BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255G07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 15,159,174 - 15,304,736
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC637043
Upstream geneGpr126, LOC100039571, LOC100039409, Vta1, D230044M03Rik, EG666904, Nmbr, LOC666917
Downstream geneLOC100039492, LOC671439, LOC382457
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255G07.bB6Ng01-255G07.g
ACCGA061610GA061611
length7151,068
definitionB6Ng01-255G07.b B6Ng01-255G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,159,174 - 15,159,888)(15,303,712 - 15,304,736)
sequence
gaattccatagcttttcccaaagtcacaccttagggaaaaccgtgtcaaa
atataagtatgtagaagacagcacaatttcagcataccacaactatatct
catatttcaacatacaaatctatattgtactccattaattcctcagaatt
taggctatggatctttgagtatgctggccaccagttagtattgcatcgtt
tccagcataagagtatagttagtaatagaggccttgtgttaggtactgat
tggatgttacaaatgaactcctaaaaatcagagctcatgatgctctcacc
caaccattggactgagtactggggtccagatggaggagttgcagaagtga
ctgaaggagctgagggtatttacagctccatggagggagcaacagtgtca
acagtccagagccccatagttcccagggactgaaccaccaaccaaagaat
acacatggagggaccaatggcactggcctcatatgtggcagaggatgggc
ttgttgggcatcagtgggagaagaggcccttggatctgagggtgcttgat
gccccaatgtaggggaatgccagggcaggaagatgtgagggggtgggaga
ggtggggaagcatcgtcatagaggcaggaagagggaaaggggataaagta
tttctgaagtagagacctgggaagggggaaaacatttaatattaaaatga
aaaaaataaaagttc
gaattccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagttccctat
ctgatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtcttttt
gtcttattgacggtgtcttttgccttgcagaaactttggagtttcattag
gtcccatttgtcaattctcgatcttacagcacaagccattgctgttctgt
aaatgctattttcttcttttttttttttttggtgtatttaatttttagta
tatattgactgtgtatcttgacaatctaataaatcagtttgttaattatt
cccaatttagggggtcattttaattttataattttataagttagatgaca
tttatgtgagaaagtaagaaaaagatgtgaacttcagattcaattcaaga
atgtgttttcatttgagaagcatgggggtgaagaatatgcaggaggtagc
attacatttgctgtaagattcatgcatttgcttacagcttccaaggtatg
tttctcagtagcagtttttcacagcactcagattacaaacatactgactt
ttaatctctctctctctctctctaatgcaatactttatttacttacattt
caaatgttttcccctttcccagtctcccctccataagccccctatcccct
ccttccccacccaccaactcccaactccctgccctggcattcccctacac
tggggcattgagccttcatgacctatcctcccattgatgcctgacaaggc
cagcctctactatatatgcaactggaccatgattcactcaatgtgtaatc
tttgtttggtggtttactccctgggagctccaggggggcggggggtctga
ttggttgatattgttgttcttcctatgggttgcaaaccccttcagctcct
tcagtcctttctctaactcctccattggggaccctgtgctcagtcaatgg
ttggctgctagcatctgcctctgtatctgacagatctgcagagcctctca
ggaaatagctatatcagctcttatcagcagcacctcactgccatccacat
aaggtctaggttttgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_15159174_15159888
seq2: B6Ng01-255G07.b_46_760

seq1  GAATTCCATAGCTTTTCCCAAAGTCACACCTTAGGGAAAACCGTGTCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAGCTTTTCCCAAAGTCACACCTTAGGGAAAACCGTGTCAAA  50

seq1  ATATAAGTATGTAGAAGACAGCACAATTTCAGCATACCACAACTATATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGTATGTAGAAGACAGCACAATTTCAGCATACCACAACTATATCT  100

seq1  CATATTTCAACATACAAATCTATATTGTACTCCATTAATTCCTCAGAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTTCAACATACAAATCTATATTGTACTCCATTAATTCCTCAGAATT  150

seq1  TAGGCTATGGATCTTTGAGTATGCTGGCCACCAGTTAGTATTGCATCGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTATGGATCTTTGAGTATGCTGGCCACCAGTTAGTATTGCATCGTT  200

seq1  TCCAGCATAAGAGTATAGTTAGTAATAGAGGCCTTGTGTTAGGTACTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCATAAGAGTATAGTTAGTAATAGAGGCCTTGTGTTAGGTACTGAT  250

seq1  TGGATGTTACAAATGAACTCCTAAAAATCAGAGCTCATGATGCTCTCACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTTACAAATGAACTCCTAAAAATCAGAGCTCATGATGCTCTCACC  300

seq1  CAACCATTGGACTGAGTACTGGGGTCCAGATGGAGGAGTTGCAGAAGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATTGGACTGAGTACTGGGGTCCAGATGGAGGAGTTGCAGAAGTGA  350

seq1  CTGAAGGAGCTGAGGGTATTTACAGCTCCATGGAGGGAGCAACAGTGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGAGCTGAGGGTATTTACAGCTCCATGGAGGGAGCAACAGTGTCA  400

seq1  ACAGTCCAGAGCCCCATAGTTCCCAGGGACTGAACCACCAACCAAAGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCAGAGCCCCATAGTTCCCAGGGACTGAACCACCAACCAAAGAAT  450

seq1  ACACATGGAGGGACCAATGGCACTGGCCTCATATGTGGCAGAGGATGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGGAGGGACCAATGGCACTGGCCTCATATGTGGCAGAGGATGGGC  500

seq1  TTGTTGGGCATCAGTGGGAGAAGAGGCCCTTGGATCTGAGGGTGCTTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGGCATCAGTGGGAGAAGAGGCCCTTGGATCTGAGGGTGCTTGAT  550

seq1  GCCCCAATGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGAAGATGTGAGGGGGTGGGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAATGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGAAGATGTGAGGGGGTGGGAGA  600

seq1  GGTGGGGAAGCACCGTCATAGAGGCAGGAAGAGGGAAAGGGGATAAGGTA  650
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGTGGGGAAGCATCGTCATAGAGGCAGGAAGAGGGAAAGGGGATAAAGTA  650

seq1  TTTCTGAAGTAGAGACCTGGGAA-GGGGAAAACATTTAAAATTAAAACAG  699
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |
seq2  TTTCTGAAGTAGAGACCTGGGAAGGGGGAAAACATTTAATATTAAAA-TG  699

seq1  AAAAAAATAAAAGTTC  715
      ||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATAAAAGTTC  715

seq1: chr10_15303712_15304736
seq2: B6Ng01-255G07.g_117_1135 (reverse)

seq1  ACACAAAACCTAGACTCTATTGTGGATGCCAGTGA-GTGCTTGCTGATAA  49
      ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| |||||||||
seq2  ACACAAAACCTAGAC-CTTATGTGGATGGCAGTGAGGTGC-TGCTGATAA  48

seq1  GAGCCTGATATAGCTATCTCCTGAGAGGCTCTGCCAGATCCTGTCAGATA  99
      ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||
seq2  GAG-CTGATATAGCTATTTCCTGAGAGGCTCTG-CAGAT-CTGTCAGATA  95

seq1  CAGAGGCAGATGCTAGCAGCCAACCATTGGACTGAGCACAGGGTCCCCAA  149
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCAGATGCTAGCAGCCAACCATT-GACTGAGCACAGGGTCCCCAA  144

seq1  TGGAGGAGTTAGAGAAAGGACTGAAGGAGCTGAAGGGGTTTGCAACCCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAGTTAGAGAAAGGACTGAAGGAGCTGAAGGGGTTTGCAACCCAT  194

seq1  AGGAAGAACAACAATATCAACCAATCAGACCCCCCGCCCCCCTGGAGCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAACAACAATATCAACCAATCAGACCCCCCGCCCCCCTGGAGCTC  244

seq1  CCAGGGAGTAAACCACCAAACAAAGATTACACATTGAGTGAATCATGGTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAGTAAACCACCAAACAAAGATTACACATTGAGTGAATCATGGTC  294

seq1  CAGTTGCATATATAGTAGAGGCTGGCCTTGTCAGGCATCAATGGGAGGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGCATATATAGTAGAGGCTGGCCTTGTCAGGCATCAATGGGAGGAT  344

seq1  AGGTCATGAAGGCTCAATGCCCCAGTGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGGAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCATGAAGGCTCAATGCCCCAGTGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGGAG  394

seq1  TTGGGAGTTGGTGGGTGGGGAAGGAGGGGATAGGGGGCTTATGGAGGGGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGTTGGTGGGTGGGGAAGGAGGGGATAGGGGGCTTATGGAGGGGA  444

seq1  GACTGGGAAAGGGGAAAACATTTGAAATGTAAGTAAATAAAGTATTGCAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGGAAAGGGGAAAACATTTGAAATGTAAGTAAATAAAGTATTGCAT  494

seq1  TAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAAAAGTCAGTATGTTTGTAATCTGAGTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAAAAGTCAGTATGTTTGTAATCTGAGTG  544

seq1  CTGTGAAAAACTGCTACTGAGAAACATACCTTGGAAGCTGTAAGCAAATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAAAAACTGCTACTGAGAAACATACCTTGGAAGCTGTAAGCAAATG  594

seq1  CATGAATCTTACAGCAAATGTAATGCTACCTCCTGCATATTCTTCACCCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATCTTACAGCAAATGTAATGCTACCTCCTGCATATTCTTCACCCC  644

seq1  CATGCTTCTCAAATGAAAACACATTCTTGAATTGAATCTGAAGTTCACAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTCTCAAATGAAAACACATTCTTGAATTGAATCTGAAGTTCACAT  694

seq1  CTTTTTCTTACTTTCTCACATAAATGTCATCTAACTTATAAAATTATAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCTTACTTTCTCACATAAATGTCATCTAACTTATAAAATTATAAA  744

seq1  ATTAAAATGACCCCCTAAATTGGGAATAATTAACAAACTGATTTATTAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATGACCCCCTAAATTGGGAATAATTAACAAACTGATTTATTAGA  794

seq1  TTGTCAAGATACACAGTCAATATATACTAAAAATTAAATACACCAAAAAA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTGTCAAGATACACAGTCAATATATACTAAAAATTAAATACACC-AAAAA  843

seq1  AAAAAAAAAGAAGAAAATAGCATTTACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAGAAGAAAATAGCATTTACAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGT  893

seq1  AAGATCGAGAATTGACAAATGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCGAGAATTGACAAATGGGACCTAATGAAACTCCAAAGTTTCTGCA  943

seq1  AGGCAAAAGACACCGTCAATAAGACAAAAAGACCACCAACAGATTGGGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAAGACACCGTCAATAAGACAAAAAGACCACCAACAGATTGGGAA  993

seq1  AGGATCTTTACCTATCCTAAATCAGA  1025
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTTTACCTATCCTAAATCAGA  1019