BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-243C06
Chromosome10 (Build37)
Map Location 100,758,731 - 100,942,020
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG667532, LOC670007, LOC235966, LOC667556, LOC100043224, LOC100043227, LOC100043231, LOC100043235, LOC667580, LOC100043239, LOC100043242, LOC100043244, LOC667607, LOC100043247, EG213051, Tmtc3, 4930430F08Rik, 1700017N19Rik
Downstream geneMgat4c, LOC667652
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-243C06.bB6Ng01-243C06.g
ACCGA052607GA052608
length1,1331,055
definitionB6Ng01-243C06.b B6Ng01-243C06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,940,886 - 100,942,020)(100,758,731 - 100,759,765)
sequence
gaattctttgtttagctctgagcctcaacttttttttttttaataaagta
catttttcatctctgttgactgcaacaaacttctttctcctgggctggtt
ccacttagtttgcatatgcgttgtccaggtagtgacattagtaggaggtg
tggctttgttggagttggtgtgtcactatgtgtatgagcctaagaccctc
atcctagctacctggaagcctgtcttctcctattggacttcagatgaaga
catagaattcttagctcctcctgcaccatccctgcctggatgctgccatg
atcctgacatgatgataatggactgaacctctgaagctgtaagcaagccc
caatgaaatgttgtccttataagagttaccatggtcatggtgtctgttca
cagtattaaaatcgtaactaattcaacagtatactattgcaatattataa
atctcaaaggtaatgataggcaagggataaaagatgtcaatcatgttacc
ataacagagaacaaatataccacattaaagttttatgcttattctggtga
tacacatgtttaaataataaagtattgagacatctttaagataacttttg
tgcaactacaataagcaagtgttttatttgtccttaattttcagaaggta
gacaatatgattcaatgattcatttctgtaaatggtaagatgcctagcca
cagggatttaacataatttaacttgtgatttatcatattccctggtctcc
tcaaataccatagaacaataatggaagaaactctaaaggtaaattgatta
atggcgtacaggtgaaaacagggtctaaaacataccctctgattttttcc
tggaattccttcatgtatagttaaaagttgtattttagcaactgaatgaa
tttaccactgagtctgacatgaatagtggttatggcacatgaagataatg
tggaaaccactggatgggaactgtctaccaaaataacacagcaaaactag
tacttcttcaaagcaattgttggatattacaggcataatactactgtaaa
aatattattataacaaagtgtttaaatagtgagggagggaagcagattga
atacattaccatgatgtttagtccaaatcacat
gaattcatatgaacattgcttagttgatttagaggactttgctatccctg
tgtcccccattacctttgggtttatactcttcctgattccttttctgtgc
gatttcatgcactttgatgggagggatttaatctggacatcctatttcaa
agtgtatattccaaggttgttctctttcagtttagtatctggctgggggt
cttttatttattcatatctgctgcaggaggaagctttcatcatgatagct
gaagaagacagtgatcaatgagtatcatagactattgttaggaaccaatt
tattgtgtctttttcttgaggtcaatagtatttgatcttaccctaggtct
ctgatctatctagtctctagctattggtcacacaagcagtgtttaatata
ggttctatctcaaggaattgacgtattgtcaaatcagacatgggctgtta
ttctaacaagccatcagtgctgtagcatgttttgcaggcagggtatatta
taggtcaaacattttgtgttatatgcttaacatttacagctagaaactga
tgcacataggtttaaagtgattatatttgtgtaattaattttttctatgt
atgtacatttcttaatgacaacaataaaacataaaatatcagaacgacta
aaaaataaattggacaaaatatctatttcactgattttacattgggtgtt
ttagtttataccatctttccaagcctaatgtttaacagcagtcatattca
gactcaaaactcccgactgcctagtcactacagagatattatgcattatt
tcaaggttatcttatcatacgtcactccacaaacttagtgacataactta
ccatattataagggctctatttattgatctgtttacttaaccaggtatac
aaaatcttggctgcttcctgtgatgtgggtagctaacagattggatcata
gctggatgaataatcttactttacgttagatacctattgttgcacggcag
cagagcagaagctgtgtgagcacatcgctctgccatataaagggaacaga
gaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_100940886_100942020
seq2: B6Ng01-243C06.b_46_1178 (reverse)

seq1  ATGTGATTTTGGCTTAAACATCATTGTATTGTATCAAATCTGCTCCCTCC  50
      |||||| |||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||| ||  |
seq2  ATGTGA-TTTGGACTAAACATCATGGTAATGTATTCAATCTGCTTCCCTC  49

seq1  CCTCACTATTTAAACACTTTGTAATAATTAATA-TTTTACAGTAGTATTA  99
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  CCTCACTATTTAAACACTTTGTTATAA-TAATATTTTTACAGTAGTATTA  98

seq1  TGCCTGTAAATATCCCAACAATTGCCTTGAAGAAGTACTAGTTTTGCTGT  149
      ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGT-AATAT-CCAACAATTGCTTTGAAGAAGTACTAGTTTTGCTGT  146

seq1  GTTATTTTGGTAGACAGTTCCCATCCAGTGG-TTCCACATTATCTTCATG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTTATTTTGGTAGACAGTTCCCATCCAGTGGTTTCCACATTATCTTCATG  196

seq1  TGCCATAACCACTATTCATGTCAGACTCAGTGGTAAATTCATTCAGTTGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATAACCACTATTCATGTCAGACTCAGTGGTAAATTCATTCAGTTGC  246

seq1  TAAAATACAACTTTTAACTATACATGAAGGAATTCCAGGAAAAAATCAGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATACAACTTTTAACTATACATGAAGGAATTCCAGGAAAAAATCAGA  296

seq1  GGGTATGTTTTAGACCCTGTTTTCACCTGTACGCCATTAATCAATTTACC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGTTTTAGACCCTGTTTTCACCTGTACGCCATTAATCAATTTACC  346

seq1  TTTAGAGTTTCTTCCATTATTGTTCTATGGTATTTGAGGAGACCAGGGAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAGTTTCTTCCATTATTGTTCTATGGTATTTGAGGAGACCAGGGAA  396

seq1  TATGATAAATCACAAGTTAAATTATGTTAAATCCCTGTGGCTAGGCATCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAAATCACAAGTTAAATTATGTTAAATCCCTGTGGCTAGGCATCT  446

seq1  TACCATTTACAGAAATGAATCATTGAATCATATTGTCTACCTTCTGAAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATTTACAGAAATGAATCATTGAATCATATTGTCTACCTTCTGAAAA  496

seq1  TTAAGGACAAATAAAACACTTGCTTATTGTAGTTGCACAAAAGTTATCTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGACAAATAAAACACTTGCTTATTGTAGTTGCACAAAAGTTATCTT  546

seq1  AAAGATGTCTCAATACTTTATTATTTAAACATGTGTATCACCAGAATAAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGTCTCAATACTTTATTATTTAAACATGTGTATCACCAGAATAAG  596

seq1  CATAAAACTTTAATGTGGTATATTTGTTCTCTGTTATGGTAACATGATTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACTTTAATGTGGTATATTTGTTCTCTGTTATGGTAACATGATTG  646

seq1  ACATCTTTTATCCCTTGCCTATCATTACCTTTGAGATTTATAATATTGCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTTATCCCTTGCCTATCATTACCTTTGAGATTTATAATATTGCA  696

seq1  ATAGTATACTGTTGAATTAGTTACGATTTTAATACTGTGAACAGACACCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTATACTGTTGAATTAGTTACGATTTTAATACTGTGAACAGACACCA  746

seq1  TGACCATGGTAACTCTTATAAGGACAACATTTCATTGGGGCTTGCTTACA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCATGGTAACTCTTATAAGGACAACATTTCATTGGGGCTTGCTTACA  796

seq1  GCTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCATGTCAGGATCATGGCAGCATCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCATGTCAGGATCATGGCAGCATCC  846

seq1  AGGCAGGGATGGTGCAGGAGGAGCTAAGAATTCTATGTCTTCATCTGAAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGGATGGTGCAGGAGGAGCTAAGAATTCTATGTCTTCATCTGAAG  896

seq1  TCCAATAGGAGAAGACAGGCTTCCAGGTAGCTAGGATGAGGGTCTTAGGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATAGGAGAAGACAGGCTTCCAGGTAGCTAGGATGAGGGTCTTAGGC  946

seq1  TCATACACATAGTGACACACCAACTCCAACAAAGCCACACCTCCTACTAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACACATAGTGACACACCAACTCCAACAAAGCCACACCTCCTACTAA  996

seq1  TGTCACTACCTGGACAACGCATATGCAAACTAAGTGGAACCAGCCCAGGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTACCTGGACAACGCATATGCAAACTAAGTGGAACCAGCCCAGGA  1046

seq1  GAAAGAAGTTTGTTGCAGTCAACAGAGATGAAAAATGTACTTTATTAAAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAGTTTGTTGCAGTCAACAGAGATGAAAAATGTACTTTATTAAAA  1096

seq1  AAAAAAAAGTTGAGGCTCAGAGCTAAACAAAGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAGTTGAGGCTCAGAGCTAAACAAAGAATTC  1133

seq1: chr10_100758731_100759765
seq2: B6Ng01-243C06.g_86_1119

seq1  AGTTGATTTAGAGGACTTTGCTATCCCTGTGTCCCCCATTACCTTTGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGATTTAGAGGACTTTGCTATCCCTGTGTCCCCCATTACCTTTGGGT  50

seq1  TTATACTCTTCCTGATTCCTTTTCTGTGCGATTTCATGCACTTTGATGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACTCTTCCTGATTCCTTTTCTGTGCGATTTCATGCACTTTGATGGG  100

seq1  AGGGATTTAATCTGGACATCCTATTTCAAAGTGTATATTCCAAGGTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTTAATCTGGACATCCTATTTCAAAGTGTATATTCCAAGGTTGTT  150

seq1  CTCTTTCAGTTTAGTATCTGGCTGGGGGTCTTTTATTTATTCATATCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCAGTTTAGTATCTGGCTGGGGGTCTTTTATTTATTCATATCTGC  200

seq1  TGCAGGAGGAAGCTTTCATCATGATAGCTGAAGAAGACAGTGATCAATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGAGGAAGCTTTCATCATGATAGCTGAAGAAGACAGTGATCAATGA  250

seq1  GTATCATAGACTATTGTTAGGAACCAATTTATTGTGTCTTTTTCTTGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCATAGACTATTGTTAGGAACCAATTTATTGTGTCTTTTTCTTGAGG  300

seq1  TCAATAGTATTTGATCTTACCCTAGGTCTCTGATCTATCTAGTCTCTAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAGTATTTGATCTTACCCTAGGTCTCTGATCTATCTAGTCTCTAGC  350

seq1  TATTGGTCACACAAGCAGTGTTTAATATAGGTTCTATCTCAAGGAATTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGTCACACAAGCAGTGTTTAATATAGGTTCTATCTCAAGGAATTGA  400

seq1  CGTATTGTCAAATCAGACATGGGCTGTTATTCTAACAAGCCATCAGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTATTGTCAAATCAGACATGGGCTGTTATTCTAACAAGCCATCAGTGCT  450

seq1  GTAGCATGTTTTGCAGGCAGGGTATATTATAGGTCAAACATTTTGTGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCATGTTTTGCAGGCAGGGTATATTATAGGTCAAACATTTTGTGTTA  500

seq1  TATGCTTAACATTTACAGCTAGAAACTGATGCACATAGGTTTAAAGTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTAACATTTACAGCTAGAAACTGATGCACATAGGTTTAAAGTGAT  550

seq1  TATATTTGTGTAATTAATTTTTTCTATGTATGTACATTTCTTAATGACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGTGTAATTAATTTTTTCTATGTATGTACATTTCTTAATGACAA  600

seq1  CAATAAAACATAAAATATCAGAACGACTAAAAAATAAATTGGACAAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAAACATAAAATATCAGAACGACTAAAAAATAAATTGGACAAAATA  650

seq1  TCTATTTCACTGATTTTACATTGGGTGTTTTAGTTTATACCATCTTTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTCACTGATTTTACATTGGGTGTTTTAGTTTATACCATCTTTCCA  700

seq1  AGCCTAATGTTTAACAGCAGTCATATTCAGACTCAAAACTCCCGACTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTAATGTTTAACAGCAGTCATATTCAGACTCAAAACTCCCGACTGCC  750

seq1  TAGTCACTACAGAGATATTATGCATTATTTCAAGGTTATCTTATCATACG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCACTACAGAGATATTATGCATTATTTCAAGGTTATCTTATCATACG  800

seq1  TCACTCCACAAACTTAGTGACATAACTTACCATATTATAAGGGCTCTATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCCACAAACTTAGTGACATAACTTACCATATTATAAGGGCTCTATT  850

seq1  TATTGATCTGTTTACTTAACCA-GTATACAAAATCTTGGCTGCTTCCTGT  899
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGATCTGTTTACTTAACCAGGTATACAAAATCTTGGCTGCTTCCTGT  900

seq1  GATGTGGGTAGCTAACAGATTGGATCATAGCTGGATGAATAATCTTACTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGGTAGCTAACAGATTGGATCATAGCTGGATGAATAATCTTACTT  950

seq1  TACGTTAGATACCTATTGTTGCACGGCAGCAAGAGCAGAAAGCTGTGTGA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TACGTTAGATACCTATTGTTGCACGGCAGC-AGAGCAG-AAGCTGTGTGA  998

seq1  GCACATCGCTCTGCCATATAAAGGGAACAGAGAGGG  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATCGCTCTGCCATATAAAGGGAACAGAGAGGG  1034