BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-199O21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,803,568 - 67,892,878
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEgr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136
Downstream gene1700040L02Rik, EG665342, Tmem26, A930033H14Rik, Rhobtb1, LOC100040182, Cdc2a, LOC100039696, EG382371
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-199O21.bB6Ng01-199O21.g
ACCGA021131GA021132
length1,068447
definitionB6Ng01-199O21.b B6Ng01-199O21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,803,568 - 67,804,629)(67,892,426 - 67,892,878)
sequence
gaattcttgccatgacttcccttggtgtcagactaccattatgaactaga
ataacccactttcctccccaagttgctttcagtcatactgtttttcacag
ccatagaaactttaaataagacagacatcaactcatcttgaaaagtgaca
aagaggtaagtaatttatcttgcttttctttaaccttagggtaatcaggg
catggatgatgaattttcatcatatatgttttccagatgacaaagttatt
agaattagaatatcgccaactgaaatgagatttcatgcaacagtcccagc
cagggtcctcctaatggcttacaaaccatttaggaacaaaaacaaacaaa
caaagacaaaacaaaaacaaagcaaaaaaaaccatgcatgattcagataa
agaccacacagagtagagatcacaaaaagatcagcatccaataaccttag
aaattttttttatcagcctttaaaatgctgttgccaagtgatcaaaataa
ataataaagccatcattgagcaagactctggctctacagaccttgtatat
aggaaacatatgggtcaaagagaggcataatcagcgaatcacaggagtat
gagcaaaatgcagaatctatacgatagcaggcagatttaaaggggatgga
ggatagagtgtccagggagaagtagagaaagggaacatttagatttaagg
agatttaacagacatgaaatccacgtatggatcttattctggtcctgatt
tgaacctgtgcagttaaaaaccacaagatgcctaggaaaatgttattgct
gtaattaatgctattacacagttaatgttaacattttaactaagttaata
gagatgtaccttcttatgactcaaccttcttatgctgtgaccctttaatg
ccgttcctcatgttgtgctgacccccaataaaattattttcactgctaca
gtctaagtgttatttgctactgttatgaattgcaatgcaaatatctaatt
atgcaggattatttgcatattaagagtcacaacccacaagggtaaaaaaa
ctgctgtttagaagatcc

ttaggatgaaggcgtgcttgcttctcatgctagagacctgggactgcctt
cctccccaccccacccccagctcctctgcctatagaaaactggagaagct
gtagaacaatggcctgcatccccttagctgtcttttcaccagagatagca
gtggccctgaagaaaacaagggcagctaataaagaagcatctagaagtga
ctaagcaaagtttcaacagcaatcagggatgtagagtggacctaaaagaa
ggcatccttgagcaaggattgcaggcatgtaaagccaatcaaaaattagg
tgagatgtatagacagatgattgatggatggatggatggatggatggatg
gacagacagatagatgatggattatagatggatagatagatggtggatgg
atagatagatgattgataattcgatagagagatatatagatagatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67803568_67804629
seq2: B6Ng01-199O21.b_49_1116

seq1  GAATTCTTGCCATGACTTCCCTTGGTGTCAGACTACCATTATGAACTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGCCATGACTTCCCTTGGTGTCAGACTACCATTATGAACTAGA  50

seq1  ATAACCCACTTTCCTCCCCAAGTTGCTTTCAGTCATACTGTTTTTCACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCCACTTTCCTCCCCAAGTTGCTTTCAGTCATACTGTTTTTCACAG  100

seq1  CCATAGAAACTTTAAATAAGACAGACATCAACTCATCTTGAAAAGTGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAAACTTTAAATAAGACAGACATCAACTCATCTTGAAAAGTGACA  150

seq1  AAGAGGTAAGTAATTTATCTTGCTTTTCTTTAACCTTAGGGTAATCAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTAAGTAATTTATCTTGCTTTTCTTTAACCTTAGGGTAATCAGGG  200

seq1  CATGGATGATGAATTTTCATCATATATGTTTTCCAGATGACAAAGTTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGATGATGAATTTTCATCATATATGTTTTCCAGATGACAAAGTTATT  250

seq1  AGAATTAGAATATCGCCAACTGAAATGAGATTTCATGCAACAGTCCCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTAGAATATCGCCAACTGAAATGAGATTTCATGCAACAGTCCCAGC  300

seq1  CAGGGTCCTCCTAATGGCTTACAAACCATTTAGGAACAAAAACAAACAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTCCTCCTAATGGCTTACAAACCATTTAGGAACAAAAACAAACAAA  350

seq1  CAAAGACAAAACAAAAACAAAGCAAAAAAAACCATGCATGATTCAGATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACAAAACAAAAACAAAGCAAAAAAAACCATGCATGATTCAGATAA  400

seq1  AGACCACACAGAGTAGAGATCACAAAAAGATCAGCATCCAATAACCTTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACACAGAGTAGAGATCACAAAAAGATCAGCATCCAATAACCTTAG  450

seq1  AAATTTTTTTTATCAGCCTTTAAAATGCTGTTGCCAAGTGATCAAAATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTTTTTATCAGCCTTTAAAATGCTGTTGCCAAGTGATCAAAATAA  500

seq1  ATAATAAAGCCATCATTGAGCAAGACTCTGGCTCTACAGACCTTGTATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAAGCCATCATTGAGCAAGACTCTGGCTCTACAGACCTTGTATAT  550

seq1  AGGAAACATATGGGTCAAAGAGAGGCATAATCAGCGAATCACAGGAGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACATATGGGTCAAAGAGAGGCATAATCAGCGAATCACAGGAGTAT  600

seq1  GAGCAAAATGCAGAATCTATACGATAGCAGGCAGATTTAAAGGGGATGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAAATGCAGAATCTATACGATAGCAGGCAGATTTAAAGGGGATGGA  650

seq1  GGATAGAGTGTCCAGGGAGAAGTAGAGAAAGGGAACATTTAGATTTAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAGAGTGTCCAGGGAGAAGTAGAGAAAGGGAACATTTAGATTTAAGG  700

seq1  AGATTTAACAGACATGAAATCCACGTATGGATCTTATTCTGGTCCTGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTAACAGACATGAAATCCACGTATGGATCTTATTCTGGTCCTGATT  750

seq1  TGAACCTGTGCAGTTAAAAACCACAAGATGCCTAGGAAAATGTTATTGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCTGTGCAGTTAAAAACCACAAGATGCCTAGGAAAATGTTATTGCT  800

seq1  GTAATTAATGCTATTACACAGTTAATGTTAACATTTTAACTAAGTTAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTAATGCTATTACACAGTTAATGTTAACATTTTAACTAAGTTAATA  850

seq1  GAGATGTACCTTCTTATGACTCAACCTTCTTATGCTGTGACCCTTTAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGTACCTTCTTATGACTCAACCTTCTTATGCTGTGACCCTTTAATG  900

seq1  CCGTTCCTCATGTTGTGCTGACCCCCAATAAAATTATTTTCACTGCTACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTCCTCATGTTGTGCTGACCCCCAATAAAATTATTTTCACTGCTACA  950

seq1  GTCTAAGTGTTATTTGCTACTGTTATGAATTGCAATGCAAATATCTAA-T  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTCTAAGTGTTATTTGCTACTGTTATGAATTGCAATGCAAATATCTAATT  1000

seq1  ATGCAGGA-TATTTGCATATTAGGAGTCACAACCCACA--GGT-AAAAAA  1045
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||
seq2  ATGCAGGATTATTTGCATATTAAGAGTCACAACCCACAAGGGTAAAAAAA  1050

seq1  CTGCTGTTTAG-AGATCC  1062
      ||||||||||| ||||||
seq2  CTGCTGTTTAGAAGATCC  1068


seq1: chr10_67892426_67892878
seq2: B6Ng01-199O21.g_66_518 (reverse)

seq1  CTATCTATCTATCTATCTATCTATCGATTTATCTATCATCTATCTATCCA  50
      |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  CTATCTATCTATATATCTCTCTATCGAATTATCAATCATCTATCTATCCA  50

seq1  TCCACCATCTATCTATCCATCTATAATCCATCATCTATCTGTCTGTCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCATCTATCTATCCATCTATAATCCATCATCTATCTGTCTGTCCAT  100

seq1  CCATCCATCCATCCATCCATCCATCAATCATCTGTCTATACATCTCACCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCATCCATCCATCCATCCATCAATCATCTGTCTATACATCTCACCT  150

seq1  AATTTTTGATTGGCTTTACATGCCTGCAATCCTTGCTCAAGGATGCCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTGATTGGCTTTACATGCCTGCAATCCTTGCTCAAGGATGCCTTC  200

seq1  TTTTAGGTCCACTCTACATCCCTGATTGCTGTTGAAACTTTGCTTAGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGTCCACTCTACATCCCTGATTGCTGTTGAAACTTTGCTTAGTCA  250

seq1  CTTCTAGATGCTTCTTTATTAGCTGCCCTTGTTTTCTTCAGGGCCACTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGATGCTTCTTTATTAGCTGCCCTTGTTTTCTTCAGGGCCACTGC  300

seq1  TATCTCTGGTGAAAAGACAGCTAAGGGGATGCAGGCCATTGTTCTACAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCTGGTGAAAAGACAGCTAAGGGGATGCAGGCCATTGTTCTACAGC  350

seq1  TTCTCCAGTTTTCTATAGGCAGAGGAGCTGGGGGTGGGGTGGGGAGGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCAGTTTTCTATAGGCAGAGGAGCTGGGGGTGGGGTGGGGAGGAAG  400

seq1  GCAGTCCCAGGTCTCTAGCATGAGAAGCAAGCACGCCTTCATCCTAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCCCAGGTCTCTAGCATGAGAAGCAAGCACGCCTTCATCCTAAGAA  450

seq1  TTC  453
      |||
seq2  TTC  453


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |