seq1: chr10_36656664_36657816
seq2: B6Ng01-192E10.b_45_1208
seq1 GAATTCCCCAAGTCTGTACAGCCTCAGGAGTCTTGCAGAATTCAAATCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCCCAAGTCTGTACAGCCTCAGGAGTCTTGCAGAATTCAAATCAT 50
seq1 CTCGGACCAGGGAGTGGTAGAAATCAATTGTTGCTGTGCACAGGTTGTTT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCGGACCAGGGAGTGGTAGAAATCAATTGTTGCTGTGCACAGGTTGTTT 100
seq1 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAAAGTAAAAAAGAGTCAAAAGAATTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAAAGTAAAAAAGAGTCAAAAGAATTG 150
seq1 GAAATCAAAGATGTTAGAAAGTCAAGCCGTGTTTGTAAGTGGCTCTGGGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAATCAAAGATGTTAGAAAGTCAAGCCGTGTTTGTAAGTGGCTCTGGGA 200
seq1 CAGAGAAGAACACAAGGGGCTTTTTGTCTACATTCTCCGCCTTGTCGGCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGAGAAGAACACAAGGGGCTTTTTGTCTACATTCTCCGCCTTGTCGGCA 250
seq1 CAGCTCACAGGAGTGTGGCGCATCTTATCTGCACTGAACGGAGGCAGCAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCTCACAGGAGTGTGGCGCATCTTATCTGCACTGAACGGAGGCAGCAA 300
seq1 TAGTTACATGCATTTATTATATCACAACAAAACGAAGGGAAGGAAAGGCT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTTACATGCATTTATTATATCACAACAAAACGAAGGGAAGGAAAGGCT 350
seq1 AGGACTCCTTGAAAGCTTTTATCTCAACAGTCTTCACAGAAGCCTGAAAG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGACTCCTTGAAAGCTTTTATCTCAACAGTCTTCACAGAAGCCTGAAAG 400
seq1 TGAACAGAGGGAGGCAGAGCTGGGCTCGTAGCATTTATTGCTGGGATGAT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAACAGAGGGAGGCAGAGCTGGGCTCGTAGCATTTATTGCTGGGATGAT 450
seq1 GGGCTAGTAAGCAAGCATGCACTTCCTTCCCAGTGAGGAAGGTAGGGCTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGCTAGTAAGCAAGCATGCACTTCCTTCCCAGTGAGGAAGGTAGGGCTT 500
seq1 TTCAGGGATAACTAGTGATACTTTAAATTTAAACTGGTTTACTCAAATGT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCAGGGATAACTAGTGATACTTTAAATTTAAACTGGTTTACTCAAATGT 550
seq1 GACTTTCATTCCATTATTAACAAAATAGGTTCTGTGTCCCGTGACACCTA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACTTTCATTCCATTATTAACAAAATAGGTTCTGTGTCCCGTGACACCTA 600
seq1 AGTGCCAAGATCAGAGTAAAGCGGCTATAGAAGTATATTTATGAGACTTG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGCCAAGATCAGAGTAAAGCGGCTATAGAAGTATATTTATGAGACTTG 650
seq1 TCAGAATCAGAATATAAACTGTGTTTTGTCCCATGATCTCTTGGGACCAT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGAATCAGAATATAAACTGTGTTTTGTCCCATGATCTCTTGGGACCAT 700
seq1 CATTTTCAAAAACACGATAACCATGTTTAGAAACACTAAGCACCACACAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATTTTCAAAAACACGATAACCATGTTTAGAAACACTAAGCACCACACAT 750
seq1 GCAGTCTTAAGTATTTGTATTGAAGTTTTACCTTTTACTGTCTATTGTAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAGTCTTAAGTATTTGTATTGAAGTTTTACCTTTTACTGTCTATTGTAA 800
seq1 TGCTCAGTGCAAGTACCCAAAACCAGGAGGCTGCTCATGGTCCCTGTGAC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTCAGTGCAAGTACCCAAAACCAGGAGGCTGCTCATGGTCCCTGTGAC 850
seq1 CCTGCTCCCAAGTTAATTCCAATTGGTAGTAAAGATACCAACAGTCAATA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTGCTCCCAAGTTAATTCCAATTGGTAGTAAAGATACCAACAGTCAATA 900
seq1 GCTAGGCAG-AAAAGACATT-GGTGGGGCTTAGGTTTCCTGGGCTTGGAA 948
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTAGGCAGAAAAAGACATTGGGTGGGGCTTAGGTTTCCTGGGCTTGGAA 950
seq1 TTAG-AGAAGCTT-GAGGAGGAGAAGAATA-TGCAGGAGGGAGAAGGAGA 995
|||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2 TTAGAAGAAGCTTGGAGGAGGAGAAGAATATTGCAGGAGGGAGAAGGAGA 1000
seq1 AGCAGCCATGGTAAG-TAGTAAGTAGTAAGTAATAATTCAGGGTTATCAA 1044
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||
seq2 AGCAGCCATGGTAAGTTAGT-AGTAGTAAGTAATAATTTCGGG-TATCAA 1048
seq1 TAGGAAAGTAGATTCCAATGGCAT-AGATCTAGGT--ATCT--GCG-CAG 1088
|| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||
seq2 TA-GAAAGTAGATTC--ATGGCATAAGATCTAGGTTATTCTTGGCGCCAG 1095
seq1 C--TCTT--GTGCTGCTTAAGGTTTATTTTAAATACAAAGGCTAT-GA-G 1132
| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |
seq2 CCTTCTTTGGTGCTGCTT-AGGTTTATTTT-AATACAAAGGCTATAGAGG 1143
seq1 TGTGTTTTTTATCCAGGAACT 1153
||||||||||| ||||||||
seq2 TGTGTTTTTTACTCAGGAACT 1164
| seq1: chr9_58966165_58966420
seq2: B6Ng01-192E10.g_84_152 (reverse)
seq1 GCCCAACCTCCAGGGCTACTTGTGCATAGTCACACCTGCTCTGATGAACA 50
|
seq2 -----------------------------------------------GCC 3
seq1 CACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACACACACACA 100
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CA-ACCCACACACACACACACACACACACACATACACACACACACACACA 52
seq1 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGCTGCTATGCCC 150
||||| |||||||||||
seq2 CACACGCACACACACAC--------------------------------- 69
seq1 AGAGAACAGCATTCTACAGTAACAGCATCTGAGAAACACCACCTGAGGGT 200
seq2 -------------------------------------------------- 69
seq1 GTCCTCTGCCTCCATACTTATGTGTACACAACAGAGGCATGCATGCACAC 250
seq2 -------------------------------------------------- 69
seq1 ACACAC 256
seq2 ------ 69
|
