BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232O14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 15,674,688 - 15,817,015
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC637043, LOC100039492, LOC671439
Downstream geneLOC382457, LOC546472, LOC100039576, LOC627511
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232O14.bB6Ng01-232O14.g
ACCGA045128GA045129
length1,129939
definitionB6Ng01-232O14.b B6Ng01-232O14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,815,899 - 15,817,015)(15,674,688 - 15,675,481)
sequence
gaattctgcagagcagaggaaggaaggattattgagccagggagaatcaa
ggacaccatgagaaaataatagaatcaactaacctgaactcatagcagct
catagagacctcaccaacaatgaggaatcttgcatcattgaacctaggcc
ctctgaatttatgttacagttgtgtatatttgtcttcttacaggactctt
aatagtggctgtctttaactcttttgcctgatttaggatctttttactcc
tggattgccttgtccagcattaatataaagggagatacttgtattactgc
aatgtgatatgcaatgtgtttggttgatatctaagggaaccttgaccttt
tggaagaaaatggaagataggagggactagtaactgggagaaaaggattg
ggggagaacaggggacaagatgtaattgataagaacagaataaatagaaa
tgtaataataaaacattataaaatgtatgtaagcaatggcaagtgtttgt
aataggatgtttgcctgtgttgaagtaaatctcactgaagatcttctcat
acttctcaacagcaaaacctttgtcttggtgatacataaccgagcccgca
cgttcatgccttcagtgctaggagctctgacttagatgtccctatctact
tagagttaatagccaggaagacatgaggtctcattctctctatagcttta
tggacctgttaagaagatctgaccttcaagaaagttcattttgagaataa
actcctgttggtatgcacagtatgattttcctcaaaatccaagccagata
taggccaggaggccttattttatggtaccgcagcatgtattaccatccca
gaggagctcctttataatgcttctctctgaagacccaggtgtgggggtgg
cagtgtaaataagctacagcactctgctttagtgtgagtgacttggggct
tctctttccgatgttatgaaatactacaattgtaatactatgtaaatatg
gaggttttacttttttacaaagaaaaaagacacaaaaggaaaggagttgg
agtctgggatagtgtcagcctccattacagggaagcagaagaccagtatt
ccagagacagctaaacattgtcttccgca

gaattcttcctgcagcatatgatagtgttatattctgagtgaggataaaa
aagagcagagaagttagaacactaaaaaaataaaattgtaattattttaa
aaattcaaacctttgaaatggtggtaaatttatttaataggatggtcaat
ttgaactctatataacattctgttgtacatttttcatgaatgtaacaact
aaggaggttaacactattagtatttatagtacccacatcattatttcata
aaatgctggctatactaaaattcagttctatctctttctattatgattta
ttttacctttgagattataataaaattagatcattcaccatatctactat
tcattctccaactcctcatatgtaaccccttgttctgtcttagattcatg
acttcttttttatttttttctatgagggttgctatatatctatgggtatc
ttaaaacatacattgtttagtcaacaatgtcatttgtatgtgtatgtttt
cacaggtaaacagttggtattggataatcagttgctgtcttcctcccaca
gaagagctatgtcttgttttttcaacattccttacttgcctatacttctt
ttaggactcatgagctttccccttccaactctgcatgcccatttgtatcg
ttcttgtacatgtcttggtgagatgtcatggatagagcatctgacattat
aggagatacaatatcatgggaaatttcctggttctctgcctcttacagtc
ttaccactctgtcttctgcaatgatccctgaaccataattacaaaaggtt
tgtgttgtagatctatgtattatgactgtgttccaaactatgcatagtga
ttggctttggctttcgttaatgctacatctgatacaaagagaatcttttc
ttgataagaggtgagaacaacatttatccagaaaatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_15815899_15817015
seq2: B6Ng01-232O14.b_47_1175 (reverse)

seq1  TGCGGAAGACCATGTTTTACTGTCTCTGG-ATACT-GTCTTCTGCTTTCC  48
      |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||
seq2  TGCGGAAGACAATGTTTAGCTGTCTCTGGAATACTGGTCTTCTGCTTCCC  50

seq1  TGTAATG--AGCTGACACTATCCCAGACTCC-ACT-CTTTCTTTTTGTGT  94
      |||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||
seq2  TGTAATGGAGGCTGACACTATCCCAGACTCCAACTCCTTTCCTTTTGTGT  100

seq1  CTTTTTTCTTTGT-AAAAAGTAAAACCTCCATA-TTACATAGTA-TACAA  141
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  CTTTTTTCTTTGTAAAAAAGTAAAACCTCCATATTTACATAGTATTACAA  150

seq1  TTGTAGTATTTCATAACATCGG-AAGAGAAGCCCCAAGTCACTCACACTA  190
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGTATTTCATAACATCGGAAAGAGAAGCCCCAAGTCACTCACACTA  200

seq1  AAGCAGAGTGCTGTAGCTTATTTACACTGCCACCCCCACACCTGGGTCTT  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGTGCTGTAGCTTATTTACACTGCCACCCCCACACCTGGGTCTT  250

seq1  CAGAGAGAAGCATTATAA--GGGCTCCTCTGGGATGGTAATACATGCTGC  288
      ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGAAGCATTATAAAGGAGCTCCTCTGGGATGGTAATACATGCTGC  300

seq1  GGTACCATAAAATAAGGCCTCCTGGCCTATATCTGGCTTGGATTTTGAGG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCATAAAATAAGGCCTCCTGGCCTATATCTGGCTTGGATTTTGAGG  350

seq1  AAAATCATACTGTGCATACCAACAGGAGTTTATTCTCAAAATGAACTTTC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCATACTGTGCATACCAACAGGAGTTTATTCTCAAAATGAACTTTC  400

seq1  TTGAAGGTCAGATCTTCTTAACAGGTCCATAAAGCTATAGAGAGAATGAG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGTCAGATCTTCTTAACAGGTCCATAAAGCTATAGAGAGAATGAG  450

seq1  ACCTCATGTCTTCCTGGCTATTAACTCTAAGTAGATAGGGACATCTAAGT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATGTCTTCCTGGCTATTAACTCTAAGTAGATAGGGACATCTAAGT  500

seq1  CAGAGCTCCTAGCACTGAAGGCATGAACGTGCGGGCTCGGTTATGTATCA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTCCTAGCACTGAAGGCATGAACGTGCGGGCTCGGTTATGTATCA  550

seq1  CCAAGACAAAGGTTTTGCTGTTGAGAAGTATGAGAAGATCTTCAGTGAGA  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGACAAAGGTTTTGCTGTTGAGAAGTATGAGAAGATCTTCAGTGAGA  600

seq1  TTTACTTCAACACAGGCAAACATCCTATTACAAACACTTGCCATTGCTTA  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTCAACACAGGCAAACATCCTATTACAAACACTTGCCATTGCTTA  650

seq1  CATACATTTTATAATGTTTTATTATTACATTTCTATTTATTCTGTTCTTA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATTTTATAATGTTTTATTATTACATTTCTATTTATTCTGTTCTTA  700

seq1  TCAATTACATCTTGTCCCCTGTTCTCCCCCAATCCTTTTCTCCCAGTTAC  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTACATCTTGTCCCCTGTTCTCCCCCAATCCTTTTCTCCCAGTTAC  750

seq1  TAGTCCCTCCTATCTTCCATTTTCTTCCAAAAGGTCAAGGTTCCCTTAGA  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCCTCCTATCTTCCATTTTCTTCCAAAAGGTCAAGGTTCCCTTAGA  800

seq1  TATCAACCAAACACATTGCATATCACATTGCAGTAATACAAGTATCTCCC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAACCAAACACATTGCATATCACATTGCAGTAATACAAGTATCTCCC  850

seq1  TTTATATTAATGCTGGACAAGGCAATCCAGGAGTAAAAAGATCCTAAATC  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATTAATGCTGGACAAGGCAATCCAGGAGTAAAAAGATCCTAAATC  900

seq1  AGGCAAAAGAGTTAAAGACAGCCACTATTAAGAGTCCTGTAAGAAGACAA  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAAGAGTTAAAGACAGCCACTATTAAGAGTCCTGTAAGAAGACAA  950

seq1  ATATACACAACTGTAACATAAATTCAGAGGGCCTAGGTTCAATGATGCAA  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACACAACTGTAACATAAATTCAGAGGGCCTAGGTTCAATGATGCAA  1000

seq1  GATTCCTCATTGTTGGTGAGGTCTCTATGAGCTGCTATGAGTTCAGGTTA  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCTCATTGTTGGTGAGGTCTCTATGAGCTGCTATGAGTTCAGGTTA  1050

seq1  GTTGATTCTATTATTTTCTCATGGTGTCCTTGATTCTCCCTGGCTCAATA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATTCTATTATTTTCTCATGGTGTCCTTGATTCTCCCTGGCTCAATA  1100

seq1  ATCCTTCCTTCCTCTGCTCTGCAGAATTC  1117
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCCTTCCTCTGCTCTGCAGAATTC  1129


seq1: chr10_15674688_15675481
seq2: B6Ng01-232O14.g_73_868

seq1  GAATTCTTCCTG-AG-ATATGATAGTGTTATATTCTGAGTGAGGATAAAA  48
      |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTGCAGCATATGATAGTGTTATATTCTGAGTGAGGATAAAA  50

seq1  AAGAGCAGAGAAGTTAGAACACTAAAAAAATAAAATTGTAATTATTTTAA  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAGAGAAGTTAGAACACTAAAAAAATAAAATTGTAATTATTTTAA  100

seq1  AAATTCAAACCTTTGAAATGGTGGTAAATTTATTTAATAGGATGGTCAAT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAAACCTTTGAAATGGTGGTAAATTTATTTAATAGGATGGTCAAT  150

seq1  TTGAACTCTATATAACATTCTGTTGTACATTTTTCATGAATGTAACAACT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTCTATATAACATTCTGTTGTACATTTTTCATGAATGTAACAACT  200

seq1  AAGGAGGTTAACACTATTAGTATTTATAGTACCCACATCATTATTTCATA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGGTTAACACTATTAGTATTTATAGTACCCACATCATTATTTCATA  250

seq1  AAATGCTGGCTATACTAAAATTCAGTTCTATCTCTTTCTATTATGATTTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTGGCTATACTAAAATTCAGTTCTATCTCTTTCTATTATGATTTA  300

seq1  TTTTACCTTTGAGATTATAATAAAATTAGATCATTCACCATATCTACTAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACCTTTGAGATTATAATAAAATTAGATCATTCACCATATCTACTAT  350

seq1  TCATTCTCCAACTCCTCATATGTAACCCCTTGTTCTGTCTTAGATTCATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTCCAACTCCTCATATGTAACCCCTTGTTCTGTCTTAGATTCATG  400

seq1  ACTTCTTTTTTATTTTTTTCTATGAGGGTTGCTATATATCTATGGGTATC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTTTTTTATTTTTTTCTATGAGGGTTGCTATATATCTATGGGTATC  450

seq1  TTAAAACATACATTGTTTAGTCAACAATGTCATTTGTATGTGTATGTTTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACATACATTGTTTAGTCAACAATGTCATTTGTATGTGTATGTTTT  500

seq1  CACAGGTAAACAGTTGGTATTGGATAATCAGTTGCTGTCTTCCTCCCACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTAAACAGTTGGTATTGGATAATCAGTTGCTGTCTTCCTCCCACA  550

seq1  GAAGAGCTATGTCTTGTTTTTTCAACATTCCTTACTTGCCTATACTTCTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCTATGTCTTGTTTTTTCAACATTCCTTACTTGCCTATACTTCTT  600

seq1  TTAGGACTCATGAGCTTTCCCCTTCCAACTCTGCATGCCCATTTGTATCG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACTCATGAGCTTTCCCCTTCCAACTCTGCATGCCCATTTGTATCG  650

seq1  TTCTTGTACATGTCTTGGTGAGATGTCATGGATAGAGCATCTGACATTAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTACATGTCTTGGTGAGATGTCATGGATAGAGCATCTGACATTAT  700

seq1  AGGAGATACAATATCATGGGAAATTTCCTGGTTCTCTGCCTCTTACAGTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATACAATATCATGGGAAATTTCCTGGTTCTCTGCCTCTTACAGTC  750

seq1  TTACCACTCTGTCTTCTGCAATGATCCCTGAACCATAATTACAAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCACTCTGTCTTCTGCAATGATCCCTGAACCATAATTACAAAA  796


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |