BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184A21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 99,979,007 - 100,126,804
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930430F08Rik, 1700017N19Rik
Upstream geneLOC667502, Csl, LOC100042246, Kitl, LOC100043208, LOC100043211, EG667532, LOC670007, LOC235966, LOC667556, LOC100043224, LOC100043227, LOC100043231, LOC100043235, LOC667580, LOC100043239, LOC100043242, LOC100043244, LOC667607, LOC100043247, EG213051, Tmtc3
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184A21.bB6Ng01-184A21.g
ACCGA009527GA009528
length1,1561,058
definitionB6Ng01-184A21.b B6Ng01-184A21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,125,647 - 100,126,804)(99,979,007 - 99,980,067)
sequence
gaattcacaaagttcagcatctcatgcatttatttttatgtgatttactt
tctgattgtactatgcatgagtttgtgattatatacactaaattaaaacc
acacatttctcacaggagaacgagggtctcttctcaattactgggtttgc
ttgtagcaaatccttcattataacatttactatatccactctttgtttta
cattatttctgtctttcaaaatgatgcatcaagtgatgtgaatgaatgtg
ctactggtatttggtacctttgaaataaaagtatagccaacacaaaggtt
tttcacacattttataagcatctgcttttcttttaggcttagtaaaatga
tacccctttcacatacaaattctgtatctcataaaataactttcagacaa
tagtttatatgtccctgtttttcctatctgttttgtttttatcaagtagg
tagtttagtgtttgtccatgtctttgtccactaaaatcaatgcttaaata
caagcaactgcttgtctttcataaatatgctacaatagtataaatctgcc
ctcagtccctaggtagtgtgccttacagttcaaaatttagaaaccatacc
atggtacttcacatttttggaaatatgaaattgcataatactgagcctag
ggatgtataactaatttcaatggaagaaaatgagcaagtctagattgcct
aaggagttaaatgacttcatcattgataaaaggcaatctgaataatcaaa
ggcaggctgcttccacaatttaagaatacgattcctctttcaagtaagaa
cctgaggcataaataccaaaatgcagactgtttctaaagcaccttgaaag
acaccatagagaaagtatttctgaatgtgtgcctatcttagtcagggttt
ctattcctgcacaaacatgatgaccaagaagcaagttggagaggaaaggg
tttattcagcttgcacttccacattgctgttcatcaccaaggaagtcagg
actgcaactcaagcaggtcaggaagcaggagccgatgcagaggccatgga
gggatgttcttttactggcttgctctctggcttgctcagcctactcttcc
ttataaacaggactacaggccaggagggtgggtccacccacaaggacctg
ccccct
gaattctcagaataaataaatatattgttagtagatagtcagctggacta
atataaataaagaagtttattccatttacgtacatgtaaaatatgttcgt
gattttcattcacttgtgtgttattcatttgaaatatagaaggagacgaa
gaattataagcagtcaataggaagtagatgagtatttgtgtttattgctg
cttagaaaagtgagagaatgaaatgctaaggtttggtggtgtttggtgct
gttattagaattgtctctttttgtgtaaatcacaagaaaagcttgcaagt
aaacttgacttccgtctaacctttcctgtgtaaactgttagctgataggg
tactcactctattataacacttgccctgcagttgctttactgtttgctgt
ctatataatgggattaaaaggagctgatgaggtatttttttcagattttc
atttacactttaatatctacagcatcaccaaccctattactgtacttaga
aaaatctactcaaaaccaccaaaatacacttgtaattgtaagcttccctg
tttcccactgctaggttatcagttggtctgatacttgagttacacttatc
gtttcctggttttatatttgggcatgacattagtcttgtctttatttgaa
tatgtgtgctactcaagtcagataagggtaactttaacgacagagcaaaa
catttctttaaaatgcatcttagaccactactctgaagtacatagaaata
ttaatgatttattttcatacattatagggataccatcaacaaataatggc
aacctggtattgtcatgctttatctaggatttgtagtttttatttttatt
aaaaaaaatggggaccaacaaaatgtctcagtatgtaaaggtacctggtg
ccagcaagcctttaataacctgtgttctgtgttcagtcactgggaccaca
tggtggaaggagaggttagactccacaagtgtctgacctctaatatgccc
tgtgcatgcactgcatgcaaataaatgattatggtgaaaccacgtttacc
atagctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_100125647_100126804
seq2: B6Ng01-184A21.b_38_1193 (reverse)

seq1  AGGGGGCAGGTCCCCTTGTGGGTGGGACCA-CCTCTGGGCTGGTAGTCTT  49
      |||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||| |
seq2  AGGGGGCAGGT--CCTTGTGGGTGGACCCACCCTCCTGGCCTGTAGTCCT  48

seq1  GGTTTTATAAG--AGAGTAGGCTGAGCAAGCCAGAGGAAGCAAGCCAGT-  96
      |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| 
seq2  G--TTTATAAGGAAGAGTAGGCTGAGCAAGCCAGAG--AGCAAGCCAGTA  94

seq1  AAAGAACATCCCTCCATGGCCTCTGCATCGGCTCCTGCTTCCTGACCTGC  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACATCCCTCCATGGCCTCTGCATCGGCTCCTGCTTCCTGACCTGC  144

seq1  TTGAGTTGCAGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTGCAGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTGC  194

seq1  AAGCTGAATAAACCCTTTCCTCTCCAACTTGCTTCTTGGTCATCATGTTT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGAATAAACCCTTTCCTCTCCAACTTGCTTCTTGGTCATCATGTTT  244

seq1  GTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGATAGGCACACATTCAGAAATACTT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGATAGGCACACATTCAGAAATACTT  294

seq1  TCTCTATGGTGTCTTTCAAGGTGCTTTAGAAACAGTCTGCATTTTGGTAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATGGTGTCTTTCAAGGTGCTTTAGAAACAGTCTGCATTTTGGTAT  344

seq1  TTATGCCTCAGGTTCTTACTTGAAAGAGGAATCGTATTCTTAAATTGTGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCCTCAGGTTCTTACTTGAAAGAGGAATCGTATTCTTAAATTGTGG  394

seq1  AAGCAGCCTGCCTTTGATTATTCAGATTGCCTTTTATCAATGATGAAGTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCCTGCCTTTGATTATTCAGATTGCCTTTTATCAATGATGAAGTC  444

seq1  ATTTAACTCCTTAGGCAATCTAGACTTGCTCATTTTCTTCCATTGAAATT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACTCCTTAGGCAATCTAGACTTGCTCATTTTCTTCCATTGAAATT  494

seq1  AGTTATACATCCCTAGGCTCAGTATTATGCAATTTCATATTTCCAAAAAT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATACATCCCTAGGCTCAGTATTATGCAATTTCATATTTCCAAAAAT  544

seq1  GTGAAGTACCATGGTATGGTTTCTAAATTTTGAACTGTAAGGCACACTAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGTACCATGGTATGGTTTCTAAATTTTGAACTGTAAGGCACACTAC  594

seq1  CTAGGGACTGAGGGCAGATTTATACTATTGTAGCATATTTATGAAAGACA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGACTGAGGGCAGATTTATACTATTGTAGCATATTTATGAAAGACA  644

seq1  AGCAGTTGCTTGTATTTAAGCATTGATTTTAGTGGACAAAGACATGGACA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTGCTTGTATTTAAGCATTGATTTTAGTGGACAAAGACATGGACA  694

seq1  AACACTAAACTACCTACTTGATAAAAACAAAACAGATAGGAAAAACAGGG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTAAACTACCTACTTGATAAAAACAAAACAGATAGGAAAAACAGGG  744

seq1  ACATATAAACTATTGTCTGAAAGTTATTTTATGAGATACAGAATTTGTAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATAAACTATTGTCTGAAAGTTATTTTATGAGATACAGAATTTGTAT  794

seq1  GTGAAAGGGGTATCATTTTACTAAGCCTAAAAGAAAAGCAGATGCTTATA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGGGGTATCATTTTACTAAGCCTAAAAGAAAAGCAGATGCTTATA  844

seq1  AAATGTGTGAAAAACCTTTGTGTTGGCTATACTTTTATTTCAAAGGTACC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGTGAAAAACCTTTGTGTTGGCTATACTTTTATTTCAAAGGTACC  894

seq1  AAATACCAGTAGCACATTCATTCACATCACTTGATGCATCATTTTGAAAG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACCAGTAGCACATTCATTCACATCACTTGATGCATCATTTTGAAAG  944

seq1  ACAGAAATAATGTAAAACAAAGAGTGGATATAGTAAATGTTATAATGAAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAATAATGTAAAACAAAGAGTGGATATAGTAAATGTTATAATGAAG  994

seq1  GATTTGCTACAAGCAAACCCAGTAATTGAGAAGAGACCCTCGTTCTCCTG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGCTACAAGCAAACCCAGTAATTGAGAAGAGACCCTCGTTCTCCTG  1044

seq1  TGAGAAATGTGTGGTTTTAATTTAGTGTATATAATCACAAACTCATGCAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATGTGTGGTTTTAATTTAGTGTATATAATCACAAACTCATGCAT  1094

seq1  AGTACAATCAGAAAGTAAATCACATAAAAATAAATGCATGAGATGCTGAA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAATCAGAAAGTAAATCACATAAAAATAAATGCATGAGATGCTGAA  1144

seq1  CTTTGTGAATTC  1158
      ||||||||||||
seq2  CTTTGTGAATTC  1156

seq1: chr10_99979007_99980067
seq2: B6Ng01-184A21.g_62_1119

seq1  GAATTCTCAGAATAAATAAATATATTGTTAGTAGATAGTCAGCTGGACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGAATAAATAAATATATTGTTAGTAGATAGTCAGCTGGACTA  50

seq1  ATATAAATAAAGAAGTTTATTCCATTTACGTACATGTAAAATATGTTCGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATAAAGAAGTTTATTCCATTTACGTACATGTAAAATATGTTCGT  100

seq1  GATTTTCATTCACTTGTGTGTTATTCATTTGAAATATAGAAGGAGACGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCATTCACTTGTGTGTTATTCATTTGAAATATAGAAGGAGACGAA  150

seq1  GAATTATAAGCAGTCAATAGGAAGTAGATGAGTATTTGTGTTTATTGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATAAGCAGTCAATAGGAAGTAGATGAGTATTTGTGTTTATTGCTG  200

seq1  CTTAGAAAAGTGAGAGAATGAAATGCTAAGGTTTGGTGGTGTTTGGTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAAAAGTGAGAGAATGAAATGCTAAGGTTTGGTGGTGTTTGGTGCT  250

seq1  GTTATTAGAATTGTCTCTTTTTGTGTAAATCACAAGAAAAGCTTGCAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTAGAATTGTCTCTTTTTGTGTAAATCACAAGAAAAGCTTGCAAGT  300

seq1  AAACTTGACTTCCGTCTAACCTTTCCTGTGTAAACTGTTAGCTGATAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGACTTCCGTCTAACCTTTCCTGTGTAAACTGTTAGCTGATAGGG  350

seq1  TACTCACTCTATTATAACACTTGCCCTGCAGTTGCTTTACTGTTTGCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACTCTATTATAACACTTGCCCTGCAGTTGCTTTACTGTTTGCTGT  400

seq1  CTATATAATGGGATTAAAAGGAGCTGATGAGGTATTTTTTTCAGATTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATAATGGGATTAAAAGGAGCTGATGAGGTATTTTTTTCAGATTTTC  450

seq1  ATTTACACTTTAATATCTACAGCATCACCAACCCTATTACTGTACTTAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACACTTTAATATCTACAGCATCACCAACCCTATTACTGTACTTAGA  500

seq1  AAAATCTACTCAAAACCACCAAAATACACTTGTAATTGTAAGCTTCCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTACTCAAAACCACCAAAATACACTTGTAATTGTAAGCTTCCCTG  550

seq1  TTTCCCACTGCTAGGTTATCAGTTGGTCTGATACTTGAGTTACACTTATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCACTGCTAGGTTATCAGTTGGTCTGATACTTGAGTTACACTTATC  600

seq1  GTTTCCTGGTTTTATATTTGGGCATGACATTAGTCTTGTCTTTATTTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCTGGTTTTATATTTGGGCATGACATTAGTCTTGTCTTTATTTGAA  650

seq1  TATGTGTGCTACTCAAGTCAGATAAGGGTAACTTTAACGACAGAGCAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTGCTACTCAAGTCAGATAAGGGTAACTTTAACGACAGAGCAAAA  700

seq1  CATTTCTTTAAAATGCATCTTAGACCACTACTCTGAAGTACATAGAAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTTTAAAATGCATCTTAGACCACTACTCTGAAGTACATAGAAATA  750

seq1  TTAATGATTTATTTTCATACATTATAGGGATACCATCAACAAATAATGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGATTTATTTTCATACATTATAGGGATACCATCAACAAATAATGGC  800

seq1  AACCTGGTATTGTCATGCTTTATCTAGGATTTGTAGTTTTTATTTTTATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGTATTGTCATGCTTTATCTAGGATTTGTAGTTTTTATTTTTATT  850

seq1  AAAAAAAATGGGGACCAACAAAATGTCTCAGTATGTAAAGGTACCTGGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATGGGGACCAACAAAATGTCTCAGTATGTAAAGGTACCTGGTG  900

seq1  CCAGCAAGCCTTTAATAACCTGTG-TCTGTGTTCAGTCACTGGGACCACA  949
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAAGCCTTTAATAACCTGTGTTCTGTGTTCAGTCACTGGGACCACA  950

seq1  TGGTGGAAGGAGAGGTTAGACTCCACAAGTGTCTGACCTCTAAATATGCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGGTGGAAGGAGAGGTTAGACTCCACAAGTGTCTGACCTCT-AATATGCC  999

seq1  CTGTGCATGCACTGCATGCAAATAAATGATTATGGTGAAAACCACCGTTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||
seq2  CTGTGCATGCACTGCATGCAAATAAATGATTATGGTG-AAACCAC--GTT  1046

seq1  TACCATAGCTAA  1061
      ||||||||||||
seq2  TACCATAGCTAA  1058