BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-175P08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 91,798,526 - 91,945,998
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041799, LOC667203
Downstream geneLOC216229, LOC100041814, Nedd1, Gm872, 4930485B16Rik, EG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-175P08.bB6Ng01-175P08.g
ACCGA003626GA003627
length1,1441,081
definitionB6Ng01-175P08.b B6Ng01-175P08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,944,873 - 91,945,998)(91,798,526 - 91,799,595)
sequence
gaattctcttgtcttatttcttaataatgtttaagggttgcacttatctg
aaaggatctacatgacactaaagcctacatcctactgagaagaacctgga
gaagtcttagcaggaagaagtcttagcactgcttggctgagagaaagcca
ggaggcatctgactgtaagaaaatgagtcaaccttctttttatgttgact
actgacatagtttaagaaaccttatctgaagcagagctttctccccttta
tattatgctgctaaaacaaaggatcatgtttcttccttttaaaagacaaa
ttattgtttgatcatctttggttttcaaggggatctgcccaagtaaaagg
aagatgttttctatcacgggatgctagatttgtttccaatgtaaatgctg
actaaaagatgacaccatttagtcatttttcatgctcagtagttggctgt
ccatgttgctgggaacacaaataggaattgatgattgtttgttagtattt
gtttgtttcacctaggcaattatcattccatggatttgttgatgagatag
aaacctgaactatctgaagaaagggtttgtttcccaacatactgtattag
ctcctcatgacagctgtaacaaataactgcaaatttagtggcttaaaaca
gtagacattaatcatctaacagtctggatgtcaaaagtgcaaaatgggtc
tcactggtctaaaatcatggtgctgcttaggtgaactttttttctgggag
ctctaaggggaatatgtgttagcatactttgtctggcttctagagaatac
atgtatgccttctgtttaagagctttttcttccatcattaaagtaaaaga
gtgttgggagcatctctctgatgttgtcatctattccagttacctatggg
tttcccttaaacaccttttaagatacccctgtgatcacatagccaacttg
gataaactaaggcaataccttttagtaaagttcagattaaagggttagtt
gaagtccagagggcaggtcgacctaacagtcaccaatttcattaataact
tttagtcttccctttaccaatatcctaaataattcccaggtcctggaaag
aaaccttttcccacttgggaatctaatatgtctcatgaaaaggg
gaattcaagatcattctttaactagacagtgagttcatgagtttgaatcc
agctcaggatatgtgagaccctgtctcagaatcgaaacaaaaacaaaaac
ccaaactccacgtagttttcctcagaatttgtaagagttcatcgaaccaa
actatcaaaaactattaatttatctcacattacatctagcaccaaagtgt
gtgaaaaactaattaagaacagaagttgcaaaaacatcaaaaagaaaagc
aaaaacaatataatcacaatcattatactatgagaagaattgggagcaaa
agttactttcaatcactctataaataatttcttccatctctagaccgata
gatgggcacttctttaaaaagccaagaaccagaataacagccaaagacat
ctgttcgtctcctccttcaacgagtgcagatggagactcctacatggtct
gggaaagaggaatcggtcatgctcattagcctgggtagatttgggtttca
aataatgagctaaatggagaactaccaagagactaactcttgctaaagct
gcactgtagcctgaagagggacatgccaatttcagattaattaaaaaggt
tattaaattgttcagatggcatgttaatgagcaatctgcagggggatcag
tcgacagccatgcctccccacataattacaggacccttattgagaagaat
cgtggagagcaggaagaaaaactaaaggagtatccatcttgactataata
caacatggtcaacctacgacaaaatccatgaaacaagatgctagttacac
ttgttatataaactcttttcagatgaaagctgccactaattccagccact
gggaatgttaataattaaatagagagacaatagataatattgtattgact
ttataatatgttttgggtctcagaagcatttattttatcacctcatattt
ttccctgtgcctagtaataaaattaggagggctcatcttttatattagac
atttgactgagctaaccacagtgctatgtatgcttttttgatctccccaa
tcttgggagatgtagcaggaaggttaaaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_91944873_91945998
seq2: B6Ng01-175P08.b_43_1186 (reverse)

seq1  CCCTTTTCATGAGAC-TA-TAGA-TCCCATGTGGGAAA--GTTTCTTTCC  45
      ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||  ||||||||||
seq2  CCCTTTTCATGAGACATATTAGATTCCCAAGTGGGAAAAGGTTTCTTTCC  50

seq1  AGAACTTGTGAATTATTTAGGATATTTGGTAAAGGGAGAACT-AAAGTTA  94
      || || || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||
seq2  AGGACCTGGGAATTATTTAGGATA-TTGGTAAAGGGAAGACTAAAAGTTA  99

seq1  TTAATGAAATT-GTGACTGTTA-GTCGACCTG-CCTCT-GACTTCAACTA  140
      ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||
seq2  TTAATGAAATTGGTGACTGTTAGGTCGACCTGCCCTCTGGACTTCAACTA  149

seq1  A-CCTTTAATCTG-ACTTTAACTAAAGGTATTGCCTTAGTTTATCCAAGT  188
      | ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTTAATCTGAACTTTACTAAAAGGTATTGCCTTAGTTTATCCAAGT  199

seq1  TGGCTATGTGATCACAGGGGTATCTTAAAAGGTG-TTAAGGGAAA-CCAT  236
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  TGGCTATGTGATCACAGGGGTATCTTAAAAGGTGTTTAAGGGAAACCCAT  249

seq1  AGGTAACTGG-ATAGATGACAACATCAGAGAGATGCT-CCAACACTC-TT  283
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  AGGTAACTGGAATAGATGACAACATCAGAGAGATGCTCCCAACACTCTTT  299

seq1  TACTTTAATGATGGAAGAAAAAGCTCTT-AACAGAAGGCATACATGTATT  332
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTAATGATGGAAGAAAAAGCTCTTAAACAGAAGGCATACATGTATT  349

seq1  CTCTAGAAGCCAGACAAAGTATGCTAACACATATT-CCCTTAGAGCTCCC  381
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTCTAGAAGCCAGACAAAGTATGCTAACACATATTCCCCTTAGAGCTCCC  399

seq1  AGAAAAAAAGTTCACCTAAGCAGCACCATGATTTTAGACCAGTGAGACCC  431
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAAAGTTCACCTAAGCAGCACCATGATTTTAGACCAGTGAGACCC  449

seq1  ATTTTGCACTTTTGACATCCAGACTGTTAGATGATTAATGTCTACTGTTT  481
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGCACTTTTGACATCCAGACTGTTAGATGATTAATGTCTACTGTTT  499

seq1  TAAGCCACTAAATTTGCAGTTATTTGTTACAGCTGTCATGAGGAGCTAAT  531
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCACTAAATTTGCAGTTATTTGTTACAGCTGTCATGAGGAGCTAAT  549

seq1  ACAGTATGTTGGGAAACAAACCCTTTCTTCAGATAGTTCAGGTTTCTATC  581
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATGTTGGGAAACAAACCCTTTCTTCAGATAGTTCAGGTTTCTATC  599

seq1  TCATCAACAAATCCATGGAATGATAATTGCCTAGGTGAAACAAACAAATA  631
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAACAAATCCATGGAATGATAATTGCCTAGGTGAAACAAACAAATA  649

seq1  CTAACAAACAATCATCAATTCCTATTTGTGTTCCCAGCAACATGGACAGC  681
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAAACAATCATCAATTCCTATTTGTGTTCCCAGCAACATGGACAGC  699

seq1  CAACTACTGAGCATGAAAAATGACTAAATGGTGTCATCTTTTAGTCAGCA  731
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTACTGAGCATGAAAAATGACTAAATGGTGTCATCTTTTAGTCAGCA  749

seq1  TTTACATTGGAAACAAATCTAGCATCCCGTGATAGAAAACATCTTCCTTT  781
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATTGGAAACAAATCTAGCATCCCGTGATAGAAAACATCTTCCTTT  799

seq1  TACTTGGGCAGATCCCCTTGAAAACCAAAGATGATCAAACAATAATTTGT  831
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGGCAGATCCCCTTGAAAACCAAAGATGATCAAACAATAATTTGT  849

seq1  CTTTTAAAAGGAAGAAACATGATCCTTTGTTTTAGCAGCATAATATAAAG  881
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAAGGAAGAAACATGATCCTTTGTTTTAGCAGCATAATATAAAG  899

seq1  GGGAGAAAGCTCTGCTTCAGATAAGGTTTCTTAAACTATGTCAGTAGTCA  931
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAAGCTCTGCTTCAGATAAGGTTTCTTAAACTATGTCAGTAGTCA  949

seq1  ACATAAAAAGAAGGTTGACTCATTTTCTTACAGTCAGATGCCTCCTGGCT  981
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAAAGAAGGTTGACTCATTTTCTTACAGTCAGATGCCTCCTGGCT  999

seq1  TTCTCTCAGCCAAGCAGTGCTAAGACTTCTTCCTGCTAAGACTTCTCCAG  1031
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCAGCCAAGCAGTGCTAAGACTTCTTCCTGCTAAGACTTCTCCAG  1049

seq1  GTTCTTCTCAGTAGGATGTAGGCTTTAGTGTCATGTAGATCCTTTCAGAT  1081
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTCTCAGTAGGATGTAGGCTTTAGTGTCATGTAGATCCTTTCAGAT  1099

seq1  AAGTGCAACCCTTAAACATTATTAAGAAATAAGACAAGAGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCAACCCTTAAACATTATTAAGAAATAAGACAAGAGAATTC  1144

seq1: chr10_91798526_91799595
seq2: B6Ng01-175P08.g_64_1144

seq1  GAATTCAAGATCATTCTTTAACTAGACAGTGAGTTCATGAGTTTGAATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGATCATTCTTTAACTAGACAGTGAGTTCATGAGTTTGAATCC  50

seq1  AGCTCAGGATATGTGAGACCCTGTCTCAGAATCGAAACAAAAACAAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGGATATGTGAGACCCTGTCTCAGAATCGAAACAAAAACAAAAAC  100

seq1  CCAAACTCCACGTAGTTTTCCTCAGAATTTGTAAGAGTTCATCGAACCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTCCACGTAGTTTTCCTCAGAATTTGTAAGAGTTCATCGAACCAA  150

seq1  ACTATCAAAAACTATTAATTTATCTCACATTACATCTAGCACCAAAGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCAAAAACTATTAATTTATCTCACATTACATCTAGCACCAAAGTGT  200

seq1  GTGAAAAACTAATTAAGAACAGAAGTTGCAAAAACATCAAAAAGAAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAAACTAATTAAGAACAGAAGTTGCAAAAACATCAAAAAGAAAAGC  250

seq1  AAAAACAATATAATCACAATCATTATACTATGAGAAGAATTGGGAGCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAATATAATCACAATCATTATACTATGAGAAGAATTGGGAGCAAA  300

seq1  AGTTACTTTCAATCACTCTATAAATAATTTCTTCCATCTCTAGACCGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTTTCAATCACTCTATAAATAATTTCTTCCATCTCTAGACCGATA  350

seq1  GATGGGCACTTCTTTAAAAAGCCAAGAACCAGAATAACAGCCAAAGACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGCACTTCTTTAAAAAGCCAAGAACCAGAATAACAGCCAAAGACAT  400

seq1  CTGTTCGTCTCCTCCTTCAACGAGTGCAGATGGAGACTCCTACATGGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCGTCTCCTCCTTCAACGAGTGCAGATGGAGACTCCTACATGGTCT  450

seq1  GGGAAAGAGGAATCGGTCATGCTCATTAGCCTGGGTAGATTTGGGTTTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAGAGGAATCGGTCATGCTCATTAGCCTGGGTAGATTTGGGTTTCA  500

seq1  AATAATGAGCTAAATGGAGAACTACCAAGAGACTAACTCTTGCTAAAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATGAGCTAAATGGAGAACTACCAAGAGACTAACTCTTGCTAAAGCT  550

seq1  GCACTGTAGCCTGAAGAGGGACATGCCAATTTCAGATTAATTAAAAAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGTAGCCTGAAGAGGGACATGCCAATTTCAGATTAATTAAAAAGGT  600

seq1  TATTAAATTGTTCAGATGGCATGTTAATGAGCAATCTGCAGGGGGATCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAATTGTTCAGATGGCATGTTAATGAGCAATCTGCAGGGGGATCAG  650

seq1  TCGACAGCCATGCCTCCCCACATAATTACAGGACCCTTATTGAGAAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGACAGCCATGCCTCCCCACATAATTACAGGACCCTTATTGAGAAGAAT  700

seq1  CGTGGAGAGCAGGAAGAAAAACTAAAGGAGTATCCATCTTGACTATAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGAGAGCAGGAAGAAAAACTAAAGGAGTATCCATCTTGACTATAATA  750

seq1  CAACATGGTCAACCTACGACAAAATCCATGAAACAAGATGCTAGTTACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGGTCAACCTACGACAAAATCCATGAAACAAGATGCTAGTTACAC  800

seq1  TTGTTATATAAACTC-TTTCAGATGAAAGCTGCCACTAA-TCCAGCCACT  848
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTGTTATATAAACTCTTTTCAGATGAAAGCTGCCACTAATTCCAGCCACT  850

seq1  -GGAATGTT-ATAATTAAATAGAGAGACAATAGATAATATTGTA-TGACT  895
       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGGAATGTTAATAATTAAATAGAGAGACAATAGATAATATTGTATTGACT  900

seq1  TTATAATATGTTTTGGGTCTCAGAAGCATT--ATTTATCAACTCATATTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||
seq2  TTATAATATGTTTTGGGTCTCAGAAGCATTTATTTTATCACCTCATATTT  950

seq1  TT-CCTGTGCCTAGTAATAAAATTA-GAAGGCTCATC-TTTATATTAAGA  990
      || |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||
seq2  TTCCCTGTGCCTAGTAATAAAATTAGGAGGGCTCATCTTTTATATT-AGA  999

seq1  CA-TTGACTGAGCTAACCACAGTGCTATGTATGC-TTTTTGATCTCCCCA  1038
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATTTGACTGAGCTAACCACAGTGCTATGTATGCTTTTTTGATCTCCCCA  1049

seq1  AACTTGGGAGATGGAAGCAGG-AGGGTAAAAGA  1070
      | |||||||||| | |||||| ||| |||||||
seq2  ATCTTGGGAGAT-GTAGCAGGAAGGTTAAAAGA  1081