BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-228K21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,383,621 - 24,532,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEnpp1, Enpp3
Upstream geneRps12, 1110021L09Rik, Vnn3, Vnn1, Taar1, Taar2, Taar3, Taar4, Taar5, Taar6, Taar7a, Taar7b, Taar7c-ps, Taar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf
Downstream geneCrsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-228K21.bB6Ng01-228K21.g
ACCGA042034GA042035
length1,0881,181
definitionB6Ng01-228K21.b B6Ng01-228K21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,531,711 - 24,532,801)(24,383,621 - 24,384,791)
sequence
gaattcaatgttgaccaagtacctgaaactcttgtggctttgaatttcct
acaacaaaggactgtgagccaaaataaatcccctttcctttaagctgctt
ttgttaggtttattatttccttctcatgaaaagtaacttagacagtggac
agctcagaggccattcttctgcagaaaccctgaaaagacgggggattaga
tgtaatccagggaagtctctggactggggtccactccttactcacactga
gcttagtcaacatgaggaactgggtgaatgtgcacagactagttcatcct
tcttactttctttgattcctggggaattagaatatgctgggtcaccccag
ctcttcaaaaccggcgagagaaaaacttgccacttggagtttagctggga
agtttggccattagaaggatgttctaattctctttcccccctgaggaaag
ctggaacctcgaggttcccagaggatctcgtgggatacagaaccatgctg
tttgagaggggactgtggcagttaccatgtggctgtgcctgtcttttgga
gcctctgaggacggttctggagttcccacggaagggactgatgcatgtgt
tgctactgaatggctgcacttgtgggacgaagagcaaacacggcttcctc
ctccttcagcttcctagcatcaacctctctttaatctattctctgtgtgt
aacgagttttaggcacgcaacttgcaatttagtgggaggatcaacaccgc
ccccccctccacatacacactttccgggttccactgaatttctggatata
aaacaggttagccatttgacgagtcttctcggaaggtacaagcaaggttt
gtaacaatcaaaaggcacgtctccagtctgtggctattgctgaactgttt
gtatgttgtcactctgtggcaggtcttgttcatatttattaggattgctt
tgaagctcatattctgtccttatggtttgtagagctgtaagcctgctatg
cattctatcctgtttgcattttggatatgttgttagcattttctttcctt
cttgaacgtttgtccatgcccatgatactggtgctctt
gaattcaccgatcagaagaaaacagaacacagacgcagggaggaagaagt
tcatgtcaccttgggcattgatgctctatgctccatgacatgtgaatggc
atggtgatgtgaactcagaaagagggaattgttgctttaagctacggtgg
ccatagccaggaactggctacgtttctaaaatatggaaggtcaaatacga
aacattatgatctttattccgtaggtaactggctcccatccctagtgtca
cagtagctaacattaagtaatttttttcctggttcttcacttttaatagt
gtctaccatgctttcaagccccactcttaagtaataagtttggctcccag
gcaggagagtgtctcctaagaagagtaagaagaggatatatccacagaaa
tctgcagtcttggatacttaaagacttctcatagagcactcaggtttgaa
ggaaaagggaggataaaagattcagagctgacggtgatttcattcaacag
ttcaatgtatcgctgtaaaaactgtaagcaaagccagttctctcagctct
tgttttgtttaaattgttctctctggctacatagaatttcatgtacatag
ttacatggttacatagaatttctttccaaaaagcataatatctttctttc
cagaagtcacagtcccttacagaaggttcttgaagtccacttcaggaata
ctaaatttaacgaagtgattataggtagcggtgaacttacctcgctgctg
actggtccatgtgaatgccctgaagaatctggttcttctaaatacagagt
gtaaaagtgtggtctaaatcaaacagtatcaaaatgtaacattttacgaa
cacattgaaaaacagagtggaaaagaataattcaacagttgatcctgatt
aaaaatcctacatccctggggaagcatccctaaaactctgaggagccatt
acaagcttaggatcttcaaatgaagctgtaattgtcactagttgcttctg
gctatatcatcagagcaaaccaccagtttgttgtagtctgtattagatgt
ctatgaaaacaaagcgggcccttgttaccagaaacctgtcttacattact
ttcatggcttaagaagcttgcagcccactcagaacagcttaagttccttt
tcttcaactggtacttgaacctataaaattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24531711_24532801
seq2: B6Ng01-228K21.b_49_1136 (reverse)

seq1  AAGAGCACACGTATTCATGTGCATGTACAAACACTCAAGAAAGGAAAGAA  50
      ||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||
seq2  AAGAGCACCAGTA-TCATGGGCATGGACAAACGTTCAAG-AAGGAAAGAA  48

seq1  AATGCTAAACAAACATAATCCAAAAATGCAAACAGGATAAGAATGCATAA  100
      ||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |
seq2  AATGCTAA--CAACAT-ATCC-AAAATGCAAACAGGAT-AGAATGCAT-A  92

seq1  GCAGGCTTACAGCCTCTAC-AACCATAAGGACAG-ATATGAGCTTCAAAG  148
      |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCAGGCTTACAG-CTCTACAAACCATAAGGACAGAATATGAGCTTCAAAG  141

seq1  CAATCCTAATAAAATATGAACAAGACCTTGCCACAGAGTGACAACATACA  198
      |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCTAAT-AAATATGAACAAGACC-TGCCACAGAGTGACAACATACA  189

seq1  AACAGTTCAGCAATAGCCACAGACTGGAGACGTGCCTTTTGATTGTTTAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AACAGTTCAGCAATAGCCACAGACTGGAGACGTGCCTTTTGATTG-TTAC  238

seq1  AAACCTTGCTTGTACCTTCCGAGAAGACTCGTCAAATGGCTAACCTGTTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTGCTTGTACCTTCCGAGAAGACTCGTCAAATGGCTAACCTGTTT  288

seq1  TATATCCAG-AATTCAGTGGAACCCGGAAAGTGTGTATGTG--GGGGGGG  345
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  TATATCCAGAAATTCAGTGGAACCCGGAAAGTGTGTATGTGGAGGGGGGG  338

seq1  GCGGTGTTGATCCTCCCACT-AATTGCAAGTTGCGTGCCT-AAACTCGTT  393
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCGGTGTTGATCCTCCCACTAAATTGCAAGTTGCGTGCCTAAAACTCGTT  388

seq1  ACACACAGAGAATAGATTAAAGAGAGGTTGATGCTAGGAAGCTGAAGGAG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAGAGAATAGATTAAAGAGAGGTTGATGCTAGGAAGCTGAAGGAG  438

seq1  GAGGAAGCCGTG-TTGCTCTTCGTCCCACAAGTGCAGCCATTCAGTAGCA  492
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGCCGTGTTTGCTCTTCGTCCCACAAGTGCAGCCATTCAGTAGCA  488

seq1  ACACATGCATCAGTCCCTTCCGTGGGAACTCCAGAACCGTCCTCAGAGGC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGCATCAGTCCCTTCCGTGGGAACTCCAGAACCGTCCTCAGAGGC  538

seq1  TCCAAAAGACAGGCACAGCCACATGGTAACTGCCACAGTCCCCTCTCAAA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAAGACAGGCACAGCCACATGGTAACTGCCACAGTCCCCTCTCAAA  588

seq1  CAGCATGGTTCTGTATCCCACGAGATCCTCTGGGAACCTCGAGGTTCCAG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATGGTTCTGTATCCCACGAGATCCTCTGGGAACCTCGAGGTTCCAG  638

seq1  CTTTCCTCAGGGGGGAAAGAGAATTAGAACATCCTTCTAATGGCCAAACT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCAGGGGGGAAAGAGAATTAGAACATCCTTCTAATGGCCAAACT  688

seq1  TCCCAGCTAAACTCCAAGTGGCAAGTTTTTCTCTCGCCGGTTTTGAAGAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCTAAACTCCAAGTGGCAAGTTTTTCTCTCGCCGGTTTTGAAGAG  738

seq1  CTGGGGTGACCCAGCATATTCTAATTCCCCAGGAATCAAAGAAAGTAAGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTGACCCAGCATATTCTAATTCCCCAGGAATCAAAGAAAGTAAGA  788

seq1  AGGATGAACTAGTCTGTGCACATTCACCCAGTTCCTCATGTTGACTAAGC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGAACTAGTCTGTGCACATTCACCCAGTTCCTCATGTTGACTAAGC  838

seq1  TCAGTGTGAGTAAGGAGTGGACCCCAGTCCAGAGACTTCCCTGGATTACA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTGAGTAAGGAGTGGACCCCAGTCCAGAGACTTCCCTGGATTACA  888

seq1  TCTAATCCCCCGTCTTTTCAGGGTTTCTGCAGAAGAATGGCCTCTGAGCT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATCCCCCGTCTTTTCAGGGTTTCTGCAGAAGAATGGCCTCTGAGCT  938

seq1  GTCCACTGTCTAAGTTACTTTTCATGAGAAGGAAATAATAAACCTAACAA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACTGTCTAAGTTACTTTTCATGAGAAGGAAATAATAAACCTAACAA  988

seq1  AAGCAGCTTAAAGGAAAGGGGATTTATTTTGGCTCACAGTCCTTTGTTGT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCTTAAAGGAAAGGGGATTTATTTTGGCTCACAGTCCTTTGTTGT  1038

seq1  AGGAAATTCAAAGCCACAAGAGTTTCAGGTACTTGGTC-ACATTGAATTC  1091
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGGAAATTCAAAGCCACAAGAGTTTCAGGTACTTGGTCAACATTGAATTC  1088

seq1: chr10_24383621_24384791
seq2: B6Ng01-228K21.g_71_1251

seq1  GAATTCACCGATCAGAAGAAAACAGAACACAGACGCAGGGAGGAAGAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCGATCAGAAGAAAACAGAACACAGACGCAGGGAGGAAGAAGT  50

seq1  TCATGTCACCTTGGGCATTGATGCTCTATGCTCCATGACATGTGAATGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTCACCTTGGGCATTGATGCTCTATGCTCCATGACATGTGAATGGC  100

seq1  ATGGTGATGTGAACTCAGAAAGAGGGAATTGTTGCTTTAAGCTACGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGATGTGAACTCAGAAAGAGGGAATTGTTGCTTTAAGCTACGGTGG  150

seq1  CCATAGCCAGGAACTGGCTACGTTTCTAAAATATGGAAGGTCAAATACGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGCCAGGAACTGGCTACGTTTCTAAAATATGGAAGGTCAAATACGA  200

seq1  AACATTATGATCTTTATTCCGTAGGTAACTGGCTCCCATCCCTAGTGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTATGATCTTTATTCCGTAGGTAACTGGCTCCCATCCCTAGTGTCA  250

seq1  CAGTAGCTAACATTAAGTAATTTTTTTCCTGGTTCTTCACTTTTAATAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGCTAACATTAAGTAATTTTTTTCCTGGTTCTTCACTTTTAATAGT  300

seq1  GTCTACCATGCTTTCAAGCCCCACTCTTAAGTAATAAGTTTGGCTCCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACCATGCTTTCAAGCCCCACTCTTAAGTAATAAGTTTGGCTCCCAG  350

seq1  GCAGGAGAGTGTCTCCTAAGAAGAGTAAGAAGAGGATATATCCACAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGAGTGTCTCCTAAGAAGAGTAAGAAGAGGATATATCCACAGAAA  400

seq1  TCTGCAGTCTTGGATACTTAAAGACTTCTCATAGAGCACTCAGGTTTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGTCTTGGATACTTAAAGACTTCTCATAGAGCACTCAGGTTTGAA  450

seq1  GGAAAAGGGAGGATAAAAGATTCAGAGCTGACGGTGATTTCATTCAACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGGGAGGATAAAAGATTCAGAGCTGACGGTGATTTCATTCAACAG  500

seq1  TTCAATGTATCGCTGTAAAAACTGTAAGCAAAGCCAGTTCTCTCAGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGTATCGCTGTAAAAACTGTAAGCAAAGCCAGTTCTCTCAGCTCT  550

seq1  TGTTTTGTTTAAATTGTTCTCTCTGGCTACATAGAATTTCATGTACATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGTTTAAATTGTTCTCTCTGGCTACATAGAATTTCATGTACATAG  600

seq1  TTACATGGTTACATAGAATTTCTTTCCAAAAAGCATAATATCTTTCTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGGTTACATAGAATTTCTTTCCAAAAAGCATAATATCTTTCTTTC  650

seq1  CAGAAGTCACAGTCCCTTACAGAAGGTTCTTGAAGTCCACTTCAGGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTCACAGTCCCTTACAGAAGGTTCTTGAAGTCCACTTCAGGAATA  700

seq1  CTAAATTTAACGAAGTGATTATAGGTAGCGGTGAACTTACCTCGCTGCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTTAACGAAGTGATTATAGGTAGCGGTGAACTTACCTCGCTGCTG  750

seq1  ACTGGTCCATGTGAATGCCCTGAAGAATCTGGTTCTTCTAAATACAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTCCATGTGAATGCCCTGAAGAATCTGGTTCTTCTAAATACAGAGT  800

seq1  GTAAAAGTGTGGTCTAAATCAAACAGTATCAAAATGTAACATTTTACGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGTGTGGTCTAAATCAAACAGTATCAAAATGTAACATTTTACGAA  850

seq1  CACATTGAAAAACAGAGTGG-AAAGAATAATTCAACAGTTGATCCTGATT  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTGAAAAACAGAGTGGAAAAGAATAATTCAACAGTTGATCCTGATT  900

seq1  AAAAATCCTACATCCCTGGGGAAGCATCCCTAAAACTCTGAGGAGCCATT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAAAATCCTACATCCCTGGGGAAGCATCCCTAAAACTCTGAGGAGCCA-T  949

seq1  TACAAGCTTAGGATTCTTCAAAATGAAGCTGTAATTGTTCACTAGTTGC-  998
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  TACAAGCTTAGGA-TCTTC-AAATGAAGCTGTAATTG-TCACTAGTTGCT  996

seq1  TCTGGCTATAAATCATCAGAGCAAACAACAGTTTTGTTGTAGTCTGTA-T  1047
      |||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |
seq2  TCTGGCTAT--ATCATCAGAGCAAACCACCAGTTTGTTGTAGTCTGTATT  1044

seq1  AGATGTCTATG-AAACAAAGCGG--CCTTTGTACCAGAAA-CTGTC-TAC  1092
      ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||| ||||| |||
seq2  AGATGTCTATGAAAACAAAGCGGGCCCTTGTTACCAGAAACCTGTCTTAC  1094

seq1  ATACCTTTCATGGC-TAGGAAGC-TGCAG-CCACTCAAGAACAGCTAAAA  1139
      ||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| || 
seq2  ATTACTTTCATGGCTTAAGAAGCTTGCAGCCCACTC-AGAACAGCTTAAG  1143

seq1  T--CCTTTCTTCAAATGGTACT--GACC--TAAAATTG  1171
      |  | ||||||||| |||||||   |||  ||||||||
seq2  TTCCTTTTCTTCAACTGGTACTTGAACCTATAAAATTG  1181