BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-221A24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 64,888,740 - 64,999,875
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC216036
Upstream geneCtnna3, LOC665206
Downstream gene1700023F02Rik, 4930407I19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-221A24.bB6Ng01-221A24.g
ACCGA036455GA036456
length185446
definitionB6Ng01-221A24.b B6Ng01-221A24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,888,740 - 64,888,924)(64,999,424 - 64,999,875)
sequence
tgagtttgtttttgttagatgggtattttgttccttggtttctgtttttt
ctctggtctgctttcttatgtggcctgggcttctcactggctgtatggtc
tggtaaaccacggatcctctttagcagtttggtattggggttcattgatt
atgaaggtgagagactgggtatgattgggggatcc

tctgaaggaaaagcatagaatctcattaaaggagtaatgtgactgactac
ctatctatttagtatggcttatgctgattcataggggttgtcccttagtc
aggtcattgattctacccagacattatttggtctctctccatccagacaa
gagatcctatgttcttgaccaggagtttgtctcctcaaaggtttcttttg
ctgctttatcttaagcatccttactccatacctatgaaactaacatttgt
gtgtatatatacgtgtatatgcatatatgtgtatattatatataatgtat
atataatatacatacatgcatattaaatgcatgcatatataatatgcata
cattatatgtatgcatgtataatatacacacatgctatatatatatacat
agtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_64888740_64888924
seq2: B6Ng01-221A24.b_54_238

seq1  TGAGTTTGTTTTTGTTAGATGGGTATTTTGTTCCTTGGTTTCTGTTTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTTGTTTTTGTTAGATGGGTATTTTGTTCCTTGGTTTCTGTTTTTT  50

seq1  CTCTGGTCTGCTTTCTTATGTGGCCTGGGCTTCTCACTGGCTGTATGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTCTGCTTTCTTATGTGGCCTGGGCTTCTCACTGGCTGTATGGTC  100

seq1  TGGTAAACCACGGATCCTCTTTAGCAGTTTGGTATTGGGGTTCATTGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAACCACGGATCCTCTTTAGCAGTTTGGTATTGGGGTTCATTGATT  150

seq1  ATGAAGGTGAGAGACTGGGTATGATTGGGGGATAC  185
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATGAAGGTGAGAGACTGGGTATGATTGGGGGATCC  185


seq1: chr10_64999424_64999875
seq2: B6Ng01-221A24.g_67_518 (reverse)

seq1  CACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTATGT  50

seq1  ATATATATATAGCATGTGTGTATATTATACATGCATACATATAATGTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATAGCATGTGTGTATATTATACATGCATACATATAATGTATG  100

seq1  CATATTATATATGCATGCATTTAATATGCATGTATGTATATTATATATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTATATATGCATGCATTTAATATGCATGTATGTATATTATATATAC  150

seq1  ATTATATATAATATACACATATATGCATATACACGTATATATACACACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATATAATATACACATATATGCATATACACGTATATATACACACAA  200

seq1  ATGTTAGTTTCATAGGTATGGAGTAAGGATGCTTAAGATAAAGCAGCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGTTTCATAGGTATGGAGTAAGGATGCTTAAGATAAAGCAGCAAA  250

seq1  AGAAACCTTTGAGGAGACAAACTCCTGGTCAAGAACATAGGATCTCTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACCTTTGAGGAGACAAACTCCTGGTCAAGAACATAGGATCTCTTGT  300

seq1  CTGGATGGAGAGAGACCAAATAATGTCTGGGTAGAATCAATGACCTGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATGGAGAGAGACCAAATAATGTCTGGGTAGAATCAATGACCTGACT  350

seq1  AAGGGACAACCCCTATGAATCAGCATAAGCCATACTAAATAGATAGGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGACAACCCCTATGAATCAGCATAAGCCATACTAAATAGATAGGTAG  400

seq1  TCAGTCACATTACTCCTTTAATGAGATTCTATGCTTTTCCTTCAGAGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCACATTACTCCTTTAATGAGATTCTATGCTTTTCCTTCAGAGAAT  450

seq1  TC  452
      ||
seq2  TC  452


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |