1  GAATTCTCAGAATTGTGTTGACTCGCCTCTCTAGGGAGTATGAACAGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGAATTGTGTTGACTCGCCTCTCTAGGGAGTATGAACAGGGT  50

seq1  TAAGAAGAAAACAGCACGGAGCCACTTCATCCTCTACGGAACCTTCTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGAAAACAGCACGGAGCCACTTCATCCTCTACGGAACCTTCTGCC  100

seq1  TCTTTCCTTACCTGCCAATGTGGATGGTGGTTGTGTCTGACTGGTTACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCTTACCTGCCAATGTGGATGGTGGTTGTGTCTGACTGGTTACTG  150

seq1  TTTGTCTCTCTCCCTCTCTCATGCCGTGGCCCCCTCCTCTTTCCCACCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTCTCTCCCTCTCTCATGCCGTGGCCCCCTCCTCTTTCCCACCTT  200

seq1  CCCTCCCTCCCTTCCTCCAACACTTACTATTTTTCTCATCTTTGCTAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCTCCCTTCCTCCAACACTTACTATTTTTCTCATCTTTGCTAGAA  250

seq1  ATTTAAGAAAAAAAAAGTTCTGTGAAGTAATCCGATAACGTCATGTATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGAAAAAAAAAGTTCTGTGAAGTAATCCGATAACGTCATGTATTT  300

seq1  TGGAGCTGGCTTTAACAGGTCTTGCTGTTGGGTTGCTTTGAAAGAAGTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTGGCTTTAACAGGTCTTGCTGTTGGGTTGCTTTGAAAGAAGTCC  350

seq1  CCAATGGATCTTCTGTCTTTCAAAGACCTGAGCAACTGGATGGGTGATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGGATCTTCTGTCTTTCAAAGACCTGAGCAACTGGATGGGTGATAG  400

seq1  CAGACTGTGCTTTTGGGTGGGAGGGAAATCAAGAGTTCTGGGTTAAGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTGTGCTTTTGGGTGGGAGGGAAATCAAGAGTTCTGGGTTAAGCTT  450

seq1  TTAAGTTGGAGAAACTTAGAATCGATGTGAAAAATGTCAAGCAGGTGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTGGAGAAACTTAGAATCGATGTGAAAAATGTCAAGCAGGTGGTT  500

seq1  GGATCTACCAGTCATGAAACTCAGGAATGCTAGATACACATTTAGTCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTACCAGTCATGAAACTCAGGAATGCTAGATACACATTTAGTCTAT  550

seq1  AACCCTGTACCCAGGGACGTGTATGACAAACCTACATTATTCAGAAACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGTACCCAGGGACGTGTATGACAAACCTACATTATTCAGAAACAC  600

seq1  CTGTTTTTATGGACTATTTAGCCCTATGAGTAAACTTATTTATAATCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTTATGGACTATTTAGCCCTATGAGTAAACTTATTTATAATCTAA  650

seq1  CAAGTGTCTGACATCTTTTAATATAAATGAATCAGGTTAATGGTTGGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGTCTGACATCTTTTAATATAAATGAATCAGGTTAATGGTTGGTAT  700

seq1  GAATTAGCAAAATTTCCTTCTCACTTTAAAGTTCAAGATAATTTCTCTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTAGCAAAATTTCCTTCTCACTTTAAAGTTCAAGATAATTTCTCTTA  750

seq1  AATTGTACATATTCACCAAGAAGTCCAAAACGGTCTTAATTGTGGTACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTACATATTCACCAAGAAGTCCAAAACGGTCTTAATTGTGGTACTT  800

seq1  AGAAAAGCAAATGGAAATAGAGCCTCTCTGGTTGTGGAAGGGTAAAGAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGCAAATGGAAATAGAGCCTCTCTGGTTGTGGAAGGGTAAAGAAC  850

seq1  GCATTGCATGATAGGGCATGGGATGTAAACAGTAGAGATGCTGGACCACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGCATGATAGGGCATGGGATGTAAACAGTAGAGATGCTGGACCACT  900

seq1  GTGACTGGGGGGGGGGGGG  919
      |||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGGGGGGGGGGGGG  919

seq1: chr10_90415480_90416373
seq2: B6Ng01-168N05.g_68_961 (reverse)

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAACACGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAACACGAAC  50

seq1  ATTAAAAAGCTTTACCTTCTCTGCTAGACCAACAGGTTCTCAGTCTGGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAAGCTTTACCTTCTCTGCTAGACCAACAGGTTCTCAGTCTGGGT  100

seq1  TTTGACCCCCCTGGGGGGGGTCTAACAACCCTTTCTTTTTTTGTTTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACCCCCCTGGGGGGGGTCTAACAACCCTTTCTTTTTTTGTTTTGTT  150

seq1  TTGTTTTGTTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTCTAACAACCCTTTCACAGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGTTTTTGTTTGTTTGGTTTTTTCTAACAACCCTTTCACAGGGA  200

seq1  TCAAATATCATATCTCCTGCATATTAGATATTTACATTACAACTTATAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATATCATATCTCCTGCATATTAGATATTTACATTACAACTTATAGC  250

seq1  AGTAATAAAATTATAGTTATGAAGTAGCAACAAAGATAATTTTATGGTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATAAAATTATAGTTATGAAGTAGCAACAAAGATAATTTTATGGTTG  300

seq1  GGAGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCAAAGCCTTAGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCAAAGCCTTAGGAA  350

seq1  GGTTGAGAACCACTGACCTAGACAGACCCTTGCTAATTCTTAGTTCCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAGAACCACTGACCTAGACAGACCCTTGCTAATTCTTAGTTCCCTA  400

seq1  TAAAGAACATGTCTGCATGCTCTGGTATATTCATTTATGCTTAATTCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAACATGTCTGCATGCTCTGGTATATTCATTTATGCTTAATTCTTC  450

seq1  ACTTTCTTGTAATTCTGCAGTTCTATGCTCTTCTATGTTCAAAATGTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTTGTAATTCTGCAGTTCTATGCTCTTCTATGTTCAAAATGTGGT  500

seq1  AGGGCTGAGATTGGCTTGTGAACATGTAGGAAATGTCGCAACCCTGGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGAGATTGGCTTGTGAACATGTAGGAAATGTCGCAACCCTGGTGC  550

seq1  TGGAAATCAGCCCACGTGGGAGACAGAGCTCCCTCTTCCCTGAGATTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATCAGCCCACGTGGGAGACAGAGCTCCCTCTTCCCTGAGATTTTT  600

seq1  GTGGCCAGATGTGAACCCTGAAAGGATCTAAACCAAAAGGAACATAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCAGATGTGAACCCTGAAAGGATCTAAACCAAAAGGAACATAAATA  650

seq1  ACAGTATTCAGAAAACACGGTCAGCTGACTGTGTAGCGGCGTGCACTACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATTCAGAAAACACGGTCAGCTGACTGTGTAGCGGCGTGCACTACT  700

seq1  ACTCCGCCATCAGTAGATGCCAAGGGGAGCTAGCATACTGCAGTCATCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCGCCATCAGTAGATGCCAAGGGGAGCTAGCATACTGCAGTCATCCA  750

seq1  GACTGTGACCAGGAATCGGGTGCACCAGGGATGCGTAGAAAAGGCCAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGACCAGGAATCGGGTGCACCAGGGATGCGTAGAAAAGGCCAGGG  800

seq1  CTGTGTTGTAAGGCCAAACACTGGGGACTTCCTCCGCTCTCACCGCAGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGTAAGGCCAAACACTGGGGACTTCCTCCGCTCTCACCGCAGAT  850

seq1  GACGCGGACCTGTGTCAACACGTGACTTGGAGCGTGATGAATTC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGCGGACCTGTGTCAACACGTGACTTGGAGCGTGATGAATTC  894