BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-212E10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,311,903 - 90,485,442
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b, Apaf1
Upstream geneE530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream gene1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-212E10.bB6Ng01-212E10.g
ACCGA030113GA030114
length1,0301,115
definitionB6Ng01-212E10.b B6Ng01-212E10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,311,903 - 90,312,924)(90,484,321 - 90,485,442)
sequence
gaattcaacaacctcatacaaaatttgaattcttagcatgaaccgggtat
tatactgagatctcagggtaccatgtcatagaagacctgttgtgtgagaa
agaatcacacaggaaagaaagtgacagatatcaatgtacctatgttccac
cctgtgaccaaatggatcacaaagtacatcggtggcactgagcagggatg
tcagctttatagaagagtgatctcaggagaggttccccagaggatgtggg
ggttatgacatgtactcaagaatgagtacatgtccaagagttcacttgga
aaacttgagggaaggatgaaggattaggtgagcttcgttgagaactgcag
ctgaaggcacgaagaccactcagtgctgtagcagtgagaggcgccgatga
tctagtgtggctgactgagtgtgagaaccgggtgagaactgaggctcttg
gattccagtctcctggtcatgggaaatgattcaagagacaaagtggaaga
gggtatggatgagtctgtcattggcaagagtcggtttggttctgtttcct
catcctgtgctgttatttttatttaatacagtccctcctttgacttctat
gatgtcttataaagtttgacctaagccgacacagtttccaggccagatga
actacagaagcagaattgaagctccaccagccaccagccaccaggttgcc
ctttgcaataataacagttccttagcttgttgtggaaaggtgtacataat
gttaccactgccttccttttataggccattttcgtctcttatttgctgat
cgcagaacaagtcttatttttttttttatcacaagcccagggttggcctt
tagagtcctctcccaagtttaagtggtccagatcaattccttcagtgtat
acccgagcgcctatgatgtgccccaggcctatcaacagagagaatgaatc
actcctacccttcccaactgttcctcatagatgtgtaaccagttccattg
aagtatgctaacatgctagaatagatagat
gaattcaaactcaggttctcaggcttgcagagcaagcatcttagcaccaa
gccacctcccagccccagctgctaatctttataagacagatgcgagttca
gacccatggataatttgaacagggtaagatgggagtcatgtgtctgattc
ggtgccaagcacaaataaaacaatgtttgcaattttgtacttcctatcat
ttctaagatccttaccctctatcatccttagaaagctccaggaaacaatg
aatgtcttccttcttgaaatgtaagggctttgccgtgaaagttcaaagtg
acaactgagagagaaccaagttaaaggcagaaaggaacagggatgcttga
gatttttcagttgtgggattactttaatttctgtcctttactgcagtgtt
tcctactttggactctagagataaaacaggcttttctttttctttttccc
ccttcccttctccctcttgctctgacccaaaggtttttttttatttgttt
ctcattaccaatggttgtgagccacgatgtggttgctgggatttgaactc
atgacctacggaagagcatccagtgctcttaaccgctgagccatctcacc
agcccccaaggcaggcttttcatgtaactattttgtaactggctgcagca
agtgaaaaccactggtcatgtgatgaagtgcttgttctgtccatgctaat
tctgaaatcatagagtaggtctgtaattcaaagtgtaatgagaggagctc
aggcacatatggtacttcattaggctggagtatatttgagggatgtacag
cagaacccaggaccaatgctgccgggacggtggccggctccgacaggttg
tcgtaagcgtgggtgggaagagcacggtgtacatgctacagttagtgtgc
tcatttatcgtagggctttgcagcagctcagaggaaggttgggtgacagt
atttagagagataatccttacatggaagctgattatgcgcatcctgttat
ttttagattgatttagagagataacacatacatgacttctagcttcagag
ctttatattagttgttctcagagggattcagtatcaatacccctttatcc
tctcaatgctttgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90311903_90312924
seq2: B6Ng01-212E10.b_45_1074

seq1  GAATTCAACAACCTCATACAAAATTTGAATTCTTAGCATGAACCGGGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAACCTCATACAAAATTTGAATTCTTAGCATGAACCGGGTAT  50

seq1  TATACTGAGATCTCAGGGTACCATGTCATAGAAGACCTGTTGTGTGAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGAGATCTCAGGGTACCATGTCATAGAAGACCTGTTGTGTGAGAA  100

seq1  AGAATCACACAGGAAAGAAAGTGACAGATATCAATGTACCTATGTTCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCACACAGGAAAGAAAGTGACAGATATCAATGTACCTATGTTCCAC  150

seq1  CCTGTGACCAAATGGATCACAAAGTACATCGGTGGCACTGAGCAGGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGACCAAATGGATCACAAAGTACATCGGTGGCACTGAGCAGGGATG  200

seq1  TCAGCTTTATAGAAGAGTGATCTCAGGAGAGGTTCCCCAGAGGATGTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTTTATAGAAGAGTGATCTCAGGAGAGGTTCCCCAGAGGATGTGGG  250

seq1  GGTTATGACATGTACTCAAGAATGAGTACATGTCCAAGAGTTCACTTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATGACATGTACTCAAGAATGAGTACATGTCCAAGAGTTCACTTGGA  300

seq1  AAACTTGAGGGAAGGATGAAGGATTAGGTGAGCTTCGTTGAGAACTGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGAGGGAAGGATGAAGGATTAGGTGAGCTTCGTTGAGAACTGCAG  350

seq1  CTGAAGGCACGAAGACCACTCAGTGCTGTAGCAGTGAGAGGCGCCGATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGCACGAAGACCACTCAGTGCTGTAGCAGTGAGAGGCGCCGATGA  400

seq1  TCTAGTGTGGCTGACTGAGTGTGAGAACCGGGTGAGAACTGAGGCTCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTGTGGCTGACTGAGTGTGAGAACCGGGTGAGAACTGAGGCTCTTG  450

seq1  GATTCCAGTCTCCTGGTCATGGGAAATGATTCAAGAGACAAAGTGGAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCAGTCTCCTGGTCATGGGAAATGATTCAAGAGACAAAGTGGAAGA  500

seq1  GGGTATGGATGAGTCTGTCATTGGCAAGAGTCGGTTTGGTTCTGTTTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGGATGAGTCTGTCATTGGCAAGAGTCGGTTTGGTTCTGTTTCCT  550

seq1  CATCCTGTGCTGTTATTTTTATTTAATACAGTCCCTCCTTTGACTTCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGTGCTGTTATTTTTATTTAATACAGTCCCTCCTTTGACTTCTAT  600

seq1  GATGTCTTATAAAGTTTGACCTAAGCCGACACAGTTTCCAGGCCAGATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTTATAAAGTTTGACCTAAGCCGACACAGTTTCCAGGCCAGATGA  650

seq1  ACTACAGAAGCAGAATTGAAGCTCCACCAGCCACCAGCCACCAGGTTGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGAAGCAGAATTGAAGCTCCACCAGCCACCAGCCACCAGGTTGCC  700

seq1  CTTTGCAATAATAACAGTTCCTTAGCTTGTTGTGGAAAGGTGTACATAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCAATAATAACAGTTCCTTAGCTTGTTGTGGAAAGGTGTACATAAT  750

seq1  GTTACCACTGCCTTCCTTTTATAGGCCATTTTCGTCTCTTATTTGCTGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCACTGCCTTCCTTTTATAGGCCATTTTCGTCTCTTATTTGCTGAT  800

seq1  CGCAGAACAAGTCTAATTTTTTTTTTTATCACAAGCCCA-GGTTGGCCTT  849
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CGCAGAACAAGTCTTATTTTTTTTTTTATCACAAGCCCAGGGTTGGCCTT  850

seq1  TAGAGTCC-CT-CCAAGTTTAAGTGGTCCAGATCAATTCCTTCAGTGTAT  897
      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCCTCTCCCAAGTTTAAGTGGTCCAGATCAATTCCTTCAGTGTAT  900

seq1  ACCCGAGGGCCTATGATGTGCCCCAGG-CTATCAACAGAGAGAAGGAA-C  945
      ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
seq2  ACCCGAGCGCCTATGATGTGCCCCAGGCCTATCAACAGAGAGAATGAATC  950

seq1  AC-CCTACCCTTCCCAACTGTT-CTCATAGATGTGTAAACAGTTCCATTG  993
      || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACTCCTACCCTTCCCAACTGTTCCTCATAGATGTGTAACCAGTTCCATTG  1000

seq1  AAGTATGCTAACA-GCCAGAATAGAGAGAT  1022
      ||||||||||||| || |||||||| ||||
seq2  AAGTATGCTAACATGCTAGAATAGATAGAT  1030

seq1: chr10_90484321_90485442
seq2: B6Ng01-212E10.g_67_1181 (reverse)

seq1  GACAAAGCAATGAGAGGAATAAAGGGGTAATGATACTGAAATCCCTCTGA  50
      ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  GACAAAGCATTGAGAGG-ATAAAGGGGTATTGATACTG-AATCCCTCTGA  48

seq1  GAACAACTTATTATAAAGCTCTGAAGCTAG-AGTCATGTATGTGTTTTAT  99
      ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
seq2  GAACAAC-TAATATAAAGCTCTGAAGCTAGAAGTCATGTATGTGTTATCT  97

seq1  CTTTTTCTTAAAATCAATCTAAAAATAACAGGATGCGCATAATCAGCTTC  149
      || |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCT------AAATCAATCTAAAAATAACAGGATGCGCATAATCAGCTTC  141

seq1  CATGTAAGGATTATCTCTCT-AATACTGTCACCCAACCTTCCTCTGAGCT  198
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAAGGATTATCTCTCTAAATACTGTCACCCAACCTTCCTCTGAGCT  191

seq1  GCTGCAAAGCCCTACGATAAATGAGCACACTAACTGTAGCATGTACACCG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAAAGCCCTACGATAAATGAGCACACTAACTGTAGCATGTACACCG  241

seq1  TGCTCTTCCCACCCACGCTTACGACAACCTGTCGGAGCCGGCCACCGTCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTCCCACCCACGCTTACGACAACCTGTCGGAGCCGGCCACCGTCC  291

seq1  CGGCAGCATTGGTCCTGGGTTCTGCTGTACATCCCTCAAATATACTCCAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAGCATTGGTCCTGGGTTCTGCTGTACATCCCTCAAATATACTCCAG  341

seq1  CCTAATGAAGTACCATATGTGCCTGAGCTCCTCTCATTACACTTTGAATT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATGAAGTACCATATGTGCCTGAGCTCCTCTCATTACACTTTGAATT  391

seq1  ACAGACCTACTCTATGATTTCAGAATTAGCATGGACAGAACAAGCACTTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCTACTCTATGATTTCAGAATTAGCATGGACAGAACAAGCACTTC  441

seq1  ATCACATGACCAGTGGTTTTCACTTGCTGCAGCCAGTTACAAAATAGTTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATGACCAGTGGTTTTCACTTGCTGCAGCCAGTTACAAAATAGTTA  491

seq1  CATGAAAAGCCTGCCTTGGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGCGGTTAAGAGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAAAGCCTGCCTTGGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGCGGTTAAGAGC  541

seq1  ACTGGATGCTCTTCCGTAGGTCATGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATCG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGATGCTCTTCCGTAGGTCATGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATCG  591

seq1  TGGCTCACAACCATTGGTAATGAGAAACAAATAAAAAAAAACCTTTGGGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCACAACCATTGGTAATGAGAAACAAATAAAAAAAAACCTTTGGGT  641

seq1  CAGAGCAAGAGGGAGAAGGGAAGGGGGAAAAAGAAAAAGAAAAGCCTGTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAAGAGGGAGAAGGGAAGGGGGAAAAAGAAAAAGAAAAGCCTGTT  691

seq1  TTATCTCTAGAGTCCAAAGTAGGAAACACTGCAGTAAAGGACAGAAATTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTCTAGAGTCCAAAGTAGGAAACACTGCAGTAAAGGACAGAAATTA  741

seq1  AAGTAATCCCACAACTGAAAAATCTCAAGCATCCCTGTTCCTTTCTGCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAATCCCACAACTGAAAAATCTCAAGCATCCCTGTTCCTTTCTGCCT  791

seq1  TTAACTTGGTTCTCTCTCAGTTGTCACTTTGAACTTTCACGGCAAAGCCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTTGGTTCTCTCTCAGTTGTCACTTTGAACTTTCACGGCAAAGCCC  841

seq1  TTACATTTCAAGAAGGAAGACATTCATTGTTTCCTGGAGCTTTCTAAGGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTCAAGAAGGAAGACATTCATTGTTTCCTGGAGCTTTCTAAGGA  891

seq1  TGATAGAGGGTAAGGATCTTAGAAATGATAGGAAGTACAAAATTGCAAAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAGGGTAAGGATCTTAGAAATGATAGGAAGTACAAAATTGCAAAC  941

seq1  ATTGTTTTATTTGTGCTTGGCACCGAATCAGACACATGACTCCCATCTTA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTTTATTTGTGCTTGGCACCGAATCAGACACATGACTCCCATCTTA  991

seq1  CCCTGTTCAAATTATCCATGGGTCTGAACTCGCATCTGTCTTATAAAGAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTTCAAATTATCCATGGGTCTGAACTCGCATCTGTCTTATAAAGAT  1041

seq1  TAGCAGCTGGGGCTGGGAGGTGGCTTGGTGCTAAGATGCTTGCTCTGCAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGCTGGGGCTGGGAGGTGGCTTGGTGCTAAGATGCTTGCTCTGCAA  1091

seq1  GCCTGAGAACCTGAGTTTGAATTC  1122
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAGAACCTGAGTTTGAATTC  1115