BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255B24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 85,192,428 - 85,283,226
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC626878, LOC669723, LOC626940
Upstream geneRfx4, EG625690, Ric8b, Fhl4, AI597468, Mterfd3, Cry1, EG666974, Btbd11, EG626858
Downstream genePwp1, Prdm4, Ascl4, D10Wsu52e, Bpil2, Fbxo7, Syn3, Timp3, EG627035, LOC672902, LOC100041419, EG382395, Hsp90b1, Nt5dc3, Fabp3-ps1, C630002B14Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255B24.bB6Ng01-255B24.g
ACCGA061409GA061410
length1,1551,108
definitionB6Ng01-255B24.b B6Ng01-255B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,282,065 - 85,283,226)(85,192,428 - 85,193,550)
sequence
gaattctttggactccacatgggtagatgcaagcctggccttttgaaaag
tactatttagcctcccaagtttaagcatcacacatttgaacacatcaccg
gaatttgatagaatttagcagcttacaatgtttctcttgacccagctcgt
tctcatgtctacgagtaaccttgaaaatcaagcccataaatccaacattg
caagtggtatttcaactctttcttgcaagctgattcataataactgcaca
tgagacaagacaaaggagatggtctgcttaacaaccaccttagaaaaaag
aaatagtctgccagctaaaagcagcagggtcattgctacaaaccagaagg
aaacatccccaggaaacatgggccagatgcaacggagcaaatactgtaaa
gacagagcaagtcttgggaatgagataacttgtggggttggagcaggggt
ttggggacataaaagtttgggaatagagcattgacacttttgtgaataca
ttttacatgcctatttttaagttgatcttcatgaatgttcacttatacca
aacagaagagtaaaagcatgcaacgacaataataaaaccccaaggaattt
cagtggcatcgtccagagcaagtgccaataaccaggcagattgagttctt
cagagagactgggaaagcttacaggacactttagcattctgtgaatcgag
agcgcatggctggtatgtgggaagaatgtgcaggaaatggtatccccatg
gctccctatgttaaactcaaaagtgcttgggatttccaggcagcagaaag
aatgagacaggcgatcaatggcttcctgtgggaccagaagaaaaggctac
cttctgattgaacatgctcatctctcagcatgagcagtactaaacccagc
tcatatctatagcagaaggagaccatctccctgttacaatttaaaaagac
acagcactctgtttctgatagtatggggccacaccagtttagaagaatcc
aatatcatgtttaatgtcagagaagctatggtgctcacaaagggcagcta
aagtagtgcttccctctatgtgggtctgtacaagaatacacctctctggg
aatgctcaggaatgatttgcatcgacatctcaactgtcagactcaatcat
ctaca
gaattcttgaaggaggccccagaaacaagcttttcagtagtgctgggaag
gagccgtttctgagttgttgcaagatcacaaacaaaacagcagacaggct
ccaaggcacagacaggatggcttctagtccccctgccataccctaagtag
cttgctgagccaggctagctagtgtttcttatatttagtgaaaggggatc
tgcaatcctggtggaagtcctcagcacctactgccccatcccagcactgc
acactctaccttgaactcaaaagcatcttccaagtcaggtgtactataag
tgttccctgcatcgaaaggcaggccccatctgaccatgtggccctcccat
taactgctttcccaatcacaagggacaagaatgagccaggagagcctgtc
cacacagcccaggctggggccagggtagatgaagcaagcattattgaggg
cttgaaatggctgttgtcagctaagtggaagctcatgtggtcactgtgtg
caaatgaggggctcatcttaagtggctcagttgggagcaggcctgatggt
ggtctctggtctccacagcaaagggttctgtgcacaccctctgcctcctg
gtaaagtgtggcgtgtctgagatatgcttgtggtgtcagctggggggagg
agacagcagtggcctcagcaaaagggtgtcatcagtagccctcctgagta
aagcttgtgtcaccagggataagttggtggaaggaacacagggctcctgg
ctcccacagcataacagcttctaaacccacacagagaaaggctcatgaaa
tttaggggacttatccaaggtgggggcagtcttgagaggatcacaaaggc
aagctgtcttctgaaaggattactttagactatgatataaagacacatgc
ccatctcccccatgagtccaatttaagactgctactattgcttcttccag
agggtctgaaaaaaatctagctgaaaaaagaatcatttgtttaaagagca
catgtggggagatcacatcactggactcacaagctaccttagcatcatct
ggcgcaggaggcattccctggtatatccatcccacgttctgtgagattta
aatccttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_85282065_85283226
seq2: B6Ng01-255B24.b_43_1197 (reverse)

seq1  TGTAGATGA-TGAG-CTGACAGTTGGAGGGAATGTAGAAGTGAAAGATCC  48
      ||||||||| |||| ||||||||| |||   |||| ||  || || ||| 
seq2  TGTAGATGATTGAGTCTGACAGTT-GAG---ATGTCGA--TGCAA-ATCA  43

seq1  TCTCTTGAGCATCCCCAGAGAGGTGTAT--CTGTACAGACCCACATAGAG  96
      | || ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  T-TCCTGAGCATTCCCAGAGAGGTGTATTCTTGTACAGACCCACATAGAG  92

seq1  GGAAACCACTACTTTAAGCTGCCCTTTGTGAGCACCATAGCTTCTCTGGA  146
      || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GG-AAGCACTACTTT-AGCTGCCCTTTGTGAGCACCATAGCTTCTCT-GA  139

seq1  CATTAAACAATGATATTGGGATTCTTCTAAACTGGTGTGG-CCCATACTA  195
      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CATTAAAC-ATGATATT-GGATTCTTCTAAACTGGTGTGGCCCCATACTA  187

seq1  TCAG-AACAGAGTGCTGTGTCTTTTTAAATTGTAACAGGGAGATGGTCTC  244
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAACAGAGTGCTGTGTCTTTTTAAATTGTAACAGGGAGATGGTCTC  237

seq1  CTTCTGCTATAGATATGAGCTGGGTTTAGTACTGCTCATGCTGAGAGATG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGCTATAGATATGAGCTGGGTTTAGTACTGCTCATGCTGAGAGATG  287

seq1  AGCATGTTCAATCAGAAGGTAGCCTTTTCTTCTGGTCCCACAGGAAGCCA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGTTCAATCAGAAGGTAGCCTTTTCTTCTGGTCCCACAGGAAGCCA  337

seq1  TTGATCGCCTGTCTCATTCTTTCTGCTGCCTGGAAATCCCAAGCACTTTT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCGCCTGTCTCATTCTTTCTGCTGCCTGGAAATCCCAAGCACTTTT  387

seq1  GAGTTTAACATAGGGAGCCATGGGGATACCATTTCCTGCACATTCTTCCC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTAACATAGGGAGCCATGGGGATACCATTTCCTGCACATTCTTCCC  437

seq1  ACATACCAGCCATGCGCTCTCGATTCACAGAATGCTAAAGTGTCCTGTAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACCAGCCATGCGCTCTCGATTCACAGAATGCTAAAGTGTCCTGTAA  487

seq1  GCTTTCCCAGTCTCTCTGAAGAACTCAATCTGCCTGGTTATTGGCACTTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCCAGTCTCTCTGAAGAACTCAATCTGCCTGGTTATTGGCACTTG  537

seq1  CTCTGGACGATGCCACTGAAATTCCTTGGGGTTTTATTATTGTCGTTGCA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGACGATGCCACTGAAATTCCTTGGGGTTTTATTATTGTCGTTGCA  587

seq1  TGCTTTTACTCTTCTGTTTGGTATAAGTGAACATTCATGAAGATCAACTT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTACTCTTCTGTTTGGTATAAGTGAACATTCATGAAGATCAACTT  637

seq1  AAAAATAGGCATGTAAAATGTATTCACAAAAGTGTCAATGCTCTATTCCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGGCATGTAAAATGTATTCACAAAAGTGTCAATGCTCTATTCCC  687

seq1  AAACTTTTATGTCCCCAAACCCCTGCTCCAACCCCACAAGTTATCTCATT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTTTATGTCCCCAAACCCCTGCTCCAACCCCACAAGTTATCTCATT  737

seq1  CCCAAGACTTGCTCTGTCTTTACAGTATTTGCTCCGTTGCATCTGGCCCA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGACTTGCTCTGTCTTTACAGTATTTGCTCCGTTGCATCTGGCCCA  787

seq1  TGTTTCCTGGGGATGTTTCCTTCTGGTTTGTAGCAATGACCCTGCTGCTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCTGGGGATGTTTCCTTCTGGTTTGTAGCAATGACCCTGCTGCTT  837

seq1  TTAGCTGGCAGACTATTTCTTTTTTCTAAGGTGGTTGTTAAGCAGACCAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTGGCAGACTATTTCTTTTTTCTAAGGTGGTTGTTAAGCAGACCAT  887

seq1  CTCCTTTGTCTTGTCTCATGTGCAGTTATTATGAATCAGCTTGCAAGAAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTTGTCTTGTCTCATGTGCAGTTATTATGAATCAGCTTGCAAGAAA  937

seq1  GAGTTGAAATACCACTTGCAATGTTGGATTTATGGGCTTGATTTTCAAGG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGAAATACCACTTGCAATGTTGGATTTATGGGCTTGATTTTCAAGG  987

seq1  TTACTCGTAGACATGAGAACGAGCTGGGTCAAGAGAAACATTGTAAGCTG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCGTAGACATGAGAACGAGCTGGGTCAAGAGAAACATTGTAAGCTG  1037

seq1  CTAAATTCTATCAAATTCCGGTGATGTGTTCAAATGTGTGATGCTTAAAC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTCTATCAAATTCCGGTGATGTGTTCAAATGTGTGATGCTTAAAC  1087

seq1  TTGGGAGGCTAAATAGTACTTTTCAAAAGGCCAGGCTTGCATCTACCCAT  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGGCTAAATAGTACTTTTCAAAAGGCCAGGCTTGCATCTACCCAT  1137

seq1  GTGGAGTCCAAAGAATTC  1162
      ||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGTCCAAAGAATTC  1155

seq1: chr10_85192428_85193550
seq2: B6Ng01-255B24.g_65_1172

seq1  GAATTCTTGAAGGAGGCCCCAGAAACAAGCTTTTCAGTAGTGCTGGGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAAGGAGGCCCCAGAAACAAGCTTTTCAGTAGTGCTGGGAAG  50

seq1  GAGCCGTTTCTGAGTTGTTGCAAGATCACAAACAAAACAGCAGACAGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCGTTTCTGAGTTGTTGCAAGATCACAAACAAAACAGCAGACAGGCT  100

seq1  CCAAGGCACAGACAGGATGGCTTCTAGTCCCCCTGCCATACCCTAAGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCACAGACAGGATGGCTTCTAGTCCCCCTGCCATACCCTAAGTAG  150

seq1  CTTGCTGAGCCAGGCTAGCTAGTGTTTCTTATATTTAGTGAAAGGGGATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGAGCCAGGCTAGCTAGTGTTTCTTATATTTAGTGAAAGGGGATC  200

seq1  TGCAATCCTGGTGGAAGTCCTCAGCACCTACTGCCCCATCCCAGCACTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATCCTGGTGGAAGTCCTCAGCACCTACTGCCCCATCCCAGCACTGC  250

seq1  ACACTCTACCTTGAACTCAAAAGCATCTTCCAAGTCAGGTGTACTATAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCTACCTTGAACTCAAAAGCATCTTCCAAGTCAGGTGTACTATAAG  300

seq1  TGTTCCCTGCATCGAAAGGCAGGCCCCATCTGACCATGTGGCCCTCCCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCCTGCATCGAAAGGCAGGCCCCATCTGACCATGTGGCCCTCCCAT  350

seq1  TAACTGCTTTCCCAATCACAAGGGACAAGAATGAGCCAGGAGAGCCTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGCTTTCCCAATCACAAGGGACAAGAATGAGCCAGGAGAGCCTGTC  400

seq1  CACACAGCCCAGGCTGGGGCCAGGGTAGATGAAGCAAGCATTATTGAGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGCCCAGGCTGGGGCCAGGGTAGATGAAGCAAGCATTATTGAGGG  450

seq1  CTTGAAATGGCTGTTGTCAGCTAAGTGGAAGCTCATGTGGTCACTGTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAATGGCTGTTGTCAGCTAAGTGGAAGCTCATGTGGTCACTGTGTG  500

seq1  CAAATGAGGGGCTCATCTTAAGTGGCTCAGTTGGGAGCAGGCCTGATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAGGGGCTCATCTTAAGTGGCTCAGTTGGGAGCAGGCCTGATGGT  550

seq1  GGTCTCTGGTCTCCACAGCAAAGGGTTCTGTGCACACCCTCTGCCTCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCTGGTCTCCACAGCAAAGGGTTCTGTGCACACCCTCTGCCTCCTG  600

seq1  GTAAAGTGTGGCGTGTCTGAGATATGCTTGTGGTGTCAGCTGGGGGGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGTGTGGCGTGTCTGAGATATGCTTGTGGTGTCAGCTGGGGGGAGG  650

seq1  AGACAGCAGTGGCCTCAGCAAAAGGGTGTCATCAGTAGCCCTCCTGAGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCAGTGGCCTCAGCAAAAGGGTGTCATCAGTAGCCCTCCTGAGTA  700

seq1  AAGCTTGTGTCACCAGGGATAAGTTGGTGGAAGGAACACAGGGCTCCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTGTGTCACCAGGGATAAGTTGGTGGAAGGAACACAGGGCTCCTGG  750

seq1  CTCCCACAGCATAACAGCTTCTAAACCCACACAGAGAAAGGCTCATGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACAGCATAACAGCTTCTAAACCCACACAGAGAAAGGCTCATGAAA  800

seq1  TTTAGGGGACTTATCCAAGGTGGGGGCAGTCTTGAGAGGATCACAAAGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGGGACTTATCCAAGGTGGGGGCAGTCTTGAGAGGATCACAAAGGC  850

seq1  AAGCTGTCTTCTGAAAGGATTACTTTAGACTATGATATAAAGACACATGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTCTTCTGAAAGGATTACTTTAGACTATGATATAAAGACACATGC  900

seq1  CCATCTCCCCCATGAGTCCAATTTAAGACTGCTACTATTGCTTCTTCCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCCCCATGAGTCCAATTTAAGACTGCTACTATTGCTTCTTCCAG  950

seq1  AGGGTCTTGAAAAAAATCTAAGCCTTGAAAAAAAGAATTCAATTTGTTTA  1000
      |||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||   |||||||| 
seq2  AGGGTC-TGAAAAAAATCT-AGC--TG-AAAAAAGAAT--CATTTGTTT-  992

seq1  AAAGAGCAACATGGTGGGGGAGATCCACAATCACTTGACTCACAAGCTAC  1050
      ||||||| |||||   |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||
seq2  AAAGAGC-ACATG--TGGGGAGAT-CAC-ATCACTGGACTCACAAGCTAC  1037

seq1  TTTAGCATCATCTGGCCGCAGGAAGCA-TCCCTGG-ATATCCA-CCCACT  1097
       |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| 
seq2  CTTAGCATCATCTGG-CGCAGGAGGCATTCCCTGGTATATCCATCCCACG  1086

seq1  TTCTGTGAGGAAATTTAAAATCCTTT  1123
      |||||||||   |||| |||||||||
seq2  TTCTGTGAG---ATTT-AAATCCTTT  1108