BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244J23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 89,684,954 - 89,867,772
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneTmem16d, Gas2l3, Nr1h4, EG627532, Slc17a8, Scyl2, Actr6, E030041M21Rik, E530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244J23.bB6Ng01-244J23.g
ACCGA053710GA053711
length84332
definitionB6Ng01-244J23.b B6Ng01-244J23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(89,867,689 - 89,867,772)(89,684,954 - 89,685,425)
sequence
ctaattcccacaatgcatatgttctctcttccccccccccccacatacag
agtggggagggaaggaaagggtgagaaggaggga
acttacagaacttcatgaatatcacaaggaagctcaatggacacagcact
ataaaatccaacggttagagtctttgcatcctctttaggtaaatttattc
ttatctaatctctgttgctaaactcagtctctttattgtgcatacaaaac
tcttccttcaacactcaattggtcaccatttggcaatcatttaatgtagc
attacatgcaggtgcatacttgtacaatatatgtgtgtgtgtattatgta
tgtatatatgtatgtgtgtatgtatgaaatgagcgtgtaatggtgaccaa
ttgagtgcttgaatttgtgtatgcatgtatta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_89867689_89867772
seq2: B6Ng01-244J23.b_52_135 (reverse)

seq1  TCCCTCCTTCTCACCCTTTCCTTCCCTCCCCACTCTGTATGTGGGGGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCTTCTCACCCTTTCCTTCCCTCCCCACTCTGTATGTGGGGGGGG  50

seq1  GGGGAAGAGAGAACATATGCATTGTGGGAATTAG  84
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGAGAGAACATATGCATTGTGGGAATTAG  84

seq1: chr10_89684954_89685425
seq2: B6Ng01-244J23.g_73_404

seq1  ACTTACAGAACTTCATGAATATCACAAGGAAGCTCAATGGACACAGCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACAGAACTTCATGAATATCACAAGGAAGCTCAATGGACACAGCACT  50

seq1  ATAAAATCCAACGGTTAGAGTCTTTGCATCCTCTTTAGGTAAATTTATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATCCAACGGTTAGAGTCTTTGCATCCTCTTTAGGTAAATTTATTC  100

seq1  TTATCTAATCTCTGTTGCTAAACTCAGTCTCTTTATTGTGCATACAAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTAATCTCTGTTGCTAAACTCAGTCTCTTTATTGTGCATACAAAAC  150

seq1  TCTTCCTTCAACACTCAATTGGTCACCATTTGGCAATCATTTAATGTAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTTCAACACTCAATTGGTCACCATTTGGCAATCATTTAATGTAGC  200

seq1  ATTACATGCAGGTGCATACTTGTACAATATATGTGTGTGTGTATTATGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATGCAGGTGCATACTTGTACAATATATGTGTGTGTGTATTATGTA  250

seq1  TGTATATATGTATGTGTGTATGTATGAATTATGCGTGTAAGTGTGTATGT  300
      |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||     
seq2  TGTATATATGTATGTGTGTATGTATGAAATGAGCGTGTAATGGTGACCAA  300

seq1  ATGTATACATGCATGTGTGTATGTATGTA-CACACATATATATGTATGTG  349
       ||  | | || || |||||||| |||||  |                  
seq2  TTGAGTGCTTGAATTTGTGTATGCATGTATTA------------------  332

seq1  TTATGTATATGTTATGTATGTATGCCTGTGTGTATATGTATGTATATATG  399
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  332

seq1  CATATGTATGTGTGTGTGTATATATATATGTATGTATATATGATTGTATG  449
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  332

seq1  CATGTGTGTATATGCATGTATTA  472
                             
seq2  -----------------------  332