seq1: chr10_5019424_5019502
seq2: B6Ng01-199E22.b_48_126
seq1 TCTAATCCAATCACAACAAGGAATTCTCTAGTCCAATCACAAGCCACATC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTAATCCAATCACAACAAGGAATTCTCTAGTCCAATCACAAGCCACATC 50
seq1 CGGCTGTCCCCCTGAGCGTGGGCAATGGG 79
|||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGGCTGTCCCCCTGAGCGTGGGCAATGGG 79
| seq1: chr10_5159595_5160681
seq2: B6Ng01-199E22.g_65_1159 (reverse)
seq1 AATTATT--AGTTTCTTAGATTTTTGTACCATTTAATATTTGAAGTAATT 48
||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |
seq2 AATTATTAAAGTTTCTACGA-TGTTGTACCAATTAATATTTGAAGTAA-T 48
seq1 ATATTTTTGTGTGAAT-AATTCACT-CACAAATAGT--AAAATATGG-CC 93
||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||
seq2 ATA-TTTTGTGGAAATAAATCCACTCCACAAATAGTAAAAAATATGGACC 97
seq1 TCATTTACAAAATTAATAG-TTCTAGATTGATTCATTTTTG-AGACAGTC 141
||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||
seq2 TCA-TTACAAAATTAATAGATACTAGATGGATTCATTTTTGAAGACAGTC 146
seq1 TCCTCT-AGCCCAGGCTAGCTTCAAACTTGGTATGTACCTG-AGCGTATC 189
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2 TCCTTTAAGCCCAGGCTAGCTTCAAACTTGGTATGTACCTGAAGCGTATC 196
seq1 CTTGGACTCCTCCCAATCCTCCTGCCTTCTCGTACATTTATCTTTAAAAC 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 CTTGGACTCCTCCCAATCCTCCTGCCTTCTCGTACATTTATCTTTTAAAC 246
seq1 AAACACAC-AAACACACATATAAACAACAAAAAAACCCTTTCAATACTTA 288
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACACACAAAACACACATATAAACAACAAAAAAACCCTTTCAATACTTA 296
seq1 TTCAGAATGTTAACCAATGTTGTGAACTCCATTTTGGGAACTAGATCAGG 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCAGAATGTTAACCAATGTTGTGAACTCCATTTTGGGAACTAGATCAGG 346
seq1 TAGAGCCCACCCCTTTTCTATATTGGTTTAATATAGGCATAGTAGTTAAT 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGAGCCCACCCCTTTTCTATATTGGTTTAATATAGGCATAGTAGTTAAT 396
seq1 TCGAGGTGTACTAGCTAAATAGAGGTGCCCAATTAATTAAAATGTACTGG 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCGAGGTGTACTAGCTAAATAGAGGTGCCCAATTAATTAAAATGTACTGG 446
seq1 TTAAATAGAGTATACTGGTTAATTAGAGATGCATTGGTTATTTGAGCAGT 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAAATAGAGTATACTGGTTAATTAGAGATGCATTGGTTATTTGAGCAGT 496
seq1 GCTAGTTAAATAGAGGTATGCTGGCTAATTACAGATATCCAGATAGAGTA 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTAGTTAAATAGAGGTATGCTGGCTAATTACAGATATCCAGATAGAGTA 546
seq1 AAGATGTACTAGTTAAATATAGATATTTTGGCTAAGTGGAGATGTGCTGG 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGATGTACTAGTTAAATATAGATATTTTGGCTAAGTGGAGATGTGCTGG 596
seq1 TAAATTAGAGGTGTGTTTGTTAAATAGAAGTGTACTAGATAGTTAGATGT 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAATTAGAGGTGTGTTTGTTAAATAGAAGTGTACTAGATAGTTAGATGT 646
seq1 TAACTAGAGACACACTAGTTAAATATGGGTGTGCTGGTTAAATAGAAGTG 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAACTAGAGACACACTAGTTAAATATGGGTGTGCTGGTTAAATAGAAGTG 696
seq1 TAACTGATTAAATAGAAATAAACCTGTTAAATAGGGGCTACTGCATGAAT 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAACTGATTAAATAGAAATAAACCTGTTAAATAGGGGCTACTGCATGAAT 746
seq1 AGTTTGCATTACCATTTTACCAAATATAAAACAAGAAGGTACTTTGGCAA 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTTTGCATTACCATTTTACCAAATATAAAACAAGAAGGTACTTTGGCAA 796
seq1 TGTGAAATGTTGATATACATTTTTTCATATTTATGAGATTGCTAAAGCAA 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGAAATGTTGATATACATTTTTTCATATTTATGAGATTGCTAAAGCAA 846
seq1 TTATAATGCACTTGTTATCTTTTAAATTCTTTATTTTTAAATGTTATTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATAATGCACTTGTTATCTTTTAAATTCTTTATTTTTAAATGTTATTTT 896
seq1 CAAGCATTATTTTTAAATGTTATTTTCACGGCACCAACAATGAATGTAAA 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGCATTATTTTTAAATGTTATTTTCACGGCACCAACAATGAATGTAAA 946
seq1 TCTTAAGCCTTTCCACTGCATTAAGAATAGTTTCCTAAGCGCACTGAACT 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTAAGCCTTTCCACTGCATTAAGAATAGTTTCCTAAGCGCACTGAACT 996
seq1 TGCCTTTCCTTCACTCTGACACTCTACTCTCCACCCAGGACATTGCGTAC 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCCTTTCCTTCACTCTGACACTCTACTCTCCACCCAGGACATTGCGTAC 1046
seq1 TACCAAGCTCTGTCAGCCGAGGGGTTGCAGACAGATGCTGCAAGAATTC 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACCAAGCTCTGTCAGCCGAGGGGTTGCAGACAGATGCTGCAAGAATTC 1095
|