BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-197H14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 74,397,948 - 74,586,505
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGnaz, LOC100040057, Rab36, Bcr
Upstream genePcdh15, EG630453, EG623346
Downstream geneSpecc1l, LOC100040670, Adora2a, EG544707, Upb1, 1110038D17Rik, Snrpd3, AI646023, Ggt1, Ggtla1, Susd2, Cabin1, Ddt, Gstt3, Gstt1, Gstt4, Gstt2, Mif, Derl3, Smarcb1, Mmp11, Ndg2, Gm867, Vpreb3, EG333669, Suhw2, Slc5a4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-197H14.bB6Ng01-197H14.g
ACCGA019327GA019328
length9661,144
definitionB6Ng01-197H14.b B6Ng01-197H14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,397,948 - 74,398,895)(74,585,380 - 74,586,505)
sequence
gaattccacgtggtggcgctagactacctgttggtactcctgtgtgtccc
aaactatctggcaatacaggcatacttgtttgggcacctgcagtgccccc
gtactaccttgtgcatgcctgtttacaagcctgctatgtcccagagccac
cacatggaggcatgggctcacctgtctctgcacctgatgggtcctatcac
tgctacctggtggtgcaggcatgcctgctcatgcccacagtacacctgcc
ataggacagagctcacttttgagtgtgcctccagtgtcctacagctgctg
tgtgctgggccctgactcatctgtttgtacacctgctgtgcccagaccag
gcacctggtggtgtgttcacacatgtcccatgtcccagcctcacaatgca
gaagctcaggcattcctgttcgcacacctgttttatcccagtgccaccag
gtttgcacacctgccatgttccagaaccaagacatggcagcctcggcttg
ccagctcacatacatgcagatgtatgtcaatatgtgacagtctaggtttg
cttgttcactcatgtgccacttactcaataccaaaacatggaggtatgga
cccctgctgtgttccagcactaccacttagcagtgtgcacatgtctgttc
ccttgtctaacatgtcccagtgctgccacattgatcatgggcatgcttgc
tttccatgtctaccatgtcccagtgctgccatagactgggtggggtacac
aatttcccatgtgtaccatgtcccaatgccaacacaatgttgcatgtgca
cagctgtttcccacattacgccatgtcccagctcagtcataatgttgtta
tgtgtatgccctggtttccaatacttaccattgttaaagcatgccacatt
gacaagtggtccctgtaccctattcatggaccatgtgatgtggtaagcat
ggcttgctcctgacat
gaattcaaagttcaaggatgtttttgtatggtccccatacaactacctat
ggggatatgatgggcaaaaagaccagaatcctctgaactaattgttggcg
aacccaggaaaagctcatcaggaccctggcctgttgccccgggctatgat
ctgtagtaccctcttgccaagcccttccagtagacactctgaagcaaaag
gcaacttaccctttgcatcaacaactttatgcagacatctaggacacgtg
gtgggttagcatgacaaccccagacagtgctagataccagaccagacatc
caagctggaaagcctttgatggtgtcagcgtatgggttgcacacaccttt
acccccagcatttgcaaggcagaggcaagtgggccagcctgttctacaaa
gaagttccagggcagtcagggctacaaaacagaccttattacaaaattta
agcaggggctgggcctggctgcacttcaaagctgctcgggtgatgctgag
agtgaggaacacctgtgagaggcagaggattctgtgacatcagctctgca
tggatgcctacagcttgcaatagtgcctagcctgagacctagcatgccag
cccaggtacaagaaactagcaactcggaaccaaatctcaccacagttaat
tgccacttcaggatctatgatcctagactatagtctggagccttccccca
gaaccctgcgtaccaagagctgactctaccttgggagaggggctgtcaat
caaggaacatgaggctggccatctacaggagcccttcctttattttggag
cagtacctggcacggtacaggtggcaggcattaccaggagctcaatttcc
taacaagagcctcagctcttgcaagaagcagggtgaaaaataccgtttgc
taggtacttcccccagcttcttcatgggtgttgtaatcttttacacaatt
ctatggatgccacgccgaccacttttggtggaacatggaacttcagtctg
ccattttttagcagaataggaaacagaatttcttgaagctggactacatt
caagttcaacctatgaacatacaaatctaagaactttaagaatggagaat
gatgcctcacccatggatgtgtgacctctgacaggtccctgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_74397948_74398895
seq2: B6Ng01-197H14.b_45_1010

seq1  GAATTCCACGTGGTGGCGCTAGACTACCTGTTGGTACTCCTGTGTGTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACGTGGTGGCGCTAGACTACCTGTTGGTACTCCTGTGTGTCCC  50

seq1  AAACTATCTGGCAATACAGGCATACTTGTTTGGGCACCTGCAGTGCCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTATCTGGCAATACAGGCATACTTGTTTGGGCACCTGCAGTGCCCCC  100

seq1  GTACTACCTTGTGCATGCCTGTTTACAAGCCTGCTATGTCCCAGAGCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTACCTTGTGCATGCCTGTTTACAAGCCTGCTATGTCCCAGAGCCAC  150

seq1  CACATGGAGGCATGGGCTCACCTGTCTCTGCACCTGATGGGTCCTATCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGAGGCATGGGCTCACCTGTCTCTGCACCTGATGGGTCCTATCAC  200

seq1  TGCTACCTGGTGGTGCAGGCATGCCTGCTCATGCCCACAGTACACCTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCTGGTGGTGCAGGCATGCCTGCTCATGCCCACAGTACACCTGCC  250

seq1  ATAGGACAGAGCTCACTTTTGAGTGTGCCTCCAGTGTCCTACAGCTGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACAGAGCTCACTTTTGAGTGTGCCTCCAGTGTCCTACAGCTGCTG  300

seq1  TGTGCTGGGCCCTGACTCATCTGTTTGTACACCTGCTGTGCCCAGACCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTGGGCCCTGACTCATCTGTTTGTACACCTGCTGTGCCCAGACCAG  350

seq1  GCACCTGGTGGTGTGTTCACACATGTCCCATGTCCCAGCCTCACAATGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTGGTGGTGTGTTCACACATGTCCCATGTCCCAGCCTCACAATGCA  400

seq1  GAAGCTCAGGCATTCCTGTTCGCACACCTGTTTTATCCCAGTGCCACCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTCAGGCATTCCTGTTCGCACACCTGTTTTATCCCAGTGCCACCAG  450

seq1  GTTTGCACACCTGCCATGTTCCAGAACCAAGACATGGCAGCCTCGGCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCACACCTGCCATGTTCCAGAACCAAGACATGGCAGCCTCGGCTTG  500

seq1  CCAGCTCACATACATGCAGATGTATGTCAATATGTGACAGTCTAGGTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTCACATACATGCAGATGTATGTCAATATGTGACAGTCTAGGTTTG  550

seq1  CTTGTTCACTCATGTGCCACTTACTCAATACCAAAACATGGAGGTATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTCACTCATGTGCCACTTACTCAATACCAAAACATGGAGGTATGGA  600

seq1  CCCCTGCTGTGTTCCAGCACTACCACTTAGCAGTGTGCACATGTCTGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCTGTGTTCCAGCACTACCACTTAGCAGTGTGCACATGTCTGTTC  650

seq1  CCTTGTCTACCATGTCCCAGTGCTGCCACA-TGATCATGGGCATGCTTGC  699
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCTAACATGTCCCAGTGCTGCCACATTGATCATGGGCATGCTTGC  700

seq1  -TTCCATGTCTACCATGTCCCAGTGCTGCCATAGACTGGGT-GGGTACAC  747
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTCCATGTCTACCATGTCCCAGTGCTGCCATAGACTGGGTGGGGTACAC  750

seq1  AA-TTCCCATGTGTACCATGTCCCAATGCCAACAC-ATGTTGCATGTGCA  795
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AATTTCCCATGTGTACCATGTCCCAATGCCAACACAATGTTGCATGTGCA  800

seq1  CAGCTG-TTCCCACA-TACGCCATGTCCCAGCTCAGTCAT-ATGTTGTTA  842
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CAGCTGTTTCCCACATTACGCCATGTCCCAGCTCAGTCATAATGTTGTTA  850

seq1  TGTGTATG-CCTG--TTCCAATACTTACCA-TGTTAAAGCAATGCCACA-  887
      |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| 
seq2  TGTGTATGCCCTGGTTTCCAATACTTACCATTGTTAAAGC-ATGCCACAT  899

seq1  TGACAAGT-GTCCCTGTACCCTA-TCAT-GACCATGTGATGT-GTAAGCA  933
      |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||
seq2  TGACAAGTGGTCCCTGTACCCTATTCATGGACCATGTGATGTGGTAAGCA  949

seq1  T-GCTTGCT-CTGACAT  948
      | ||||||| |||||||
seq2  TGGCTTGCTCCTGACAT  966

seq1: chr10_74585380_74586505
seq2: B6Ng01-197H14.g_67_1210 (reverse)

seq1  CCCCA-GGACCTGTCAGATGTCAC-CACTCATGGGTGAAGCATCTATCTC  48
      ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||  ||||
seq2  CCCCAGGGACCTGTCAGAGGTCACACATCCATGGGTGAGGCATCATTCTC  50

seq1  CA-TCTTAAAGTTCTTAGATTGTAATGGTCATAGG-TGGACTTGAATGTA  96
      || ||||||||||||||||||   ||| ||||||| || |||||||||||
seq2  CATTCTTAAAGTTCTTAGATTTGTATGTTCATAGGTTGAACTTGAATGTA  100

seq1  GTCAAGCTTCA--GAATTCTGTTTCCTA-TCTGCT-AAAAATGGCAGACT  142
      ||| |||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  GTCCAGCTTCAAGAAATTCTGTTTCCTATTCTGCTAAAAAATGGCAGACT  150

seq1  GGAAGTCCATG-TCCACC-AAAGT-GTCGGCGT-GCATCCATAGAA-TGT  187
      | |  |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||
seq2  GAAGTTCCATGTTCCACCAAAAGTGGTCGGCGTGGCATCCATAGAATTGT  200

seq1  GTAAAAGATTACAACA-CCATGAAG-AGCTGGGGGAAGTACCTAGCAAAC  235
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGATTACAACACCCATGAAGAAGCTGGGGGAAGTACCTAGCAAAC  250

seq1  GGTATTTTTCACCCTGCTTCTTGCAAGAGCTGAGGCTCTTGTTAGGAAAT  285
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTTTCACCCTGCTTCTTGCAAGAGCTGAGGCTCTTGTTAGGAAAT  300

seq1  TGAGCTCCTGGTAATGCCTGCCACCTGTACCGTGCCAGGTACTGCTCCAA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCTGGTAATGCCTGCCACCTGTACCGTGCCAGGTACTGCTCCAA  350

seq1  AATAAAGGAA-GGCTCCTGTAGATGGCCAGCCTCATGTTCC-TGATTGAC  383
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AATAAAGGAAGGGCTCCTGTAGATGGCCAGCCTCATGTTCCTTGATTGAC  400

seq1  AGCCCCTCTCCCAAGGTAGAGTCAGCTCTTGGTACGCAGGGTTCTGGGGG  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCTCTCCCAAGGTAGAGTCAGCTCTTGGTACGCAGGGTTCTGGGGG  450

seq1  AAGGCTCCAGACTATAGTCTAGGATCATAGATCCTGAAGTGGCAATTAAC  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTCCAGACTATAGTCTAGGATCATAGATCCTGAAGTGGCAATTAAC  500

seq1  TGTGGTGAGATTTGGTTCCGAGTTGCTAG-TTCTTGTACCTGGGCTGGCA  532
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGAGATTTGGTTCCGAGTTGCTAGTTTCTTGTACCTGGGCTGGCA  550

seq1  TGCTAGGTCTCAGGCTAGGCACTATTGCAAGCTGTAGGCATCCATGCAGA  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGGTCTCAGGCTAGGCACTATTGCAAGCTGTAGGCATCCATGCAGA  600

seq1  GCTGATGTCACAGAATCCTCTGCCTCTCACAGGTGTTCCTCACTCTCAGC  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATGTCACAGAATCCTCTGCCTCTCACAGGTGTTCCTCACTCTCAGC  650

seq1  ATCACCCGAGCAGCTTTGAAGTGCAGCCAGGCCCAGCCCCTGCTTAAATT  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCCGAGCAGCTTTGAAGTGCAGCCAGGCCCAGCCCCTGCTTAAATT  700

seq1  TTGTAATAAGGTCTGTTTTGTAGCCCTGACTGCCCTGGAACTTCTTTGTA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATAAGGTCTGTTTTGTAGCCCTGACTGCCCTGGAACTTCTTTGTA  750

seq1  GAACAGGCTGGCCCACTTGCCTCTGCCTTGCAAATGCTGGGGGTAAAGGT  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGGCTGGCCCACTTGCCTCTGCCTTGCAAATGCTGGGGGTAAAGGT  800

seq1  GTGTGCAACCCATACGCTGACACCATCAAAGGCTTTCCAGCTTGGATGTC  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCAACCCATACGCTGACACCATCAAAGGCTTTCCAGCTTGGATGTC  850

seq1  TGGTCTGGTATCTAGCACTGTCTGGGGTTGTCATGCTAACCCACCACGTG  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTGGTATCTAGCACTGTCTGGGGTTGTCATGCTAACCCACCACGTG  900

seq1  TCCTAGATGTCTGCATAAAGTTGTTGATGCAAAGGGTAAGTTGCCTTTTG  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGATGTCTGCATAAAGTTGTTGATGCAAAGGGTAAGTTGCCTTTTG  950

seq1  CTTCAGAGTGTCTACTGGAAGGGCTTGGCAAGAGGGTACTACAGATCATA  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGAGTGTCTACTGGAAGGGCTTGGCAAGAGGGTACTACAGATCATA  1000

seq1  GCCCGGGGCAACAGGCCAGGGTCCTGATGAGCTTTTCCTGGGTTCGCCAA  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGGGGCAACAGGCCAGGGTCCTGATGAGCTTTTCCTGGGTTCGCCAA  1050

seq1  CAATTAGTTCAGAGGATTCTGGTCTTTTTGCCCATCATATCCCCATAGGT  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTAGTTCAGAGGATTCTGGTCTTTTTGCCCATCATATCCCCATAGGT  1100

seq1  AGTTGTATGGGGACCATACAAAAACATCCTTGAACTTTGAATTC  1126
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTATGGGGACCATACAAAAACATCCTTGAACTTTGAATTC  1144