BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-230L18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 70,425,632 - 70,587,465
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBicc1
Upstream geneAnk3, Ccdc6, 2310015B20Rik, Slc16a9, LOC632955, 1200015N20Rik, LOC665398, Phyhipl, EG665429
Downstream geneLOC622551, C730027H18Rik, Tfam, Ube2d1, LOC665472, Zcd1, Ipmk, LOC100039860, LOC216081, EG216082, LOC622812, EG327767, 1700049L16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-230L18.bB6Ng01-230L18.g
ACCGA043523GA043524
length1,1631,068
definitionB6Ng01-230L18.b B6Ng01-230L18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,425,632 - 70,426,806)(70,586,397 - 70,587,465)
sequence
gaattccctgagtcctttctgtccagtacaggatagagatccgtaaatat
ccaggtaccatccacaaccattgagccttttgttcttccaaagcaggaat
tacccagttgccactgagtagggattatacctggactacatacgtcggga
tgtctccactgccagcataccccacaggtcaaggtcaattctatgctgaa
cacatcacatattttgaggtgcaaccagtcaatccaggggagagcccagg
gaaggaaggaaaggagactactcagctcctctgagcagtacatgacacca
cagctgacaacaccctgcagctttggaatgtggaatatgggctgaacccc
cacttaatcacccctctactggcaccctgcccttctctgccatgtccccc
ctgctactcctgactgaggctctccttatcccattatctttttagccctg
tctctgacatttgcaatgactttaagattgctcggaactttccaaaactg
tttttcataggctctaagtttagggaacccaaaagcaaggcacacggatg
cccacccaccacagtctatgaacccgtttttatctggtttgacagaagtg
acaaatgattctgaagaatatagatcaatattatttacacacacacacac
acacacacacacacataccatgtgcaaggtatgttaacttgtaaacccat
tacttcccaggctggataaacactaaaattcttatacacctgcacctgta
gaggtgcaggcatgcttagtttaaagataaccaaattatcgtaacttttt
ctttcccacacagaacaataagcaaaaggaaaaaaaaaaaaaaaagaaca
aaaacaaaaccaccctcaacagcaaatttaggagtgaatgagcaccacct
agtggtcagaaagtgaattatcaatgaagctgggactgcatgtcttcaac
ccctaaccccaaccctcaagattcagctcttgttagaaagtggcctcttt
ggattggccaagcttaatagaaaccgaagaaaaacaaatactacacattg
gatcaaagggatgagatgctaggaacatgcttcgctatctccccctacct
cctggtccgctctgctttacgtagaagaccttgcaatgctgctgctcctg
ctcaggtctgaac
gaattctagtggttcgtgtgtgtcatccaccaaactaagggtccccatag
catagatgaacacttagtggggccacagtgagccttcctttctaagtcag
tgagtcccaggcagaccataacagtagggcttcccaccttccccatgggc
agtctgtcatcgtgaaggctactgtacctttgtcgctgggagcaccagct
tgccaatattctttcagagtcagtcagtgctttataataaggaggccaaa
accactttctatgattttagtaaagtagcaatttgagaaaaagcctatga
aataatgatagacttttttttaaagaactaatctgttagtttagcactta
ctgatttgagctttttaaactttaaatatttctttgagacgtttaaacat
gagtaatgggtttatataatttcctccctgtctttctccgttccagctct
ctttcatctcccctgactccctttcaaatttatgatctcatcacctttaa
ttattattgttaaatgcagtgccagtgggcaccagaagagggcgttgtat
gcccaggaagtggaattactggtggttgactatgagtgctgagaactcag
gctctggaagaacagtgcattctcttaactactgagcaatctctccagcc
tctgtgctccctgtcccctgagaaacctttattatacacaaagtcccaac
actcctaagtctctcctgtttgctttctgatctactgagaatattctcta
caggacagttgatgagaggggcacagtgtgcatttaggattttattggcc
catgtactttacctgtggcttttaaggcagcctgtgtcagtcattaggta
tgtacgtacacgtctgtgcccagcaacagtgcagataagacgggcttcat
ctctaattatctccctgtaagggtcacagggttttggaccttgataagga
agagaagctcattttcttcttgtcctcaggggagctgtcagttaaaactg
gctagaacatctcggttctgggtggctggtcacttgagatttgggcagca
gcagcctgtgttgcaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_70425632_70426806
seq2: B6Ng01-230L18.b_47_1209

seq1  GAATTCCCTGAGTCCTTTCTGTCCAGTACAGGATAGAGATCCGTAAATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGAGTCCTTTCTGTCCAGTACAGGATAGAGATCCGTAAATAT  50

seq1  CCAGGTACCATCCACAACCATTGAGCCTTTTGTTCTTCCAAAGCAGGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTACCATCCACAACCATTGAGCCTTTTGTTCTTCCAAAGCAGGAAT  100

seq1  TACCCAGTTGCCACTGAGTAGGGATTATACCTGGACTACATACGTCGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAGTTGCCACTGAGTAGGGATTATACCTGGACTACATACGTCGGGA  150

seq1  TGTCTCCACTGCCAGCATACCCCACAGGTCAAGGTCAATTCTATGCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCACTGCCAGCATACCCCACAGGTCAAGGTCAATTCTATGCTGAA  200

seq1  CACATCACATATTTTGAGGTGCAACCAGTCAATCCAGGGGAGAGCCCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCACATATTTTGAGGTGCAACCAGTCAATCCAGGGGAGAGCCCAGG  250

seq1  GAAGGAAGGAAAGGAGACTACTCAGCTCCTCTGAGCAGTACATGACACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGGAAAGGAGACTACTCAGCTCCTCTGAGCAGTACATGACACCA  300

seq1  CAGCTGACAACACCCTGCAGCTTTGGAATGTGGAATATGGGCTGAACCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGACAACACCCTGCAGCTTTGGAATGTGGAATATGGGCTGAACCCC  350

seq1  CACTTAATCACCCCTCTACTGGCACCCTGCCCTTCTCTGCCATGTCCCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAATCACCCCTCTACTGGCACCCTGCCCTTCTCTGCCATGTCCCCC  400

seq1  CTGCTACTCCTGACTGAGGCTCTCCTTATCCCATTATCTTTTTAGCCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACTCCTGACTGAGGCTCTCCTTATCCCATTATCTTTTTAGCCCTG  450

seq1  TCTCTGACATTTGCAATGACTTTAAGATTGCTCGGAACTTTCCAAAACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGACATTTGCAATGACTTTAAGATTGCTCGGAACTTTCCAAAACTG  500

seq1  TTTTTCATAGGCTCTAAGTTTAGGGAACCCAAAAGCAAGGCACACGGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCATAGGCTCTAAGTTTAGGGAACCCAAAAGCAAGGCACACGGATG  550

seq1  CCCACCCACCACAGTCTATGAACCCGTTTTTATCTGGTTTGACAGAAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCACCACAGTCTATGAACCCGTTTTTATCTGGTTTGACAGAAGTG  600

seq1  ACAAATGATTCTGAAGAATATAGATCAATATTATTTACACACACACACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGATTCTGAAGAATATAGATCAATATTATTTACACACACACACAC  650

seq1  ACACACACACACACATACCATGTGCAAGGTATGTTAACTTGTAAACCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACATACCATGTGCAAGGTATGTTAACTTGTAAACCCAT  700

seq1  TACTTCCCAGGCTGGATAAACACTAAAATTCTTATACACCTGCACCTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCCAGGCTGGATAAACACTAAAATTCTTATACACCTGCACCTGTA  750

seq1  GAGGTGCAGGCATGCTTAGTTTAAAGATAACCAAATTATCGTAACTTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGCAGGCATGCTTAGTTTAAAGATAACCAAATTATCGTAACTTTTT  800

seq1  CTTTCCAACAACAGAACAATAAGCAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  850
      |||||| || ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||
seq2  CTTTCCCAC-ACAGAACAATAAGCAAAAGG-----AAAAAAAAAAAAAAA  844

seq1  AGAACAAAAAACAAAACCA-CCTCAACAGCAAATTTAGAAGTGAATGAGC  899
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGAAC-AAAAACAAAACCACCCTCAACAGCAAATTTAGGAGTGAATGAGC  893

seq1  ACCACCTAGTGGTCAGAAAGTGAATTATTCAATGAAGCTGGGACTGCAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  ACCACCTAGTGGTCAGAAAGTGAATTA-TCAATGAAGCTGGGACTGC-AT  941

seq1  GTCTTCAACCCCTAACCCCAACCCTC-AGATTCAGCTCTTGTTAGAAAGT  998
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAACCCCTAACCCCAACCCTCAAGATTCAGCTCTTGTTAGAAAGT  991

seq1  GG-CTCTTT-GATTTGCCAAGCTTAATAGAAACCG-AGAAAAACAAATAC  1045
      || |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGCCTCTTTGGATTGGCCAAGCTTAATAGAAACCGAAGAAAAACAAATAC  1041

seq1  TACCACATTGGATCAAAGGGATGAGATGGCTAGGGACATGC-TCGCTATC  1094
      || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||
seq2  TA-CACATTGGATCAAAGGGATGAGAT-GCTAGGAACATGCTTCGCTATC  1089

seq1  TCCCCCCTACTCTCTGGGTCCGCTCTTGCCTTTACGTAGAAGACATGTGC  1144
      | |||||||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||| | |||
seq2  T-CCCCCTAC-CTCCTGGTCCGCTCT--GCTTTACGTAGAAGACCT-TGC  1134

seq1  -ATGCTGCCTGCTGCCTGCTTCTAGTCTGAAC  1175
       |||||| ||||| ||||| ||  ||||||||
seq2  AATGCTG-CTGCT-CCTGC-TCAGGTCTGAAC  1163

seq1: chr10_70586397_70587465
seq2: B6Ng01-230L18.g_69_1136 (reverse)

seq1  CCCTGCCACACAGGCCTGCCTGCCTTCCCAAATCCTCAAGTGACCAGCCA  50
      |||||| ||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCCTGCAACACAGG-CTG-CTG-CTGCCCAAAT-CTCAAGTGACCAGCCA  46

seq1  CCCAGAACCGAGATG-TCTAGCCAG-TTTAACTGACAGCTCCCCTGAGGA  98
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAACCGAGATGTTCTAGCCAGTTTTAACTGACAGCTCCCCTGAGGA  96

seq1  CAAGAAG-AAATGAGC-TCTCTTCCTTATCAAGGTTCCAAAACCCTGTGA  146
      ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAAGAAGAAAATGAGCTTCTCTTCCTTATCAAGG-TCCAAAACCCTGTGA  145

seq1  CCCTTACAGGGAGATAATTAGAGATGAAGCCCGTCTTATCTGCACTGTTG  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTACAGGGAGATAATTAGAGATGAAGCCCGTCTTATCTGCACTGTTG  195

seq1  CTGGGCACAGACGTGTACGTACATACCTAATGACTGACACAGGCTGCCTT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCACAGACGTGTACGTACATACCTAATGACTGACACAGGCTGCCTT  245

seq1  AAAAGCCACAGGTAAAGTACATGGGCCAATAAAATCCTAAATGCACACTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCACAGGTAAAGTACATGGGCCAATAAAATCCTAAATGCACACTG  295

seq1  TGCCCCTCTCATCAACTGTCCTGTAGAGAATATTCTCAGTAGATCAGAAA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCTCTCATCAACTGTCCTGTAGAGAATATTCTCAGTAGATCAGAAA  345

seq1  GCAAACAGGAGAGACTTAGGAGTGTTGGGACTTTGTGTATAATAAAGGTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACAGGAGAGACTTAGGAGTGTTGGGACTTTGTGTATAATAAAGGTT  395

seq1  TCTCAGGGGACAGGGAGCACAGAGGCTGGAGAGATTGCTCAGTAGTTAAG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGGGACAGGGAGCACAGAGGCTGGAGAGATTGCTCAGTAGTTAAG  445

seq1  AGAATGCACTGTTCTTCCAGAGCCTGAGTTCTCAGCACTCATAGTCAACC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGCACTGTTCTTCCAGAGCCTGAGTTCTCAGCACTCATAGTCAACC  495

seq1  ACCAGTAATTCCACTTCCTGGGCATACAACGCCCTCTTCTGGTGCCCACT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTAATTCCACTTCCTGGGCATACAACGCCCTCTTCTGGTGCCCACT  545

seq1  GGCACTGCATTTAACAATAATAATTAAAGGTGATGAGATCATAAATTTGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTGCATTTAACAATAATAATTAAAGGTGATGAGATCATAAATTTGA  595

seq1  AAGGGAGTCAGGGGAGATGAAAGAGAGCTGGAACGGAGAAAGACAGGGAG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAGTCAGGGGAGATGAAAGAGAGCTGGAACGGAGAAAGACAGGGAG  645

seq1  GAAATTATATAAACCCATTACTCATGTTTAAACGTCTCAAAGAAATATTT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTATATAAACCCATTACTCATGTTTAAACGTCTCAAAGAAATATTT  695

seq1  AAAGTTTAAAAAGCTCAAATCAGTAAGTGCTAAACTAACAGATTAGTTCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTAAAAAGCTCAAATCAGTAAGTGCTAAACTAACAGATTAGTTCT  745

seq1  TTAAAAAAAAGTCTATCATTATTTCATAGGCTTTTTCTCAAATTGCTACT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAAAAGTCTATCATTATTTCATAGGCTTTTTCTCAAATTGCTACT  795

seq1  TTACTAAAATCATAGAAAGTGGTTTTGGCCTCCTTATTATAAAGCACTGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAAAATCATAGAAAGTGGTTTTGGCCTCCTTATTATAAAGCACTGA  845

seq1  CTGACTCTGAAAGAATATTGGCAAGCTGGTGCTCCCAGCGACAAAGGTAC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCTGAAAGAATATTGGCAAGCTGGTGCTCCCAGCGACAAAGGTAC  895

seq1  AGTAGCCTTCACGATGACAGACTGCCCATGGGGAAGGTGGGAAGCCCTAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCCTTCACGATGACAGACTGCCCATGGGGAAGGTGGGAAGCCCTAC  945

seq1  TGTTATGGTCTGCCTGGGACTCACTGACTTAGAAAGGAAGGCTCACTGTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGGTCTGCCTGGGACTCACTGACTTAGAAAGGAAGGCTCACTGTG  995

seq1  GCCCCACTAAGTGTTCATCTATGCTATGGGGACCCTTAGTTTGGTGGATG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCACTAAGTGTTCATCTATGCTATGGGGACCCTTAGTTTGGTGGATG  1045

seq1  ACACACACGAACCACTAGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACGAACCACTAGAATTC  1068