BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192P07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 65,222,947 - 65,305,370
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCtnna3, LOC665206, LOC216036
Downstream gene1700023F02Rik, 4930407I19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192P07.bB6Ng01-192P07.g
ACCGA016060GA016061
length1,109929
definitionB6Ng01-192P07.b B6Ng01-192P07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,222,947 - 65,224,063)(65,304,446 - 65,305,370)
sequence
gaattccagggtaagttaaacttcaccttatcatctttataggtagtaat
gtttgtttgggaagcagctctatgggaatctggtgtatattcatacataa
atcatcaatgtatcatatgcaatatgtatttgtgtaaatattaaatatat
cctaagtttcacaagatatattttccacaataggaagaaaggaggtagaa
aggaatatgctcataaattctgagcaaaattataacacttcttggtctaa
aagacatacatagaaagggaagcagatataattaaaattgattttcaaat
tgtgtctccttagacagatagtgatgatattagaagttataagtaagata
atagtaactacataataggaaaagaaaattagatcaatagcagagatatt
tattcaatgcaattaaaggatatacaaatatcctagagaaagttaaaata
tgagattatagtaacaatgatatataaataaggttaagagtgttgatacc
atactcactcagctagaaactgtggaccacagctcttctagtctgtctag
agttagtaaatgatagtttccgatagatattacaaaaatactaaaataat
attacaaatgagttgacagactctcagtggtgagccagtcaactcacata
tgtaaaatttctatacgaatctattaaattagaggttatcatgtttacag
ggataatcaatacctattacagtccctttcaactaaaataatgaacatca
catgggttcatttaagtgataagtttttctgaacttctcaacaagttttt
tttatctgaaattagacatgatgttaatatcctgtaatttcaatttttct
gattgatttatgacataacattatgtattagtagatctaaagatggtgga
agttttattttatactcaatgaatattaaaacctagttttcatttacaga
gagtacaaaggatcatgatgagtgtattttcacaatgaaatagaaattat
aatcagaacattgcccattggagagatcacaaccaagcactttgcttaca
tctagtactgccatgatgtctggtctttcatgtctaaaaatggacattac
cgtgtagaa

gaattctcaggagctggagttattaggaagacagggaacgtttgatgtag
gtgctaggaatagagagctgctctttcaagagcagcaatgtagcttaact
attggcccatttctctgtcttgtacatagtaacctcttcttaaaagatgc
attgtttttactttattcatgtggttttttgtatgtctgtccacgtacca
catgttacaccatgtgcctgcactgccttcagatgtcagatctcctctaa
atggagatacagttatctgcctgtggatgcttacattaaaacccaggtca
tctgcaggagcaactcttacctgttatgagagcatcctcatacactgaaa
ttttcagtcagtcttcaaggcttctgagggtttttttttccccttttaca
actattttgctcaaaacaatttaagaagacagtatccattatggtaaatt
atgttgtttgggatttaaaatgtcctatatatggtaatccctgtttttca
gctctcccttggcaatatctttgtggaagtacagtgttatttattcttta
tatatttttaggtaaggacaaattctcactctaattcatacttcatttaa
cttgctcataatgtttctgaatgcatataaacagcagttaagtcttgagg
cccaataagagaaaccttgtcataagtgatgtttcatatatcatacttac
tattcccttaaggtgcatattgctttgtctgtttcatttgggaacttgac
aatggttcttctatgatccacctgctttatgctctaaatcttactgatct
ctgttcacctatgcttttgggatcaatgattgttattactaagaggtgag
cttgcctgtaagaactgcttctgaccactgaaactcagaggagagaccta
atcttcccagggtctgctgaaagagggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_65222947_65224063
seq2: B6Ng01-192P07.b_45_1153

seq1  GAATTCCAGGGTAAGTTAAACTTCACCTTATCATCTTTATAGGTAGTAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGGTAAGTTAAACTTCACCTTATCATCTTTATAGGTAGTAAT  50

seq1  GTTTGTTTGGGAAGCAGCTCTATGGGAATCTGGTGTATATTCATACATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGGGAAGCAGCTCTATGGGAATCTGGTGTATATTCATACATAA  100

seq1  ATCATCAATGTATCATATGCAATATGTATTTGTGTAAATATTAAATATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAATGTATCATATGCAATATGTATTTGTGTAAATATTAAATATAT  150

seq1  CCTAAGTTTCACAAGATATATTTTCCACAATAGGAAGAAAGGAGGTAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGTTTCACAAGATATATTTTCCACAATAGGAAGAAAGGAGGTAGAA  200

seq1  AGGAATATGCTCATAAATTCTGAGCAAAATTATAACACTTCTTGGTCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATATGCTCATAAATTCTGAGCAAAATTATAACACTTCTTGGTCTAA  250

seq1  AAGACATACATAGAAAGGGAAGCAGATATAATTAAAATTGATTTTCAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATACATAGAAAGGGAAGCAGATATAATTAAAATTGATTTTCAAAT  300

seq1  TGTGTCTCCTTAGACAGATAGTGATGATATTAGAAGTTATAAGTAAGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTCCTTAGACAGATAGTGATGATATTAGAAGTTATAAGTAAGATA  350

seq1  ATAGTAACTACATAATAGGAAAAGAAAATTAGATCAATAGCAGAGATATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAACTACATAATAGGAAAAGAAAATTAGATCAATAGCAGAGATATT  400

seq1  TATTCAATGCAATTAAAGGATATACAAATATCCTAGAGAAAGTTAAAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCAATGCAATTAAAGGATATACAAATATCCTAGAGAAAGTTAAAATA  450

seq1  TGAGATTATAGTAACAATGATATATAAATAAGGTTAAGAGTGTTGATACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATTATAGTAACAATGATATATAAATAAGGTTAAGAGTGTTGATACC  500

seq1  ATACTCACTCAGCTAGAAACTGTGGACCACAGCTCTTCTAGTCTGTCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCACTCAGCTAGAAACTGTGGACCACAGCTCTTCTAGTCTGTCTAG  550

seq1  AGTTAGTAAATGATAGTTTCCGATAGATATTACAAAAATACTAAAATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGTAAATGATAGTTTCCGATAGATATTACAAAAATACTAAAATAAT  600

seq1  ATTACAAATGAGTTGACAGACTCTCAGTGGTGAGCCAGTCAACTCACATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAAATGAGTTGACAGACTCTCAGTGGTGAGCCAGTCAACTCACATA  650

seq1  TGTAAAATTTCTATACGAATCTATTAAATTAGAGGTTATCATGTTTACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAATTTCTATACGAATCTATTAAATTAGAGGTTATCATGTTTACAG  700

seq1  GGATAATCAATACCTATTACAGTCCCTTTCAACTAAAATAATGAACATCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAATCAATACCTATTACAGTCCCTTTCAACTAAAATAATGAACATCA  750

seq1  CATGGGTTCATTTAAGTGATAAGTTTTTCTGAACTTCTCAACAAGTTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGTTCATTTAAGTGATAAGTTTTTCTGAACTTCTCAACAAGTTTTT  800

seq1  TTTATCTGAAATTAGACATGATGTTAATATCCTGTAATTTCAATTTTTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTGAAATTAGACATGATGTTAATATCCTGTAATTTCAATTTTTCT  850

seq1  GATTGATTTATGACATAACATTATGTATTAGTAGATCTAAAGATGGTGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGATTTATGACATAACATTATGTATTAGTAGATCTAAAGATGGTGGA  900

seq1  AGTTT--ATTTATACTCAATGAATATTAAAACCTAGTTTTCATTTACAGA  948
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTATTTTATACTCAATGAATATTAAAACCTAGTTTTCATTTACAGA  950

seq1  GAGTACAAAGGATCATGATGAGTGTA-TTTCACAATG-AATAGAAA-TAT  995
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||
seq2  GAGTACAAAGGATCATGATGAGTGTATTTTCACAATGAAATAGAAATTAT  1000

seq1  AATCAGAACATTGCCCATTGGAGAGAAAACACAAAACAAAGCAACTTTGC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||     || ||| |||| |||||||
seq2  AATCAGAACATTGCCCATTGGAGAGA----TCACAACCAAGC-ACTTTGC  1045

seq1  TTAACATCTAGTACTGCCATGATTGTCTTTGTCTTTTTTCATTGTCTTAA  1095
      || ||||||||||||||||||| |||| | |||   ||||| |||| |||
seq2  TT-ACATCTAGTACTGCCATGA-TGTC-TGGTC---TTTCA-TGTC-TAA  1087

seq1  AAATGGACAATACCGTGTAGAA  1117
      ||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATGGACATTACCGTGTAGAA  1109


seq1: chr10_65304446_65305370
seq2: B6Ng01-192P07.g_65_993 (reverse)

seq1  TACCCTCTATCAGCAGA-CCTGGG-AGATTAGCTCTCTCCTCTGAGTTTC  48
      |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  TACCCTCTTTCAGCAGACCCTGGGAAGATTAGGTCTCTCCTCTGAGTTTC  50

seq1  AGTGGTCAG-AGCAGTCTCTACAGGCAAGCTCACCTCTTAGTAATAACAA  97
      ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCAGAAGCAGTTCTTACAGGCAAGCTCACCTCTTAGTAATAACAA  100

seq1  TCATTGATCCCAAAAGCATAGGTG-ACAGAGATCAGTAAGATTTAGAGCA  146
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCATTGATCCCAAAAGCATAGGTGAACAGAGATCAGTAAGATTTAGAGC-  149

seq1  ATAAAGCAGGTGGATCATAGAAGAACCATTGTCAAGTTCCCAAATG-AAC  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ATAAAGCAGGTGGATCATAGAAGAACCATTGTCAAGTTCCCAAATGAAAC  199

seq1  AGACAAAGCAATATGCACCTTAAGGGAATAGTAAGTATGATATATGAAAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAGCAATATGCACCTTAAGGGAATAGTAAGTATGATATATGAAAC  249

seq1  ATCACTTATGACAAGGTTTCTCTTATTGGGCCTCAAGACTTAACTGCTGT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTATGACAAGGTTTCTCTTATTGGGCCTCAAGACTTAACTGCTGT  299

seq1  TTATATGCATTCAGAAACATTATGAGCAAGTTAAATGAAGTATGAATTAG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGCATTCAGAAACATTATGAGCAAGTTAAATGAAGTATGAATTAG  349

seq1  AGTGAGAATTTGTCCTTACCTAAAAATATATAAAGAATAAATAACACTGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGAATTTGTCCTTACCTAAAAATATATAAAGAATAAATAACACTGT  399

seq1  ACTTCCACAAAGATATTGCCAAGGGAGAGCTGAAAAACAGGGATTACCAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCACAAAGATATTGCCAAGGGAGAGCTGAAAAACAGGGATTACCAT  449

seq1  ATATAGGACATTTTAAATCCCAAACAACATAATTTACCATAATGGATACT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGGACATTTTAAATCCCAAACAACATAATTTACCATAATGGATACT  499

seq1  GTCTTCTTAAATTGTTTTGAGCAAAATAGTTGTAAAAGGGGAAAAAAAAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCTTAAATTGTTTTGAGCAAAATAGTTGTAAAAGGGGAAAAAAAAA  549

seq1  CCCTCAGAAGCCTTGAAGACTGACTGAAAATTTCAGTGTATGAGGATGCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGAAGCCTTGAAGACTGACTGAAAATTTCAGTGTATGAGGATGCT  599

seq1  CTCATAACAGGTAAGAGTTGCTCCTGCAGATGACCTGGGTTTTAATGTAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAACAGGTAAGAGTTGCTCCTGCAGATGACCTGGGTTTTAATGTAA  649

seq1  GCATCCACAGGCAGATAACTGTATCTCCATTTAGAGGAGATCTGACATCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCACAGGCAGATAACTGTATCTCCATTTAGAGGAGATCTGACATCT  699

seq1  GAAGGCAGTGCAGGCACATGGTGTAACATGTGGTACGTGGACAGACATAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCAGTGCAGGCACATGGTGTAACATGTGGTACGTGGACAGACATAC  749

seq1  AAAAAACCACATGAATAAAGTAAAAACAATGCATCTTTTAAGAAGAGGTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCACATGAATAAAGTAAAAACAATGCATCTTTTAAGAAGAGGTT  799

seq1  ACTATGTACAAGACAGAGAAATGGGCCAATAGTTAAGCTACATTGCTGCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGTACAAGACAGAGAAATGGGCCAATAGTTAAGCTACATTGCTGCT  849

seq1  CTTGAAAGAGCAGCTCTCTATTCCTAGCACCTACATCAAACGTTCCCTGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAAGAGCAGCTCTCTATTCCTAGCACCTACATCAAACGTTCCCTGT  899

seq1  CTTCCTAATAACTCCAGCTCCTGAGAATTC  925
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTAATAACTCCAGCTCCTGAGAATTC  929


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |