BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-253B08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 26,905,268 - 26,967,934
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLama2
Upstream geneSamd3, L3mbtl3, LOC435208, LOC667572, LOC100040349, Arhgap18
Downstream geneLOC100040385, LOC100040961, LOC100040401, Ptprk
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-253B08.bB6Ng01-253B08.g
ACCGA059912GA059913
length1,1051,094
definitionB6Ng01-253B08.b B6Ng01-253B08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,966,826 - 26,967,934)(26,905,268 - 26,906,369)
sequence
gaattctcaactaataaaatacttactaatgttattttggggatctaatt
tttatttaaacacttatttatttaaatatttatttatttatttttacact
ctagactccattccactcccagtccaccctccaaccgttcaacatcccat
gactccacctcaccccccatctccacgaggatgtccccattcccgtaaca
ctccaccacaccagaccttcaaactccccagggcctccagtttcctgagg
gccagatgcaccctctccaactgaacccagacttaaacagtaagagataa
ataaggaaatgtccatgaaagtatatctttcatgtatagggttatcttat
gtgcaaaaactccactttgtgatttacttttaagtaaaccctgtgtagaa
acaccataaagactgcctgttaatctaagacctttcaccaagatgttcaa
tgaaagcactcaaaaatagtgcttactgtgtggatatgcatttaaagatt
tcagatgtcactaagttcccagaaacatgccatctacctatttaaaagac
tcaattgaatttccttttctgcttcaaggattatatagaaattaatacat
attccaatgctctatccagatatcaggaagggaaaaaatgaacagcaaca
aaagaaaagaaataaaagaatgtaactttcaacaaataaacacaccaatg
agctgaacacttagttctccaaagaagaaataaaaatagccaatagataa
agcagacattaaaactgctttagattcctactcattccactgagatgctt
aacatcaagaaaacaaatgagagcaaatatgagtgacaaattgggaatga
ggagtctttatagttagtgggaaggtaacctggcatagccactgtagaaa
tcagtgtagggcttttaaaaacactagaaacagcatgatggtatgatcca
gttaccattccatatgatccatgaccgtactactcctcaaccgccactta
accagatattcttcatcttgcccagaggtacttgcatattgctgttatag
ctgctctatcataatagcaagttagagaactcacaacatactctgcaccc
tttag
gaattcacatgctgatttcacaacattgtggtgcgcgagcccttacaaaa
ccaatttggggctaaaacgcaggtttttctttcctctccttagagcagca
tagtggtagtaagggtcgcatagaactttaagcagcagctcctctctgat
aagaacaccttcgctcttctgcactctgtggactgtgatgcaagaggcaa
aactcctgcgtgtttgaccagtcttctctccactgaaacctccaggagga
cccgacactactgttagaagatacaagcatcgttttgccttccttctctt
gtgcacacaatcatatgagagagcggggtttaaagaatcaagagactctt
aaacagtggcaacaatagatactctgctgtgaataatgtttctctggtga
tgagaggagctcacatgtagatgaaagggtagagaggcataaggatagaa
atgcaagcaatggcttcacttgtttctggatatggcctccatttaaatga
atactagacactagaagttactacatacgtaactcaaacttaaactctct
ttctgataccgctgtagtttatgtaacgataaagaggttgggctatgtct
tactcgggggttattttaactctgtcatgttttccctgtcttaaatacac
aagtgctggtgatgtatctgccttacttgctttcctggtgaacatacaac
ttgagttttcatagggtttacaaaaattgatgtgtagtgaaaaatgaaaa
caagagttgtcccagaagtaacactgatgacatgttctgtgagctatcaa
attcttagggtagtctgtaagaacctgcaaagtagtccacttgtataccc
aatatgtaggccagctttggtttctattacaaatgtattttgctttttct
aaactaattagcaatatatatgacagtggttttttttttgtttgtttctt
tttgttttgttttgtttagtacatgtttttctgtactgaaacatgataag
aacccaaaggaatataacgagagtgagttctagctcatgattactcttca
ctgaacccccttcattctaatctagtgagcacacgatcttctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_26966826_26967934
seq2: B6Ng01-253B08.b_47_1151 (reverse)

seq1  CTAAAGGGTGCAGAAGTATGTTGTGAGTCCTCT-ACTTGCTATTATGAAT  49
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||
seq2  CTAAAGGGTGCAG-AGTATGTTGTGAGTTCTCTAACTTGCTATTATG-AT  48

seq1  AGAGCAGCTATAAACAGCAATATGCAAGTACCTCTGGGGCAAGATGAAGA  99
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGAGCAGCTAT-AACAGCAATATGCAAGTACCTCT-GGGCAAGATGAAGA  96

seq1  ATATCTTGGTTAAGTGGCGGTTGAGGAGTAGTACGGTCATGGATCATATG  149
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATC-TGGTTAAGTGGCGGTTGAGGAGTAGTACGGTCATGGATCATATG  145

seq1  GAATGGTAACTGGATCATACCATCATGCTGTTTCTAGTGTTTTTAAAAGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGTAACTGGATCATACCATCATGCTGTTTCTAGTGTTTTTAAAAGC  195

seq1  CCTACACTGATTTCTACAGTGGCTATGCCAGGTTACCTTCCCACTAACTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACACTGATTTCTACAGTGGCTATGCCAGGTTACCTTCCCACTAACTA  245

seq1  TAAAGACTCCTCATTCCCAATTTGTCACTCATATTTGCTCTCATTTGTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACTCCTCATTCCCAATTTGTCACTCATATTTGCTCTCATTTGTTT  295

seq1  TCTTGATGTTAAGCATCTCAGTGGAATGAGTAGGAATCTAAAGCAGTTTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATGTTAAGCATCTCAGTGGAATGAGTAGGAATCTAAAGCAGTTTT  345

seq1  AATGTCTGCTTTATCTATTGGCTATTTTTATTTCTTCTTTGGAGAACTAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCTGCTTTATCTATTGGCTATTTTTATTTCTTCTTTGGAGAACTAA  395

seq1  GTGTTCAGCTCATTGGTGTGTTTATTTGTTGAAAGTTACATTCTTTTATT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCAGCTCATTGGTGTGTTTATTTGTTGAAAGTTACATTCTTTTATT  445

seq1  TCTTTTCTTTTGTTGCTGTTCATTTTTTCCCTTCCTGATATCTGGATAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTCTTTTGTTGCTGTTCATTTTTTCCCTTCCTGATATCTGGATAGA  495

seq1  GCATTGGAATATGTATTAATTTCTATATAATCCTTGAAGCAGAAAAGGAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGGAATATGTATTAATTTCTATATAATCCTTGAAGCAGAAAAGGAA  545

seq1  ATTCAATTGAGTCTTTTAAATAGGTAGATGGCATGTTTCTGGGAACTTAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATTGAGTCTTTTAAATAGGTAGATGGCATGTTTCTGGGAACTTAG  595

seq1  TGACATCTGAAATCTTTAAATGCATATCCACACAGTAAGCACTATTTTTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCTGAAATCTTTAAATGCATATCCACACAGTAAGCACTATTTTTG  645

seq1  AGTGCTTTCATTGAACATCTTGGTGAAAGGTCTTAGATTAACAGGCAGTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTTTCATTGAACATCTTGGTGAAAGGTCTTAGATTAACAGGCAGTC  695

seq1  TTTATGGTGTTTCTACACAGGGTTTACTTAAAAGTAAATCACAAAGTGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGGTGTTTCTACACAGGGTTTACTTAAAAGTAAATCACAAAGTGGA  745

seq1  GTTTTTGCACATAAGATAACCCTATACATGAAAGATATACTTTCATGGAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTGCACATAAGATAACCCTATACATGAAAGATATACTTTCATGGAC  795

seq1  ATTTCCTTATTTATCTCTTACTGTTTAAGTCTGGGTTCAGTTGGAGAGGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTTATTTATCTCTTACTGTTTAAGTCTGGGTTCAGTTGGAGAGGG  845

seq1  TGCATCTGGCCCTCAGGAAACTGGAGGCCCTGGGGAGTTTGAAGGTCTGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCTGGCCCTCAGGAAACTGGAGGCCCTGGGGAGTTTGAAGGTCTGG  895

seq1  TGTGGTGGAGTGTTACGGGAATGGGGACATCCTCGTGGAGATGGGGGGTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGAGTGTTACGGGAATGGGGACATCCTCGTGGAGATGGGGGGTG  945

seq1  AGGTGGAGTCATGGGATGTTGAACGGTTGGAGGGTGGACTGGGAGTGGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGAGTCATGGGATGTTGAACGGTTGGAGGGTGGACTGGGAGTGGAA  995

seq1  TGGAGTCTAGAGTGTAAAAATAAATAAATAAATATTTAAATAAATAAGTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTCTAGAGTGTAAAAATAAATAAATAAATATTTAAATAAATAAGTG  1045

seq1  TTTAAATAAAAATTAGATCCCCAAAATAACATTAGTAAGTATTTTATTAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATAAAAATTAGATCCCCAAAATAACATTAGTAAGTATTTTATTAG  1095

seq1  TTGAGAATTC  1109
      ||||||||||
seq2  TTGAGAATTC  1105

seq1: chr10_26905268_26906369
seq2: B6Ng01-253B08.g_65_1158

seq1  GAATTCACATGCTGATTTCACAACATTGTGGTGCGCGAGCCCTTACAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATGCTGATTTCACAACATTGTGGTGCGCGAGCCCTTACAAAA  50

seq1  CCAATTTGGGGCTAAAACGCAGGTTTTTCTTTCCTCTCCTTAGAGCAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTGGGGCTAAAACGCAGGTTTTTCTTTCCTCTCCTTAGAGCAGCA  100

seq1  TAGTGGTAGTAAGGGTCGCATAGAACTTTAAGCAGCAGCTCCTCTCTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGTAGTAAGGGTCGCATAGAACTTTAAGCAGCAGCTCCTCTCTGAT  150

seq1  AAGAACACCTTCGCTCTTCTGCACTCTGTGGACTGTGATGCAAGAGGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACACCTTCGCTCTTCTGCACTCTGTGGACTGTGATGCAAGAGGCAA  200

seq1  AACTCCTGCGTGTTTGACCAGTCTTCTCTCCACTGAAACCTCCAGGAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTGCGTGTTTGACCAGTCTTCTCTCCACTGAAACCTCCAGGAGGA  250

seq1  CCCGACACTACTGTTAGAAGATACAAGCATCGTTTTGCCTTCCTTCTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGACACTACTGTTAGAAGATACAAGCATCGTTTTGCCTTCCTTCTCTT  300

seq1  GTGCACACAATCATATGAGAGAGCGGGGTTTAAAGAATCAAGAGACTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACACAATCATATGAGAGAGCGGGGTTTAAAGAATCAAGAGACTCTT  350

seq1  AAACAGTGGCAACAATAGATACTCTGCTGTGAATAATGTTTCTCTGGTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTGGCAACAATAGATACTCTGCTGTGAATAATGTTTCTCTGGTGA  400

seq1  TGAGAGGAGCTCACATGTAGATGAAAGGGTAGAGAGGCATAAGGATAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGAGCTCACATGTAGATGAAAGGGTAGAGAGGCATAAGGATAGAA  450

seq1  ATGCAAGCAATGGCTTCACTTGTTTCTGGATATGGCCTCCATTTAAATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGCAATGGCTTCACTTGTTTCTGGATATGGCCTCCATTTAAATGA  500

seq1  ATACTAGACACTAGAAGTTACTACATACGTAACTCAAACTTAAACTCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAGACACTAGAAGTTACTACATACGTAACTCAAACTTAAACTCTCT  550

seq1  TTCTGATACCGCTGTAGTTTATGTAACGATAAAGAGGTTGGGCTATGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATACCGCTGTAGTTTATGTAACGATAAAGAGGTTGGGCTATGTCT  600

seq1  TACTCGGGGGTTATTTTAACTCTGTCATGTTTTCCCTGTCTTAAATACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCGGGGGTTATTTTAACTCTGTCATGTTTTCCCTGTCTTAAATACAC  650

seq1  AAGTGCTGGTGATGTATCTGCCTTACTTGCTTTCCTGGTGAACATACAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTGGTGATGTATCTGCCTTACTTGCTTTCCTGGTGAACATACAAC  700

seq1  TTGAGTTTTCATAGGGTTTACAAAAATTGATGTGTAGTGAAAAATGAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTTCATAGGGTTTACAAAAATTGATGTGTAGTGAAAAATGAAAA  750

seq1  CAAGAGTTGTCCCAGAAGTAACACTGATGACATGTTCTGTGAGCTATCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTTGTCCCAGAAGTAACACTGATGACATGTTCTGTGAGCTATCAA  800

seq1  ATTCTTAGGGTAGTCTGTAAGAACCTGCAAAGTAGTCCACTTGTATACCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTAGGGTAGTCTGTAAGAACCTGCAAAGTAGTCCACTTGTATACCC  850

seq1  AATATGTAGGCCAGCTTTGGTTTCTATTACAAATGTATTTTGC-TTTTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AATATGTAGGCCAGCTTTGGTTTCTATTACAAATGTATTTTGCTTTTTCT  900

seq1  AAACTAATTAGCAATATATATGACAGTGG-TTTTTTTTTGTTTGTTTCTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAATTAGCAATATATATGACAGTGGTTTTTTTTTTGTTTGTTTCTT  950

seq1  TTTGTTTTGTTTTGTTTTAGTACATGTTTTTCTGTACTGAAAAACATGAT  998
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  TTTGTTTTGTTTTG-TTTAGTACATGTTTTTCTGTACTG--AAACATGAT  997

seq1  AAAGAACCCAAAGGAATATAAACGAGAAGGTGAGTTCTAGCTCATGATTA  1048
       |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| 
seq2  -AAGAACCCAAAGGAATAT-AACGAGA--GTGAGTTCTAGCTCATGATT-  1042

seq1  ACTCTTTCACTGAAACCCCCTTCA-TCT-ATCTAGTGAGCAACACGAATC  1096
      |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||
seq2  ACTC-TTCACTG-AACCCCCTTCATTCTAATCTAGTGAGC-ACACG-ATC  1088

seq1  TTCTAT  1102
      ||||||
seq2  TTCTAT  1094