BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184H19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 103,758,159 - 103,862,431
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043277, 6430590A10Rik, Slc6a15, EG667697, LOC667701, EG627488, EG667692, EG667695, LOC100043292
Downstream geneLOC100042383, Tmtc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184H19.bB6Ng01-184H19.g
ACCGA009849GA009850
length1,1901,163
definitionB6Ng01-184H19.b B6Ng01-184H19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,861,250 - 103,862,431)(103,758,159 - 103,759,329)
sequence
gaattcacacccaacgtttgctcagggtaccagctcagaccagagggaaa
ctgtgccactggtcaggtgtagattctggctgcctgagacccactggtcc
cagttactttcagtgttggggcagatgttttgtcctcctcacctctgatc
ctaagatcctgagcatgttagagagcttgggagtggagattcctctgggt
gttgttggcctggctgtgatcctatgatcctgggagtgttggagtacctg
ggggtgaatattcctctgaatgttgtggaatggcttacagagttcacccc
caaggtctgcagattttaactttttaaacatctccttaggtaatacaata
acatagctgccaataattaatcatatcagatataagtaatttaaacacaa
aggaccacactatttctataaactttgacaacagcatctctctaaagatt
tccactttgtgaaatatcagaaacaaatattttcattattgggattttca
gttgagtaacaattttatatccacttctaactatccagtcatgtcatttg
tatgcctacttttcatctttgcatgaagtcacatttatcccatgagataa
attgttgtattttttatttagtaaaatgaaatgtcacacacttcatttac
aattgcatagaaaagtatacaaagattctcccaaagctcataattctaaa
actcgaataaacttaccacaaactggaaaacagattcaagtttttcttta
aacttatgtaatatttttcagaaaagtaaagaatgcatatatccatttca
ttcatgtttataggacatgctcatttaggtaattgagatacagttatgca
tatttccatttttgctgttattgtcacttatcattttattatatgttttt
ttttctggtgaactaatgtgtacctacacatgtttttaccttttgtttat
gtgtggggttgtaatgcatcctatctattggaatatagcacaagttatct
aatcaagttacctttcccttttcttactgatataaaaaaaggaagcaact
acaccaattaacttctacagtgaaaaccttagtcatgactcttgttcctc
cacagacttatcattttttcttaggttattacctacgaagaagttttaag
aactgtagtagaatacctgaattatgatccaaagttcaac
gaattcctgatctttccaatacttgtaacatgagtggttgttgtattttg
tcaaagactttttgtgtatccaatgagatgctcatgtgttttttttttct
ttgagtttgcttatatagtggattgcattgattgatttccatttggtaaa
ccatccctgcatcccttggataaatcctacttgatcatggtggatgattt
tttgatgtcaaattctttatgagtttttagtccttttacacaggcttttg
actctgaaagtggtaacatgctaagtcttttttctgttgggaaacttggt
atgctccagctattactatgtggtttcatcatttgtagtttctataaaca
cttttattaaacttttcagatgaaccagctcaactgtgccatctgcttca
tagcacaaaaagaaaaagtgcttttcttgtgtccataaattttcatcttt
gatcagcttttaaggttatttcccttaacaaattcttgttctttgccatg
cttctagaccgttaaatggatcttcatagatgggcatggtggtacacacc
tttaatccctgcacttgggaggcagaggcaggcagatttctgagtacaag
gctagcctggtctacaaagtgagttacaggacagccaaggctatacagag
gaaaccctgtctcgaaaaacaaaagcaaagcaaagcaaagcaaagcaaag
caaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaa
caaaacaaaaaggatcttcatgaaagccacaatcaccagagtggtaatgg
taagcagaatgcgggaacttgcctaagatgagtttacttaagtttcaggg
gtcaccttttttcaccacaacaaactgttcattttaaatatgtttactta
cccaattatgttcattttaaacactcaaacatccttctcttttgtgtggc
tttcacatacatggagcttgtttttgtttgattacttaccttctgaattt
aatttccttgtctccttggtagacacttctttaatatgatactacacaaa
ctcacagcaagagctagttatccatcctgaagaaccatttatagcatcta
atatgacaatagtacctataggttaacatgatagcatctagtctgcaaac
ctaaatatttctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_103861250_103862431
seq2: B6Ng01-184H19.b_40_1229 (reverse)

seq1  GTTG-ATTTTGAATCATAAATCCCAGTTATTCTACTACAGTACTAAAGAA  49
      |||| | |||| ||||||| |  ||| |||||||||||||| || || | 
seq2  GTTGAACTTTGGATCATAATT--CAGGTATTCTACTACAGTTCTTAAAAC  48

seq1  TTCTTCCTAAGTTAT----TACTAGAAAATGATAAGTCTGTGGAG--AC-  92
      |||||| || || ||    ||  | ||||||||||||||||||||  || 
seq2  TTCTTCGTAGGTAATAACCTAAGAAAAAATGATAAGTCTGTGGAGGAACA  98

seq1  AGAGTCATGACTAGGGTTTTTCACTGTAGAAGTTAA-TGGTGTTAGTTGC  141
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  AGAGTCATGACTAAGG-TTTTCACTGTAGAAGTTAATTGGTG-TAGTTGC  146

seq1  TTCC-TTTTTTATATCAGTAAGAAAAGGGAAAGGTAACTTGATTAGATAA  190
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTTTTTATATCAGTAAGAAAAGGGAAAGGTAACTTGATTAGATAA  196

seq1  CTTGTGCTATATT-CAATAGATAGGATGCATTACAACCCCACACATAAAC  239
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGCTATATTCCAATAGATAGGATGCATTACAACCCCACACATAAAC  246

seq1  AAAAGGTAAAAACATGTGTAGGTACACATTAGTTCACCAG-AAAAAAAAC  288
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAAAGGTAAAAACATGTGTAGGTACACATTAGTTCACCAGAAAAAAAAAC  296

seq1  ATATAATAAAATGATAAGTGACAATAACAGCAAAAATGGAAATATGCATA  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATAAAATGATAAGTGACAATAACAGCAAAAATGGAAATATGCATA  346

seq1  ACTGTATCTCAATTACCTAAATGAGCATGTCCTATAAACATGAATGAAAT  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTATCTCAATTACCTAAATGAGCATGTCCTATAAACATGAATGAAAT  396

seq1  GGATATATGCATTCTTTACTTTTCTGAAAAATATTACATAAGTTTAAAGA  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATATGCATTCTTTACTTTTCTGAAAAATATTACATAAGTTTAAAGA  446

seq1  AAAACTTGAATCTGTTTTCCAGTTTGTGGTAAGTTTATTCGAGTTTTAGA  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTGAATCTGTTTTCCAGTTTGTGGTAAGTTTATTCGAGTTTTAGA  496

seq1  ATTATGAGCTTTGGGAGAATCTTTGTATACTTTTCTATGCAATTGTAAAT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGAGCTTTGGGAGAATCTTTGTATACTTTTCTATGCAATTGTAAAT  546

seq1  GAAGTGTGTGACATTTCATTTTACTAAATAAAAAATACAACAATTTATCT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTGTGACATTTCATTTTACTAAATAAAAAATACAACAATTTATCT  596

seq1  CATGGGATAAATGTGACTTCATGCAAAGATGAAAAGTAGGCATACAAATG  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGATAAATGTGACTTCATGCAAAGATGAAAAGTAGGCATACAAATG  646

seq1  ACATGACTGGATAGTTAGAAGTGGATATAAAATTGTTACTCAACTGAAAA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGACTGGATAGTTAGAAGTGGATATAAAATTGTTACTCAACTGAAAA  696

seq1  TCCCAATAATGAAAATATTTGTTTCTGATATTTCACAAAGTGGAAATCTT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAATAATGAAAATATTTGTTTCTGATATTTCACAAAGTGGAAATCTT  746

seq1  TAGAGAGATGCTGTTGTCAAAGTTTATAGAAATAGTGTGGTCCTTTGTGT  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGATGCTGTTGTCAAAGTTTATAGAAATAGTGTGGTCCTTTGTGT  796

seq1  TTAAATTACTTATATCTGATATGATTAATTATTGGCAGCTATGTTATTGT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTACTTATATCTGATATGATTAATTATTGGCAGCTATGTTATTGT  846

seq1  ATTACCTAAGGAGATGTTTAAAAAGTTAAAATCTGCAGACCTTGGGGGTG  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCTAAGGAGATGTTTAAAAAGTTAAAATCTGCAGACCTTGGGGGTG  896

seq1  AACTCTGTAAGCCATTCCACAACATTCAGAGGAATATTCACCCCCAGGTA  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGTAAGCCATTCCACAACATTCAGAGGAATATTCACCCCCAGGTA  946

seq1  CTCCAACACTCCCAGGATCATAGGATCACAGCCAGGCCAACAACACCCAG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAACACTCCCAGGATCATAGGATCACAGCCAGGCCAACAACACCCAG  996

seq1  AGGAATCTCCACTCCCAAGCTCTCTAACATGCTCAGGATCTTAGGATCAG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATCTCCACTCCCAAGCTCTCTAACATGCTCAGGATCTTAGGATCAG  1046

seq1  AGGTGAGGAGGACAAAACATCTGCCCCAACACTGAAAGTAACTGGGACCA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGGAGGACAAAACATCTGCCCCAACACTGAAAGTAACTGGGACCA  1096

seq1  GTGGGTCTCAGGCAGCCAGAATCTACACCTGACCAGTGGCACAGTTTCCC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTCTCAGGCAGCCAGAATCTACACCTGACCAGTGGCACAGTTTCCC  1146

seq1  TCTGGTCTGAGCTGGTACCCTGAGCAAACGTTGGGTGTGAATTC  1182
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTCTGAGCTGGTACCCTGAGCAAACGTTGGGTGTGAATTC  1190

seq1: chr10_103758159_103759329
seq2: B6Ng01-184H19.g_64_1226

seq1  GAATTCCTGATCTTTCCAATACTTGTAACATGAGTGGTTGTTGTATTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGATCTTTCCAATACTTGTAACATGAGTGGTTGTTGTATTTTG  50

seq1  TCAAAGACTTTTTGTGTATCCAATGAGATGCTCATGTGTTTTTTTTTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGACTTTTTGTGTATCCAATGAGATGCTCATGTGTTTTTTTTTTCT  100

seq1  TTGAGTTTGCTTATATAGTGGATTGCATTGATTGATTTCCATTTGGTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTGCTTATATAGTGGATTGCATTGATTGATTTCCATTTGGTAAA  150

seq1  CCATCCCTGCATCCCTTGGATAAATCCTACTTGATCATGGTGGATGATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCCTGCATCCCTTGGATAAATCCTACTTGATCATGGTGGATGATTT  200

seq1  TTTGATGTCAAATTCTTTATGAGTTTTTAGTCCTTTTACACAGGCTTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGTCAAATTCTTTATGAGTTTTTAGTCCTTTTACACAGGCTTTTG  250

seq1  ACTCTGAAAGTGGTAACATGCTAAGTCTTTTTTCTGTTGGGAAACTTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAAAGTGGTAACATGCTAAGTCTTTTTTCTGTTGGGAAACTTGGT  300

seq1  ATGCTCCAGCTATTACTATGTGGTTTCATCATTTGTAGTTTCTATAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCAGCTATTACTATGTGGTTTCATCATTTGTAGTTTCTATAAACA  350

seq1  CTTTTATTAAACTTTTCAGATGAACCAGCTCAACTGTGCCATCTGCTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATTAAACTTTTCAGATGAACCAGCTCAACTGTGCCATCTGCTTCA  400

seq1  TAGCACAAAAAGAAAAAGTGCTTTTCTTGTGTCCATAAATTTTCATCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACAAAAAGAAAAAGTGCTTTTCTTGTGTCCATAAATTTTCATCTTT  450

seq1  GATCAGCTTTTAAGGTTATTTCCCTTAACAAATTCTTGTTCTTTGCCATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGCTTTTAAGGTTATTTCCCTTAACAAATTCTTGTTCTTTGCCATG  500

seq1  CTTCTAGACCGTTAAATGGATCTTCATAGATGGGCATGGTGGTACACACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGACCGTTAAATGGATCTTCATAGATGGGCATGGTGGTACACACC  550

seq1  TTTAATCCCTGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCCCTGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTACAAG  600

seq1  GCTAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTACAGGACAGCCAAGGCTATACAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTACAGGACAGCCAAGGCTATACAGAG  650

seq1  GAAACCCTGTCTCGAAAAACAAAAGCAAAGCAAAGCAAAGCAAAGCAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCCTGTCTCGAAAAACAAAAGCAAAGCAAAGCAAAGCAAAGCAAAG  700

seq1  CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAA  750

seq1  CAAAACAAAAAGGATCTTCATGAAAGCCACAATCACCAGAGTGGTAATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAAAGGATCTTCATGAAAGCCACAATCACCAGAGTGGTAATGG  800

seq1  TAAGCAGAATGCGGGAACTTGCCTAAGATGAGTTTACTTAAGTTTCAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGAATGCGGGAACTTGCCTAAGATGAGTTTACTTAAGTTTCAGGG  850

seq1  GTCACCCTTTTTTCACCACAACAAACTGTTCATTTTAAATATGTTTACTT  900
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCA-CCTTTTTTCACCACAACAAACTGTTCATTTTAAATATGTTTACTT  899

seq1  ACCCAATTATGTTCATTTTAAAACACTCAAACATCC-TCTC-TTTGTGTG  948
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||
seq2  ACCCAATTATGTTCATTTT-AAACACTCAAACATCCTTCTCTTTTGTGTG  948

seq1  GCTTTCACATACATGGAGCTTGTTTTTGTTTTGATTACTTACCTTCTGAT  998
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  GCTTTCACATACATGGAGCTTGTTTTTG-TTTGATTACTTACCTTCTGAA  997

seq1  TTTAATTTCCTTGTCTCCCTTGGTAGAACAC-TCTTT-ATATGAATACTA  1046
      |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||
seq2  TTTAATTTCCTTGTCT-CCTTGGTAG-ACACTTCTTTAATATG-ATACTA  1044

seq1  CACAAACTCACAGCAAGAGCTAG-TATCAACCCTTGAAAGACAATTTATA  1095
      ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||  || |||||||
seq2  CACAAACTCACAGCAAGAGCTAGTTATCCATCC-TGAAGAACCATTTATA  1093

seq1  GCATCTATTATGACAAATAGTACTTATA-GTAAACAATGAATAAGCATCT  1144
      ||||||| |||||| |||||||| |||| || ||| ||||   |||||||
seq2  GCATCTAATATGAC-AATAGTACCTATAGGTTAAC-ATGA--TAGCATCT  1139

seq1  AAGTTCTGCAAAACTAAATATATTCTC  1171
      |   |||||||| |||||||| |||||
seq2  A--GTCTGCAAACCTAAATAT-TTCTC  1163