BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192J20
Chromosome10 (Build37)
Map Location 104,449,091 - 104,601,493
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG627488, EG667692, EG667695, LOC100043292, LOC100042383
Downstream geneTmtc2, EG627573, BC067068, Ccdc59, EG667758
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192J20.bB6Ng01-192J20.g
ACCGA015810GA015811
length1,1091,106
definitionB6Ng01-192J20.b B6Ng01-192J20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,600,382 - 104,601,493)(104,449,091 - 104,450,211)
sequence
gaattctttgcaaagcttaacctttttttccttgccacatcaccacccgt
agttgaagatctaatgcatttttacatcttaggtaaactatcattggtaa
ttcccatcctgttatttcatgaggaattgtgagcttcttctgtttttcta
atttttattttatggcttttttaaacaaagtactcaaatatttgtataag
acagtgatatgactataactattcatctacacactgtgtgatcaacctac
actttttctccatagtctgaaaatagtcatttcccaattagatggggact
ccttacaagaaaaccaacagacagaggttggacctaggccccctgcatat
ttggagcagatgtgcagcatggtcttcatgtggatccccaatatgtgagg
cttaccctgactctgttacctgcctgtggattctgttcccctaactgggc
tgccttatctttgggagacaatgtatgtagtcctgaaaggatttcacgtg
tcagggcaggatgatacccacggatagcatccccttctcagagatgaaag
gggagggagtaggagaggagctgtatgaggtgaggtactgtgaacaggat
gtatagtgaataaatgaataaataaatggaaaaaatgaagttccccaatt
atggctctcatgtcattctgatctgttctctgatggccagtgttgaaatt
tctgacccgaaaaagtcttacattagattcaaggtctgatttgttcagtt
gtggtttgactcttttatgttcagtctatgttcaccctataccaactatg
acagcaggtcacaagattttgaatttgtcacccaacatgcaattacatgc
actacaaggctttgctgtgttatgctaatagattcttgtagatctgtgta
acgtgattcttactttttattgactacagaaaagtctttgcatcctccct
tagcattcataggcctattggagcttgagagcagagctaatgatggagca
catcctacgcaaaatttcacagatgcttctttgggcatctatgaaccaag
caattcttagtataagaaacattttggattgagcctaaacggttctacct
ttagatgtc
gaattcagtattctgctaacagccttcagttgaagatgtagaactctcag
ccactcctgcatcatgcttgcctggatgctgccacacttccaccttgaag
ataatggacagaacctctgaacctgtaatccagcccaaattaaatgttgt
ccttatgagagttgacttggtcatggtgtctcttcacagcagtaaaactc
taatgaggacactttaacacagtgaatttgagagggaatgaagtacagaa
aagcctgtctcaaattaaataaacaaataaataaaatataaacattttgt
cattaaaaagagctcaattcctttacaagccaaaagaaaagagaaacttt
ttgtggacctatttgaaaaaaaaaataggacctatttagtgaaaatcaaa
ttagaatctcattagctagctctttagttggcaaatgattagcccctagg
cattattgatggatgcctgaatctacttctccctcccatgcaatatgtta
ttgcactctggcaacaatcacataatttcaactcagaaagttccttttcc
gctgattggaaagagagtgattaatattagttattagtctacatataatt
atgcatatattctacagtgccaggccttagatggaacatataagggcagc
ataaaagtgaacaaagagtatgatatttttcttgtgataagaacatgaat
atttgactctgtaacagacaatctgatgaaatagtacttgtcagcagatc
aatctcttgaagaggtctttgtatttactcatatcagtgtaaaaagcgtt
tgggataaattcattaatatgcactcccctgatttcctatgagtactcga
atttacaacatttgggaatctgggaatataaattctattagccttctaaa
agtaattcaacttagactccctagcttttcccctaagtgtgttatttttc
tgctggggagattatggacgctgtgaggagagctgcactctatcttttat
ccattattcacctcaggatggggataaaggctcagataaggaattaaagg
ctctttagacaagagccctatttaccttatagatcagtactgcctaagaa
gcattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_104600382_104601493
seq2: B6Ng01-192J20.b_42_1150 (reverse)

seq1  GACATCTAAGGGTAGAAACGTTTTAAGCTCAATCCAAATTGTTTCTTATA  50
      ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  GACATCTAAAGGTAGAACCG-TTTAGGCTCAATCCAAAATGTTTCTTATA  49

seq1  CTAAGAATTTGCTTGGTTCATAGATGCCCAAAGAAGCATCTGTGAAAATT  100
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  CTAAGAA-TTGCTTGGTTCATAGATGCCCAAAGAAGCATCTGTGAAA--T  96

seq1  TTTGCGTAGGATGTGCTCCATCCTTTAGCTCTGCTCTCAAGCTCCAATAG  150
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCGTAGGATGTGCTCCAT-CATTAGCTCTGCTCTCAAGCTCCAATAG  145

seq1  GCCTATGAATGCTAAGGGAGGATGCAAAGAC-TTTCTGTAGTCAAT-AAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  GCCTATGAATGCTAAGGGAGGATGCAAAGACTTTTCTGTAGTCAATAAAA  195

seq1  AGTAAGAATCACGTTACACAGATCTACAAGAATCTATTAGCATAACACAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAATCACGTTACACAGATCTACAAGAATCTATTAGCATAACACAG  245

seq1  CAAAGCCTTGTAGTGCATGTAATTGCATGTTGGGTGACAAATTCAAAATC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTTGTAGTGCATGTAATTGCATGTTGGGTGACAAATTCAAAATC  295

seq1  TTGTGACCTGCTGTCATAGTTGGTATAGGGTGAACATAGACTGAACATAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGACCTGCTGTCATAGTTGGTATAGGGTGAACATAGACTGAACATAA  345

seq1  AAGAGTCAAACCACAACTGAACAAATCAGACCTTGAATCTAATGTAAGAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTCAAACCACAACTGAACAAATCAGACCTTGAATCTAATGTAAGAC  395

seq1  TTTTTCGGGTCAGAAATTTCAACACTGGCCATCAGAGAACAGATCAGAAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCGGGTCAGAAATTTCAACACTGGCCATCAGAGAACAGATCAGAAT  445

seq1  GACATGAGAGCCATAATTGGGGAACTTCATTTTTTCCATTTATTTATTCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGAGAGCCATAATTGGGGAACTTCATTTTTTCCATTTATTTATTCA  495

seq1  TTTATTCACTATACATCCTGTTCACAGTACCTCACCTCATACAGCTCCTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCACTATACATCCTGTTCACAGTACCTCACCTCATACAGCTCCTC  545

seq1  TCCTACTCCCTCCCCTTTCATCTCTGAGAAGGGGATGCTATCCGTGGGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACTCCCTCCCCTTTCATCTCTGAGAAGGGGATGCTATCCGTGGGTA  595

seq1  TCATCCTGCCCTGACACGTGAAATCCTTTCAGGACTACATACATTGTCTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTGCCCTGACACGTGAAATCCTTTCAGGACTACATACATTGTCTC  645

seq1  CCAAAGATAAGGCAGCCCAGTTAGGGGAACAGAATCCACAGGCAGGTAAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGATAAGGCAGCCCAGTTAGGGGAACAGAATCCACAGGCAGGTAAC  695

seq1  AGAGTCAGGGTAAGCCTCACATATTGGGGATCCACATGAAGACCATGCTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAGGGTAAGCCTCACATATTGGGGATCCACATGAAGACCATGCTG  745

seq1  CACATCTGCTCCAAATATGCAGGGGGCCTAGGTCCAACCTCTGTCTGTTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTGCTCCAAATATGCAGGGGGCCTAGGTCCAACCTCTGTCTGTTG  795

seq1  GTTTTCTTGTAAGGAGTCCCCATCTAATTGGGAAATGACTATTTTCAGAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTTGTAAGGAGTCCCCATCTAATTGGGAAATGACTATTTTCAGAC  845

seq1  TATGGAGAAAAAGTGTAGGTTGATCACACAGTGTGTAGATGAATAGTTAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGAAAAAGTGTAGGTTGATCACACAGTGTGTAGATGAATAGTTAT  895

seq1  AGTCATATCACTGTCTTATACAAATATTTGAGTACTTTGTTTAAAAAAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATATCACTGTCTTATACAAATATTTGAGTACTTTGTTTAAAAAAGC  945

seq1  CATAAAATAAAAATTAGAAAAACAGAAGAAGCTCACAATTCCTCATGAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAATAAAAATTAGAAAAACAGAAGAAGCTCACAATTCCTCATGAAA  995

seq1  TAACAGGATGGGAATTACCAATGATAGTTTACCTAAGATGTAAAAATGCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGATGGGAATTACCAATGATAGTTTACCTAAGATGTAAAAATGCA  1045

seq1  TTAGATCTTCAACTACGGGTGGTGATGTGGCAAGGAAAAAAAGGTTAAGC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATCTTCAACTACGGGTGGTGATGTGGCAAGGAAAAAAAGGTTAAGC  1095

seq1  TTTGCAAAGAATTC  1112
      ||||||||||||||
seq2  TTTGCAAAGAATTC  1109

seq1: chr10_104449091_104450211
seq2: B6Ng01-192J20.g_65_1170

seq1  GAATTCAGTATTCTGCTAACAGCCTTCAGTTGAAGATGTAGAACTCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTATTCTGCTAACAGCCTTCAGTTGAAGATGTAGAACTCTCAG  50

seq1  CCACTCCTGCATCATGCTTGCCTGGATGCTGCCACACTTCCACCTTGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCTGCATCATGCTTGCCTGGATGCTGCCACACTTCCACCTTGAAG  100

seq1  ATAATGGACAGAACCTCTGAACCTGTAATCCAGCCCAAATTAAATGTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGGACAGAACCTCTGAACCTGTAATCCAGCCCAAATTAAATGTTGT  150

seq1  CCTTATGAGAGTTGACTTGGTCATGGTGTCTCTTCACAGCAGTAAAACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATGAGAGTTGACTTGGTCATGGTGTCTCTTCACAGCAGTAAAACTC  200

seq1  TAATGAGGACACTTTAACACAGTGAATTTGAGAGGGAATGAAGTACAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAGGACACTTTAACACAGTGAATTTGAGAGGGAATGAAGTACAGAA  250

seq1  AAGCCTGTCTCAAATTAAATAAACAAATAAATAAAATATAAACATTTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGTCTCAAATTAAATAAACAAATAAATAAAATATAAACATTTTGT  300

seq1  CATTAAAAAGAGCTCAATTCCTTTACAAGCCAAAAGAAAAGAGAAACTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAAAAGAGCTCAATTCCTTTACAAGCCAAAAGAAAAGAGAAACTTT  350

seq1  TTGTGGACCTATTTGAAAAAAAAAATAGGACCTATTTAGTGAAAATCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGACCTATTTGAAAAAAAAAATAGGACCTATTTAGTGAAAATCAAA  400

seq1  TTAGAATCTCATTAGCTAGCTCTTTAGTTGGCAAATGATTAGCCCCTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATCTCATTAGCTAGCTCTTTAGTTGGCAAATGATTAGCCCCTAGG  450

seq1  CATTATTGATGGATGCCTGAATCTACTTCTCCCTCCCATGCAATATGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTGATGGATGCCTGAATCTACTTCTCCCTCCCATGCAATATGTTA  500

seq1  TTGCACTCTGGCAACAATCACATAATTTCAACTCAGAAAGTTCCTTTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACTCTGGCAACAATCACATAATTTCAACTCAGAAAGTTCCTTTTCC  550

seq1  GCTGATTGGAAAGAGAGTGATTAATATTAGTTATTAGTCTACATATAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTGGAAAGAGAGTGATTAATATTAGTTATTAGTCTACATATAATT  600

seq1  ATGCATATATTCTACAGTGCCAGGCCTTAGATGGAACATATAAGGGCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATATATTCTACAGTGCCAGGCCTTAGATGGAACATATAAGGGCAGC  650

seq1  ATAAAAGTGAACAAAGAGTATGATATTTTTCTTGTGATAAGAACATGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGTGAACAAAGAGTATGATATTTTTCTTGTGATAAGAACATGAAT  700

seq1  ATTTGACTCTGTAACAGACAATCTGATGAAATAGTACTTGTCAGCAGATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGACTCTGTAACAGACAATCTGATGAAATAGTACTTGTCAGCAGATC  750

seq1  AATCTCTTGAAGAGGTCTTTGTATTTACTCATATCAGTGTAAAAAGCGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCTTGAAGAGGTCTTTGTATTTACTCATATCAGTGTAAAAAGCGTT  800

seq1  TGGGATAAATTCATTAATATGCACTCCCCTGATTTCCTATGAGTACTCGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATAAATTCATTAATATGCACTCCCCTGATTTCCTATGAGTACTCGA  850

seq1  ATTTACAACATTTGGGAATCTGGGAATATAAATTCTATTAGCCTTCTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACAACATTTGGGAATCTGGGAATATAAATTCTATTAGCCTTCTAAA  900

seq1  AGTAATTCAAACTTAAGACTCCCTAGCTTTTTCCCTAAGTGTG-TATTTT  949
      |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  AGTAATTC-AACTT-AGACTCCCTAGCTTTTCCCCTAAGTGTGTTATTTT  948

seq1  TCTGCTGGGGAGATTATGGACGCTGTGAGGGAGGAAGCTGGCAACTCTAT  999
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||
seq2  TCTGCTGGGGAGATTATGGACGCTGTGA-GGAG--AGCTG--CACTCTAT  993

seq1  CTTTTAATCCATTATTCA-CTCAGGATGGGGGATAAAAGCCTCAGATAAA  1048
      ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||
seq2  CTTTT-ATCCATTATTCACCTCAGGAT-GGGGAT-AAAGGCTCAGAT-AA  1039

seq1  AGATATAAAGCTTCTTTTAGACCAAAGAGCCCTATTTTACTTTATTAGAT  1098
       ||  |||||  || |||||||  |||||||||| ||||| ||| |||||
seq2  GGAATTAAAGGCTC-TTTAGAC--AAGAGCCCTA-TTTACCTTA-TAGAT  1084

seq1  CAGTACTG-CTAGGGAAAGCATTT  1121
      |||||||| ||| |  ||||||||
seq2  CAGTACTGCCTAAG--AAGCATTT  1106