BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170E10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 92,278,887 - 92,383,852
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm872, 4930485B16Rik
Upstream geneLOC100041799, LOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1
Downstream geneEG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, Ntn4, LOC667338, LOC100041907, Usp44, Metap2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170E10.bB6Ng01-170E10.g
ACCDH961029DH961030
length695567
definitionDH961029|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E10, 5' end.DH961030|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,383,158 - 92,383,852)(92,278,887 - 92,279,460)
sequence
gaattcaggctcaggtgtgccatacgtcactttttattataggtaccatg
gtggtctctttaggtatatcctccaacatgtcccagatttgtgggtctag
tcttactacttttgtttactgttgttcatcgaagtgtcccattggcatgt
cttattcagatgtttttagtttagaaacctctttctcctctctctcctcc
tcttccttgtgcagccagggctttgtgagtgtgagccaggcactgcctct
atgttatagctcctgccccttttagatttctcatgatttctccaagggaa
gaacagtcttcattttgcctaatctaatttgattttagcagagagttata
cctgacttgcttaatttgtatttgtaaactgggtaattgaagcatccttg
aaaacaagtgctggagtttacagtgagaacataaattaaattggaatgag
cgattattttcttctgctttggttttcctggtgatctgggacttgctggg
tgaccttgctggaggcagatgctgattagaattttgatttcattataagt
agtaatttcatcaccccagcatatatacttagaatggaaaactagcaata
aagcaagtttgtttcctaaagaaagaggggaacacacatggggtcaaatg
ggaacggaggtggggagaatcttggagggtatttgggggagggga
cccaaatatcagctactcaatcattccttcattccacaaacatgagcaaa
gagacagcaaagaaacacactcataatgtttatgtctatttatgtactca
agatagtagacgttaaaacatggaaagggcataatgtcagaagatactta
ctcaaattattccaaatatggaaataaatatttatataggcaaagaaacc
ccagtcaatcagccgacaggagattcactcttgtatagatcttgatggca
tgttatggctgtccagctgacacaaggcaaaaactctaacaaatcagaac
ttgaaaaggccaggcagtgtttgcatactttagggatgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgttctatcatgtgtgtctgtgcatgtgactgtgtgca
tatgtgtgtctgattgtgtatctatgctggtatatgtatctctgtatgtg
tttgtatatctatgtgtgtacatttgaatatgtgtgtctgtgcctgtgtg
tacatctatttcagtgtgtttgtaactttgtgtgtttgtgtgtgtgtgat
gttttgtgtttgcatgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_92383158_92383852
seq2: B6Ng01-170E10.b_46_740 (reverse)

seq1  TCCCCTCCCCCAAATACCCTCCAAGATTCTCCCCACCTCCGTTCCCATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCCCCAAATACCCTCCAAGATTCTCCCCACCTCCGTTCCCATTT  50

seq1  GACCCCATGTGTGTTCCCCTCTTTCTTTAGGAAACAAACTTGCTTTATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCATGTGTGTTCCCCTCTTTCTTTAGGAAACAAACTTGCTTTATTG  100

seq1  CTAGTTTTCCATTCTAAGTATATATGCTGGGGTGATGAAATTACTACTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTTTCCATTCTAAGTATATATGCTGGGGTGATGAAATTACTACTTA  150

seq1  TAATGAAATCAAAATTCTAATCAGCATCTGCCTCCAGCAAGGTCACCCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAAATCAAAATTCTAATCAGCATCTGCCTCCAGCAAGGTCACCCAG  200

seq1  CAAGTCCCAGATCACCAGGAAAACCAAAGCAGAAGAAAATAATCGCTCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCCAGATCACCAGGAAAACCAAAGCAGAAGAAAATAATCGCTCAT  250

seq1  TCCAATTTAATTTATGTTCTCACTGTAAACTCCAGCACTTGTTTTCAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATTTAATTTATGTTCTCACTGTAAACTCCAGCACTTGTTTTCAAGG  300

seq1  ATGCTTCAATTACCCAGTTTACAAATACAAATTAAGCAAGTCAGGTATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTCAATTACCCAGTTTACAAATACAAATTAAGCAAGTCAGGTATAA  350

seq1  CTCTCTGCTAAAATCAAATTAGATTAGGCAAAATGAAGACTGTTCTTCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGCTAAAATCAAATTAGATTAGGCAAAATGAAGACTGTTCTTCCC  400

seq1  TTGGAGAAATCATGAGAAATCTAAAAGGGGCAGGAGCTATAACATAGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGAAATCATGAGAAATCTAAAAGGGGCAGGAGCTATAACATAGAGG  450

seq1  CAGTGCCTGGCTCACACTCACAAAGCCCTGGCTGCACAAGGAAGAGGAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCCTGGCTCACACTCACAAAGCCCTGGCTGCACAAGGAAGAGGAGG  500

seq1  AGAGAGAGGAGAAAGAGGTTTCTAAACTAAAAACATCTGAATAAGACATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGGAGAAAGAGGTTTCTAAACTAAAAACATCTGAATAAGACATG  550

seq1  CCAATGGGACACTTCGATGAACAACAGTAAACAAAAGTAGTAAGACTAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGGGACACTTCGATGAACAACAGTAAACAAAAGTAGTAAGACTAGA  600

seq1  CCCACAAATCTGGGACATGTTGGAGGATATACCTAAAGAGACCACCATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAAATCTGGGACATGTTGGAGGATATACCTAAAGAGACCACCATGG  650

seq1  TACCTATAATAAAAAGTGACGTATGGCACACCTGAGCCTGAATTC  695
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATAATAAAAAGTGACGTATGGCACACCTGAGCCTGAATTC  695

seq1: chr10_92278887_92279460
seq2: B6Ng01-170E10.g_69_641

seq1  GAATTCCCCAAATATCAGCTACTCAATCATTCCTTCATTCCACAAACATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCAAATATCAGCTACTCAATCATTCCTTCATTCCACAAACATG  50

seq1  AGCAAAGAGACAGCAAAGAAACACACTCATAATGTTTATGTCTATTTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAGAGACAGCAAAGAAACACACTCATAATGTTTATGTCTATTTATG  100

seq1  TACTCAAGATAGTAGACGTTAAAACATGGAAAGGGCATAATGTCAGAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAAGATAGTAGACGTTAAAACATGGAAAGGGCATAATGTCAGAAGA  150

seq1  TACTTACTCAAATTATTCCAAATATGGAAATAAATATTTATATAGGCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTACTCAAATTATTCCAAATATGGAAATAAATATTTATATAGGCAAA  200

seq1  GAAACCCCAGTCAATCAGCCGACAGGAGATTCACTCTTGTATAGATCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCCAGTCAATCAGCCGACAGGAGATTCACTCTTGTATAGATCTTG  250

seq1  ATGGCATGTTATGGCTGTCCAGCTGACACAAGGCAAAAACTCTAACAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATGTTATGGCTGTCCAGCTGACACAAGGCAAAAACTCTAACAAAT  300

seq1  CAGAACTTGAAAAGGCCAGGCAGTGTTTGCATACTTTAGGGATGTGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACTTGAAAAGGCCAGGCAGTGTTTGCATACTTTAGGGATGTGTGTG  350

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTATCATGTGTGTCTGTGCATGTGACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTATCATGTGTGTCTGTGCATGTGACTG  400

seq1  TGTGCATATGTGTGTCTGATTGTGTATCTATGCTGGTATATGTATCTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATATGTGTGTCTGATTGTGTATCTATGCTGGTATATGTATCTCTG  450

seq1  TATGTGTTTGTATATCTATGTGTGTACATTTGAATATGTGTGTCTGTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTTTGTATATCTATGTGTGTACATTTGAATATGTGTGTCTGTGCC  500

seq1  TGTGTGTACATCTATTTCAGTGTGTTTGTAACTTTGTGTGTTTGTGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTACATCTATTTCAGTGTGTTTGTAACTTTGTGTGTTTGTGTGTG  550

seq1  TGTGATGTGTTTGTGTGTGCATGC  574
      |||||||| ||||||| |||||||
seq2  TGTGATGT-TTTGTGTTTGCATGC  573