BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-179H10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 96,228,526 - 96,395,485
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC628256
Upstream geneEea1, EG432491, LOC667380, Btg1
Downstream gene4930556N09Rik, EG667407, Dcn, Lum, Kera, Epyc, 4921510H08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-179H10.bB6Ng01-179H10.g
ACCGA006176GA006177
length511946
definitionB6Ng01-179H10.b B6Ng01-179H10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,228,526 - 96,229,042)(96,394,551 - 96,395,485)
sequence
ttcttttagacggacatgtaaattatgaacctgacttttaatgaaaggca
ttttaatattttatttcttagtctggcaagaagtaataacttcaagatgg
gaagtaggtacctgtgcctcttcactcagccatggtagacactgttcatt
atgcctgtcactgatctggcgatctggtcttggtctcagaatgctttact
atattgtactttagatggcaactgccaagtggttgctatctctgtagaaa
tggaagcaaagagttctgtttaatttattatgcatagaacagcagaaagc
cggcagcttgttatgtatatgatatatttaatagtaatatgcttaaagta
atataagtgttgactttgtagtctttgattgggcaaaaagcagtcttaaa
atatgctatttagacctgaaaacccatgatcacaacatattattgatgtg
tttataaaaagataaaggaagcaagaatatgttttggtgggtgtgtggtg
aggtgtggggg
gaattcaagtacagtcatgagcattatatgcagtgttctaaataaccata
agcatttttatattatacactggtgtaatgatgctataattaacatcact
gagaatgcatgaagatcaaaatcttaaaatgaatatcaattgtaaatata
aggtaagttcagaggtcagaaatattgatttttttatctcatttaagttc
tgtttcatacaacaaatatgtttgaaaaaatcaacaaattaagtatttgg
aattatatgctacaaaaatttatagtcattaaatattgtgtaaagatatc
taaatatgcacccagttacactcatttttcttctgctactttgtagaagg
tagctactgctggttttaaggatgtgctaagggatcttgtgttcaaccta
caggcacagtcttttttgttgttcaaagtttatctgtgccttaagcactg
actttctacccctagggactatttgataatgttgagtgatatattttgac
ctaaaaggaatataccactggcatctataagtagatttgaggaatgctgc
taaccctcctctggtatacagaaaacccttagcacagtgtcctatatacc
agctcaagtgaccaacaatgctaaaattaagatgctctctgtctttaaag
tcatgctattccagtgtgaaaaagagcattggttccacacaacacatacc
ttgaaatctgagaacaccacagaaacagttcatattttctctcagtaatt
tagcttcgttattgtctgcaactgagtttagactgaagtcaacaaaaagc
ctcttgaaaaagctcactgtgaacgtgttttttctgagaggtatgttttt
gaactgtaaggataaccctcactctgaaggtctcaagaatattagcatag
ttgatgcttggcctctccatttgtacaatataaggtgctttaacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_96228526_96229042
seq2: B6Ng01-179H10.b_34_550

seq1  GAATTCTTCTTTTAGACGGACATGTAAATTATGAATTTGACTTTTAATGA  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTTTAGACGGACATGTAAATTATGAACCTGACTTTTAATGA  50

seq1  AAGGCATTTTAATATTTTATTTCTTAGTCTGGCAAGAAGTAATAACTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATTTTAATATTTTATTTCTTAGTCTGGCAAGAAGTAATAACTTCA  100

seq1  AGATGGGAAGTAGGTACCTGTGCCTCTTCACTCAGCCATGGTAGACACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGAAGTAGGTACCTGTGCCTCTTCACTCAGCCATGGTAGACACTG  150

seq1  TTCATTATGCCTGTCACTGATCTGGCGATCTGGTCTTGGTCTCAGAATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTATGCCTGTCACTGATCTGGCGATCTGGTCTTGGTCTCAGAATGC  200

seq1  TTTACTATATTGTACTTTAGATGGCAACTGCCAAGTGGTTGCTATCTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTATATTGTACTTTAGATGGCAACTGCCAAGTGGTTGCTATCTCTG  250

seq1  TAGAAATGGAAGCAAAGAGTTCTGTTTAATTTATTATGCATAGAACAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAATGGAAGCAAAGAGTTCTGTTTAATTTATTATGCATAGAACAGCA  300

seq1  GAAAGCCGGCAGCTTGTTATGTATATGATATATTTAATAGTAATATGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCCGGCAGCTTGTTATGTATATGATATATTTAATAGTAATATGCTT  350

seq1  AAAGTAATATAAGTGTTGACTTTGTAGTCTTTGATTGGGCAAAAAGCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAATATAAGTGTTGACTTTGTAGTCTTTGATTGGGCAAAAAGCAGT  400

seq1  CTTAAAATATGCTATTTAGACCTGAAAACCCATGATCACAACATATTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAATATGCTATTTAGACCTGAAAACCCATGATCACAACATATTATT  450

seq1  GATGTGTTTATAAAAAGATAAAGGAAGCAAGAATATGTTTTGGTGGGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTTTATAAAAAGATAAAGGAAGCAAGAATATGTTTTGGTGGGTGT  500

seq1  GTGGTGAGGTGTGGGGG  517
      |||||||||||||||||
seq2  GTGGTGAGGTGTGGGGG  517

seq1: chr10_96394551_96395485
seq2: B6Ng01-179H10.g_67_1011 (reverse)

seq1  TGTTTAAGCA-CTTATTTTGTACAAAT-GAGAGGCC-AGCATCAACTATG  47
      |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  TGTTAAAGCACCTTATATTGTACAAATGGAGAGGCCAAGCATCAACTATG  50

seq1  CTAATATTCTTGAGAACCTTCAGAGTGA-GGTTATCC-TACAGTTC-AAA  94
      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||
seq2  CTAATATTCTTGAG-ACCTTCAGAGTGAGGGTTATCCTTACAGTTCAAAA  99

seq1  ACATACCTCTCAG-AAAAACACGTTCACAGTGAGCTTTTTCAAGAGGC-T  142
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACATACCTCTCAGAAAAAACACGTTCACAGTGAGCTTTTTCAAGAGGCTT  149

seq1  TTTGTTGACTTCAGTCT-AACTCAGTTGCAGACAATAACGAAGCTAAATT  191
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGACTTCAGTCTAAACTCAGTTGCAGACAATAACGAAGCTAAATT  199

seq1  ACTGAGAG-AAATATGAACTGTTTCTGTGGTGTTCTCAGATTTCAAGGTA  240
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGAGAAAATATGAACTGTTTCTGTGGTGTTCTCAGATTTCAAGGTA  249

seq1  TGTGTTGTGTGGAACCAATGCTCTTTTTCACACTGGAATAGCATGACTTT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGTGTGGAACCAATGCTCTTTTTCACACTGGAATAGCATGACTTT  299

seq1  -AAGACAGAGAGCATCTTAATTTTAGCATTGTTGGTCACTTGAGCTGGTA  339
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAGAGAGCATCTTAATTTTAGCATTGTTGGTCACTTGAGCTGGTA  349

seq1  TATAGGACACTGTGCTAAGGGTTTTCTGTATACCAGAGGAGGGTTAGCAG  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGACACTGTGCTAAGGGTTTTCTGTATACCAGAGGAGGGTTAGCAG  399

seq1  CATTCCTCAAATCTACTTATAGATGCCAGTGGTATATTCCTTTTAGGTCA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCTCAAATCTACTTATAGATGCCAGTGGTATATTCCTTTTAGGTCA  449

seq1  AAATATATCACTCAACATTATCAAATAGTCCCTAGGGGTAGAAAGTCAGT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATATCACTCAACATTATCAAATAGTCCCTAGGGGTAGAAAGTCAGT  499

seq1  GCTTAAGGCACAGATAAACTTTGAACAACAAAAAAGACTGTGCCTGTAGG  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGGCACAGATAAACTTTGAACAACAAAAAAGACTGTGCCTGTAGG  549

seq1  TTGAACACAAGATCCCTTAGCACATCCTTAAAACCAGCAGTAGCTACCTT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACACAAGATCCCTTAGCACATCCTTAAAACCAGCAGTAGCTACCTT  599

seq1  CTACAAAGTAGCAGAAGAAAAATGAGTGTAACTGGGTGCATATTTAGATA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAAAGTAGCAGAAGAAAAATGAGTGTAACTGGGTGCATATTTAGATA  649

seq1  TCTTTACACAATATTTAATGACTATAAATTTTTGTAGCATATAATTCCAA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACACAATATTTAATGACTATAAATTTTTGTAGCATATAATTCCAA  699

seq1  ATACTTAATTTGTTGATTTTTTCAAACATATTTGTTGTATGAAACAGAAC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTAATTTGTTGATTTTTTCAAACATATTTGTTGTATGAAACAGAAC  749

seq1  TTAAATGAGATAAAAAAATCAATATTTCTGACCTCTGAACTTACCTTATA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGAGATAAAAAAATCAATATTTCTGACCTCTGAACTTACCTTATA  799

seq1  TTTACAATTGATATTCATTTTAAGATTTTGATCTTCATGCATTCTCAGTG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAATTGATATTCATTTTAAGATTTTGATCTTCATGCATTCTCAGTG  849

seq1  ATGTTAATTATAGCATCATTACACCAGTGTATAATATAAAAATGCTTATG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAATTATAGCATCATTACACCAGTGTATAATATAAAAATGCTTATG  899

seq1  GTTATTTAGAACACTGCATATAATGCTCATGACTGTACTTGAATTC  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTAGAACACTGCATATAATGCTCATGACTGTACTTGAATTC  945